The power function in sample size determination has to be characterized by an appropriate statistical test for the hypothesis of interest. Nonparametric tests are suitable in the analysis of ordinal data or frequency data with ordered categories which appear frequently in the biomedical research literature. In this paper, we study sample size calculation methods for the Wilcoxon-Mann-Whitney test for one- and two-dimensional ordinal outcomes. While the sample size formula for the univariate outcome which is based on the variances of the test statistic under both null and alternative hypothesis perform well, this formula requires additional information on probability estimates that appear in the variance of the test statistic under alternative hypothesis, and the values of these probabilities are generally unknown. We study the advantages and disadvantages of different sample size formulas with simulations. Sample sizes are calculated for the two-dimensional ordinal outcomes of efficacy and safety, for which bivariate Wilcoxon-Mann-Whitney test is appropriate than the multivariate parametric test.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
/
v.23
no.1
/
pp.209-218
/
2012
The method of generalized estimating equations (GEEs) provides consistent esti- mates of the regression parameters in a marginal regression model for longitudinal data, even when the working correlation model is misspecified (Liang and Zeger, 1986). In this paper we compare the estimators of parameters in GEE approach. We consider two aspects: coverage probabilites and efficiency. We adopted to ordinal responses th results derived from binary outcomes.
Purpose: This study was done to examine the incidence of oral mucositis in hematopoietic stem cell transplantation patients and to identify factors influencing oral mucositis and patient outcomes according to severity. Methods: In this retrospective study, data were collected from electronic medical records of 222 patients who had received hematopoietic stem cell transplantation. Oral mucositis was evaluated using WHO's assessment scale. Data were analyzed using Chi-square test, Fisher exact test, Spearman's correlation, Ordinal logistic regression, ANOVA and Kruskal-Wallis test. Results: A total of 69.8% of the patients evaluated developed oral mucositis (grade II and over). As a results of ordinal regression, factors influencing oral mucositis severity were found to be diagnosis, type of transplantation, oxygen inhalation and the number of antiemetics administration before transplantation. The severity of oral mucositis was found to increase the days of hospitalization, days of TPN administration, days of using antibiotics and the number and dosage of analgesics. Conclusion: The results would help predict severity of oral mucositis in hematopoietic stem cell transplantation patients and suggest that provision of appropriate nursing assessment and oral care would improve patient outcomes.
Communications for Statistical Applications and Methods
/
v.26
no.2
/
pp.205-216
/
2019
Diagnostic tests in medical fields detect or diagnose a disease with results measured by continuous or discrete ordinal data. The performance of a diagnostic test is summarized using the receiver operating characteristic (ROC) curve and the area under the curve (AUC). The diagnostic test is considered clinically useful if the outcomes in actually-positive cases are higher than actually-negative cases and the ROC curve is concave. In this study, we apply the stochastic ordering method in a Bayesian hierarchical model to estimate the proper ROC curve and AUC when the diagnostic test results are measured in discrete ordinal data. We compare the conventional binormal model and binormal model under stochastic ordering. The simulation results and real data analysis for breast cancer indicate that the binormal model under stochastic ordering can be used to estimate the proper ROC curve with a small bias even though the sample sizes were small or the sample size of actually-negative cases varied from actually-positive cases. Therefore, it is appropriate to consider the binormal model under stochastic ordering in the presence of large differences for a sample size between actually-negative and actually-positive groups.
This paper presents ordinal probit semiparametric regression models using Bayesian Spectral Analysis Regression (BSAR) method. Ordinal probit regression is a way of modeling ordinal responses - usually more than two categories - by connecting the probability of falling into each category explained by a combination of available covariates using a probit (an inverse function of normal cumulative distribution function) link. The Bayesian probit model facilitates posterior sampling by bringing a latent variable following normal distribution, therefore, the responses are categorized by the cut-off points according to values of latent variables. In this paper, we extend the latent variable approach to a semiparametric model for the Bayesian ordinal probit regression with nonparametric functions using a spectral representation of Gaussian processes based BSAR method. The latent variable is decomposed into a parametric component and a nonparametric component with or without a shape constraint for modeling ordinal responses and predicting outcomes more flexibly. We illustrate the proposed methods with simulation studies in comparison with existing methods and real data analysis applied to a Korean National Health and Nutrition Examination Survey (KNHANES) 2016 for investigating nonparametric relationship between smoking behavior and coffee intake.
Background: The purpose of this study was to examine the impact of the regional characteristics on the accessibility of emergency care and the impact of emergency medical accessibility on the patients' prognosis and the emergency medical expenditure. Methods: This study used the 13th beta version 1.6 annual data of Korea Health Panel and the statistics from the Korean Statistical Information Service. The sample included 8,119 patients who visited the emergency centers between year 2013 and 2017. The arrival time, which indicated medical access, was used as dependent variable for multi-level analysis. For ordinal logistic regression and multiple regression, the arrival time was used as independent variable while patients' prognosis and emergency medical expenditure were used as dependent variables. Results: The results for the multi-level analysis in both the individual and regional variables showed that as the number of emergency medical institutions per 100 km2 area increased, the time required to reach emergency centers significantly decreased. Ordinal logistic regression and multiple regression results showed that as the arrival time increased, the patients' prognosis significantly worsened and the emergency medical expenses significantly increased. Conclusion: In conclusion, the access to emergency care was affected by regional characteristics and affected patient outcomes and emergency medical expenditure.
Science and technology (S&T) is one of the most important elements in a nation's competitiveness. In an effort to strengthen their national competitiveness, all countries are focusing on upgrading the level of eir S&T. With these factors in mind, Korea has increased its support of national research and development (R&D). In recent years, this added support has resulted in an increased interest in the effectiveness of R&D. We have made continuous efforts to enhance the accountability and effectiveness of R&D by strengthening performance evaluation and considering R&D evaluation results during the budget review (appropriation) process. In order to change to a performance based system, we need to develop objective and scientific indicators to measure and evaluate the quality of the research performance of R&D programs. One of the primary research outcomes is publications. The impact factor of publications is widely used to evaluate overall journal quality and the quality of the papers published therein. However, the use of impact factors has been criticised because they can vary greatly when works from different subject areas are compared. In order to overcome this limitation, we have developed three kinds of qualitative indicators, which are functions of the impact factor. Two of these qualitative indicators, Modified Rank Normalized Impact Factor and Ordinal Rank Normalized Impact Factor, are based on order statistics (rank) for all journals from a specific specialty. The third qualitative indicator, Relative Field Impact Factor, uses the average impact factor of all journals within a subject category. We also suggest a quantitative indicator, Percentage of Contribution. In this study, we suggest 4 indicators and use them to evaluate the performance of outcomes from three R&D programs supported by the Ministry of Education, Science & Technology. We also perform a simulation study to verify the effectiveness of the proposed indicators. It can be shown that the proposed Ordinal Rank Normalized Impact Factor is the most reliable and effective indicator for comparing research performance across subject categories. However, we recommend using previous indicators in combination with the proposed indicators in this study for the research evaluation of R&D programs.
We consider sample-size determination problem motivated by comparative clinical trials where patient outcomes are characterized by a bivariate outcome of efficacy and safety. Thall and Cheng (1999) presented a sample size methodology for the case of bivariate binary outcomes. We propose a bivariate Wilcoxon-Mann-Whitney(WMW) statistics for sample-size determination for binary outcomes, and this nonparametric method can be equally used to determine sample sizes of ordinal outcomes. The two methods of sample size determination rely on the same testing strategy for the target parameters but differs in the test statistics, an asymptotic bivariate normal statistic of the transformed proportions in Thall and Cheng (1999) and nonparametric bivariate WMW statistic in the other method. Sample sizes are calculated for the two experimental oncology trials, described in Thall and Cheng (1999), and for the first trial example the sample sizes of a bivariate WMW statistic are smaller than those of Thall and Cheng (1999), while for the second trial example the reverse is true.
Communications for Statistical Applications and Methods
/
v.29
no.4
/
pp.421-439
/
2022
Phase I dose-finding trials are essential in drug development. By finding the maximum tolerated dose (MTD) of a new drug or treatment, a Phase I trial establishes the recommended doses for later-phase testing. The primary toxicity endpoint of interest is often a binary variable, which describes an event of a patient who experiences dose-limiting toxicity. However, there is a growing interest in dose-finding studies regarding non-binary outcomes, defined by either the weighted sum of rates of various toxicity grades or a continuous outcome. Although several novel methods have been proposed in the literature, accessible software is still lacking to implement these methods. This study introduces a newly developed R package, UnifiedDoseFinding, which implements three phase I dose-finding methods with non-binary outcomes (Quasi- and Robust Quasi-CRM designs by Yuan et al. (2007) and Pan et al. (2014), gBOIN design by Mu et al. (2019), and by a method by Ivanova and Kim (2009)). For each of the methods, UnifiedDoseFinding provides corresponding functions that begin with next that determines the dose for the next cohort of patients, select, which selects the MTD defined by the non-binary toxicity endpoint when the trial is completed, and get oc, which obtains the operating characteristics. Three real examples are provided to help practitioners use these methods. The R package UnifiedDoseFinding, which is accessible in R CRAN, provides a user-friendly tool to facilitate the implementation of innovative dose-finding studies with nonbinary outcomes.
Background: Elements of informed consent including capacity, disclosure, understanding, voluntariness, and permission of the participant, are all crucial for clinical trials to be legally and ethically valid. During the informed consent process, the patient information leaflet is an important information source which prospective research subjects can utilize in their decision-making. In the adequate provision of information, KGCP guideline necessitate 20 specific items, as well as the use language that individuals can understand. This study measures the vocabulary level of patient information leaflets in an effort to provide an objective evaluation on the readability of such material. Methods: The word difficulty of 13 leaflets was quantitatively evaluated using Kim kwang Hae's vocabulary grading framework, which was compared to the difficulty level of words found in the $6^{th}$ grade Korean textbook. The quantitative outcomes were statistically analyzed using chi-squared tests and linear by linear association for ordinal data. Results: There was a statistically significant difference between the vocabulary level and frequency of words in leaflets and the 6th Korean textbook. The leaflets were on average 260 sentences and about roughly 15 pages long, including lay language (easier or equal to language used in primary school) of around 12% less; technical language of around 4.5% more. As the vocabulary grades increase, there was a distinct difference in vocabulary level between Korean textbook and each information leaflet (p < 0.001). Conclusion: Patient information leaflets may fail to provide appropriate information for self-determination by clinical trial subject through the difficulty level of its wording. Improvements in the degree of patients' understanding and appropriate use of information leaflets are collaboratively equipped to strengthen patient's autonomy and therefore guaranteeing participant's rights.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.