• Applied Biological Chemistry
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• 제38권4호
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• pp.313-319
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• 1995

본 실험은 알팔파(Medicago sativa) 근류균인 Rhizobium meliloti TAL1372 균주에서 섬유소분해효소의 활성을 확인하고 이 유전자를 크로닝하기 위해 코스미드 벡타인 pLAFR3를 사용하여 유전자 은행을 만들었다. 이 유전자 은행으로 부터 분리한 1,000개의 형질 도입체에서 CM-cellulase(carboxymethylcellulase) 활성이 있는 클론(pRC8-71) 하나를 분리하였으며 30kb 크기의 R. meliloti DNA 단편을 함유하고 있는 것을 확인하였다. 이 CM-cellulase 유전자의 발현 산물을 native PAGE 법에 의하여 분자량을 측정한 결과 약 45kD 정도의 크기로 추정되었으며 pRC8-71로 부터 Tn5 변이법에 의해 조사한 결과 30kb 단편 내에서 CM-cellulase 유전자의 위치는 제한효소 KpnI에 의해 절단되는 약 3kb 단편에 존재하였다. 표시교환 변이법에 의해 야생균주 R. meliloti TAL1372로부터 cellulase 무생산 변이체를 얻어 근류형성 정도를 실험한 결과 CM-cellulase유전자가 근류형성에 관련될 것으로 추정되었다.

• Journal of the Korean Wood Science and Technology
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• 제46권2호
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• pp.166-177
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• 2018

Plant essential oils are defined as fragrant volatile oils extracted from leaves, stems, fruits, flowers, and roots of a plant. Such oils are composed of multiple components and multiple functions. By accumulation of inductive information, various plant essential oils have been studied for using in therapeutic medicine for various diseases. Despite of the apparent advantages of essential oils as a source of therapeutic medicines, plant essential oils have many limitations, including cytotoxic side effects. Therefore, it is necessary to evaluate the toxicity and the mechanisms of cytotoxicity of such oils. In this study, we evaluated the cytotoxicity to human-derived cell lines of 10 plant essential oils provided by National Institute of Forest Science (i.e., Larix kaempferi; Abies holophylla; Zanthoxylum ailanthoides; Pinus parviflora; Tsuga sieboldti; Chamaecyparis pisifera; Cryptomeria japonica; Pinus densiflora; Illicium anisatum; Pinus thunbergii). Cytotoxicity evaluations were accomplished by using CCK-assays and PCR-based cytotoxicity-related marker gene analyses with A549 cell line, and the Detroit551 cell line which are lung and skin cell line. The genes were analyzed included caspase-3 has a role in cell apoptosis, and the other cyclinA, cyclinB, cyclinD, and cyclinE regulated cell cycling for the cell proliferation. By examining the five cytotoxicity-related marker genes by performing real-time PCR and examined the cytostatic gene regulation associated with the various essential oils. The results of this study showed that the degree of cytotoxicity and the cytostatic gene regulation which could give precious information for using the plant essential oil for the clinical usages.

• 대한본초학회지
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• 제22권2호
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• pp.97-102
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• 2007

Objectives : This study presents a high performance liquid chromatography - electrospray ionization-mass spectrometer (HPLC-MS/MS) methods for the quantitative and qualitative analysis of various active components in Samul-tang, which is composed of four crude herbs. Methods : HPLC-ESI-MS/MS for the determinations of paeoniflorin and 5-HMF (5-hydroxymethyl 2-furaldehyde) in the Samul-tang, the separation method was performed on an COSMOS1L 5C18-AR-Il (2.0 X 150 mm I.D.) column by gradient elution with 0.1% acetic acid and 5% CH3CN in water (A)-0.1% acetic acid and 5% H20 in CH3CN (B) as the mobile phase at a flow-rate of 300 ${\mu}L/min$ with detection at quadrupole mass spectrometer. The all marker substances were always detected as the base peaks in the positive ion mode. Results : The paeoniflorin of Paeoniae Radix in Samul-tang showed a strong base peak [M+H2O]+ in the positive detection mode to give the following as; paeoniflorin (498.109 [M+H2O]+, 479.8 [M]+, 301 [M-glucose]+, 179.3 [glucose]+). Based on the HPLC retnetion time and MS of standard compounds confirmed the identity of active compounds in Rehmanniae Radix Preparata as follows; 5-HMF (127.0[M+H]+, 109.3 [M-OH]+) in the positive ion mode. Conclusion : According to the above results, HPLC-ESI-MS method permits assignment of tentative structures such as paeoniflorin and 5-HMF in the Samul-tang.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제28권7호
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• pp.936-942
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• 2015

The purpose of this study was to characterize genetic architecture of behavior patterns in Sapsaree dogs. The breed population (n=8,256) has been constructed since 1990 over 12 generations and managed at the Sapsaree Breeding Research Institute, Gyeongsan, Korea. Seven behavioral traits were investigated for 882 individuals. The traits were classified as a quantitative or a categorical group, and heritabilities ($h^2$) and variance components were estimated under the Animal model using ASREML 2.0 software program. In general, the $h^2$ estimates of the traits ranged between 0.00 and 0.16. Strong genetic ($r_G$) and phenotypic ($r_P$) correlations were observed between nerve stability, affability and adaptability, i.e. 0.9 to 0.94 and 0.46 to 0.68, respectively. To detect significant single nucleotide polymorphism (SNP) for the behavioral traits, a total of 134 and 60 samples were genotyped using the Illumina 22K CanineSNP20 and 170K CanineHD bead chips, respectively. Two datasets comprising 60 (Sap60) and 183 (Sap183) samples were analyzed, respectively, of which the latter was based on the SNPs that were embedded on both the 22K and 170K chips. To perform genome-wide association analysis, each SNP was considered with the residuals of each phenotype that were adjusted for sex and year of birth as fixed effects. A least squares based single marker regression analysis was followed by a stepwise regression procedure for the significant SNPs (p<0.01), to determine a best set of SNPs for each trait. A total of 41 SNPs were detected with the Sap183 samples for the behavior traits. The significant SNPs need to be verified using other samples, so as to be utilized to improve behavior traits via marker-assisted selection in the Sapsaree population.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제25권1호
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• pp.1-12
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• 2022

Inflammation plays an important role in the outcome of patients with cystic fibrosis (CF). It may develop due to cystic fibrosis transmembrane conductance regulator protein dysfunction, pancreatic insufficiency, or prolonged pulmonary infection. Fecal calprotectin (FC) has been used as a noninvasive method to detect inflammation. Therefore, the aim of the current meta-analysis was to investigate the relationship between FC and phenotype severity in patients with CF. In this study, searches were conducted in PubMed, Science Direct, Scopus, and Embase databases up to August 2021 using terms such as "cystic fibrosis," "intestine," "calprotectin," and "inflammation." Only articles published in English and human studies were selected. The primary outcome was the level of FC in patients with CF. The secondary outcome was the relationship between FC and clinical severity. Statistical analysis was performed using Comprehensive Meta-Analysis software. Of the initial 303 references, only six articles met the inclusion criteria. The mean (95% confidence interval [CI]) level of FC was 256.5 mg/dL (114.1-398.9). FC levels were significantly associated with pancreatic insufficiency (mean, 243.02; 95% CI, 74.3 to 411.6; p=0.005; I²=0), pulmonary function (r=-0.39; 95% CI, -0.58 to -0.15; p=0.002; I²=60%), body mass index (r=-0.514; 95% CI, 0.26 to 0.69; p<0.001; I²=0%), and Pseudomonas colonization (mean, 174.77; 95% CI, 12.5 to 337.02; p=0.035; I²=71%). While FC is a reliable noninvasive marker for detecting gastrointestinal inflammation, it is also correlated with the severity of the disease in patients with CF.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제21권1호
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• pp.151-156
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• 2017

대형 누수와 같은 상수도 사고가 발생했을 경우 신속한 대응조치를 위해서는 현장 관리자가 문제가 발생한 관로의 제수변을 찾아 제어해야 한다. 그러나 현재 상수도 시스템으로는 해당 제수변을 찾는 것이 쉽지 않고, 찾았다하더라도 관련 정보를 바로 알 수 없어 신속하게 대응하지 못하는 문제를 가지고 있다. 이를 해결하기 위해 본 연구에서는 GPS와 증강현실 기술을 사용하여 제수변 위치를 찾는 시스템을 구현하였다. 제안된 시스템은 자이로, 가속도계, 자기 센서를 포함한 안도로이드 장치의 센서를 활용하여 원격 데이터베이스 서버의 위치 데이터와 장치의 현재 GSP 위치가 일치하는 밸브를 찾는다. 또한 증강현실 기술을 사용하여 캡처한 실제 장면에 그래픽 패턴과 추가 정보들을 오버레이하여 나타내었다. 본 연구의 시스템 구현으로 제수변의 체계적인 관리가 가능하므로 사고 발생 시 신속한 대응으로 문제를 해결할 수 있을 것으로 기대된다.

• 응용통계연구
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• 제18권3호
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• pp.533-541
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• 2005

본 저자는 앞선 연구에서 제안한 SSVS 방법을 이용하여 한 양적형질에 대한 연관분석에 있어, QTL에 가까이 있는 관련된 표지유전자들의 위치를 정하고자 한다. 본 논문에서는 QTL에 연관되어 있고 동시에 서로 연관되어 있는 몇 가지 표지유전자들을 대상으로 하는데, 이 유전자 좌위들의 i.b.d. 값들을 상호 상관이 있는 예측변수로서 고려하여, SSVS 방법으로 분석한다. 두개의 QTL에 강하게 연관되어 있는 표지유전자들 만을 동시에 고려한 분석의 결과, QTL에 가장 가까이 위치한 표지 유전자가 다른 유전자들보다 더 분명하게 양적형질과의 관련성을 보여주었다. SSVS를 이용한 상호 상관이 있는 표지 유전자들의 분석의 결과는 전통적인 다중회귀분석을 이용한 결과와 거의 일치했다. 본 모의실험을 바탕으로, 복합 양적형질에 대하여 서로 연관된 다중의 표지유전자들을 동시에 연관분석을 수행하는 데에 SSVS 방법이 상당히 유용하다고 결론 내린다.

• KSBB Journal
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• 제29권1호
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• pp.50-57
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• 2014

NF-${\kappa}B$ is a transcriptional factor which is involved in many biological processes including immunity, inflammation, and cell survival. Many investigators studied on the mechanism involved in activation of NF-${\kappa}B$ signalling pathway via ubiquitination and degradation of $I{\kappa}B$ regarding skin disease. Some specific molecules including Akt, MEK, p38 MAP Kinase, Stat3, et al. represent convergence points and key regulatory proteins in signaling pathways controlling cellular events such as growth and differentiation, energy homeostasis, and the response to stress and inflammation. Ultraviolet (UV) irradiation has many adverse effects on skin, including inflammation, alteration in the extracellular matrix, cellular senescence, apoptosis and skin cancer. Prunus mume, a naturally derived plant extract, has beneficial biological activities as blood fluidity improvement, anti-fatigue action, antioxidative and free radical scavenging activities, inhibiting the motility of Helicobacter pyolri. Previous reports on various beneficial function prompted us to investigate UVB-induced or other immunostimulated biological marker regarding P. mume extract. P. mume extract suppresses UVB-induced cyclooxygenase-2 (COX-2) expression in mouse skin epidermal JB6 P+ cells. The activation of activator protein-1 and nuclear factor-${\kappa}B$ induced by UVB was dose-dependently inhibited by P. mume extract treatment. This results suggest that P. mume extracts might be used as a potential agents for protection of inflammation or UVB induced skin damage.

• 생명과학회지
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• 제22권5호
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• pp.595-599
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• 2012

최근 알러지성 비염, 알러지성 피부염, 알러지성 천식, 알러지성 과민반응 등과 같은 질병이 점차 늘어나고 있으며 그에 따른 효과적인 치료제나 효율적인 치료법이 시급한 실정이다. 본 연구에서 동물모델과 비만세포 탈과립작용에서 Platycodin D가 포함된 도라지 추출물(PG-Platycodin D)의 항알러지 효과를 연구하였다. $In$ $vivo$ 상에서 PG-Platycodin D가 항원-항체 반응에 의한 알러지 반응을 효과적으로 억제하는지 살펴보기 위한 아나필락틱 쇼크 평가에서 Platycodin D의 함량이 1%에서 5%까지 증가한 도라지 추출물일수록 $in$ $vivo$ 수준에서의 알러지반응이 억제되는 것을 확인할 수 있었다. 또한 항원-항체 반응에 의해 매개된 RBL-2H3 비만세포의 탈 과립현상에 대한 PG-Platycodin D의 효과를 알아보기 위한 ${\beta}$-hexosaminidase의 방출량 측정에서 Platycodin D의 함량이 1%에서 5%까지 포함된 도라지 추출물에서 농도가 증가함에 따라 ${\beta}$-hexosaminidase의 방출량이 농도 의존적으로 감소하는 것을 알 수 있었다. 또한, PG-Platycodin D의 처리가 항원-항체 반응에 의해 매개된 RBL-2H3 비만세포 내의 IL-3의 발현이 감소하는 양상을 확인할 수 있었다. 이들의 결과로부터 Platycodin D가 포함된 도라지 추출물이 IL-3의 유전자 발현을 억제함으로써 항원-항체 반응에 의한 탈 과립현상을 억제하여 알러지 작용을 제어하는 가능성을 확인하였다.

• 한국산림과학회지
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• 제96권6호
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• pp.667-675
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• 2007

I-SSR 표지자를 이용하여 영월지역의 줄댕강나무 2개 집단의 유전적 다양성과 공간구조가 조사되었다. 줄댕강나무는 분포가 제한되어있고 집단크기가 작음에도 불구하고 개체 수준에서 추정된 유전변이는 다른 관목류와 유사한 수준으로 판단되었다.(S.I.=0.336, h=0.217). Genet 수준에서 조사된 유전다양성 역시 개체 수준의 값과 큰 차이가 없었다(S.l.=0.339, h=0.219). 전체 유전변이의 약 18.7%가 집단 간 차이로 나타나, 다른 관목류에 비해 다소 높거나 비슷한 수준이었다. $N_G/N$ 값과 Simpson's index로 추정된 유전자형 다양성 역시 다른 관목류에 비해 높았다($N_G/N=0.729$. $D_G=0.988$). 한 genet의 최대직경은 5.5 m로 비교적 작게 나타났다. 높은 수준의 유전자 및 유전자형 다양성과 genet의 작은 직경 크기는, 무성번식이 줄댕강나무 집단의 유전적 구성에 차지하는 비중이 그렇게 크지 않음을 보여주었다. 개체 및 genet 수준에서 큰 차이 없이, 약 12-18 m 거리 내에 분포하는 개체 간에 자기상관성이 인정되었다. 줄댕강나무 집단의 현지외 보전을 위한 표본 추출 시, 연속 분포하는 집단에서는 최소 18m 이상의 간격을 두는 것이 좋고, 소규모 단편으로 분리되어 분포하는 경우 최대한 많은 단편으로부터 표본을 채취하는 것이 효율적일 것으로 판단되었다.