• 제목/요약/키워드: pE194

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생물방제균 Bacillus sp. YBL-7의 형질전환조건 (Genetic Transformation of Biocontrol Agent Bacillus sp, YBL-7 by Plasmid pE194)

  • 한길환;정병곤;김상달
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제20권4호
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    • pp.384-389
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    • 1992
  • 식물근부균 Fusarium solani의 생육을 강력히 길항하는 Bacillus sp. YBL-7을 토양으로부터 분리하였으며 그 길항기작이 항생물질임을 이미 보고하였다. 분리된 생물방제균 Bacillus sp. YBL-7 균주들 siderophore, 가수분해능 등의 타 방제기능을 도입할 수 있는 다기능적인 방제균으로 육종하기 위해 plasmid vector pE194를 이용하여 효율적인 형질전환 system을 확립하고자 하였으며, 이때 필요한 여러가지 조건을 조사하였다. 생물방제균 Bacillus sp. YBL-7 원형질체 형성의 최적조건은 5시간 배양된 균체를 사용함으로써, 최종농도가 200${\mu}g$/ml인 lysozyme을 $37^{\circ}C$에서 90분간 처리함으로써 원형질체 생성율이 가장 높았다. 삼투압안정 완충제인 SMM bufferso의 sucrose 농도는 0.5M에서 안정하였고, mannitol 재생 배지에서 원형질체를 재생시켰을 경우 첨가된 agar의 농도가 1.2%에서, mannitol은 0.7M의 농도에서 가장 재생율이 높았다. 형질전환율은 polyethylene glycol 농도가 40%(w/v)일 때 가장 높았으며, plasmid DNA와의 접촉시간과 발현배양시간은 각각 10분, 120분에서 가장 효과가 좋았다. 또한 plasmid DNA의 농도는 5$\mu$g/ml 첨가에서 가장 높았으며, 형질전환된 숙주균주 Bacillus sp. YBL-7내에서의 pE194는 매우 안정하게 유지되었으며, 외붕 전자가 도입된 전환체와 숙주균주가 동일한 억제력을 갖는 것으로 확인되었으며, agarose gel 상에서도 고유의 plasmid pE194의 band를 확인 할 수 있었다.

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Staphylococcus aureus DH1에서 분리한 R-plasmid pSBK203상의 복제개시 부위 ori에 관한 연구 (Replication origin (ori) of R-plasmid pSBK203 Isolated from Staphylococcus aureus DHI)

  • 민경일;변우현
    • 미생물학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.186-191
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    • 1994
  • Staphylococcus aureus로부터 분리한 R-plasmid pSBK203의 복제개시 단백질인 Rep의 작용부위인 ori 및 dsDNA로의 전환을 위해 요구되는 minus origin부위를 밝히고자 시도하였다. Escherichia coli vecotr를 이용하여 pSBK203의 복제관련 부위를 최소한도로 포함하는 재조합 E.coli-Bacillus subtilis shuttle vector를 구성, 분리하고 여기에 포함된 pSBK203부위의 염기 서열을 분석함으로써 ori를 확인하였다. pSBK203의 복제개시 부위 ori는 rep의 구조 유전자 ORF내에서 약 50bp의 크기로 발견되었으며 지금까지 알려진 staphylococcal plasmid들중에서 pT181족 plasmid들의 ori와 높은 상동성을 갖는 것으로 분석되었다. 복제 과정에서 ssDNA로 먼저 만들어진 (+)쇄가 dsDNA로 전환되기 위해 필요한 신호로 작용하는 것으로 알려저 있는 minus origin (M-O)인 긴 palindrome 구조, 즉 pal 부위가 rep 우전자의 상류에서 2개 연이어 존재하는 것이 발견되었다. 이중에서 pOX6, pC194, 및 pE194 등과 같은 다른 staphylococcal plasmid들의 pal 부위와 비교적 높은 상동성을 갖는 paLA 는 plasmid 유지에 별 영향을 미치지 못하는 반면 다른 plasmid에서 유사 서열이 보고되지 않은 palA는 plasmid 유지에 필수적이라는 사실이 밝혀졌다.

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Purification and Characterization of Cop, a Protein Involved in the Copy Number Control of Plasmid pE194

  • Kwak, Jin-Hwan;Kim, Jung-Ho;Kim, Mu-Yong;Choi, Eung-Chil
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제21권3호
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    • pp.291-297
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    • 1998
  • Cop protein has been overexpressed in Escherichia coli using a T7 RNA polymerase system. Purification to apparent homogeneity was achieved by the sequential chromatography on ion exchange, affinity chromatography, and reverse phase high performance liquid chromatography system. The molecular weight of the purified Cop was estimated as 6.1 kDa by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). But the molecular mass of the native state Cop was shown to be 19 kDa by an analytical high performance size exclusion chromatography, suggesting a trimer-like structure in 50 mM Tris-HCI buffer (pH 7.5) containing 100 mM NaCl. Cop protein Was calculated to contain $39.1% {\alpha}-helix, 16.8% {\beta}-sheet$, 17.4% turn, and 26.8% random structure. The DNA binding property of Cop protein expressed in E. coli Was preserved during the expression and purification process. The isoelectric point of Cop was determined to be 9.0. The results of amino acid composition analysis and N-terminal amino acid sequencing of Cop showed that it has the same amino acid composition and N-terminal amino acid sequence as those deduced from its DNA sequence analysis, except for the partial removal of N-terminal methionine residue by methionyl-aminopeptidase in E. coli.

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Staphylococcus aureus DH1에서 분리된 Macrolide-Lincosamide-Streptogramin B 계열 항생물질에 대한 저항성 인자의 특성과 염기서열 (Nucleotide Sequence and Properties of Macrolide-Lincosamide-Streptogramin B Resistance Gene from Staphylococcus aureus DH1)

  • 권동현;박승문;윤권상;변우현
    • 미생물학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.27-34
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    • 1990
  • 지속성 및 유발성 발한의 두 macrolide-lincosamide-streptogramin B 저항성 인자가 한 Staphylococcus aureus DHI 균주의 염색체 DNA 및 plasmid pDE1(7.4kb)로부터 각각 분리되었다. pDE1상의 유발성 Em 저항성 인자의 염기서열은 이미 보고 된 바 있는 pE194상의 ermC와 동일하였으며 지속성 Em 저항성 인자의 경우는 그 제한효소 인식부위의 mapping 결과로 보아 ermCdb전자에서 유발성 기구에 관여하는 leader peptide 부위가 결여된 인자인 것으로 밝혀졌다.

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재조합 Plasmid DNA에 의한 Bacillus subtilis의 형질전환 (Transformation of Bacillus subtilis Protoplast by Recombinant Plasmid DNA)

  • Kim, Sang-Dal;John Spizizen
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제13권4호
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    • pp.345-348
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    • 1985
  • Mannitol hypertonic regeneration media를 사용하는 PEG-induced protoplast transformation system을 이용해서 pUB110과 pE194의 recombinant plasmid로 B. subtilis BR151을 transformation 시킴으로써 두 plasmid에서 유래되는 각각의 Neo$^{R}$와 Em$^{R}$을 동일한 recipient cell 내에서 동시에 발현시킬 수 있었다. Neomycin과 erythromycin을 함께 함유하는 mannitol regeneration media상에서 recombinant plasmid의 transformation frequency는 6.5 $\times$ $10^{-5}$이었다. 한편 transformant cell 내에서 recombinant plasmid의 replication이 agarose gel electrophoresis로 확인되었다.

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자외선 수직형 LED 제작을 위한 Indium Tin Oxide 기반 반사전극 (Indium Tin Oxide Based Reflector for Vertical UV LEDs)

  • 정기창;이인우;정탁;백종협;하준석
    • 한국재료학회지
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    • 제23권3호
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    • pp.194-198
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    • 2013
  • In this paper, we studied a p-type reflector based on indium tin oxide (ITO) for vertical-type ultraviolet light-emitting diodes (UV LEDs). We investigated the reflectance properties with different deposition methods. An ITO layer with a thickness of 50 nm was deposited by two different methods, sputtering and e-beam evaporation. From the measurement of the optical reflection, we obtained 70% reflectance at a wavelength of 382 nm by means of sputtering, while only 30% reflectance resulted when using the e-beam evaporation method. Also, the light output power of a $1mm{\times}1mm$ vertical chip created with the sputtering method recorded a twofold increase over a chip created with e-beam evaporation method. From the measurement of the root mean square (RMS), we obtained a RMS value 1.3 nm for the ITO layer using the sputtering method, while this value was 5.6 nm for the ITO layer when using the e-beam evaporation method. These decreases in the reflectance and light output power when using the e-beam evaporation method are thought to stem from the rough surface morphology of the ITO layer, which leads to diffused reflection and the absorption of light. However, the turn-on voltage and operation voltage of the two samples showed identical results of 2.42 V and 3.5 V, respectively. Given these results, we conclude that the two ITO layers created by different deposition methods showed no differences in the electric properties of the ohmic contact and series resistance.

Identification of Polymorphisms in CYP2E1 Gene and Association Analysis among Chronic HBV Patients

  • Chun, Ji-Yong;Park, Byung-Lae;Cheong, Hyun-Sub;Kim, Jason-Y.;Park, Tae-Joon;Lee, Jin-Sol;Lee, Hyo-Suk;Kim, Yoon-Jun;Shin, Hyoung-Doo
    • Genomics & Informatics
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    • 제7권4호
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    • pp.187-194
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    • 2009
  • Cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) is a member of the cytochrome P450 superfamily, and it is a key enzyme responsible for the metabolic activation of many smallmolecular-weight compounds such as alcohol, which is classified as a human carcinogen. In this study, we identified 19 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in CYP2E1 in Korean population. In these SNPs, we examined possible genetic association of CYP2E1 polymorphisms with HBV clearance and the risk of hepatocellular carcinoma (HCC). Five common polymorphic sites were selected, CYP2E1 polymorphisms at rs381-3867, rs3813870, rs2070673, rs2515641 and rs2480257, considering their allele frequencies, haplotype-tagging status and LDs for genotyping in larger-scale subjects (n=1,092). Statistical analysis demonstrated that CYP2E1 polymorphisms and haplotypes show no significant association with HBV clearance, HCC occurrence and onset age of HCC (p>0.05). Previous studies, however, have shown contradictory findings on associations of CYP2E1 polymorphisms with CYP2E1 activities and HCC risk. Comparing the contrasting results of previous researches suggest that CYP2E1 polymorphism is associated with CYP2E1 activity induced by ethanol, but is not directly associated with HCC risk. CYP2E1 variation/haploype information identified in this study will provide valuable information for future studies on CYP2E1.

Change in Community Composition and Soil Carbon Stock Along Transitional Boundary in a Sub-Tropical Forest of Garhwal Himalaya

  • Kumar, Munesh;Kumar, Manish;Saleem, Sajid;Prasad, Sunil;Rajwar, G.S.
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제29권3호
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    • pp.194-199
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    • 2013
  • The aim of the present study was to assess the effect of transitional boundary on community composition and soil carbon stock. Five vegetation types were recognized horizontally along the transitional strip based on the dominance of tree species i.e., Pure Anogeissus latifolia forest (P.AL), mixed Pinus roxburghii and Lannea coromandelica forest (M.PR&LC), pure Pinus roxburghii forest (P.PR), mixed Pinus roxburghii and Lannea coromandelica (M.PR&LC) and pure Anogeissus latifolia forest (P.AL). The results revealed that Anogeissus latifolia was reported dominant tree in the outer transitional boundaries of the forest, which reduced dominance of trees towards middle where Pinus roxburghii was found dominant. The soil carbon stock was reported higher in the Anogeissus latifolia dominant forest and reduced with the dominance of Pinus roxburghii in the middle site. Both the species are growing close to one another and competing for survival, but the aggressive nature of Anogeissus latifolia particular in this region may change new growth of Pinus roxburghii and will enhance soil carbon stock. But high anthropogenic pressure on Anogeissus latifolia tree species could be limited chance to further its flourish.

병원간호사의 셀프리더십, 의사소통 장애가 간호업무성과에 미치는 영향 (The Effect of Self-leadership and Communication Barriers on Nursing Performance in Hospital Nurses)

  • 조정림
    • 문화기술의 융합
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    • 제5권2호
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    • pp.239-246
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    • 2019
  • 본 연구는 병원간호사의 셀프리더십, 의사소통 장애, 간호업무성과의 정도 및 그 관계를 파악하고, 간호업무성과에 영향을 미치는 요인을 규명하기 위해 시도되었다. 연구대상자는 B시에 소재한 종합병원에서 근무하는 간호사 194명으로, 구조화된 설문지를 이용해 자료를 수집하였다. 자료 분석은 SPSS 18.0을 이용하여 빈도분석, t-test, ANOVA, Pearson's correlation coefficients, 단계적 다중회귀분석을 이용하였다. 연구결과, 대상자의 간호업무성과 정도는 셀프리더십(r=.59, p=<.001)과 의사소통 장애(r=.35, p=<.001)와는 정적 상관관계가 있는 것으로 나타났다. 연구대상자의 간호업무성과에 영향을 미치는 요인으로는 셀프리더십(${\beta}=.50$, p<.001), 직위(${\beta}=.15$, p=.011), 의사소통 장애(${\beta}=.16$, p=.014), 순으로 나타났다. 그리고 이들 변수의 간호업무성과에 대한 설명력은 37%이었다(F=37.95, p<.001).