The bacterium Sphingomonas chungbukensis DJ77 produces the extracellular polysaccharide gellan in high yield. Gellan produced by this bacterium is widely used as a gelling agent, and the enzyme UDP-glucose pyrophosphorylase (UGP) is thought to play a key role in the gellan biosynthetic pathway. The UGP gene has been successfully cloned and over-expressed in E. coli. The expressed enzyme was purified with a molecular weight of approximately 32 kDa, as determined by a SDS-polyacrylamide gel, but the enzyme appears as ca. 63 kDa on a native gel, suggesting that the enzyme is present in a homodimer. Kinetic analysis of UDP-glucose for UGP indicates $K_m$ = 1.14 mM and $V_{max}$ = 10.09 mM/min/mg at pH 8.0, which was determined to be the optimal pH for UGP catalytic activity. Amino acid sequence alignment against other bacteria suggests that the UGP contains two conserved domains: An activator binding site and a glucose-1-phosphate binding site. Site-directed mutagenesis of Lys194, located within the glucose-1-phosphate binding site, indicates that substitution of the charge-reversible residue Asp for Lys194 dramatically impairs the UGP activity, supporting the hypothesis that Lys194 plays a critical role in the catalysis.
Kim, Ki-Chan;Lee, Seung-Don;Han, Ju-Hee;Sohng, Jae-Kyung;Liou, Kwang-Kyoung
한국생물공학회:학술대회논문집
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한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
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pp.749-754
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2000
알려진 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase의 amino acid 서열로 부터 primer를 제작하여 내열성 균주인 Thermus caldophilus GK24에서 colony hybridization 과정을 거쳐 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase를 포함하는 cosmid DNA를 얻었다. 유전자 분석을 위해 cosmid DNA를 subclone 하여 작은 크기로 분리하였다. 분리된 cosmid를 pSMTC-1 으로 명명하고 pSMTC-1를 BamHI으로 반응시켜 BamHI 단편 모두를 pGEM 7(+)를 이용하여 subclone 하였다. 각각의 이름은 크기에 따라 pKCB10(1.2kb-BamHI), pKCB20(1.6kb-BamHI), pKCB30(2.Ikb-BamHI), pKCB40(2.5kb-BamHI), pKCB50(2.5kb-BamHI), pKCB60(2.7kb-BamHI), pKCB70(3.4kb-BamHI), pKCB80(4.4kb-BamHI), pKCB90(7.0kb-BomHI) 으로 명명하였다. 각각의 subclone된 유전자를 분석하기 위해 Erase-a-base 방법을 이용하여 template를 준비하였고 이를 자동 염기서열 분석기를 이용하여 염기서열을 분석하였다. 염기서열분석 결과 pKCB80(4.2kb)에 dTDP-D-glucose synthase(orfA) 유전자를 비롯하여 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase(orfB), orfC (dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase) 그리고 orfD(dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase)와 유사한 유전자들이 있음이 확인 되었고 dTDP-L-rhamnose의 생합성 과정을 예상할 수 있었다.
Changes in the phosphorylation of Chlorella cells during the life cycle the aulotrophic and micotrophic synchronous culture were followed under the light and dark. 1. In the autotrophic culture of Chlorella the amounts of esterified phosphate compounds of the algal cell under the light increased during the growing period and decreased strikingly in the ripening period showing a peak at the $L_1$ i/-cell stage. 2. TRhe amount of total esterified phosphate compounds of the cell under the dark, however, decreased during the growing period and then kept fairly constnat during the ripening nad division periods showing the greates activity of the oxidative phosphorylation in the early growing stage. 3. It is presumed that the energy requirement of the dividing algal cell in the autotrophic culture is fulfilled prior to the nuclear division mostly by the photosynthetic phosphorylation. 4. In the mixotrophic culture, the amount of esterified phosphate compounds of the algal cells under the light increased during the growing period and decreased during the late ripening and early division periods showing a peak in the $L_2$-cell stage as in the case of the phosphorylation under the dark. 5. The phosphorylation of the fell grown in the glucose medium is more active under the dark than under the light in the stages of the growing and early ripening periods. 6. It is considered that the excess glucose in the algal cell not only promotes the oxidative phosphorylation but also inhibits the photosynthetic phosphorylation of the cell. 7. It is presumed that the energy requirement of the dividing algal cell in the glucose medium is fulfilled prior to the nuclear division by the combined action of oxidative and photosynthetic phosphorylation, mostly by the oxidative phosphorylation.
Corynebacterium glutamicum is one of the well-studied industrial strain that is used for the production of nucleotides and amino acids. Recently, it has also been studied as a possible producer of organic acids such as succinic acid, based on its ability to produce organic acids under an oxygen deprivation condition. In this study, we conducted the optimization of medium components for improved succinate production from C. glutamicum under an oxygen deprivation condition by Plackett-Burman design and applied a response surface methodology. A Plackett-Burman design for ten factors such as glucose, ammonium sulfate, magnesium sulfate, potassium phosphate ($K_2HPO_4$ and $KH_2PO_4$), iron sulfate, manganese sulfate, biotin, thiamine, and sodium bicarbonate was applied to evaluate the effects on succinate production. Glucose, ammonium sulfate, magnesium sulfate, and dipotassium phosphate were found to have significant influence on succinate production, and the optimal concentrations of these four factors were sequentially investigated by the response surface methodology using a Box-Behnken design. The optimal medium components obtained for achieving maximum concentration of succinic acid were as follows: glucose 10 g/l, magnesium sulfate 0.5 g/l, dipotassium phosphate ($K_2HPO_4$) 0.75 g/l, potassium dihydrogen phosphate ($KH_2PO_4$) 0.5 g/l, iron sulfate 6 mg/l, manganese sulfate 4.2 mg/l, biotin 0.2 mg/l, thiamine 0.2 mg/l, and sodium bicarbonate 100 mM. The parameters that differed from a normal BT medium were glucose changed from 40 g/l to 10 g/l, dipotassium phosphate ($K_2HPO_4$) 0.5 g/l changed to 0.75 g/l, and ammonium sulfate ($(NH_4)_2SO_4$) 7 g/l changed to 0 g/l. Under these conditions, the final succinic acid concentration was 16.3 mM, which is about 1.46 fold higher than the original medium (11.1 mM) at 24 h. This work showed the improvement of succinate production by a simple change of media components deduced from sequential optimization.
Cellulomonas sp. CS1-1 생성의 $\beta$-glucosidase는 cell-bound 효소이었으며, Avicelase와 Carboxymethyl-cellulase (CMCase)는 extracellular 효소로 존재함을 확인하였다. Cellobiose나 CMC 최소배지에서의 균의 생장은 cellobiose보다 glucose 첨가시에 현저히 증가하였다. Cellobiose나 CMC 최소배지에서의 $\beta$-glucosidase 생합성은 glucose 첨가로 현저히 억제되었으나, CMC 최소배지에 cellobiose를 첨가하였을 경우, glucose에 의한 억제 효과와는 반대로, 효소의 생성은 오히려 촉진되었다. 그 외의 탄소원에 관한 영향을 조사한 결과 CMC, 전분, maltose 등의 첨가도 glycerol, arabinose, xylose, trehalose의 첨가시 보다 효소의 생성이 증가되었다. 이상의 결과로 $\beta$-glucosidase 생합성은 glucose에 의하여 catabolite repression을 받았으며, cellobiose, CMC, starch등은 다른 당류보다 효소생성을 현저히 유도하였으므로, 이 효소는 inducible enzyme임을 알 수 있었다. 효소생성에 미치는 질소원을 조사한 결과는 yeast extract가 peptone이나 ammonium sulfate보다 효소생성을 증가시켰다. 효소의 특성을 조사한 결과, 50mM MgCl$_2$가 포함된 10mM potassium phosphate buffer (pH 7.0)에서 효소의 역가가 증가하였고, 최적 pH는 6.0이었고 최적온도는 42$^{\circ}C$ 이었다. p-nitrophenyl-$\beta$-D-glucoside의 농도에 대한 glucose의 Km값은 0.265mM 이었고 $\beta$-D(+)-glucose에 대한 Ki값은 9.0 mM 이었다.
Glucose is universal and essential fuel of energy metabolism and in the synthesis pathways of all mammalian cells. Glucose is the one of the major precursors of lactose synthesis using glycolysis result in producing milk fat and protein. During the milk fat synthesis, lipoprotein lipase (LPL) and CD36 are required for glucose uptake. Various morecules such as acyl-CoA synthetase 1 (ACSL1) activity of acetyl-CoA synthetase 2 (ACSS2), ACACA, FASN AGPAT6, GPAM, LPIN1 are closely related with milk fat synthesis. Additionally, glucose plays a major role for synthesizing lactose. Activations of lactose synthesize enzymes such as membranebound enzyme, beta-1,4-galactosyl transferase (B4GALT), glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) are changed by concentration of glucose in blood resulting change of amount of lactose production. Glucose transporters are a wide group of membrane proteins that facilitate the transport of glucose over a plasma membrane. There are 2 types of glucose transporters which consisted facilitative glucose transporters (GLUT); and sodium-dependent transport, mediated by the Na+/glucose cotransporters (SGLT). Among them, GLUT1, GLUT8, GLUT12, SGLT1, SGLT2 are main glucose transporters which involved in mammary gland development and milk synthesis. However, more studies are required for revealing clear mechanism and function of other unknown genes and transporters. Therefore, understanding of the mechanisms of glucose usage and its regulation in mammary gland is very essential for enhancing the glucose utilization in the mammary gland and improving dairy productivity and efficiency.
The mature cyst of Acanthamoeba is highly resistant to various antibiotics and therapeutic agents. Cyst wall of Acanthamoeba are composed of cellulose, acid-resistant proteins, lipids, and unidentified materials. Because cellulose is one of the primary components of the inner cyst wall, cellulose synthesis is essential to the process of cyst formation in Acanthamoeba. In this study, we hypothesized the key and short-step process in synthesis of cellulose from glycogen in encysting Acanthamoeba castellanii, and confirmed it by comparing the expression pattern of enzymes involving glycogenolysis and cellulose synthesis. The genes of 3 enzymes, glycogen phosphorylase, UDP-glucose pyrophosphorylase, and cellulose synthase, which are involved in the cellulose synthesis, were expressed high at the 1st and 2nd day of encystation. However, the phosphoglucomutase that facilitates the interconversion of glucose 1-phosphate and glucose 6-phosphate expressed low during encystation. This report identified the short-cut pathway of cellulose synthesis required for construction of the cyst wall during the encystation process in Acanthamoeba. This study provides important information to understand cyst wall formation in encysting Acanthamoeba.
P. aeruginosa F722는 탄화수소를 분해하는 과정에 biosurfactant (BS)를 생산한다. 탄화수소 분해에 사용되는 C-배지에서 BS 생산량은 0.78 g/ $\ell$이었으나, 질소원과 탄소원을 각각 0.05% (w/v) NH$_4$Cl + 0.1% (w/v) yeast extract과 3.0% (w/v) glucose로 조정한 경우는 BS 생산량이 1.66 g/ $\ell$로 증가하였다. 최적의 BS 생산조건으로 배양하는 동안 air 1.0 LPM를 공급해 주었을 때는 공기를 공급하지 않을 때의 1.66 g/ $\ell$보다 약 20% 증가한 1.94 g/ $\ell$이었다 뿐만 아니라, glucose 분해속도는 대수증식기와 정지기에서 air를 공급하지 않은 경우 0.25, 0.18 h$^{-1}$ 였으나, 공기를 1.0 LPM으로 공급한 경우 0.33, 0.29 h$^{-l}$ 로 조사되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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