• BMB Reports
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• 제29권5호
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• pp.429-435
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• 1996

To investigate the structure-antagonistic relationship of the cyclohexapeptide L-659,877, a selective NK-2 tachykinin receptor antagonist, seven analogues were chemically synthesized by a solid phase method. The agonistic and antagonistic activities of the analogues were evaluated by contraction assay using the smooth muscle of guinea pig trachea (GPT) containing the NK-2 receptor. It was shown that the aromatic ring of Phe at position 3 and the sulfur group of Met at position 6 in L-659,877 were essential for binding to the NK-2 receptor. Decrease in antagonistic activity of L-659,877 caused by substituting Leu for Nle at position 5 indicates that the ${\gamma}$ methyl group and side chain length of Leu plays an important role in its antagonistic action. Although the activity was slightly lower than L-659,877, cyclo $[{\beta}Ala^{8}]NKA(4-10)$ (analogue 1) showed potential antagonistic activity for the NK-2 receptor. It was confirmed that the expansion of the ring in L-659,877 by substitution of ${\beta}Ala$ for Gly at position 4 stabilized its conformation monitored by CD spectra. The results suggest that analogue 1 can be used as a new leader compound to design a more powerful, selective, and stable NK-2 receptor antagonist.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제33권11호
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• pp.3601-3606
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• 2012

Structural properties of a small hexapeptide molecule modeled after metal-binding siderochrome immersed in a room-temperature ionic liquid (RTIL) are studied via molecular dynamics simulations. We consider two different RTILs, each of which is made up of the same cationic species, 1-butyl-3-methylimidazolium ($BMI^+$), but different anions, hexafluorophosphate ($PF_6{^-}$) and chloride ($Cl^-$). We investigate how anionic properties such as hydrophobicity/hydrophilicity or hydrogen bonding capability affect the stabilization of the peptide in RTILs. To examine the effect of peptide-RTIL electrostatic interactions on solvation, we also consider a hypothetical solvent $BMI^0Cl^0$, a non-ionic counter-part of $BMI^+Cl^-$. For reference, we investigate solvation structures in common polar solvents, water and dimethylsulfoxide (DMSO). Comparison of $BMI^+Cl^-$ and $BMI^0Cl^0$ shows that electrostatic interactions of the peptide and RTIL play a significant role in the conformational fluctuation of the peptide. For example, strong electrostatic interactions between the two favor an extended conformation of the peptide by reducing its structural fluctuations. The hydrophobicity/hydrophilicity of RTIL anions also exerts a notable influence; specifically, structural fluctuations of the peptide become reduced in more hydrophilic $BMI^+Cl^-$, compared with those in more hydrophobic $BMI^+PF_6{^-}$. This is ascribed to the good hydrogen-bond accepting power of chloride anions, which enables them to bind strongly to hydroxyl groups of the peptide and to stabilize its structure. Transport properties of the peptide are examined briefly. Translations of the peptide significantly slow down in highly viscous RTILs.

• 대한미생물학회지
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• 제22권2호
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• pp.167-174
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• 1987

N-myc, a DNA sequence related to the oncogene c-myc, was found to be amplified in untreated primary neuroblastomas and the amplification appeared to be associated with advanced disease at diagnosis and rapid tumor progression. Synthetic peptides have been useful immunogens for generating antisera and monoclonal antibodies to a number of native proteins. In order to identify myc-related protein in the tumor cells, an antiserum against a synthetic hexapeptide (-Glu-Asp-Ile-Trp-Lys-Lys-), whose sequence corresponds to a part of the exon 2 of oncogene N-myc, was prepared by immunizing a rabbit with BSA-conjugated peptide. After ammonium sulfate precipitation and affinity column chromatography, it appeared to be specific to the peptide. Strong nuclear staining in immunoperoxidase method using this serum was observed in both human promyeloid leukemic cell line, HL-60(containing high c-myc copy number), and human neuroblastoma cell line, LA-N-5 (containing high N-myc copy number), whereas LA351 (human lymphoid cell line) cells did not react with the serum. This reaction was completely abrogated by incubating the antiserum with soluble excess peptide. These data suggest that the protein encoded by N-myc could be localized in the nucleus as c-myc protein and this antiserum can be used to detect myc-related tumor cells in clinical samples and to determine if the N-myc expression correlates with genomic amplification in cell lines, untreated primary tumors, and untreated metastases.

• 대한화학회지
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• 제36권4호
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• pp.523-535
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• 1992

ECEPP/2 및 MM2 방법을 이용하여 고리형 헥사펩티드의 형태 및 알칼리 금속 양이온과의 착물형성 그리고 DPH에 의한 양이온 전달방해를 이론적으로 살펴보았다. 착물을 형성하지 않은 고리형 펩티드에 대하여 여러 가지 안정한 형태가 얻어졌으며, 대부분의 아미드 수소원자는 카르보닐 산소와 분자내 수소결합을 이루고 있어 조밀한 구조를 나타내었다. 펩티드와 Na$^+$ 이온 및 DPH간의 착물형성에너지는 각각 -60kcal/mol 및 -18kcal/mol이었다. 그러나 헥사펩티드의 국부최소에너지 구조들에는 금속 양이온을 결합할 수 있는 공동이 존재하지 않았고 공동이 존재하는 헥사펩티드의 에너지는 본 연구의 최저에너지 구조보다 10kcal/mol 정도 높은 에너지를 주었으며, 이러한 에너지 차이와 금속 양이온의 탈수 과정을 고려하면 DPH에 의한 양이온 전달방해를 설명할 수 있었다. 또한 DPH와 결합하는데 있어서의 가장 중요한 아미노산 잔기는 글리신이었으며 이를 사코신(N-메틸 글리신) 으로 치환할 때 양이온 전달이 저해되는 실험적 사실을 설명할 수 있었다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제46권1호
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• pp.107-114
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• 2004

본 연구는 우둔 단백질에서 분리한 헥사펩타이드, VLAQYK의 자연발증 고혈압쥐의 혈압, 중성 지질, 그리고 콜레스테롤에 미치는 영향을 알아보기 위해 실시하였다. 헥사 펩타이드는 in vitro에서 138.34${\mu}\ell$/ml의 $IC_{50}$ 값을 보였던 것으로 농축하여 체중 kg당 각각 0.2g, 0.5g, 1.0g의 농도가 되도록 스테인레스 존데를 이용하여 경구투여한 후 혈압의 변화와 지질 수준을 살펴보았다. 실험기간동안 사료의 섭취량의 변화는 대체로 대조구와 처리구 사이에 크게 나타나지 않았지만 8주차에 이르러서는 대조군보다 세 처리구 모두 사료의 섭취량이 22 ${\sim}$ 24%로 감소하였다. 실험기간 동안 랫트의 체중의 변화는 비교적 저속적으로 증가하였지만 사료섭취에 대한 체중의 증가는 일정한 수준을 유지하여 경구 투여한 펩타이드에 대한 체중 증가는 없었다. 체내 중요 기관의 중량을 측정한 결과 대조군에 비해 간, 염통은 큰 변화가 없었으나 신장과 비장, 고환의 중량은 약간의 차이를 보였다. 신장의 중량은 0.2g과 0.5g의 헥사펩타이드 처리군에서 대조군보다 감소하였으며(P < 0.001), 비장은 대조군보다 오히려 중량이 증가 하였고(P < 0.05), 고환도 대조군보다 처리에 따라 중량의 증가를 보였다(P < 0.05). 헥사펩타이드를 체중 kg당 10.g의 농도로 투여한 군은 3주가 되자 대조군의 혈압보다 - 55.9mmHg로 저하되어 가장 강한 혈압 저하율을 보였으나(P < 0.05) 그 이루호는 6주째에 체중 kg당 0.2g의 농도로 투여한 구가 가장 높은 혈압 저하율을 보였다(P < 0.05). 실험 종료 후의 혈액내 총 콜레스테롤 함량은 0.2g, 0.5g, 1.0g의 헥사펩타이드의 모든 처리군에서 각각 대조군보다 25.4%, 23.5%, 23.7% 수준으로 더 낮은 농도를 보였다(P <0.001). 성인병 발병의 원인인 중성지질의 함량도 처리량에 따라 유의적으로 감소하여 113.3 ${\pm}$ 1.5mg 이었던 중성지방이, 0.5g/kg B.W의 헥사펩타이드 급여군에서는 93.6 ${\pm}$ 2.5mg의 수준으로 . 감소함을 보였다. 하지만 1.0g/kg B.W.의 헥사펩타이드의 급여군에서는 중성지질의 함량이 108.3 ${\pm}$ 1.5mg으로 증가하였다. 반면, HDL 콜레스테롤 함량은 대조군보다 모든 처리군에서 감소하는 경향을 보였으나 처리군 사이에서는 유의차를 보이지 않았다(P < 0.05). LDL 콜레스테롤 함량은 대조군바다 처리량에 따라 유의적으로(P <0.001) 감소하여 대조군에서 61.3 ${\pm}$ 1.7 이었던 것이 1.0gcjflrns에서는 36.4 ${\pm}$ 1.4mg의 함량으로 큰폭으로 감소하였음을 나타내었다. 본 연구의 결과를 종합하면, in vitro 상에서 ACE 억제 효과가 있었던 헥사펩타이드는 in vivo 상에서 농도 의존적인 혈압저하 효과를 보이지 못했지만 실험 개시후 3주에 가장 높은 혈압저하 수준을 보였고, 성인병의 발병지표로서 사용되는 LDL 콜레스테롤의 함량을 40.6%감소시켰다.