• Genomics & Informatics
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• 제21권1호
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• pp.13.1-13.8
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• 2023

Importance of accurate molecular diagnosis and quantification of particular disease-related pathogenic microorganisms is highlighted as an introductory step to prevent and care for diseases. In this study, we designed a primer/probe set for quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) targeting rgpA gene, known as the specific virulence factor of periodontitis-related pathogenic bacteria 'Porphyromonas gingivalis', and evaluated its diagnostic efficiency by detecting and quantifying relative bacterial load of P. gingivalis within saliva samples collected from clinical subjects. As a result of qRT-PCR, we confirmed that relative bacterial load of P. gingivalis was detected and quantified within all samples of positive control and periodontitis groups. On the contrary, negative results were confirmed in both negative control and healthy groups. Additionally, as a result of comparison with next-generation sequencing (NGS)-based 16S metagenome profiling data, we confirmed relative bacterial load of P. gingivalis, which was not identified on bacterial classification table created through 16S microbiome analysis, in qRT-PCR results. It showed that an approach to quantifying specific microorganisms by applying qRT-PCR method could solve microbial misclassification issues at species level of an NGS-based 16S microbiome study. In this respect, we suggest that P. gingivalis-specific primer/probe set introduced in present study has efficient applicability in various oral healthcare industries, including periodontitis-related microbial molecular diagnosis field.

• 한국축산식품학회지
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• 제44권2호
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• pp.372-389
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• 2024

This study investigated the efficacy of ultraviolet-C (UV-C) irradiation in enhancing the quality of raw bovine milk by targeting microbial populations and lipid peroxidation, both of which are key factors in milk spoilage. We categorized the raw milk samples into three groups based on initial bacterial load: low (<3 Log 10 CFU/mL), medium (3-4 Log 10 CFU/mL), and high (>4 Log 10 CFU/mL). Using a 144 W thin-film UV-C reactor, we treated the milk with a flow rate of 3 L/min. We measured the bacterial count including standard plate count, coliform count, coagulase-negative staphylococci count, and lactic acid bacteria count and lipid peroxidation (via thiobarbituric acid reactive substances assay) pre- and post-treatment. Our results show that UV-C treatment significantly reduced bacterial counts, with the most notable reductions observed in high and medium initial load samples (>4 and 3-4 Log 10 CFU/mL, respectively). The treatment was particularly effective against coliforms, showing higher reduction efficiency compared to coagulase-negative staphylococci and lactic acid bacteria. Notably, lipid peroxidation in UV-C treated milk was significantly lower than in pasteurized or untreated milk, even after 72 hours. These findings demonstrate the potential of UV-C irradiation as a pre-treatment method for raw milk, offering substantial reduction in microbial content and prevention of lipid peroxidation, thereby enhancing milk quality.

• 한국식품조리과학회지
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• 제21권5호
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• pp.703-708
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• 2005

The purposes of this study were to establish washing conditions for vegetable salad to reduce the microbial hazard by using sodium hypochlorite solution and eventually to implement HACCP for salad processing. By using the salad production line of Shinkeum Co. located in Gwacheon, Gyunggi-do, salad samples were washed under several washing conditions (chlorine dip period, chlorine concentration, rinse time, etc.) to determine the most effective conditions. The original washing line consisted of 3 baths (100 ppm chlorine water dip, water rinse, and water rinse), each with a capacity of 100 L of tap water and 5 kg of salad. First, the salad samples were washed with 100 ppm of sodium hypochlorite solution for various dip times (3, 6, 9, 12 min); however, only a 1 log- or less-reduction in total microbial counts was achieved in all groups and the time of chlorine water dip was not a significant factor in reducing the microbial hazard. When another water bath was added before the chlorine water dip (4-bath washing), a 2 log-reduction in total microbial counts was achieved. This result suggested the importance of pre-dipping salad materials in water before chlorine treatment to reduce the organic load on the surface of the vegetables. Coliforms were not detected at all after washing. As the concentration of chlorine $(50{\sim}150\;ppm)$ and rinse time $(0.5{\sim}2\;min)$ increased, greater microbial reduction was achieved; however, physical damage of the salad was observed. Finally, the optimum washing conditions for salad were determined as 3 min-water dip, 3 min-chlorine (100 ppm) dip, 2 min-rinse, and 2 min-rinse.

• Restorative Dentistry and Endodontics
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• 제46권2호
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• pp.19.1-19.12
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• 2021

Objectives: The purpose of this study was to conduct a systematic review and meta-analysis of in vitro studies regarding the effectiveness of reciprocating and rotary instrumentation on microbial reduction in root canals. Materials and Methods: PubMed, Scopus, Web of Science, the Cochrane Library, and the gray literature were searched through December 2019. Studies comparing the influence of reciprocating and rotary instrumentation on the removal of microorganisms from root canals that quantified the antimicrobial effect were included. Data extraction was completed using a systematic form for data collection. The risk of bias of the studies was evaluated. Standardized mean differences (SMDs) and confidence intervals (CIs) were calculated using a random effects meta-analysis. Results: Seventeen in vitro studies were included in this systematic review, of which 7 provided adequate data for inclusion in the meta-analysis. Both reciprocating and rotary systems were similarly effective in reducing the microbial load in infected root canals (SMD [95% CI], 0.0481 [-0.271, 0.367]). Three studies showed a low risk of bias, whereas most of the studies (82%) presented a medium risk. Conclusions: Although both techniques decrease the microbial content (with reductions of 23.32%-88.47% and 23.33%-89.86% for reciprocating and rotary instrumentation, respectively), they are not able to provide complete disinfection of root canals.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제6권3호
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• pp.276-280
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• 1999

항균력이 있는 것으로 확인된 대황 및 황련추출물을 오이, 호박, 상치 및 고추에 처리하였을 때 총균수가 감소하였다. 채소의 종류에 따라서 적절한 처리농도는 달랐는 데, 호박, 상치 및 고추는 100 ppm, 오이는 500 ppm 처리가 적절한 것으로 나타났다. 채소를 침지할 때의 시간은 10분 정도가 적절한 것으로 나타났으며, 세척수의 온도를 4$0^{\circ}C$로 높일 경우에도 채소류 표면의 총균수 감소 효과는 실온의 세척수와 비슷하였다. 또한 오이와 호박을 대황 및 황련 추출물로 처리한 다음 1$0^{\circ}C$에서 건조하고 PVC랩으로 포장하여 저장한 결과 대조구에 비하여 총균수가 낮은 것으로 나타났다. 저장 기간 중 무게는 지속적으로 감소하였으며, 처리구와 대조구간에 큰 차이를 나타내지는 않았다. Ascorbic acid의 함량은 저장 기간 중 지속적으로 감소하는 것으로 나타났는데, 대황 및 황련추출물을 처리한 시험구가 대조구에 비하여 ascorbic acid의 함량이 높은 것으로 나타났다

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제31권4호
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• pp.264-271
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• 2016

본 연구는 어린잎 채소와 생산환경에서 미생물학적 오염도를 조사하고자 수행하였다. 이를 위하여 11종의 어린잎채소와 종자, 관개용수, 상토, 작업도구 및 작업자 장갑 등 총 126개의 시료를 채취하여 위생지표세균(대장균군, E. coli)과 병원성미생물(Escherichia coli O157:H7, Salmonella spp., Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes, Bacillus cereus)을 조사하였다. 그 결과, 종자와 관개용수를 제외한 대부분의 시료에서 대장균군이 검출되었다. E. coli는 분석시료 중 10.3% (13/126)에서 검출되었으며 검출된 시료로는 관개용수, 칼, 작업자 장갑, 및 다채, 적무, 청경채였다. 또한 B. cereus는 상토, 작업도구 및 청경채, 비트, 적근대 등 총 38% (48/126)의 시료에서 검출되었다. 한편 E. coli O157:H7, Salmonella spp., L. monocytogenes는 검출되지 않았다. 본연구의 결과로 미루어 볼 때 어린잎채소는 미생물 안전성면에서는 크게 우려할 수준은 아니지만 어린잎채소의 미생물오염을 사전 예방하는 차원에서 농업현장에서 쉽게 실천할 수 있는 위생관리 기술 개발과 보급이 필요하다고 판단된다.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제9권2호
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• pp.121-125
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• 2002

방울토마토의 포장에 적합한 필름을 선택하기 위하여 기체 투과도가 다른 여러 가지 필름으로 방울토마토를 포장하고 저장하면서 포장내 기체 농도, 총균수, 효모 및 곰팡이 수, 중량 감소율, 부패율 등을 조사한 결과는 다음과 같았다. CPP와 PD961로 포장한 시험 구는 저장 기간 동안 계속 적으로 산소와 이산화탄소 농도가 계속적으로 변화하였으나 다른 포장재로 포장한 시험구는 저장 10일 경에 대체적으로 평형에 도달하였다. 저장 기간 중 중량 감소율은 PY85로 포장한 시험구가 가장 현저하였으며 다른 포장재로 포장한 시험구는 저장 20일까지도 1% 부근이었다. 포장 직후의 총 균 수는 $10^4$ CFU/g 부근이었으며, 이들은 대부분 곰팡이나 효모인 것으로 나타났다. 또한 저장 기간이 경과함에 따라서 대체적으로 미생물의 수는 증가하였다. CPP로 포장한 시험구는 저장 5일에는 총균수, 효모 및 곰팡이 수가 가장 적었으나 10일 이후에는 가장 많았으며, 저장 20일에는 총균수가 $10^{8}$ CFU/g이었으며, 효모 및 곰팡이 수는 $10^{7.97}$ CFU/g 이었다. 저장 기간 중 pH는 대체적으로 증가하였으며, 총산 및 가용성 고형물은 큰 변화가 없으나 대체적으로 감소하였다. 단지 PY85로 포장한 시험구는 저장 기간동안 지속적으로 총산과 가용성 고형물이 증가하였다. 저장 5일 이후에는MPD와 PY85를 제외한 시험구에서 부패가 발생하기 시작하였으며, CPP와 PD961로 포장한 시험구의 부패율이 대체적으로 높았다. MPD는 저장 20일에도 5.3%의 가장 낮은 부패율을 보였다.다.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제10권2호
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• pp.131-135
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• 2003

피망에 대한 MA 저장에 적합한 포장재를 선발하기 위하여 기체에 대한 투과도가 다른 cast polypropylene (CPP), low density polyethylene (LDPE), polyolefin (MPD), polyolefin(PD961) 및 Linear low density polyethylene (LLDPE) 포장재로 피망을 포장하고 1$0^{\circ}C$에서 저장하면서 품질 변화를 고찰하였다. 저장 기간 중 포장 내부의 산소 농도는 4주까지 대체적으로 감소하였으나 그 이후에는 급격하게 증가하였다. 기체에 대한 투과성이 낮은 CPP로 포장한 시험구는 저장 4주에 산소의 농도가 10.4%, 이산화탄소의 농도가 4.5%로 다른 시험구에 비하여 산소의 농도는 낮고, 이산화탄소의 농도는 높았다. 저장 기간 중 피망의 중량 감소율은 LLDPE로 포장한 시험구가 가장 현저하였으며 다른 포장재로 포장한 시험구는 저장 5주까지도 1.5% 미만이었다. 다른 시험구에 비하여 CPP로 포장한 시험구의 총균수, 효모 및 곰팡이수가 많았는데, 저장 3주 이후에 그 차이가 현저하였다. 피망의저장 중 황색도를 나타내는 b값은 대체적으로 증가하였으며, 저장 4주가지 PD961과 MPD로 포장한 시험구가 다른 시험구에 비하여 높은 값을 나타내었다.

• 한국포장학회지
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• 제19권1호
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• pp.11-15
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• 2013

도서관 등에서의 책의 위생적 유통과 관리를 위한 방안을 찾기 위하여 보관되는 책 및 관련된 환경 오염원에서의 미생물 오염도를 측정하였고, 미생물 부하를 저감시키는 방안에 대하여 연구하였다. 일반적으로 책 내부 표면의 오염도는 매우 낮으며 부주의한 취급으로 침 등과 같은 액체에 의해서 오염되는 경우에 미생물 부하가 증가될 수 있었다. 그리고 책 내부 표면에 비해서 먼지가 축적되기 쉬운 옆끝면에서 미생물 오염부하가 높았다. 책에서의 미생물적 오염의 다양성을 고려할 때, 책의 청결도 유지를 위한 조작으로서는, 미생물 부하가 많은 먼지 등의 건조 분체 오염은 공기와류 장치를 사용하고, 습윤상태의 오염은 280 nm UV LED를 사용하는 것이 적절한 것으로 나타났다. UV LED에 의한 미생물 사멸에서는 2 cm 정도의 가까운 거리에서 약 5분 정도 이상의 조사가 효과적이었고, 공기 와류에 의한 건조 분체 오염부하을 저감시키는 조건으로는 풍속 5.5 m/s에서 30초~1분의 처리가 적절하였다.

• Animal Bioscience
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• 제37권1호
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• pp.151-160
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• 2024

Objective: The growing consumers' interest on animal welfare has raised the request of products obtained by alternative rearing systems. The present study was conducted to assess the influence of housing system on gut and muscle morphology and on microbial load in rabbits reared under free-range (FR) and cage system (CS). Methods: A total of forty weaned (35 days of age) male Italian White breed rabbits were allotted according to the rearing system, and at 91 days of age were randomly selected and slaughtered for the morphological evaluation of tissue from duodenum and longissimus lumborum. Morphometric analysis of the villus height, villus width, crypt depth, villus height/crypt depth ratio, and villus surface was performed. The microbial loads on hind muscle was determined by total mesophilic aerobic count (TMAC), Escherichia coli and Enterobacteriaceae; whereas, total anaerobic bacteria count (TABC) and TMAC, E. coli and Enterobacteriaceae was determined on caecal content. Results: Rearing system did not interfere with the duodenum and muscle histomorphology in both rabbit groups. Similarly, microbial load of caecal content showed no significant differences on the TABC and TMAC. Conversely, significant difference was found for E. coli strains in caecal content, with the lower counts in FR compared to CS rabbits (p<0.01). Microbiological assay of muscle revealed significant lower TMAC in FR vs CS rabbits (p< 0.05). All rabbit meat samples were negative for E. Coli and Enterobacteriaceae. Conclusion: Free-range could be considered a possible alternative and sustainable rearing system in rabbits to preserve gut environment and muscle quality.