Solid phase peptide synthesis method, which was introduced by Merrifield in 1963, has spawned the concept of combinatorial chemistry. In this review, we summarize the present technologies of solid phase peptide synthesis (SPPS) that are related to combinatorial chemistry. The conventional methods of peptide library synthesis on polymer support are parallel synthesis, split and mix synthesis and reagent mixture synthesis. Combining surface chemistry with the recent technology of microelectronic semiconductor fabrication system, the peptide microarray synthesis methods on a planar solid support are developed, which leads to spatially addressable peptide library. There are two kinds of peptide microarray synthesis methodologies: pre-synthesized peptide immobilization onto a glass or membrane substrate and in situ peptide synthesis by a photolithography or the SPOT method. This review also discusses the application of peptide libraries for high-throughput bioassays, for example, peptide ligand screening for antibody or cell signaling, enzyme substrate and inhibitor screening as well as other applications.
Turek, Marian;Mitko, Krzysztof;Bandura-Zalska, Barbara;Ciecierska, Kamila;Dydo, Piotr
Membrane and Water Treatment
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v.4
no.4
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pp.237-249
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2013
Ultra-pure water (UPW), a highly treated water free of colloidal material and of a conductivity less than 0.06 ${\mu}S$, is an essential component required by modern industry. One of the methods for UPW production is the electrodialysis-ion exchange (ED/IE) system, in which the electrodialysis (ED) process is used as a preliminary demineralization step. The IE step can be replaced with electrodeionization (EDI) to decrease the volume of post-regeneration lyes. In this paper, the electrodialysis process carried out to relatively low diluate conductivity was investigated and the costs of UPW production were calculated. The optimal value of desalination degree by ED in the ED/IE and ED/EDI systems was estimated. UPW unit costs for integrated ED/IE and ED/EDI systems were compared to simple ion exchange and other methods for UPW production (RO-IE, RO-EDI). The minimal UPW unit costs in ED/EDI integrated system were estimated as $0.37/$m^3$ for feed TDS 600 mg/L and $0.36/$m^3$ for feed TDS 400 mg/L at 64 $m^3/h$ capacity, which was lower than in the comparable ED/IE integrated system ($0.42-0.44/$m^3$). The presented results suggest that an ED/EDI integrated system may be economically viable.
Lee, Soon Hong;Huh, Hoon;Lee, Young Moo;Kim, Jin Il;Park, Young Hoon
Applied Chemistry for Engineering
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v.4
no.1
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pp.188-195
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1993
Polyelectrolyte complexes and graft copolymers as biomaterials were synthesized from the water soluble cellulose derivatives. Polyelectrolyte complexes have been prepared from carboxymethyl cellulose (CMC) and gelatin. Graft copolymers(Mc-g-AA) were synthesized by grafting acrylic acid (AA) onto methyl cellulose(MC). (Mc-g-AA) and gelatin polyelectrolyte complexes were also prepared. The optimum conditions of each sample were investigated after chemical crosslinking or heat treatment. The preliminary results show that these materials might be interesting for biomedical applications.
Kim, Woo-Il;Choi, Kyung-A;Do , Hyun-Soo;Yu, Yeon-Gyu
BMB Reports
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v.41
no.11
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pp.808-813
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2008
Human microsomal prostaglandin E synthase-1 (mPGES-1) is a membrane associated protein that catalyzes the conversion of prostaglandin $H_2$ ($PGH_2$) into prostaglandin $E_2$ ($PGE_2$). In this study, the expression of human mPGES-1 in E. coli was significantly enhanced by modifying the utility of specific codons and the recombinant mPGES-1 was efficiently purified to homogeneity. The $K_m$ and $V_{max}$ of the purified enzyme were determined and the trimeric state characterized by chemical cross-linking with glutaraldehyde. The purified mPGES-1 was used for the screening of a chemical library of bioactive or drug compounds to identify novel inhibitors, and oxacillin and dyphylline were identified as moderately inhibiting mPGES-1 with $I_{C50}$ values of 100 and 200 ${\mu}M$, respectively. As these compounds competitively inhibited the catalysis of $PGH_2$, their binding sites appeared to be located near the $PGH_2$ binding pocket.
Proceedings of the Korean Powder Metallurgy Institute Conference
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2006.09a
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pp.489-490
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2006
Branched sulfonated poly(ether sulfone-ketone) copolymer was prepared with bisphenol A, 4,4-difluorobenzophenone, sulfonated chlorophenyl sulfone (40mole% of bisphenol A) and THPE (1,1,1-tris-p-hydroxyphenylethane). THPE was used 0.4 mol% of bisphenol A to synthesize branched copolymers. Organic-inorganic nano composite membranes were prepared with copolymer and a series of $SiO_2$ nanoparticles (20 nm, 4, 7 and 10 wt%). The composite membranes were cast from dimethylsulfoxide solutions. The films were converted from the salt to acid forms with dilute hydrochloric acid. The membranes were studied by differential scanning calorimetry (DSC) and thermogravimetric analysis (TGA). Sorption experiments were conducted to observe the interaction of sulfonated polymers with water and methanol. Branched copolymer and nano composite membranes exhibit proton conductivities from $1.12{\times}10^{-3}$ to $6.04{\times}10^{-3}\;S/cm^2$, water uptake from 52.9 to 62.4%, IEC from 0.81 to 1.21 meq/g and methanol diffusion coefficients from $1.2{\times}10^{-7}$ to $1.5{\times}10^{-7}\;cm^2/S$.
Proceedings of the Korean Powder Metallurgy Institute Conference
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2006.09a
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pp.487-488
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2006
Novel bisphenol-based wholly aromatic poly(ether sulfone-ketone) copolymer containing pendant sulfonate groups were prepared by direct aromatic nucleophilic substitution polycondensation of 4,4-difluorobenzophenone, 2,2'-disodiumsulfonyl-4,4'-fluorophenylsulfone (40mole% of bisphenol A) and bisphenol A. Polymerization proceeded quantitatively to high molecular weight in N-methyl-2-pyrrolidinone at $180^{\circ}C$. Organic-inorganic composite membranes were obtained by mixing organic polymers with hydrophilic $SiO_2$ (ca. 20nm) obtained by sol-gel process. The polymer and a series of composite membranes were studied by FT-IR, $^1HNMR$, differential scanning calorimetry (DSC) and thermal stability. The proton conductivity as a function of temperature decreased as $SiO_2$ content increased, but methanol permeability decreased. The nano composite membranes were found to posse all requisite properties; Ion exchange capacity (1.2meq./g), glass transition temperatures $(164-183\;^{\circ}C)$, and low affinity towards methanol $(4.63-1.08{\times}10^{-7}\;cm^2/S)$.
This study aimed to prepare a W/O nonionic microemulsion system(MEs) consisting of OP-4[polyoxyethylene(4) nonylphenol], OP-7[polyoxyethylene(7) nonylphenol], 1-hexanol, D2EHPA, kerosene and HCl solution and applied to the extraction of La(III) from chloride aqueous solution within the polysulfone hollow fiber contactor (HFC),laboratory-scale experiments were carried out to investigate the recovery of La(III) using as-prepared microemulsion from the simulation wastewater containing La(III),Al(III) and Fe(III). The right weight ratio(Rs) of OP-4 to OP-7 was firstly confirmed through determination of the solubilization capacity of HCl solution(W0,HCl) in microemulsion, the effect of several factors such as the HCl concentration, temperature and effective extraction time on the extraction efficiency of La(III) was discussed. Results showed that the acceptable Rs was 4:6 to prepare the W/O MEs. The extraction yield of La(III) increased with the increasing of HCl concentration, temperature and effective extraction time and reaches to 97.3% while using five-stage modules. The recovery yield of La(III) from simulation La-bearing wastewater was 90.6%.
Membrane disruption by an antimicrobial peptide, protegrin-1 (PG-1), was investigated by measuring the $^2H$ solid-state nuclear magnetic resonance (SSNMR) spectra of 1-palmitoyl-$d_{31}$-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphatidylcholine (POPC_$d_{31}$) in the mixture of PG-1 and POPC_$d_{31}$ lipids deposited on thin cover-glass plates. The experimental line shapes of anisotropic $^2H$ SSNMR spectra measured at various peptide-to-lipid (P/L) ratios were simulated reasonably by assuming the mosaic spread of bilayers containing pore structures or the coexistence of the mosaic spread of bilayers and a fast-tumbling isotropic phase. Within a few days of incubation in the hydration chamber, the pores were formed by the peptide in the POPC_$d_{31}$ and POPC_$d_{31}$/cholesterol membranes. However, the formation of the pores was not clear in the POPC_$d_{31}$/1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphatidylglycerol (POPG) membrane. Over a hundred days after hydration, a rapidly rotating isotropic phase increased in the POPC_$d_{31}$ and the POPC_$d_{31}$/cholesterol membranes with the higher P/L ratios, but no isotropic phase appeared in the POPC_$d_{31}$/POPG membrane. Cholesterol added in the POPC bilayer acted as a stabilizer of the pore structure and suppressed the formation of a fast-tumbling isotropic phase.
A simple and fast method for extraction and determination of trace amounts of copper(II) ions using octadecyl-bonded silica membrane disks modified with 2-propylpiperidine-1-carbodithioate (PPCD)I and atomic absorption spectrometry (AAS) is introduced. Extraction efficiency and the influence of flow rates, pH, and type and smallest amount of stripping acid were investigated. Maximum capacity of the membrane disks modified with 2 mg of the anthraquinone derivative used was found to be 425μg Cu2+. The limit of detection of the proposed method is 7 ng/ml. The method is applied to the recovery of Cu2+ from different synthetic samples and a spring water sample.
Structural studies of membrane proteins, importantly involving interpretation of genomics information, many signaling pathway and major drug target for drug discovery, are having difficulty in characterizing the function using conventional solution nmr spectroscopy and x-ray crystallography because phospholipid bilayers hindered fast tumbling and crystallization. Here, we studied the structure of the pf1 coat protein in oriented phospholipid bilayers by home-built solid-state NMR probe. Bacteriophage pf1 was purified from Paeudomonas Aeruginosa and coat protein of bacteriophage pf1 was isolated from DNA and other proteins.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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