• 대한의생명과학회지
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• 제5권1호
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• pp.27-40
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• 1999

본 연구는 MarA와 함께 MarB가 AcrAB efflux pump를 목표로 하는지 여부, 그리고 항생제의 균체외 배출기능에 대하여 어떤 조절 작용이 있는지를 항생제 내성검사를 통하여 살펴보았다. 본 연구 결과는 MarB가 MarA와 함께 AcrAB/TolC efflux pump의 항생제 배출기 능을 억제적으로 조절한다는 것을 간접적으로 보여 주었으며, 한편 이미 알려진 대로 MarA는 acrRAB operon의 발현을 전사 수준에 서 positive regulation하므로, MarB는 AcrAB efflux pump의 기능을 억제적으로 조절한다는 것을 암시하고 있다. 그리고 MarA와 함께 MarB단백질의 작용 목표는 AcrAB efflux pump임을 간접적으로 보여주고 있다. 또한 MarB는 MarA와 함께 대장균의 다른 efflux system(들)의 항생제 배출기능에 대해서도 억제적으로 조절할 가능성이 높은 것으로 나타났다.

• 대한의생명과학회지
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• 제5권1호
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• pp.17-26
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• 1999

Mar (multiple-antibiotic-resistance) 대장균의 marRAB 돌연변이가 그람음성 세균들 사이로 전파 될수 있는지를 알아보기 위해서, 염색체 위의 marRAB 돌연변이를 $\lambda$placMu9 (Km$^{r}$)를 이용하여 대장균의 다른 균주내의 pUC19 (Lac$^{+}$, Ap$^{r}$)의 클로닝 사이트, S. typhimurium 및 P. aeruginosa의 염색체 위로 각각 전달시킨 후, Mar phenotype, Km$^{r}$, Lac$^{-}$, 혹은 Ap$^{r}$ 균주를 선택한 다음, salicylate (SAL)의 유도 (induction) 유무에 따른 항생제 내성검사를 실시하였다. pUC19의 보유 유무에 관계없이 대조군인 야생형 대장균 JM109, NM522에 비해서, pUC19::marRAB 돌연변이를 가진 JM109 혹은 NM522의 대부분 균주들은 항생제 내성 수준들이 훨씬 더 높았으며, Mar표현형의 유도도 SAL에 의해서 훨씬 더 높게 나타났다. 하지만 일부 소수의 항생제에 대해서는 예외적으로 내성 수준이 더 낮게 나타났는데, 야생형 JM109 균주에서는 chloramphenicol (Cm)과 tetracycline (Tc)이 , pUC19::marRAB 돌연변이를 가진 NM522 균주 에서는 Tc와 ciprofloxacin (Cp)에 대한 내성 수준이 각각 더 낮게 나타났다. S. typhimurium 및 P. aeruginosa에 대한 같은 실험의 결과도 야생형 대장균의 경우와 거의 대부분 일치하였다. 형질전환 (transformation)과 형질도입 (transduction)의 방법을 주로 사용한 이 실험의 결과는, marRAB 돌연변이가 그람음성 세균들 사이로 전파될 수 있음을 간접적으로 암시한다.

• 대한의생명과학회지
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• 제10권2호
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• pp.153-161
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• 2004

Antibiotic resistance is often associated with the production of inner membrane proteins (for example, AcrAB/TolC efflux pump) that are capable to extrude antibiotics, detergents, dyes and organic solvents. In order to evaluate the unknown MarB function of Escherichia coli, especially focused on the function of OmpF porin, several mutants were construted by T4GT7 transduction. MarA plays a major roles in mar (multiple antibiotic resistance) phenotype with AcrAB/TolC efflux pump in E. coli K-12. Futhermore, MarA decreases OmpF porin expression via micF antisense RNA. Expression of acrAB is increased in strains containing mutation in marR, and in those carrying multicopy plasmid expressing marA. MarB protein of E. coli K-12 showed its activity at OmpF porin & TolC protein as target molecule. Some paper reported MarB positively regulates OmpF function. MarA shows mar phenotype, and MarB along with MarA show decreased MIC through OmpF function. By this experiment, MarB could decrease MIC through the OmpF porin & TolC protein as target.

• Genomics & Informatics
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• 제1권1호
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• pp.40-49
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• 2003

The genes related to specific events or pathways in bacteria are frequently localized proximate to the genome of their neighbors, as with the structures known as operon, but eukaryotic genes seem to be independent of their neighbors, and are dispersed randomly throughout genomes. Although cases are rare, the findings from structures similar to prokaryotic operons in the nematode genome, and the clustering of housekeeping genes on human genome, lead us to assess the genomic association of genes as functional subunits. We evaluated the genomic association of neighboring genes on chromosomes 4 and 5 of Arabidopsis thaliana with and without respectively consideration of the scaffold/matrix­attached regions (S/MAR) loci. The observed number of functionally identical bigrams and trig rams were significantly higher than expected, and these results were verified statistically by calculating p-values for weighted random distributions. The observed frequency of functionally identical big rams and trig rams were much higher in chromosome 4 than in chromosome 5, but the frequencies with, and without, consideration of the S/MAR in each chromosome were similar. In this study, a genomic association among functionally related neighboring genes in Arabidopsis thaliana was suggested.