Microarray gene expression technology has applications that could refine diagnosis and therapeutic monitoring as well as improve disease prevention through risk assessment and early detection. Especially, microarray expression data can provide important information regarding specific genes related with metastasis through an appropriate analysis. Various methods for clustering analysis microarray data have been introduced so far. We used twostep clustering fot ascertain metastasis related gene through t-test. Through t-test between two groups for two publicly available medulloblastoma microarray data sets, we intended to find significant gene for metastasis. The paper describes the process in detail showing how the process is applied to clustering analysis and t-test for microarray datasets and how the metastasis-associated genes are explorated.
Rosales, Azucena Moreno;Molina, Miguel Corres;Moo, Jacqueline Gongora;Morelos, Pablo Romero;Bandala, Cindy
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제17권11호
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pp.5019-5023
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2016
Background: In Mexico, breast cancer (BCa) is in first place regarding cancer mortality and has been established as a priority health issue. The incidence of metastasis from BCa is very high and presents as the principal mortality factor among women younger than 40 years of age. OBJECTIVE. To determine any associations between clinicopathological characteristics and metastasis in Mexican women under 40 years of age. Methods: During the 2010-2015 period, a total of 180 female BCa cases seen at the Navy General High Specialty Hospital, SEMAR, in Mexico City; we collected information on 20 patients with BCa younger than 40 years of age. Statistical analyses were conducted using the Kolmogorov-Smirnov, Students t, Fisher, Chi square, and Mantel-Haenszel tests. Results: The prevalence of women with BCa younger than the age of 40 years during the 2010-2015 period was 13.3%. We found a high frequency of obesity in of these cases (>75%); 100% of obese patients with a history of smoking presented with metastasis (p <0.05). In addition, the hormone phenotype was important; HER2-positive cases were 12 times more likely tto exhibit metastasis (p <0.05), while expression of estrogen and progesterone receptors appeared to be protective. Diabetes mellitus in combination with smoking was also a risk factor for development of metastasis (p <0.05). Conclusion: In this study, we obtained essential data regarding risk of metastasis in young breast cancer cases which could be useful for predicting disease evolution and treatment response.
Background: Adjuvant androgen deprivation therapy (ADT) is a treatment option for prostate cancer (PC) patients after radical prostatectomy (RP). Although it can achieve a good progression-free survival rate, some patients still develop clinical metastasis. We here investigated risk factors of clinical metastasis in post-prostatectomy patients who received immediate adjuvant ADT. Materials and Methods: We identified 197 patients with non-metastatic PC who underwent RP at our institution between 2000 and 2012, followed by adjuvant ADT. The associations of various clinicopathologic factors with clinical metastasis (primary endpoint) and cancer-specific survival (secondary endpoint) were assessed. Multivariate analysis was conducted using a Cox proportional hazards model. Median follow-up was 87 months after RP. Results: Nine (4.6%) patients developed clinical metastasis and six (3.0%) died from PC. Eight of nine metastatic patients had a pathologic Gleason score (GS) 9 and developed bone metastasis, while the remaining one had pathologic GS 7 and developed metastasis only to para-aortic lymph nodes. On multivariate analyses, pathologic GS ${\geq}9$ and regional lymph node metastasis (pN1) were independent predictors of clinical metastasis and pathologic GS ${\geq}9$ was an independent predictor of cancer-specific death. Conclusions: Pathologic GS ${\geq}9$ and pN1 were independent predictors of clinical metastasis in post-prostatectomy patients who received immediate adjuvant ADT. Furthermore, pathologic GS ${\geq}9$ was an indispensable condition for bone metastasis, which may imply that patients with GS ${\leq}8$ on adjuvant ADT are unlikely to develop bone metastasis.
Objective: Although thermal ablation is effective in treating low-risk papillary thyroid microcarcinomas (PTMCs), comparison of treatment outcomes between thermal ablation and surgery has not yet been systematically evaluated. This study aimed to compare the efficacy and safety of thermal ablation and surgery for the treatment of low-risk PTMCs. Materials and Methods: Ovid-MEDLINE and EMBASE databases were searched for studies reporting comparisons of treatment results between thermal ablation and surgery for patients with low-risk PTMC published up to April 6, 2020. The analysis evaluated the efficacy (local tumor recurrence, occurrence of new tumor, metastasis, and rescue surgery) and safety (complication rate) of thermal ablation and surgery. Results: This systematic review included four studies with a total of 339 PTMCs in 339 patients who underwent thermal ablation and 320 PTMCs in 314 patients who underwent surgery. There was no local tumor recurrence or distant metastasis in either group. There was no significant difference in the pooled proportion of lymph node metastasis (2.6% with thermal ablation vs. 3.3% with surgery, p = 0.65), occurrence of new tumors (1.4% with thermal ablation vs. 1.3% with surgery, p = 0.85), or rescue surgery (2.6% with thermal ablation vs. 1.6% with surgery, p = 0.62). However, the pooled complication rate was significantly higher in the surgery group than in the ablation group (3.3% with thermal ablation vs. 7.8% with surgery, p = 0.03). Conclusion: Both thermal ablation and surgery are effective and safe options for the management of low-risk PTMCs, with thermal ablation achieving a lower complication rate. Therefore, thermal ablation may be considered as an alternative treatment option for low-risk PTMC in patients who refuse surgery and active surveillance or are ineligible for surgery.
Emmanuel Fiagbedzi;Francis Hasford;Samuel Nii Tagoe
한국의학물리학회지:의학물리
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제35권1호
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pp.1-9
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2024
Margin inclusion or exclusion remains the most critical and controversial aspect of stereotactic radiosurgery (SRS) for metastatic brain tumors. This review aimed to examine the available literature on the impact of margins in SRS of brain metastasis and to assess the response of some medical physicists on the use of these margins. The Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses method was used to review articles published in PubMed, Embase, and Science Direct databases from January 2012 to December 2022 using the following keywords: planning target volume, brain metastasis, margin, and stereotactic radiosurgery. A simple survey consisting of five questions was completed by ten medical physicists with experience in SRS treatment planning. The results were analyzed using IBM SPSS Statistics version 26.0. Of the 1,445 articles identified, only 38 articles were chosen. Of these, eight papers were deemed relevant to the focus of this review. These papers showed an increase in the risk of radionecrosis, whereas differences in local control were variable as the margin increased. In the survey, the response rate to whether or not to use margins in SRS, a critical question, was 50%. Margin addition increases the risk of radio necrosis. The local control rate varies among treatment modalities and cannot be generalized. From the survey, no consensus was reached regarding the use of these margins. This calls for further deliberations among professionals directly involved in SRS.
Purpose: This study was a retrospective analysis with survey study which analyze influence of depression of patients with cancer on metastasis. Methods: The subjects of this research were 223 patients who underwent chemotherapy or are in follow-up management with stomach, colon, or breast cancer. The questionnaires were collected in 2002 and medical documents were reviewed 400 days after the first data collection. Subjects were divided according to the depression level into over-average group and under average group. Results: In survival analysis, metastasis occurred in 49 of 211 in 223 subjects for whom follow-up review was done after 400 days. The depression and anxiety level were higher in the group with metastasis than the other with no metastasis. As a result, it showed that the lower depression they have, the lesser the metastasis occurred. Conclusion: This research showed that patients who have higher level of depression, experienced higher risk for cancer metastasis. Nurses who take care of cancer patients are responsible for giving patients with positivity with intention to subside their depression.
Leon-Hernandez, Saul Renan;Padilla, Eleazar Lara;Algara, Alfredo Cortes;Rodriguez, Noemi Cardenas;Sanchez, Esau Floriano;Cruz, Jaime Lopez;Barradas, Cesar Miguel Mejia;Bandala, Cindy
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제15권14호
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pp.5709-5714
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2014
Background: An association between alcohol/tobacco use and risk of metastasis in breast cancer has been clearly shown. Materials and Methods: The present study explored, in 48 samples of tissue from mammary ductal carcinoma (taken from Mexican women with an average age of $58.2{\pm}10.9$ years), the association of risk of metastasis with the status of hormonal receptors and the c-erbB2 protein (by immunohistochemistry) as well as clinical, histopathological and sociodemographic factors. Results: Of 48 patients, 41.6% (20/48) presented with metastasis, 43.8% were positive for the estrogen receptor (RE+), 31.3% for the progesterone receptor (RP+) and 47.7% for c-erbB2 (c-erbB2+). The following combinations were found: RE+/RP+/c-erbB2+ 8.3%, RE+/RP+ 22.9%, RE+/RP- 20.8%, RE-/RP+ 8.3%, RE-/RP-/c-erbB2- 22.9% and RE-/RP- 47.8%. There were 12 patients who used alcohol/tobacco, of which 91.6% did not present metastasis and 81.9% were RE-/RP-. Compared to the RE-/RP-/c-erbB2+, the RE+/RP+/c-erbB2+ group had a 15-fold greater risk for metastasis (95%CI, 0.9-228.8, p=0.05). The carriers of the double negative hormonal receptors had a 4.7 fold greater probability of being (or having been) smokers or drinkers (95%CI, 1.0-20.4, p = 0.03). Conclusions: There was a clear protective effect of using alcohol and/or tobacco, in the cases included in the present study of mammary ductal carcinoma, associated with double negative hormonal receptors. However, this association could be due to a protective factor not measured (Neyman bias) or to a bias inherent in the rate of hospitalization (Berkson fallacy). This question should be explored in a broad prospective longitudinal study.
Park, Hye Eun;Yoo, Seungyeon;Bae, Jeong Mo;Jeong, Seorin;Cho, Nam-Yun;Kang, Gyeong Hoon
대한병리학회지
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제52권6호
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pp.386-395
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2018
Background: Previous studies on synchronous colorectal carcinoma (SCRC) have reported inconsistent results about its clinicopathologic and molecular features and prognostic significance. Methods: Forty-six patients with multiple advanced tumors (T2 or higher category) who did not receive neoadjuvant chemotherapy and/or radiotherapy and who are not associated with familial adenomatous polyposis were selected and 99 tumors from them were subjected to clinicopathologic and molecular analysis. Ninety-two cases of solitary colorectal carcinoma (CRC) were selected as a control considering the distributions of types of surgeries performed on patients with SCRC and T categories of individual tumors from SCRC. Results: SCRC with multiple advanced tumors was significantly associated with more frequent nodal metastasis (p=.003) and distant metastasis (p=.001) than solitary CRC. KRAS mutation, microsatellite instability, and CpG island methylator phenotype statuses were not different between SCRC and solitary CRC groups. In univariate survival analysis, overall and recurrence-free survival were significantly lower in patients with SCRC than in patients with solitary CRC, even after adjusting for the extensiveness of surgical procedure, adjuvant chemotherapy, or staging. Multivariate Cox regression analysis revealed that tumor multiplicity was an independent prognostic factor for overall survival (hazard ratio, 4.618; 95% confidence interval, 2.126 to 10.030; p<.001), but not for recurrence-free survival (p=.151). Conclusions: Findings suggested that multiplicity of advanced T category-tumors might be associated with an increased risk of nodal metastasis and a risk factor for poor survival, which raises a concern about the guideline of American Joint Committee on Cancer's tumor-node-metastasis staging that T staging of an index tumor determines T staging of SCRC.
Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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제33권3호
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pp.199-203
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2007
Several matrix metalloproteinases (MMPs) have been shown to play an important role in the invasion and metastasis of oral squamous cell carcinoma (OSCC). The members of the TGF-$\beta$ signaling pathway are being considered as predictive biomarkers for progressive tumorigenesis and molecular targets for the prevention and the treatment of cancer and metastasis. The aim of the present study was to find the clinical significance of the expression of TGF-${\beta}1$ and MMP-2 related to the regional lymph node metastasis in OSCC. This study included 76 cases of primary OSCC, of which 42 cases showed regional lymph node metastases. Immunohistochemistry was used for the localization of protein. The relation between the expression of each protein and clinical variables was statistically evaluated. In results, the expression of TGF-${\beta}1$ both main mass with lymph node metastasis and without lymph node metastasis was found not to be statistically significant (p>0.05). The expression of MMP-2 was found to be statistically significant related to regional lymph node metastasis (p<0.05). When compared the expression in the metastatic lymph node, TGF-${\beta}1$ was significantly highly expressed than MMP-2 (p<0.05). In conclusion, the expression of MMP-2 was significantly elevated in patients with lymph node metastasis as compared to the patients without lymph node metastasis, which could be useful in predicting the risk of lymph node metastasis in OSCC.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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