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Structural Basis for the Antibiotic Resistance of Eukaryotic Isoleucyl-tRNA Synthetase

  • Chung, Scisung;Kim, Sulhee;Ryu, Sung Ho;Hwang, Kwang Yeon;Cho, Yunje
    • Molecules and Cells
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    • 제43권4호
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    • pp.350-359
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    • 2020
  • Pathogenic aminoacyl-tRNA synthetases (ARSs) are attractive targets for anti-infective agents because their catalytic active sites are different from those of human ARSs. Mupirocin is a topical antibiotic that specifically inhibits bacterial isoleucyl-tRNA synthetase (IleRS), resulting in a block to protein synthesis. Previous studies on Thermus thermophilus IleRS indicated that mupirocin-resistance of eukaryotic IleRS is primarily due to differences in two amino acids, His581 and Leu583, in the active site. However, without a eukaryotic IleRS structure, the structural basis for mupirocin-resistance of eukaryotic IleRS remains elusive. Herein, we determined the crystal structure of Candida albicans IleRS complexed with Ile-AMP at 2.9 A resolution. The largest difference between eukaryotic and prokaryotic IleRS enzymes is closure of the active site pocket by Phe55 in the HIGH loop; Arg410 in the CP core loop; and the second Lys in the KMSKR loop. The Ile-AMP product is lodged in a closed active site, which may restrict its release and thereby enhance catalytic efficiency. The compact active site also prevents the optimal positioning of the 9-hydroxynonanoic acid of mupirocin and plays a critical role in resistance of eukaryotic IleRS to anti-infective agents.

2차원 상의 음원위치 추정을 위한 효율적인 영역분할방법 (An efficient space dividing method for the two-dimensional sound source localization)

  • 김환용;최홍섭
    • 한국음향학회지
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    • 제35권5호
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    • pp.358-367
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    • 2016
  • 음원의 위치를 찾는 SSL(Sound Source Localization)은 로봇과의 인터페이스, 화상회의, 스마트 자동차 등 여러 분야에서 꼭 필요한 기술이다. 일반적으로 음원의 위치 정보를 활용하는 기술들은 주로 측정 장치에 대한 음원의 각도 정보를 찾아서 이용하고 있다. 그러나 음원의 위치에 대한 각도를 추정할 때 이용하는 사인 역함수의 비선형적인 특성으로 추정된 각도에 오차가 발생하며, 이에 대한 방안으로 마이크가 담당하는 영역을 분할하는 방법이 제안되었다. 본 논문에서는 마이크 어레이 패턴에 따른 영역분할 방법을 제안하고 음원의 위치를 2차원상의 평면 좌표로 특정하는 방법으로 위치 추정 성능을 평가하였다. 실험에서 잡음에 강인한 GCC-PHAT(Generalized Cross Correlation Phase Transform) 방법을 사용했으며, 마이크 어레이의 패턴은 마이크 3개와 4개로 삼각형과 사각형 두 종류로 구성하였으며, 100개의 음성 데이터로 실험한 결과 실제 환경에서는 3개의 마이크 어레이를 사용해서는 영역 분할 해상도가 낮아서 음원의 위치를 정해진 특정 범위내로 추정하는데 실패했으나, 4개 마이크를 이용하여 해상도를 높였더니 위치추정 성공률이 67 %로 크게 향상됨을 확인할 수 있었다.

INTERFEROMETRIC MONITORING OF GAMMA–RAY BRIGHT ACTIVE GALACTIC NUCLEI II: FREQUENCY PHASE TRANSFER

  • ALGABA, JUAN-CARLOS;ZHAO, GUANG-YAO;LEE, SANG-SUNG;BYUN, DO-YOUNG;KANG, SIN-CHEOL;KIM, DAE-WON;KIM, JAE-YOUNG;KIM, JEONG-SOOK;KIM, SOON-WOOK;KINO, MOTOKI;MIYAZAKI, ATSUSHI;PARK, JONG-HO;TRIPPE, SASCHA;WAJIMA, KIYOAKI
    • 천문학회지
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    • 제48권5호
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    • pp.237-255
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    • 2015
  • The Interferometric Monitoring of Gamma–ray Bright Active galactic nuclei (iMOGABA) program provides not only simultaneous multifrequency observations of bright gamma–ray detected active galactic nuclei (AGN), but also covers the highest Very Large Baseline Interferometry (VLBI) frequencies ever being systematically monitored, up to 129 GHz. However, observation and imaging of weak sources at the highest observed frequencies is very challenging. In the second paper in this series, we evaluate the viability of the frequency phase transfer technique to iMOGABA in order to obtain larger coherence time at the higher frequencies of this program (86 and 129 GHz) and image additional sources that were not detected using standard techniques. We find that this method is applicable to the iMOGABA program even under non–optimal weather conditions.

u-city를 위한 3차원 공간 영상 도시 모델 생성 및 적용 방안 (3D Spatial Image City Models Generation and Applications for Ubiquitous-City)

  • 연상호;이영대
    • 한국인터넷방송통신학회논문지
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    • 제8권1호
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    • pp.47-52
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    • 2008
  • 3차원 도시환경의 디지털기반의 가시화는 도시계획 및 통신계획, 건설, 건축, 입체적인 도시공간정보시스템 구현, 안전 및 방재 등에서 많은 필요와 그 중요성이 크게 부각되고 있다. 현재 2차원적인 지도정보와 등고선을 이용한 DEM 방식은 3차원 공간을 표현하기에는 많은 한계를 가지고 있다. 최근 레이저와 GPS 측량기술을 이용한 높은 정확도와 보정이 용이한 LiDAR Data로 표고값을 측정하는 연구가 선진국에서 시도되고 있다. 본 연구에서는 해외 선진기술을 도입하여 우리 실정에 적합한 유비쿼터스 입체 도시 건설을 위해 3차원 공간영상 도시모델 생성 기법 및 알고리즘을 개발하여 u-City의 최적 관리를 위한 방안을 제시하고자 한다. 이를 위하여 원격탐사 영상 Data를 중심으로 하는 정사보정하고 이에 매칭할 수 있는 벡터와의 실시간 통합 및 전환으로 U-city에서의 3차원 영상 도시 모델의 생성과 다양한 활용을 제시하였다.

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양자 교환된 리튬나오베이트를 이용한 광 픽업용 λ/2 파장판 제작 (Fabrication of λ/2 Phase Plates for Optical Pickup Using a Proton Exchanged LiNbO$_{3}$)

  • 손경락;김광택;김영조;송재원;박경찬;김진용
    • 대한전자공학회논문지SD
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    • 제37권4호
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    • pp.38-44
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    • 2000
  • 본 논문에서는 리튬나오베이트 기판 상에 벤젠산으로 양자 교환 후 습식 식각하는 방법을 이용하여 청색레이저 다이오드를 광원으로 사용하고자 하는 광 픽업을 위한 λ/2 파장판을 제작하였으며 소자의 기능과 제작과정에 대해서 상세히 서술하였다. 그리고, 소자제작을 위한 최적의 조건을 실험을 통하여 확립하였다. 제작된 소자의 위상 특성은 광학계로 마하젠더 간섭계를 구성하여 파장이 632.8nm인 헬륨-네온 레이저로 측정하였다. 측정 결과 위상오차는 +5°∼6°(3% 이내)로 측정되었다. 본 연구에서 제작한 파장판은 청색 레이저 다이오드를 광원으로 사용하는 광 픽업 시스템의 해상도와 안정도를 향상시키는 유용한 소자로 응용될수 있다.

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펨토초 레이저 미세가공을 위한 3차원 형상 복원 시스템의 최적설계 및 구현 (Optimal Design and Implementation of 3D Shape Restoration System for Femto-second Laser Micromachining)

  • 박정홍;이지홍;고윤호;박영우
    • 전자공학회논문지SC
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    • 제43권6호
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    • pp.16-26
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    • 2006
  • 본 논문에서는 평판형 디스플레이 장치의 필수 구성품인 투명한 ITO(Indium-Tin-Oxide) 유리를 가공하기 위한 펨토초(Femto-second) 레이저 미세 가공의 효율을 극대화하기 위해 가공 대상체의 정보를 추출하는 시스템을 제안한다. 제안한 시스템은 레이저 스캐닝 시스템을 활용하여 펨토초 레이저빔의 초점 거리 오차와 각도 오차를 사전에 계측하고 3차원으로 형상을 복원한다. 본 시스템은 라인 스캔 레이저, 고해상도 카메라, 리니어 모션 가이드(Linear Motion Guide), 시스템 제어부로 구성되어있다. 또한 본 시스템의 모델링을 통한 카메라와 레이저의 위치와 측정 결과와의 관계를 나타낼 수 있는 민감도 지수를 정의하고, 이를 활용하여 더욱더 정확한 측정이 가능한 시스템을 설계할 수 있었다. 가공 대상체인 ITO 유리의 높이와 표면 형상을 측정하고 3차원으로 형상을 복원하여 주사 탐침 현미경(SPM)으로 얻은 결과와 비교하여 본 시스템의 성능을 검증하였다.

적응 템플릿 필터링에서 복셀의 부분 볼륨 효과로 인한 헤지 아티팩트의 제거 (Removal of Edge Artifact due to Pertial Volume Effect in the Adaptive Template Filtering)

  • 안창범;송영철
    • Investigative Magnetic Resonance Imaging
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    • 제4권2호
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    • pp.120-127
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    • 2000
  • 최근에 해상도의 손실없이 신호대잡음비를 개선시킬 수 있는 적응 템플릿 필터링이 제안되었다. 적응 템플릿 필터링은 다중 템플릿들 중에서 현재 복셀의 주변 구조와 가장 잘 매칭이 되는 템플릿을 선택하여 적응필터 링을 적용하는 방법이다. 적응 템플릿 필터링을 자기공명영상에 적용할때 기존의 필터링 방법들에 비하여 향상된 결과를 얻을 수 있으나, $T_1$ 영상과 같이 비교적 작은 동적 범위를 가진 영상에서는 에지에서 계단모양의 artifact가 발견되곤 한다. 이것은 자기 공명영상에서 복셀의 부분적인 볼륨 효과에 기인하는 것으로 여러 조직의 성분을 포함하고 있는 경계면의 복셀들에 적응 템플릿 필터링이 적용될 경우 다중성분을 가진 복셀들의 그레이레벨이 인접한 단일성분의 그레이레벨 값에 가까워져 에지가 강조되기 때문이다 본 논문에서는 다중 성분을 갖는 복셀들을 선별하여 이들에 대해서는 가장 큰 크기의 템플릿을 할당함으로써 artifact를 제거하는 방법을 제안하였다. 제안한 방법을 $T_1$ 자기공명영상과 팬텀 영상에 적용한 결과 에지 artifact가 사라지는 것을 확인할 수 있었으며, 최대 신호대잡음비 면에서도 향상된 결과를 얻을 수 있었다.

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CDMA슬롯ALOHA시스템에서 확산 이득 제어의 영향 (The Effect of Spreading Gain Control on a CDMA Slotted ALOHA System)

  • 도미선;박중신;강지은;이재용
    • 한국통신학회논문지
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    • 제26권12B호
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    • pp.1665-1676
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    • 2001
  • 본 논문에서는 획득 확률과 확산 이득 제어가 CDMA 슬롯 ALOHA 시스템의 처리율에 미치는 영향을 연구한다. 이동 단말들은 공유 채널을 통해 패킷을 전송하고, 동일한 시간 슬롯에서 전송되는 패킷들은 동시 접속 간섭으로 작용한다. 대역확산 신호를 사용함으로써, CDMA 슬롯 ALOHA 채널은 높은 시간 해상도 특성에 의해 높은 획득 확률을 얻고, 확산 이득의 크기에 따라 사용자의 비트율이 결정된다. 동시 접속 간섭의 크기가 증가할 때, 확산 이득의 증가는 패킷 전송 성공 확률을 증가시켜 패킷 처리율을 향상시키나 패킷이 전송하는 사용자 정보 비트수가 감소되어 유효 처리율을 저하시킨다. 이러한 문제점을 해결하기 위하여, 덜 논문에서는 획득 확률과 동시 접속 간섭 크기가 시스템 처리율에 미치는 영향을 연구하고, 확산 이득 제어 방법에 따른 시스템 처리율 성능을 평가하였다. 시스템 상태에 따라 최적 확산 이득을 구함으로써 동시 접속 간섭 크기의 변화에 대해 통일된 방법으로 최대 유효 처리율을 얻을 수 있었다.

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영상유통포맷 표준 개발 필요성과 방향에 대한 연구 (A Study on The Need and Direction for Development of Imagery Transmission Format Standard)

  • 임성호;박완용;조재희
    • 대한공간정보학회지
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    • 제18권1호
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    • pp.55-61
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    • 2010
  • 디지털 영상이 여러 종류의 다양한 정보와 결합되어 사용되면서 효율적인 영상정보 활용을 위한 영상유통포맷 표준 개발에 대한 필요성이 요구된다. 영상유통포맷 표준의 목적은 영상과 관련 자료의 교환을 용이하게 하는 일반적인 포맷을 제공하는 것이다. 본 논문에서는 현재까지 영상정보를 위해 요구되는 모든 종류의 영상을 포괄적으로 다룰 수 있으며, 군의 정보 분야에 필수적인 영상주기 및 메타정보를 체계적으로 관리할 수 있는 기반을 마련하고 있는 영상유통포맷 표준의 대표적인 사례인 미국의 NITF(National Imagery Transmission Format)을 중심으로 현재까지 개발된 대표적인 군과 민(民)의 영상유통포맷 표준들의 현황을 조사하여 각각의 표준들이 갖고 있는 규격과 기능을 분석함으로써 최적의 영상유통포맷이 가져야 할 조건을 정리하였다. 또한 영상 자료의 고해상도, 대용량화에 따라 필연적인 영상압축 기술과 관련한 현대의 영상포맷 발전 추세에 부응하여 영상유통포맷의 발전방향을 제시하였다.

완전삽입형 인공망막 구현을 위한 인공망막모듈 개발 (Development of Retinal Prosthesis Module for Fully Implantable Retinal Prosthesis)

  • 이강욱;카이호 요시유키;후쿠시마 타카후미;타나까 테츠;고야나기 미쯔마사
    • 대한의용생체공학회:의공학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.292-301
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    • 2010
  • To restore visual sensation of blind patients, we have proposed a fully implantable retinal prosthesis comprising an three dimensionally (3D) stacked retinal chip for transforming optical signal to electrical signal, a flexible cable with stimulus electrode array for stimulating retina cells, and coupling coils for power transmission. The 3D stacked retinal chip is consisted of several LSI chips such as photodetector, signal processing circuit, and stimulus current generator. They are vertically stacked and electrically connected using 3D integration technology. Our retinal prosthesis has a small size and lightweight with high resolution, therefore it could increase the patients` quality of life (QOL). For realizing the fully implantable retinal prosthesis, we developed a retinal prosthesis module comprising a retinal prosthesis chip and a flexible cable with stimulus electrode array for generating optimal stimulus current. In this study, we used a 2D retinal chip as a prototype retinal prosthesis chip. We fabricated the polymide-based flexible cable of $20{\mu}m$ thickness where 16 channels Pt stimulus electrode array was formed in the cable. Pt electrode has an impedance of $9.9k{\Omega}$ at 400Hz frequency. The retinal prosthesis chip was mounted on the flexible cable by an epoxy and electrically connected by Au wire. The retinal prosthesis chip was cappted by a silicone to pretect from corrosive environments in an eyeball. Then, the fabricated retinal prosthesis module was implanted into an eyeball of a rabbit. We successfully recorded electrically evoked potential (EEP) elicited from the rabbit brain by the current stimulation supplied from the implanted retinal prosthesis module. EEP amplitude was increased linearly with illumination intensity and irradiation time of incident light. The retinal prosthesis chip was well functioned after implanting into the eyeball of the rabbit.