A rapid and economical method of simultaneous extraction of DNA and RNA from seaweeds has been developed by the use of lithium chloride. Lithium chloride facilitates the softening of cell walls resulting in a decrease in both compressive and tensile modulus of elasticity. The DNA was characterized by high molecular weight larger than 27 kb and a relative lack of carbohydrate and protein contamination. The DNA and RNA extracted by the method from many seaweeds were of sufficient quality to be used as a template for per amplification with a plant intergenic gene primer set, for RAPD analysis with arbitrary primers, and for differential display with arbitrary primers in the morphologically distinct regions of the matured Porphyra thallus. The cDNA polymorphism indicated that the reproductive tissue types (male, female, patch) had a relatively high degree of similarity; the vegetative tissue types (dividing, non-dividing) also showed a similar pattern with respect to each other. Holdfast tissue had very low similarity with the other tissues, but appeared most similar to vegetative non-dividing tissue type.
During a survey of marine algal flora, a red algal species was collected from Giseong, Uljin located on the eastern coast of Korea. This species has the generic features of Cryptonemia belonging to Halymeniaceae, and is characterized by the presence of erect foliose thalli arising from a discoid holdfast, somewhat fan-shaped blade with an evanescent midrib at the base, narrow main axes with blade-like wings of slightly undulate margin, a perennial stalk, and entwined filamentous medulla with refractive stellate cells. In a phylogenetic tree based on rbcL sequence, the Korean alga nests in the same clade with C. lomation from France and C. seminervis from Spain. Genetic divergence among the sequences within the clade was not recognized thus suggesting that both the species are conspecific. The name C. lomation considered to be valid nomenclaturally is accepted for the entity. Based on the morphological and molecular analyses, the Korean alga is identified as C. lomation, originally described from Italy. This confirms the occurrence of C. lomation in Korea. The species appears to be distributed in the temperate region influenced more or less by the North Korea Cold Current.
Oh, Soon-Ok;Wang, Xin Yu;Wang, Li Song;Liu, Pei Gui;Hur, Jae-Seoun
Mycobiology
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v.42
no.3
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pp.229-240
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2014
On the basis of extensive field investigation and a series of herbarium specimen identifications, we present and discuss the descriptions and distribution of 22 species of Ramalina found in the Hengduan Mountains of southwestern China. In this revisionary study, representatives of the Ramalina genus, including R. americana, R. confirmata, R. dendriscoides, R. obtusata, R. pacifica, R. pentecostii, R. peruviana, R. shinanoana, and R. subcomplanata are found for the first time in this area. In addition, R. holstii is reported for the first time China. Finally, a newly described species identified as Ramalina hengduanshanensis S. O. Oh & L. S. Wang is reported. It is characterized as growing from a narrow holdfast, solid, sparsely or richly and irregularly dichotomously branched, palmate and flattened lobes with distinctly dorsiventral appearance, surface rugose to reticulate, surface rugosely cracked, dense chondroid tissue, helmet shaped soralia at the tip. The species grows on rock and tree at the highest elevations in this area. Although very few lichen species belonging to the genus Ramalina have been collected above 4,000 m, this new species is found at this elevation. We present detailed morphological, anatomical, and chemical descriptions of this species along with molecular phylogenetic analysis of the internal transcribed spacer rDNA sequences.
Concentrations of Al, As, Cd, Co, Cr, Cu, Fe, Mn, Ni, Pb, Zn were determined in four arctic brown algae (Laminaria saccharina, L. digitata, Alaria esculenta, Desmarestia aculeata) in an attempt to examine for their metal accumulation capacity and also to assess their contamination levels. Macroalgae were collected from shallow subtidal waters (<20m) of Kongsfjorden (Kings Bay) on Spitsbergen during the period of the late July to early August 2003. Metal concentrations highly varied between sampling sites, species and tissue parts. Input of melt-water laden with terrigenous sediment particles seemed to have a large influence on baseline accumulations of some metals (Al, Fe, Mn, Pb etc.) in the macroalgae, causing a significant spatial variation. There were also significant concentration differences between the young and old tissue parts in L. saccharina, L. digitata and A. esculenta. While Al, Fe, Mn, Pb were higher in the perennial parts (stipes and holdfast below meristematic region), Cd and As concentrations were significantly higher in the young blades above the meristematic region. Zn and Cr, on the other hand, showed little differences between the tissue parts. The highest metal concentrations were found in D. aculeata, which seems to be due to its filamentous fine branches leading to high surface/volume ratios. The lowest concentrations were found in the two Laminaria spp., the blades of which are thicker than D. aculeata and A. esculenta. No distinct signs of contamination were detected in the brown algal species analyzed. Added to this, the results of the present studies suggest the potential utility of L. saccharina, L. digitata and A. esculenta as biomonitors for metal pollution monitoring in this area.
Garbary, David J.;Beveridge, Leah F.;Flynn, Andrea D.;White, Katelyn L.
ALGAE
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v.27
no.1
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pp.33-42
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2012
Population ecology of Palmaria palmata is described from the intertidal zone of Digby Neck and adjacent islands of Nova Scotia. The primary objectives were: to evaluate the difference in habitat specialization and population structure of P. palmata between harvest and non-harvest shores, and to characterize differences in thallus structure and frond sizes between epilithic and epiphytic populations. Harvest shores were gently sloping boulder fields with boulders typically about 0.5-1.0 m with dense cover of P. palmata on many of the rocks. Non-harvest shores (with or without P. palmata) consisted of boulders that were smaller or larger than harvest shores, or bedrock; when P. palmata was present on nonharvest sites it was typically epiphytic on other algae (e.g., Fucus spp., Mastocarpus stellatus, Devaleraea ramentacea). Harvestable epiphytic populations occurred only in high current areas. While there was little difference in average cover of P. palmata harvest and non-harvest shores ($31.2{\pm}13.7%$ vs. $19.4{\pm}7.3%$, mean ${\pm}$ standard deviation [SD]), the cover of P. palmata on harvest shores was highly skewed such that individual boulders often had >90% cover while adjacent rocks had little. Frond length of large fronds was greater on harvested shores, and mean frond density ($g\;m^{-2}$) was three times higher than the mean density on the non-harvested shores. Frond lengths of entire epiphytic and epilithic frond complements of 119 thalli from harvest beaches showed no difference in mean size of the largest fronds, and no difference in frond number per holdfast when epiphytic and epilithic thalli were compared.
Hwang, Eun Kyoung;Yoo, Ho Chang;Kim, Se Mi;Yoo, Hyun Il;Baek, Jae Min;Park, Chan Sun
Korean Journal of Environmental Biology
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v.32
no.4
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pp.306-310
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2014
The brown seaweed Sargassum fusiforme is an edible and highly valued in Korea. During the summer season, phytal organisms graze heavily on young algal blades and holdfastsof the species and substantially reduce harvestable biomass. Here, in this study, we investigated the effects of pH (range: 2~13) and salinity (range: 0~44 psu) on the removal of two major phytal animals, Caprella scaura and Gammaropsis utinomi, associated with S. fusiforme. We also examined the optimum quantum yield (Fv/Fm) of algae in the same experimental conditions to quantify the tolerance of algae to acid and salinity treatments. It was observed that the phytal animals showed more than 80% mortality at pH lower that pH 4 and the extreams of salinity (0~10 psu and 44 psu) after a 5 min of immersion. However, the quantum yield of S. fusiforme was not significantly different from controls within the pH 3~11 range, and the 0~44 psu salinity range. Precisely, if the pH and salinity conditions outside these ranges were used in comercial Sargassum culture, the removal of the animal species would be higher, but with reduced quantum yield of algae. Taken together, our study results indicated that the pH and salinity treatments could allow multiple harvests from the same holdfast of S. fusiforme.
We report a species of diplostomid fluke recovered from 3 carcasses of wild Korean raccoon dog, Nyctereutes procyonoides koreensis, in Korea. A total of 107 diplostomid flukes were recovered from the small intestines of Korean raccoon dogs, which were obtained from the Gangwon Wildlife Medical Rescue Center. Worms fixed with 10% neutral formalin were subjected to microscopic observation and those fixed in 70% ethanol were used for molecular genomic analysis. The worm was divided into 2 separate parts, forebody and hindbody, with a total length of 3,020-4,090 (3,855) ㎛ and a width of 1,210-1,770 (1,562) ㎛. The boat-shaped forebody has a pair of characteristic tentacular appendage, 2 suckers, holdfast organ, and vitelline follicles. The oval to cylindrical hindbody has reproductive organs. The ovary was round or elliptical and located in the anterior of the testes. Two large testes were slightly segmented and tandemly arranged, occupying almost half of hindbody. The short uterus contained a relatively small number of unembryonated eggs sized 130-140×85-96 ㎛. The partial sequence of 18S rRNA of this fluke was consistent with Alaria alata. Based on the morphological and molecular characteristics, the diplostomid flukes recovered from the small intestine of Korean raccoon dogs were identified as A. alata (Digenea: Diplostomidae).
This study examines a business survey on the utilization of fishery by-products with the aim to assess the feasibility of incorporating these by-products into various industries. The research involved surveying 312 biocompanies across the country and conducting an empirical analysis based on the collected data. South Korea, a leading seafood-producing country with a developed seafood processing industry, provides conditions necessary to utilize seafood by-products as raw materials for the marine bioindustry. Among the surveyed biocompanies, 38.5% expressed their intention to engage in industrial activities involving the use of fishery by-products in the future, indicating a significant level of interest within the bioindustry in utilizing marine and fishery by-products. Companies showed interest in diverse materials, such as scales, fish bones, skin, and kelp holdfast beyond those currently defined under the Fisheries By-products Recycling Promotion Act (officially unnamed, 2021). This suggests a need for improvements in the regulatory framework to accommodate these diverse biomaterials. Furthermore, we propose enhancing the efficiency of fishery by-product utilization by focusing on regional specialization in marine bioindustry. This involves utilizing existing legal framework for upcycling fishery by-products and fostering a regionally specialized marine bioindustry.
Recently an unknown microbial desease and some parasitic crustaceans are prevailing in the sea-weed farms of Uudaria pinnatifida along the south-eastern coast of Korea.(1) Green spots probably caused by the microbial pathogens were found on the fronds of Undaira Pinnatifide. Particularly they were densely distributed on the distal half of the fronds. The tissues of the green spot area rot off, and small holes with green colored margin are formed. The holes at the distal part of the fronds are enlarged and they finally coalesced each other. Then this process accelerates decaying of the distal ends of the fronds.. The fronds growing in the central part of the farms are usually severely damaged, whereas in the marginal area of the farm toward the open sea side the damage is less serious. An examination revealed that the deseased fronds bore a number of viable bacteria, $6.8\times10^5\;to\;1.2\times10^6$ per gram at $15^{\circ}C$, whereas the healthy fronds $1.1\times10^4$. Twenty-six kinds of colonies, 247 strains of bacteria, were isolated from deseased fronds, belonging to Moraxella, Achromobacter, Vibrio, Flavobacterium, Acinetobacter, Pseudomonas, etc. (2) Pinholes occurred in one series on the frond. They were probably caused by a harpacticoid copepod, Thalestris sp. Seven years ago when the disease was first found to occur the copepod was observed on the fronds from March of the year. Recently, however, they have been found as early as December of the previous year. (3) A gammarid amphipod, Ceinina iaponica, invades the pith of the midrib through holdfast of thalli. This rarely causes the longitudinal seperation of the entire frond through the midrib as they bore a tunnel in the pith. Sometimes holdfasts of tile heavy damaged thalli make the frond departed from the substrate.
Kim, Young-Dae;Lee, Ju;Son, Yong-Soo;Choi, Jae-Seok;Kim, Dong-Sam;Hong, Yong-Ki
Journal of Life Science
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v.14
no.2
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pp.331-338
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2004
Growth and sexual differentiation of the seaweed Porphyra pseudolinearis Ueda have been investigated monthly in the intertidal zone of the East Sea, Korea. Young blades of P. pseudolinearis appeared at the beginning of October. Carp os pores were released at the end of November immediately after carposporangia formation. Then the thalli of P. pseudolinearis were extinguished at the end of March. Young thalli were budded through the stages of conchocelis and conchospore. Thalli showed lanceolate type in shape, cordate type in holdfast, absence of microscopic spinulate process and sexual generation. Ratios of length to width in female thalli ranged from 5.6 to 7.4 at the maturation in December and slightly decreased 3.3 to 4.8 in January and 4.9 to 7.3 in December while the ratios of male thalli ranged from 4.2 to 4.8 in January. On October 12, average five individuals were obsered in a quadrate (30 cm ${\times}$ 30 cm), 238$\pm$18 individuals for the maturation stage in December and then it was reduced to 150 individuals in February and 15 individuals in March. Average sex ratios for female, male and vegetative thalli were 31.3% 46.9% and 21.9% respectively in early December, the beginning time of sex maturation. The sex ratio of female and male thalli in December 17, changed to 69.4%, 30.6% respectively.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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