We aimed to understand the molecular changes in host cells that accompany infection by the seasonal influenza A H1N1 virus because the initial response rapidly changes owing to the fact that the virus has a robust initial propagation phase. Human epithelial alveolar A549 cells were infected and total RNA was extracted at 30 min, 1 h, 2 h, 4 h, 8 h, 24 h, and 48 h post infection (h.p.i.). The differentially expressed host genes were clustered into two distinct sets of genes as the infection progressed over time. The patterns of expression were significantly different at the early stages of infection. One of the responses showed roles similar to those associated with the enrichment gene sets to known 'gp120 pathway in HIV.' This gene set contains genes known to play roles in preventing the progress of apoptosis, which infected cells undergo as a response to viral infection. The other gene set showed enrichment of 'Drug Metabolism Enzymes (DMEs).' The identification of two distinct gene sets indicates that the virus regulates the cell's mechanisms to create a favorable environment for its stable replication and protection of gene metabolites within 8 h.
19 Aromatic ring and L-amino acid ester contained rupestonic acid amide derivatives 2a~2l, 3a~3g were synthesized and preliminarily evaluated in vitro against influenza virus $A_3$,B and herpes simplex virus type 1 (HSV-1), 2(HSV-2) by the national center for drug screening of China. The rusults showed that 2i possessed the highest inhibition against both influenza virus $A_3\;(TC_{50}\;=\;120.6\;{\mu}mol/L,\;IC_{50}=\;19.2\;{\mu}$mol/L, SI = 6.3) and B (T$C_{50}\;=\;120.6\;{\mu}mol/L,\;IC_{50}=\;29.9\;{\mu}$mol/L, SI = 4.0); 2g was more active against influenza $A_3$ virus at very low cytotoxicity ($TC_{50}\;>\;2092.1\;{\mu}mol/L,\;IC_{50}=\;143.7\;{\mu}mol/L,$ SI > 14.6) than the parent compound; Compounds 2b, 2c, 2f showed higher activities both against HSV-1 and HSV-2 than that of the parent compound, and 2f was the most potent inhibitor of HSV-1 ($TC_{50}\;=\;200.0\;{\mu}mol/L,\;IC_{50}\;=\;11.3\;{\mu}mol$/L, SI = 17.7 ) and HSV-2 ($TC_{50}\;=\;200.0\;{\mu}mol/L,\;IC_{50}\;=\;20.7\;{\mu}mol$/L , SI = 9.7).
It's a threat for the public health that H1N1 (Influenza virus A) causes disease and transmits among humans. WHO (world health organization) declared that the infections caused by the new strain had reached pandemic proportions. The approved neuraminidase inhibitors (Zanamivir and Oseltamivir) and related investigative drug (BCX-1812) are potent, specific inhibitors of influenza A and B viruses. These drugs are highly effective to prevent influenza A and B infections. Early therapeutic use reduces illness duration and respiratory complications. Recently, we found one of the potent inhibitor of erystagallin A ($IC_{50}$ of 2.04 ${\mu}M$) for neuraminidase target, this inhibitor shows most similar structure to its natural substrate, sialic acid. Therefore, we chose 1l7f to get the receptor structure for docking study among many crystal structures. A docking study has been performed in Surflex-Dock module in SYBYL 8.1. In the present study, we attempt to compare the docking studies of pterocarpin and erystagallin A with neuraminidase receptor structure. In the previous report, the methoxy group of pterocarpin had H-bonding with Arg residues. The present docking results for erystagallin A showed the backbone of hydroxyl group shows significant H-bonding interactions with Arg152 and Arg292. The results showed that erystagallin A interacts more favorably with distinctive binding site rather than original active site. Therefore, we tried to reveal plausible binding mode and important amino acid for this inhibitor using docking and site id search calculations of Sybyl. The results obtained from this work may be utilized to design novel inhibitors for neuraminidase.
Heo, Hyun Young;Kim, Yong Tae;Chen, Yuchao;Choi, Jong Young;Seo, Tae Seok
Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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2013.08a
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pp.273-273
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2013
Recently, Point-of-care (POC) testing microdevices enable to do the patient monitoring, drug screening, pathogen detection in the outside of hospital. Immunochromatographic strip (ICS) is one of the diagnostic technologies which are widely applied to POC detection. Relatively low cost, simplicity to use, easy interpretations of the diagnostic results and high stability under any circumstances are representative advantages of POC diagnosis. It would provide colorimetric results more conveniently, if the genetic analysis microsystem incorporates the ICS as a detector part. In this work, we develop a reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) microfluidic device integrated with a ROSGENE strip for colorimetric influenza H1N1 virus detection. The integrated RT-PCR- ROSGENE device is consist of four functional units which are a pneumatic micropump for sample loading, 2 ${\mu}L$ volume RT-PCR chamber for target gene amplification, a resistance temperature detector (RTD) electrode for temperature control, and a ROSGENE strip for target gene detection. The device was fabricated by combining four layers: First wafer is for RTD microfabrication, the second wafer is for PCR chamber at the bottom and micropump channel on the top, the third is the monolithic PDMS, and the fourth is the manifold for micropump operation. The RT-PCR was performed with subtype specific forward and reverse primers which were labeled with Texas-red, serving as a fluorescent hapten. A biotin-dUTP was used to insert biotin moieties in the PCR amplicons, during the RT-PCR. The RT-PCR amplicons were loaded in the sample application area, and they were conjugated with Au NP-labeled hapten-antibody. The test band embedded with streptavidins captures the biotin labeled amplicons and we can see violet colorimetric signals if the target gene was amplified with the control line. The off-chip RT-PCR amplicons of the influenza H1N1 virus were analyzed with a ROSGENE strip in comparison with an agarose gel electrophoresis. The intensities of test line was proportional to the template quantity and the detection sensitivity of the strip was better than that of the agarose gel. The test band of the ROSGENE strip could be observed with only 10 copies of a RNA template by the naked eyes. For the on-chip RT-PCR-ROSGENE experiments, a RT-PCR cocktail was injected into the chamber from the inlet reservoir to the waste outlet by the micro-pump actuation. After filling without bubbles inside the chamber, a RT-PCR thermal cycling was executed for 2 hours with all the microvalves closed to isolate the PCR chamber. After thermal cycling, the RT-PCR product was delivered to the attached ROSGENE strip through the outlet reservoir. After dropping 40 ${\mu}L$ of an eluant buffer at the end of the strip, the violet test line was detected as a H1N1 virus indicator, while the negative experiment only revealed a control line and while the positive experiment a control and a test line was appeared.
Arusa (Adhatoda vasica) is an important medicinal plant widely used in Unani system of medicine of (Family-Acanthaceae). The leaves of Adhatoda vasica contain several biologically active phytochemicals such as alkaloids, tannins, saponins, phenolics and flavonoids. It mainly consists of pyrroquinazoline, alkaloids, viz. vasicine, vasicol, vasicinone, peganine along with other minor constituents. The plant possesses diverse pharmacological activities, In Unani system of medicine, the drug is described as having dafa-e-tashannuj (anti-spasmodic), qatil-e-jarasim (antibiotic), mukhrij-e-balgham (expectorant), dafa-e-humma (antipyretic) properties due to which it is prescribed in a wide range of ailments like influenza, tuberculosis, bronchitis, gastric ulcers etc. Leaf juice is beneficial in the treatment of dysentery and diarrhoea. Various other activities like radio modulation, hypoglycaemic effect, cardiovascular protection, antitubercular, antiviral, hepatoprotective and antioxidant activity have also been reported.
Oseltamivir, also known as Tamifu, is an inhibitor of neuraminidase protein which plays an essential role in proliferation and replication of influenza virus. Binding to the active site of neuraminidase, the oseltamivir prevents the protein from enzyme reaction. Conformational change of the protein(neuraminidase) should be accompanied by the enzyme reaction, but the drug inhibits the protein to deform. In this study, we examine the influence of oseltamivir on protein's conformational change in the structural and mechanical point of view. Finite element analysis of the protein can be an useful approach to investigate the influence of oseltamivir on the deformation of a protein. We suggest the finite element based protein model, and then perform the linear static analysis with the displacement loading condition based on the first two largest motion which can be obtained from the normal mode analysis. The results show that it takes more energy to change shape of the protein with an oseltamivir attached than the protein without an oseltamivir.
Oseltamivir is an antiviral medication prescribed to prevent and treat influenza A and B. A case from a community pharmacy in Korea was reported for an adverse event associated with oseltamivir administration. A 20-month-old boy had psychiatric symptoms after receiving 2 doses of oseltamivir. Therefore, an evaluation of whether the psychiatric symptoms were caused by oseltamivir was required. To determine whether the adverse event resulted from the administrated medication or other factors, three tools were used: the Naranjo scale, the Korean causality assessment algorithm (Ver.2), and the World Health Organization-Uppsala Monitoring Center (WHO-UMC) criteria. The psychiatric symptoms occurred after oseltamivir administration, and were attenuated after oseltamivir termination. A possible cause of the psychiatric symptoms is high fever, but information on the body temperature of the patient was not sufficient. Therefore, it was unclear whether there were other nonpharmacological causes of adverse drug reaction. For these reasons, in terms of causality, the results evaluated by the three tools represented, "possible", "probable", and "probable/likely", respectively.
Kim, Hyo-Jeong;Kim, Young-Hoon;Kim, Han-Sung;Woo, Jung-Sik;Oh, Su-Jin
Health Policy and Management
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v.23
no.1
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pp.19-34
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2013
Background: The study describes the changes resulted from imposition on tertiary hospital outpatient coinsurance rate rise policy and in tertiary or general hospital drug coverage rise policy on healthcare service utilization. Methods: Accordingly, the hypothesis about outpatient healthcare utilization after rise policy in outpatient coinsurance rate and drug coverage was established, using interrupted time-series analysis and segmented regression analysis to test the hypothesis. 5-year analysis period (2007. 3-2012. 3) from the outset year was designated, the data about most common 10 high-ranking of the main diseases targeting visiting patient from age of 6 to 64 were collected. Results: The summary on the major research is followed. First, the medical expense and duration of treatment tends to be increased in case of imposition about rise policy in outpatient coinsurance rate in the tertiary hospital under the interrupted time-series analysis. It showed temporary increase and slow down on account of influenza A even after the policy enforcement. In segmented regression analysis, duration of visit and medical expense in the tertiary hospital increased temporally right after the policy implementation and the decreased rapidly depends on period. Both rise and fall is statistically significant. The second, In case of tertiary or general hospital outpatient drug coverage rise policy, all of the tertiary hospital healthcare service utilization variables by the interrupted time-series analysis, drug coverage policy in the general hospital deeply declined according to decreasing trend before policy implementation. The third, in case of segmented regression analysis, the visit duration and medical expense statistically declined right after the policy implementation in both the tertiary and general hospital. Meanwhile, administration day was statistically meaningful only for the decrease right after the policy implementation. Otherwise, general hospital changes are not statistically meaningful. And the medicine cost was statistically, meaningfully decreased after the increase in drug coverage. Conclusion: Finally, the result demonstrated according to the analysis is only 1 hypothesis is denied, the other 2 are partially supported. Then, tertiary hospital outpatient coinsurance rate increase policy comparatively makes decrease effect on long-term healthcare utilization, and tertiary or general hospital outpatient drug coverage policy showed partially short-term effect is assured.
Care of patients with sepsis has improved over the last decade. However, in the recent two years, there was no significant progress in the development of a new drug for critically ill patients. In January 2011, it was announced that the worldwide phase 3 randomized trial of a novel anti-Toll-like receptor-4 compound, eritoran tetrasodium, had failed to demonstrate an improvement in the mortality of patients with severe sepsis. In October 2011, Xigris (drotrecogin alfa, a recombinant activated protein C) was withdrawn from the market following the failure of its worldwide trial that had attempted to demonstrate improved outcome. These announcements were disappointing. The recent failure of 2 promising drugs to further reduce mortality suggests that new approaches are needed. A study was published showing that sepsis can be associated to a state of immunosuppression and loss of immune function in human. However, the timing, incidence, and nature of the immunosuppression remain poorly characterized, especially in humans. This emphasizes the need for a better understanding of sepsis as well as new therapeutic strategies. Many clinical experiences of the extracorporeal membrane oxygenator (ECMO) treatment for adult acute respiratory distress syndrome (ARDS) patients, which is caused by the H1N1 influenza A virus, were reported. The use of ECMO in severe respiratory failure, particularly in the treatment of adult ARDS, is occurring more commonly.
Park, Eunhwi;Kim, Hye-Jin;Seo, Seung-Yeul;Lee, Han-Na;Choi, Si-Sun;Lee, Sang Joung;Kim, Eung-Soo
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.31
no.9
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pp.1305-1310
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2021
Shikimate is a key high-demand metabolite for synthesizing valuable antiviral drugs, such as the anti-influenza drug, oseltamivir (Tamiflu). Microbial-based strategies for shikimate production have been developed to overcome the unstable and expensive supply of shikimate derived from traditional plant extraction processes. In this study, a microbial cell factory using Corynebacterium glutamicum was designed to overproduce shikimate in a fed-batch culture system. First, the shikimate kinase gene (aroK) responsible for converting shikimate to the next step was disrupted to facilitate the accumulation of shikimate. Several genes encoding the shikimate bypass route, such as dehydroshikimate dehydratase (QsuB), pyruvate kinase (Pyk1), and quinate/shikimate dehydrogenase (QsuD), were disrupted sequentially. An artificial operon containing several shikimate pathway genes, including aroE, aroB, aroF, and aroG were overexpressed to maximize the glucose uptake and intermediate flux. The rationally designed shikimate-overproducing C. glutamicum strain grown in an optimized medium produced approximately 37.3 g/l of shikimate in 7-L fed-batch fermentation. Overall, rational cell factory design and culture process optimization for the microbial-based production of shikimate will play a key role in complementing traditional plant-derived shikimate production processes.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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