• 제목/요약/키워드: gentic analysis

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폐염균에서 작은 RecA 유사체의 검출 및 형질전환 때의 비유도성 확인 (A small recA analog in streptococcus pneumoniae that is not induced during competence for genetic transformation)

  • 이동권
    • 미생물학회지
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    • 제27권2호
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    • pp.162-167
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    • 1989
  • Western blot analysis of lysates of Streptococcus pneumoniae revealed a single polypeptide species that cross-reacted with E. coli RecA antiserum. The apparent molecular weight of this putative RecA protein analog (RecAsp) was 24, 000 smaller than any other known RecA analogue. The RecAsp protein was present at the same level in competent and non-competent cells.

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유전 알고리즘 기반의 서포트 벡터 회귀를 이용한 소프트웨어 비용산정 (Estimation of software project effort with genetic algorithm and support vector regression)

  • 권기태;박수권
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제16D권5호
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    • pp.729-736
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    • 2009
  • 소프트웨어 공학에서 정확한 개발 비용 예측은 성공적인 개발 프로젝트를 위한 필수적인 요소로, 현재까지 많은 소프트웨어 비용산정을 위한 모델들이 개발되어 왔다. 전통적인 통계적 기법부터 기계학습을 적용한 알고리즘까지 다양한 분야의 아이디어를 접목하고 있다. 본 논문에서는 소프트웨어 개발 비용 예측을 위한 방법으로 유전 알고리즘과 서포트 벡터 머신의 회귀모델인 서포트 벡터 회귀를 결합한 GA-SVR 모델을 제안한다. 제안된 모델은 기존의 연구에 비해 향상된 결과를 보이고 있다.

분말사료와 Pallet 사료의 생산비 비교 (Comparison of Mash and Pelleting Feed Production Cost)

  • 박경규;;;김인수
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제3권
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    • pp.55-61
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    • 1985
  • 양계 및 양돈용 배합사료중 pellet 사료와 분말사료의 생산비를 비교하였다. 비교분석을 위하여 박(1982)이 개발한 모형을 이용하였으며 공장의 규모는 일산 80ton으로부터 400ton이었다. 분석된 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 동력비는 pellet 사료가 분말사료에 비해 4배가 높았다. 2. 노동비는 pellet 사료가 분말사료에 비해 20%가 높았다. 3. 일산 200ton 규모의 경우 투자비용은 pellet 사료가 20% 높았다. 4. 고정비 및 변동비를 고려한 총생산비를 공장규모가 100ton에서 400ton으로 커질 경우 pellet 사료가 분말사료에 비해 30%에서 50%로 증가되었다.

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Monitoring of Gentic Variability in Dicofol-susceptible, Dicofol-resistant, and its Reverse-selected Strains of Tetranychus urticae by RAPD-PCR

  • Song, Cheol;Park, Jin-Hee;Kim, Gil-Hah;Kwon, O-Yu;Cho, Kwang-Yun
    • Journal of Life Science
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    • 제9권1호
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    • pp.14-16
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    • 1999
  • Genetic variability was monitored by random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) in dicofol-susceptible (S), dicofol-resistant (R) and its reverse-selected (RS) strains of two-spotted spider mite, of Tetranychus urticae. Before the reverse-selection, RS strain, selected reversely from R strain, was 23-fold resistance ratio at {TEX}$LC_{50}${/TEX} to S strain. The resistance was started to in incline slowly to the resistance level of S strain after one year, and the resistance ratio was 4-fold in the 7 years after then. PCR-amplification of T. urticae DNA showed polymorphism in the amplifications with 12 primers in 100 kinds of arbitrary DNA sequences. RAPD amplification with primer OPR-12 (5`-ACAGGTGCGT-3`) showed amplified bands at 1,000 base pair in the S-and RS-strain, and at 350 base pair in R-strain. The results of polymorphism are genetic variabilities derived from development and selection of resistance in each strain. The peculiarly amplified fragments were guessed to participate in dicofol resistance. From the analysis of genetic similarity, it is inferred the gene composition of S-and RS-strain is much closer than that of R-strain.

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한국산 퉁가리속 어류의 유전 및 형태적 변이에 관한 연구 (Genetic and Morphological Variation of the Genus Liobagrus in Korea)

  • 양서영;서영목
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제2권2호
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    • pp.1-12
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    • 1986
  • 한국산 퉁가리속 어류의 종간및 종내 집단간의 유전적 근연관계와 변이정도를 알아보기 위하여 남한의 6개 수계의 7개 지역에서 채집된 420개분 표본을 대상으로 전기영동에 의한 유전자분석과 형태비교를 실시하였다. 집단간 유전적 변이정도를 분석한 결과 L. andersoni 3개 집단에서는 P=21.3%, H=0.068이였고 L. mediadiposalis 의 경우는 P=16.3%, H=0.056으로 나타났다. 또 L.andersoni 및 L. mediadiposalis 의 집단간 유전적 평균근연치는 각기 S=0.592, S=0.675이었고 그 중 금강집단이 가장 근연치가 먼 것으로 나타났으며 종간 근연치는 S=0.530이었다. 외부형태형질에 대한 discriminant function analysis를 실시한 결과 L. andersoni 의 금강 집단이 뚜렷하게 구분되어 전기영동결과와 일치함을 보였다. 이상의 결과에서와 같이 종내 집단간에서도 현저한 유전적 차이를 나타내고 었어 같은 수 계안의 집단간에 대하여서도 더욱 자세한 유전적, 형태적 비교분석이 있어야 할 것으로 사료된다.

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참깨 항산화물질의 기능과 함량 및 이용 전망 (Perspectives of Utilization and Function of Antioxidants in Sesame)

  • 류수노;강철환;이정일;이승택;김관수;안병옥
    • 한국작물학회지
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    • 제41권spc1호
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    • pp.94-109
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    • 1996
  • Antioxidants of sesame have been reported to cure and prevent various diseases by means of diverse physiological activities, prevention of acidification in organisms, prevention of acidification and decay of lipids, cholesterol depression, preventive effects on chemical breast cancer, skin beauty and senescence inhibition, and so on. Recognizing their significance to health and disease prevention, researchers in Japan and America have given so much importance to study antioxidants in the last decade. In addition, they are actively pursuing studies on production, processing for food use and development of new varieties that have high antioxidant content. Recently, researchers in Korea have shown the same interest and have conducted similar studies, however, the importance of the following basic issues must be recognized to guide in future activites : First, improvement of sesame quality must be done to raise the contents of not only the fat and fatty acid but also sesamin, sesamolin and sesaminol glucoside. For the use of these components it is necessary to study the gentic pattern and individual selections developed from minimum sample size and fast lipid analysis techniques. Second, sesaminol of sesame has a remarkable function in preventing acidification and so sesame can be utilized as a food that prevents or delays aging caused by automatic acidification of fat. Therefore, for maximum medicinal benefit from sesame oil there is a need to develop food materials having new medicinal functions. Third, the sesamin and sesamolin content of sesame germplasms collected in Korea showed lower ranges of $0.04\~0.68$ percent and $0.08\~0.68$ percent respectively, while Japanese germ-plasm showed 1.9 percent maximum content of seasmin. Thus, germplasm collection and analysis of worldwide genetic resources are urgently needed.

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Hypocholesterolemic Soybean Peptide (IAVP) Inhibits HMG-CoA Reductase in a Competitive Manner

  • Pak, Valeriy V.;Koo, Min-Seon;Lee, Na-Ri;Oh, Su-Kyung;Kim, Myung-Sunny;Lee, Jong-Soo;Kwon, Dae-Young
    • Food Science and Biotechnology
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    • 제14권6호
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    • pp.727-731
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    • 2005
  • Synthesized Ile-Ala-Val-Pro (IAVP) peptide, which has the highest hypocholesterolemic effect among a number of synthesized derivatives of Ile-Ala-Val-Pro-Gly-Glu-Val-Ala (IAVPGEVA) isolated from 11S globulin of soy protein by pepsin digestion, was selected for investigation in the present study. Using a recombinant Syrian hamster 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase (HMGR), we studied in detail the inhibition of this enzyme by IAVP and compared the action of this peptide to that of lovastatin, a known competitive inhibitor of this enzyme. The concentration of IAVP required for 50% inhibition ($IC_{50}$) of HMGR activity in given experimental conditions was $340\;{\mu}M$. Kinetic analysis revealed that the studied peptide is a competitive inhibitor of HMGR with respect to both 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A (HMG-CoA) and nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH), with an equilibrium constant of inhibitor binding ($K_i\;=\;[E][I]/[EI]$) of $61{\pm}1.2\;{\mu}M$ and $157{\pm}4.4\;{\mu}M$, respectively. At the same conditions, $K_i$ and $IC_{50}$ for lovastatin were $2.2{\pm}0.1\;nM$ and 12.5 nM, respectively. Thus, the given peptide interacts with HMGR as a bisubstrate, consequently blocking access of both substrates to the active sites. The achieved results suggest the design of new peptide sequences having a higher relative affinity to binding sites of this enzyme and an enhancement of their hypocholesterolemic properties.

옥수수의 위축모자이크바이러스에 대한 저항성: 이면교배에 의한 유전분석 (Resistance of Corn to Maize Dwarf Mosaic Virus: Genetic Analysis by Diallel Cross)

  • 허노열;김달웅;유갑희;강창식;이경휘
    • 한국식물병리학회지
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    • 제1권2호
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    • pp.136-140
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    • 1985
  • 옥수수 위축모자이크바이러스병의 저항성품종 육성을 위한 기초자료를 얻고자 8개 옥수수 자식계통을 공시하여 이면교배에 의하여 조합능력검정 및 유전자의 분포상태를 추정한 요약하면 다음과 같다. 28개 $F_1$ 잡종조합의 본 바이러스에 대한 반응은 다양하여 이병도(1-4)의 조사결과 1.87에서 3.63까지 변이의 폭을 보였다. 조합능력의 분산분석결과 일반조합능력은 고도의 유의성이 인정되었으며, 특정조합능력은 유의성이 확정되지 않았다. 일반조합능력의 효과는 A632와 KS15가 부의 효과를 나타내어 이들 계통을 모본으로 사용하였을 때 잡종조합에 있어서 저항성을 증대시킬 수 있을 것으로 기대되었다. 특정조합능력의 효과는 A632와 KS5의 조합에서 가장 높은 부의 값을 나타내었으며 몇 개의 조합에서 부의 효과를 나타내었다. 회귀분석에 의한 유전자의 분포상태조사에서 저항성계통에는 우성유전자가 이병성계통에는 열성유전자가 많이 존재하는 것으로 나타났다.

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누에의 실용형질에 대한 유전력, 유전상관 및 경로계수의 분석 (Heritability, Genetic Correlation and Path Coefficient Analysis of Economic Characters in the Silkworm, Bombyx mori)

  • 정원복
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.91-101
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    • 1989
  • 가잠육종의 선발에 대한 유전적 Parameter를 추적학 ldnl해 누에 일본종계통 3, 중국종계통 4 모두 7개 품종을 이면교배하여 주요 견성과 사질의 유전력과 유전상관을, 그리고 유전상관의 값을 이용하여 여러 형질이 직접 또는 간접적으로 견사량에 미치는 영향을 구명하기 위한 경로계수를 추정하였다. 원잠종을 재료로 한 각 형질의 유전력은 F1, F2세대에서 5령경과, 단견중, 견층중, 견층비율, fibroin량, 견층연감율, 견사량 등이 모두 76.65% 이상이었다. 형질상호간의 상관관계를 F1, F2 세대에서 자웅별로 보면 표현형상관과 유전상관의 값은 대체로 정의 방향이었고, 유전상관의 값이 표현형상관의 값보다 일반적으로 높았다. 견사량과의 형질상호간의 상관관계에서 단견중, 견층중, 견층비율, fibroin량 등은 F1, F2세대의 자웅이 모두 0.727 이상의 높은 유전상관 값을 보였다. 주요 형질들의 유전력이 대체로 높고 유전상관의 값이 정의 방향이므로 이들 형질은 선발이 용이할 것으로 기대된다. 경로계수는 견사량에 관여하는 직접효과가 F1세대에서 자의 견층중이 0.991, 웅의 단견중이 0.803이고, F2세대에서 웅의 견층비율이 0.938, 웅의 fibroin량이 0.930으로서 정의 방향으로 그 효과가 크게 표현되었다. 경로계수에서 견사량에 관여하는 직·간접효과가 세대간과 자웅간에 차이는 있으나 주로 증량적 형질인 단견중, 견층중 등의 영향이 컸을 것으로 평가된다.

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n-Hexane 노출에 의한 신경행동학적 증상에 monoamine oxidase(B)와 serotonin transporter receptor 유전자다양성의 영향 (Genetic polymorphisms of monoamine oxidase(MAO) B and serotonin transporter receptor(5-HTTR) influence variability in neurobehavioral symptoms by n-hexane exposur)

  • 김기웅
    • 한국산업보건학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.116-122
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    • 2011
  • Human occupational exposure to n-hexane has been associated with neurobehavioral symptoms such as depression, irritablity, acute irritation symptom, concentration disturbance and fatigue. Effects of monoamine oxidase (MAO) B and serotonin transporter receptor (5-HTTR) polymorphisms on the neurobehavioral symptoms were investigated in 70 male workers from TV and computer monitor manufacturing plants exposed to n-hexane. Neurobehavioral symptoms were assessed through a self-reported questionnaire and ambient level of n-hexane was measured by NIOSH method. Blood and urine were collected from each workers to determine the MAO(B), 5-HTTR and urinary 2,5-hexanedione(2,5-HD). The mean concentration of volatile n-hexane was $18.8{\pm}28.8ppm$ and that of urinary 2,5-HD was $1.07{\pm}1.47mg/g$ creatinine. Statistically significant associations with sexual disturbance were age and smoking. The frequencies of MAO(B) AA, AG and GG were 18.6%, 45.7% and 35.7%, respectively, and the frequencies of 5-HTTR ll, ls and ss genotype were 82.9%, 15.7% and 1.4%, respectively. MAO (B) gene polymorphisms had susceptibility to the neurobehavioral symptoms such as fatigue, concentration disturbance, irritability and acute irritation symptom and 5-HTTR gene polymorphism had susceptibility to the sleep disturbance and acute irritation symptom. On multiple logistic regression analysis for the neurobehavioral symptoms, memory disturbance was significantly associated with smoking(OR=6.752, 95% CI=37.46) and drinking(OR=4.033, 95% CI=1.252-12.98), emotional lability was MAO(B) genotype(OR=0.412, 95% CI=0.170-0.996), fatigue (OR=1.011, 95% CI=1.000-1.021) and acute irritation(OR=0.990, 95% CI=0.981-1.000) were working duration and sexual disturbance were significantly associated with age(OR=1.208, 95% CI=1.042-1.399), ambient n-hexane(OR=1.077, 95% CI=1.005-1.154) and 2,5-HD(OR=0.186, 95% CI=0.041-0.841). This finding implies that the MAO (B) and 5-HTTR polymorphisms may affect susceptibility for specific neurobehavioral symptoms associated with n-hexane exposure in workers.