Molecular cloning was carried out on the Danish strain of bovine viral diarrhea virus(BVDV) to construct strategy for the diagnostic tools and effective vaccine of BVD afterwards. A recombinant DNA clone(No. 29) was established successfully from cDNA for viral RNA tailed with adenine homopolymer at 3'-end. $^{32}P$-labeled DNA probes of 300~1,800bp fragments, originating from the clone 29, directed specific DNA-RNA hybridization results with BVDV RNA. Recombinant DNA of the clone 29 was about 5,200bp representing 41.6% of the full length of Danish strain's RNA, and restriction sites were recognized for EcoR I, Sst I, Hin d III and Pst I restriction enzymes in the DNA fragment.
A genomic clone carrying a proteinase inhibitor I sequence was isolated and characterized. The clone contained a 0.7 kb EcoRI fragment hybridized with tomato inhibitor I cDNA. The nucleotide sequence of the EcoRI fragment revealed presence of a truncated form of a proteinase inhibitor I gene of potato. The truncated gene contained the 5' flanking region and the first exon of a functional proteinase inhibitor I gene. Although the 5' flanking region contained the regulatory sequences TATAAA and CCACT, a deletion of 40 bp occurred between them.
최근 3D 애니메이션은 스마트폰, 태블릿PC, 스마트TV 등 새로운 플랫폼이 미디어 환경의 급격한 변화 속에서 애니메이션은 이에 적합한 새로운 콘텐츠를 개발하고 미디어의 전략을 수립해야 하는 상황에 놓여 있다. 동일한 스토리, 캐릭터 소재를 가지고 스마트폰, 태블릿PC, 스마트TV 등 새로운 스마트 미디어의 특성에 맞게 콘텐츠 형식을 다각화하는 개발방법과 새로운 미디어 기술을 기반으로 애니메이션 영상콘텐츠의 개발이 시도되고 있다. 본 연구는 아바타의 3D 동영상 제작 기술인 iClone를 활용하여 아바타를 만들고 의상편집과 모션편집을 통한 3D 애니메이션 제작 방법을 연구하였다.
인삼의 잎, 줄기, 뿌리 절편에 Agrobatriumrhizogenes(stain $A_4$를 접종하여 형질이 전환된 조직(모상근)을 유도, 배양한 후 saponin 고생산능 clones을 선발하였으며, 아울러 형질전환 여부를 dot blot hybridization 과 opine 분석으로 확인하였다. 여러 부위에서 유도된 모상근은 모두 암조건의 MS 배지에서 활발히 생장하였으며, 이들 중 HB3 clone을 이용하여 동질화딘 모상근 clon으로 배양한 후 saponin 고생산능 clon을 선발한 결과 HB2-10 clone이 최대의 생장을 보였으며 총 saponin함량은 0.55wt%로 나타났다. 그러나 총 saponin함량이 가장 높은 clone은 비교적 생장이 느린 HB3-2 clone이었으며 0.74wt%의 함량을 나타내었다. 아울러 dot blot hybridization 결과 Ri-T-DNA가 식물체의genome 내로 삽입되어 있었으며, opine확인결과 모든 모상근 clone으로부터 argropine과 mannopine이 검출되었다.
한국의 6개 지역에서 채집한 흰넓적다리붉은쥐(Apodemus peninsulae p peninsulae)를 사용하여. 8개 제한효소로 절단한 미토콘드리아 DNA(mtDNA) 의 단펀들을 분석하였다. 총 29개의 절단단편들이 나타났고. 7개 mtDNA의 clone이 밝혀졌다. 이들 m mtDNA clone간의 nucleotide-sequence divergence(p)는 0.42-2.01%였으 며, 이들은 평균 divergence가 1. 52%인 3개 소군으로 나뒤어졌다. 한 소군은 3 개 clone으로써 3개 지역의 18마리(청주 16. 소백산 1. 설악산 1)였고, 다른 한 소군은 3개 clone으로 4개 지역의 8p1-리(청주 2. 월악산 2. 가야산 2. 해남 2)였 다 나머지 한 소군은 1개 clone으로 청주의 2마리였다. 뿐만아니라, 이들 3개 소 군은 Stu I의 genotype에 있어서 서로 뚜렷한 차이를 보였고, 전자의 2개 소군과 마지막 소군과는 Pvu II의 genotype이 달랐다. 이들 뚜렷한 mtDNA 소군의 분류학적 위치를 규명하기 위하여 한국내 여러지역 의 더 많은 표본들을 사용한 계속적인 연구가 필요하다고 본다.
JI SANG CHUN;KIM DOCKYU;YOON JUNG-HOON;OH TAE-KWANG;LEE CHOONG-HWAN
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제16권1호
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pp.153-157
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2006
A soil metagenomic library was constructed using an E. coli-fosmid cloning system with environmental DNAs extracted from Kwangreung forest topsoil. We targeted the genes involved in the biosynthesis of bacterial polyketides. Initially, a total of 36 clone pools (10,800 clones) were explored by the PCR-based method using the metagenomic DNAs from each pool and a degenerate primer set, which has been designed based on the highly conserved regions among ketoacyl synthase (KS) domains in actinomycete type I polyketide synthases (PKS Is). Six clone pools were tentatively selected as positive and further examined through a hybridization-based method for selecting a fosmid clone containing PKS I genes. Colony hybridization was performed against fosmid clones from the 6 positive pools, and finally 4 clones were picked out and confirmed to contain the conserved DNA fragment of KS domains. In this study, we present a simple and feasible sorting method for a desired clone from metagenomic libraries.
Park, Ui-Sun;Choi, Kwan-Sam;Kim, Kab-Sig;Kim, Nam-Won;Choi, Kwang-Tae
Journal of Ginseng Research
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제19권1호
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pp.56-61
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1995
Molecular cloning and restriction mapping on ATPase $\alpha$-subunit gene (atpA) were carried out to obtain genomic information concerned with the gene structure and organization in Korean ginseng mitochondria. Two different clones containing the homologous sequence of atpA gene were selected from SalI and PstI libraries of mitochondrial DNA (mtDNA) of Korean ginseng. The sizes of mtDNA fragments inserted in SalI and PstI clones were 3.4 kb and 13 kb, respectively. Southern blot analysis with [$^{32}P$] labelled Oenothera atPA gene probe showed that atpA gene sequence was located in 2.0 kb XkaI fragment in PstI clone and in 1.7 kb XbaI fragment in SalI clone. A partial sequening ascertained that the SalI clone included about 1.2 kb fragment from SalI restriction site to C-terminal sequence of this gene but about 0.3 kb N-terminal sequence of open reading frame was abscent. The PstI fragment was enough large to cover the full sequence of atpA gene. The same restriction pattern of the overlapped region suggests that both clones include the same fragment of atiA locus. Data of Southern blot analysis and partial nucleotide sequencing suggested that mtDNA of Korean ginseng has a single copy of atpA gene. Key words ATPase a-subunit, mitochondrial DNA, Panax ginseng.
전위유전자 표지를 이용한 2배체 야생근연종 감자의 유용 유전자 cloning 체계를 개발하기 위하여 옥수수의 진위유전자 Ac를 조작하여 전위효소는 생산하나 이동은 불가능하도록 제작된 immobilized Ac (iAc)와 자체 이동은 불가능하나 iAc의 작용에 의해 이동이 가능한 Ds를 Agrobacterium tumefaciens를 이용한 형질전환에 의해 2배체 근연종 감자 (Solanum tuberosum Group Phureja) 계통 1.22에 도입하였다. iAc및 Ds 삽입 binary vector들을 보유하는Agrobacterium 계통들로 형질전환 처리된 1.22 기내배양신초의 잎과 줄기 절편의 경우 50mg/L 의 kanamycin이 첨가된 배지에서도 캘러스를 형성하였으며, 잎 절편으로부터 재분화신초가 획득되었다. 형질전환 처리되지 않은 1.22 신초는 100mg/L의 kanamycin이 첨가된 배지에서 전혀 발근이 되지 않았으나, 형질전환 처리에 의해 획득된 재분화 신초는 동일 배지에서 발근이 되었다. iAc와 Ds의 염기배열에 대해 특이적인 oligonucleotide primer들을 이용하여 형질전환 처리 획득 식물들로부터 추출된 DNA에 대한 PCR분석을 실시한 결과, 사용된 primer들의 iAc 와 Ds의 염기배열에 있어서의 위치에 의해 예상되는 크기의 DNA들이 형성되어 iAc 와 Ds의 1.22 genome내 도입이 확인되었다.
We characterized a cDNA clone for a low molecular weight heat-shock protein (LMW HSP) from tobacco named TLHS-l. Nucleotide sequence determination of TLHS-1 identified an open reading frame for 159 amino acids. To the upstream of the open reading frame, a sequence of 124 nucleotides was determined. To the 3' downstream of the open reading frame, 212 nucleotides were identified which carried poly(A)-tail. Comparison of the open reading frame and hydropathy plot of TLHS-1 with the previously reported class I LMW HSPs showed high identity which classified TLHS-1 as a class I LMW HSP cDNA clone. We proposed that there are six consensus regions in class I LMW HSPs. RNA blot hybridization for TLHS-1 showed a typical expression pattern of heat-shock-inducible gene from three common tobacco cultivars. The open reading frame of TLHS-1 was overexpressed in Escherichia coli. TLHS-1 protein confers thermal protection of other proteins in vitro and in vivo. Thermal induced aggregation of citrate synthase was reduced by purified TLHS-1 protein, and thermal death rate at $50^{\circ}C$ was reduced in E. coli expressing TLHS-l. From these data, we can expect that TLHS-1 acts as a molecular chaperone.perone.
The efficiency of in vitro regeneration of four clones of Populus euramericana, Canada blanc, Eugenii, I-45/51, and Wisconsin #5, was examined. Cytokinins and the combinations with auxins affected the rate of regeneration from the explants of root segments, stem internodes, and leaf discs. Overall, BA and the combination with auxins were effective in root segments and leaf discs of the Canada blanc clone, whereas zeatin and the combination with auxins were important in stem internodes of the Wisconsin #5 clone. The highest number of shoots averaging 17.6 $\pm$ 0.47 from root segments in the Canada blanc clone,18.2 $\pm$ 3.0 from stem internodes in the Wisconsin #5 clone, and 17.8 $\pm$ 1.92 from leaf discs in the Canada blanc clone were obtained with 2.0 mg/1 BA, 2.0 mg/l zeatin combined with 0.2 mg/l IAA, and 0.5 mg/l BA combined with 0.05 mg/l 2,4-D, respectively. In particular, the addition of 2,4-D into cytokinin medium promoted shoot proliferation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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