• 제목/요약/키워드: pathotyping

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닭 도축장에서의 뉴캣슬병 바이러스 오염 실태 조사 (Surveillance of Newcastle Disease Virus in Chicken Slaughterhouses)

  • 최강석;이은경;전우진;권준헌;이진화;성환우
    • 한국가금학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.97-104
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    • 2011
  • 국내 도축장 및 도축장 출하 닭을 대상으로 NDV 오염 실태를 조사하였다. 조사결과, 닭출하농장, 닭수송용차량, 도축장 현수실, 도축장 냉각수에서 각각 조사 대상건수의 13.0%, 13.3%, 16.0%, 10.8%에서 NDV가 분리되었다. 시기별로 보면 차량, 현수실, 냉각수 모두에서 7월에 가장 많이 바이러스가 분리되었다. Pathotyping RT-PCR을 실시한 결과, 이들 분리된 NDV 분리주는 모두 저병원성 NDV 양성 반응을 나타내었으며, F 단백질 분절 부위에 모두 $^{112}GKQGR/L^{117}$ motif를 가지고 있었다. 본 연구에서 분리된 NDV 분리주의 F 단백질 유전자를 분석하여 보았을 때, 조사한 NDV 분리주 25주 중 24주가 NDV V4주와 같은 유전적 cluster를 형성하였으며, 나머지 1주는 NDV Ulster 2C주와 같은 유전적 cluster를 형성하였다. 이와 같은 연구 결과로 보아 국내에서는 출하 닭, 수송 차량, 현수실, 냉각수 등 생산에서 도축 단계까지 일련의 과정에서 높은 빈도로 저병원성 NDV 오염이 이루어지고 있음을 알 수 있었다.

야생벼 Oryza minuta에서 유래한 수원506호의 흰잎마름병 저항성유전자에 대한 고찰 (Genetic Analysis on the Bacterial Blight Resistance Gene from a Wild Relative, Oryza minuta)

  • 정지웅;노태환;강경호;신영섭;김연규
    • 한국작물학회지
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    • 제56권2호
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    • pp.124-133
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    • 2011
  • 벼 흰잎마름병은 세계적으로 벼 재배치에서 가장 문제시되는 병해충의 하나이다. 우리나라의 경우 상습발생지를 중심으로 Xa1과 Xa3 이 저항성 유전자로 활용되었으나, 소수의 저항원이 집중적으로 활용됨으로 인해 최근 이병화가 급속히 진행되고 있다. 특히 최근 Xa1과 Xa3 모두를 침해하는 새로운 균계 K3a가 확인됨에 따라 새로운 저항성 유전자의 동정 및 활용의 중요성이 높아가고 있다. 국내육성 자포니카품종 화성벼와 야생벼 O. minuta 간의 종간교잡을 통해 확립된 수원506호의 흰잎마름병에 대한 유전분석을 실시하였다. 수원506호와 통일계 품종인 밀양23호간의 교잡을 통해 확보한 F2 개체들을 활용하여 흰잎마름균주 HB3011 의 접종에 따른 병반장의 변이와 유전자지도 작성에 사용된 SSR 마커의 유전자형간의 연관성분석을 수행하였다. 수원506호의 흰잎마름병 저항성을 지배하며 우성유전자로 작용하는 주동유전인자가 염색체 4변 하단에서 SSR 마커 RM255 에 의해 표지 되었는데, 해당 염색체영역은 Xa1과 Xa2 및 Xa22 등이 보고되었던 영역과 매우 유사할 것으로 추정되었다.

뉴캣슬병 바이러스 검출 및 병원성 감별을 위한 Duplex RT-PCR법 개발 (Development of a Duplex RT-PCR Assay for the Simultaneous Detection and Discrimination of Avirulent and Virulent Newcastle Disease Virus (NDV))

  • 김지예;이현정;장일;이희수;윤성준;박지성;설재구;김승환;홍지무;;;최강석
    • 한국가금학회지
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    • 제44권2호
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    • pp.93-102
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    • 2017
  • 본 연구에서 NDV의 L유전자와 F유전자를 표적 부위로 각각 제작한 primer 세트를 사용함으로써 하나의 PCR 튜브에서 NDV 검출(386 bp의 증폭 크기)과 함께 병원성 NDV(229 bp의 증폭 크기)를 동시에 감별 증폭할 수 있는 dRT-PCR 검사법을 개발하였다. 개발된 dRT-PCR검사법은 NDV를 특이적으로 검출하고, 병원성을 감별하였다. 특히 국내 병성감정 실시기관에서 적용 중인 기존의 RT-PCR 상용키트에서는 검출하지 못하는 class I NDV과 PPMV(class II 유전형 VI형)을 NDV를 검출함과 동시에 병원성 NDV도 감별가능하였다. 개발된 dRT-PCR 검사법의 검출 민감도는 약 $10^{3.0}EID_{50}/0.1mL$로 평가되었다. 또한 ND발생국의 야외 시료에 적용했을 때, NDV 공통항원 검출율은 94.4%였으며, 병원성 NDV 검출율은 100%이었다. 그러므로 본 연구에서 개발한 dRT-PCR 검사법은 의심축 사례에서 ND를 신속 정확하게 진단하는 데 유용할 진단 방법을 제공할 수 있을 것으로 판단된다.