• 제목/요약/키워드: genetic correlations

검색결과 394건 처리시간 0.027초

유전자형과 재배환경에 따른 검정콩 안토시아닌 함량변이 (Variation of Anthocyanin Contents by Genotypes and Growing Environments in Black Colored Soybeans)

  • 황인택;이주영;최병렬;이은섭;김용호
    • 한국작물학회지
    • /
    • 제59권4호
    • /
    • pp.477-482
    • /
    • 2014
  • 검정콩 함유 안토시아닌 함량의 환경 변이 특성을 구명하고자 검정콩의 재배 지역과 파종기를 달리하며 안토시아닌 함량을 분석한 결과 안토시아닌 함량은 지역, 품종 및 파종기 모두에 영향을 받는 것으로 나타났다. 품종별로는 일품검정콩의 평균 안토시아닌 함량이 11.58 mg/g으로 제일 높았으며, 지역에서는 연천에서 재배한 품종들의 평균 함량이 9.85 mg/g으로 제일 높았다. 파종기에서는 6월 15일 파종이 9.00 mg/g, 5월 30일 8.36 mg/g, 5월 15일 8.24 mg/g으로 나타나 만식재배가 안토시아닌 함량 제고에 유리할 것으로 판단되었다. 검정콩 안토시아닌의 색도와 안토시아닌 함량과의 상관을 분석한 결과 L (명도)과 b (적색도)값은 안토시아닌 개별색소 및 총 안토시아닌 함량과 고도의 부의 상관을 보인 반면, a (적색도)값은 고도의 정의 상관을 나타내었다. 검정콩 안토시아닌 함량과 기상요인의 관계를 분석한 결과, 일품검정콩과 청자콩은 평균기온 및 적산온도와 부의 상관, 평균일교차와는 정의 상관을 보였다. 따라서 안토시아닌 고함유 검정콩 생산을 위해서는 등숙기간 중 평균기온이 낮고 일교차가 큰 지역에서 생산하는 것이 유리할 것으로 판단되었다.

터너증후군의 핵형과 표현형간의 연관성 (Correlation between Karyotype and Phenotype in Turner Syndrome)

  • 심예지;황영주;이건수
    • Journal of Genetic Medicine
    • /
    • 제6권1호
    • /
    • pp.67-73
    • /
    • 2009
  • 목 적 : 터너증후군 환자들에게는 다양한 핵형과 표현형이 나타나지만 우리나라에서는 그 연관성에 대한 연구가 미미한 실정이다. 그리하여 본 연구에서는 터너증후군으로 진단받은 환자들의 염색체 이상, 임상양상, 동반 질환에 대해 조사하였다. 대상 및 방 법 : 경북대학교병원에서 터너증후군으로 진단받은 환자 92명을 대상으로 염색체 핵형을 분류하였으며, 그 중 62명을 대상으로 임상 양상 및 동반 질환을 조사하였다. 결 과 : 핵형이 45,X인 환자는 54.3%였고. 섞임증 및 구조 이상이 나머지를 차지하였다. 섞임증의 경우 45,X에 비하여 Turner stigmata의 빈도가 낮았다. 46,X,del(Xp) 및 45,X/46,X,del(Xq)에서는 모두 골격 이상이 나타난 반면, 46,X, del(Xq)에서는 나타나지 않았다. 46,X,del(Xp)에서는 성적 유치증이 나타나지 않았지만, 46,X,del(Xq) 및 45,X/46,X,del(Xq)의 경우에는 이차 성징 지연이 지연 및 무월경이 나타났다. 46,X,i(Xq) 및 45,X/46,X,i(Xq)의 경우 이차 성징이 발현되지 않았고 모두 일차 무월경을 보였다. 그 외에 장완의 isochromosome이 있는 경우 청력 장애 및 갑상선 질환이 더 빈번하게 나타났다. 결 론 : 터너증후군 환자들의 핵형과 표현형 사이의 연관성을 조사하는 작업은 성염색체에 위치하는 유전자자리를 예측하는 정보를 얻을 수 있다는 점에서 중요하다고 생각한다.

  • PDF

잠란의 반문수와 타계량형질과의 유전상관과 환경상관에 관한 연구 (STUDY ON THE GENOTYPIC AND ENVIRONMENTAL CORRELATION BETWEEN THE NUMBER OF THE EGG MARKINGS AND OTHER METRIC CHARACTERS, IN SILKWORM, Bombyx mori L.)

  • 박광의
    • 한국잠사곤충학회지
    • /
    • 제2권
    • /
    • pp.41-47
    • /
    • 1962
  • 1961년 춘기에 난문수와 각종 실용형질과의 표현, 유전 및 환경상관과 각형질의 유전력을 농촌진흥청 잠업시험장에서 잠품종 각도 연락시험에 공시하는 8 품종에 대하여 조사하였으며 각 시험장에 보존되어 있는 잠품종중 25 품종에 대하여는 상관, 계통별 난문수 또는 변이를 조사하여 다음과 같은 결과를 얻었다. (1) 난문수와 전망중, 견층중 및 섬도와는 고도의 빈표현상관과 빈유전상관을 나타냈으며 환경상관은 나타나지 않았다. (2) 난문수는 중국계통이 가장 많고 일본계통이 중간이고 가주계통이 최소였다. (3) 감잠비율과 난문수와의 관계는 일정한 경향이 없다. (4) 견층중과 계장의 유전력은 전견중, 섬도 및 난문수의 것에 비해서 적었다. (5) 난문집단의 소다각형 반문수가 많은 품종일수록 난문의 절대수가 많았다. (6) 난문수의 변이는 가주계통이 가장 크고 중국계통, 일본계통의 순으로 적은 것 같다. 전견중, 견층중, 및 섬도는 난문수를 기준으로 하여 그것들을 선발하면 간접적으 선발 효과를 높일 수 있을 것이며 특히 난시대에 선발함으로서 사육의 경비를 절약할 수 있을 것이다.

  • PDF

Somatic cell score: gene polymorphisms and other effects in Holstein and Simmental cows

  • Citek, Jindrich;Brzakova, Michaela;Hanusova, Lenka;Hanus, Oto;Vecerek, Libor;Samkova, Eva;Jozova, Eva;Hostickova, Irena;Travnicek, Jan;Klojda, Martin;Hasonova, Lucie
    • Animal Bioscience
    • /
    • 제35권1호
    • /
    • pp.13-21
    • /
    • 2022
  • Objective: The aim of the study was to evaluate the influence of gene polymorphisms and nongenetic factors on the somatic cell score (SCS) in the milk of Holstein (n = 148) and Simmental (n = 73) cows and their crosses (n = 6). Methods: The SCS was calculated by the formula SCS = log2(SCC/100,000)+3, where SCC is the somatic cell count. Polymorphisms in the casein alpha S1 (CSN1S1), beta-casein (CSN2), kappa-casein (CSN3), beta-lactoglobulin (LGB), acyl-CoA diacylglycerol transferase 1 (DGAT1), leptin (LEP), fatty acid synthase (FASN), stearoyl CoA desaturase 1 (SCD1), and 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 6 (AGPAT6) genes were genotyped, and association analysis to the SCS in the cow's milk was performed. Further, the impact of breed, farm, year, month of the year, lactation stage and parity on the SCS were analysed. Phenotype correlations among SCS and milk constituents were computed by Pearson correlation coefficients. Results: Only CSN2 genotypes A1/A2 were found to have significant association with the SCS (p<0.05), and alleles of CSN1S1 and DGAT1 genes (p<0.05). Other polymorphisms were not found to be significant. SCS had significant association with the combined effect of farm and year, lactation stage and month of the year. Lactation parity and breed had not significant association with SCS. The phenotypic correlation of SCS to lactose content was negative and significant, while the correlation to protein content was positive and significant. The correlations of SCS to fat, casein, nonfat solids, urea, citric acid, acetone and ketones contents were very low and not significant. Conclusion: Only CSN2 genotypes, CSN1S1 and DGAT1 alleles did show an obvious association to the SCS. The results confirmed the importance of general quality management of farms on the microbial milk quality, and effects of lactation stage and month of the year. The lactose content in milk reflects the health status of the udder.

인삼 품종과 육성계통의 작물학적 특성 변이 (Variations of Agronomic Characteristics of Cultivars and Breeding Lines in Korean Ginseng (Panax ginseng C. A. Mey.))

  • 방경환;서아연;김영창;조익현;김장욱;김동휘;차선우;조용구;김홍식
    • 한국약용작물학회지
    • /
    • 제20권4호
    • /
    • pp.231-237
    • /
    • 2012
  • These studies were conducted to provide basic information on Korean ginseng cultivars and breeding lines (Panax ginseng C. A. Mey.) and to identify the variations that can be utilized in ginseng breeding programs. The agronomic characteristics was used to clarify the genetic relationships among Korean ginseng cultivars and breeding lines and to classify them into distinct genetic groups. Angle of petiole and number of fibrous root showed a wide variation from $15.0{\sim}67.8^{\circ}$ and 0~5, respectively. The average plant length was 54.2cm with a range of 37.9~64.8cm and the average stem diameter was 5.6mm with a range of 4.0~7.5mm. The average stem length was 31.9cm with a range of 21.8~37.9cm and the average root weight was 38.1 g with a range of 23.0~52.0 g. The 24 Korean ginseng cultivars and breeding lines were classified into 4 groups based on agronomic characteristics using the complete linkage cluster analysis. The I, II, III and IV groups included the 60.8%, 7.4%, 13.1% and 8.7% of the cultivars and breeding lines, respectively. The breeding lines in group I could be characterized as the group with the highest growth characters and yield components, such as plant length, stem diameter and root weight. The root weight, the yield component, had highly significant positive correlations with stem diameter, plant length and stem length.

홍화의 작물학적 특성에 의한 품종군 분류 (Classification of Safflower(Carthamus tinctorius L.) Collections by Agronomic Characteristics)

  • 방경환;김영국;박희운;성낙술;조준형;박상일;김홍식
    • 한국약용작물학회지
    • /
    • 제9권4호
    • /
    • pp.301-309
    • /
    • 2001
  • 홍화 수집종들의 작물학적 특성을 통하여 유전적 다양성 및 유연관계를 밝히고, 품종군을 분류하여 품종육성의 기초자료로 이용코자 시험한 결과를 요약하면 다음과 같다. 개화일수는 $74{\sim}88$일 분포로 평균 83일이었고, 80일 이하의 조숙성을 가진 수집종은 21개 이었으며, 1차분지수와 2차분지수는 각각 $3.8{\sim}14.8$개와 $0{\sim}26.9$개의 범위로 분포하였고, 다분지형의 특성을 가진 품종은 IT201434, IT202723 등 이었으며, 생육특성 중 2차 분지수의 변이가 켰다. 수량구성 요소로서 두상화수는 $5.0{\sim}40.7$개, 두상화당 종실수는 $25{\sim}68$개, 100립중 및 주당 종실중은 각각 $2.9{\sim}5.4g,\;3{\sim}47.5g$의 범위로 분포하였고, 종실중 > 두상화수 > 두상화당 종실수 순으로 변이가 큰 경향이었다. 수집종들은 작물학적 특성에 따라 11개군으로 분류되었으며, I군은 25%, II군은 33%, III군은 14%, IV군은 8%, VI군은 3%, IX군은 2%, X군은 1%, ?군은 1%가 속하였으며, III군은 모두 국내재래종 이었다. 분류된 군중 X군은 출아소요일수가 짧고, 개화소요일수가 길었으나 수량 구성 요소인 두상화수, 주당 종실중 및 두상화당 종실수가 가장 우세한 군으로 분류되었다. 수량구성요소인 두상화수와 주당 종실중은 경직경, 제1차분지수, 제2차분지수, 엽수 및 엽장과 높은 정의 상관을 보였다.

  • PDF

울산지역 초등학생의 알레르기비염 유병과 면역반응과의 상관성: 환자-대조군 연구 (Correlation between Allergic Rhinitis Prevalence and Immune Responses of Children in Ulsan: A Case-control Study)

  • 이지호;오인보;김아라;김민호;심창선;김양호
    • 한국환경보건학회지
    • /
    • 제41권4호
    • /
    • pp.249-258
    • /
    • 2015
  • Objectives: This study aims to investigate the correlations between the prevalence of allergic rhinitis (AR) and cytokines among elementary school children in an industrial city, Ulsan, South Korea, and to identify major environmental risk factors associated with AR prevalence. Methods: We conducted a case-control study in June 2009 and February 2010 in order to evaluate the relationship between AR and related cytokines. Data on physician-treated prevalence over the past 12 months and potential risk factors for AR were compiled through a questionnaire from a survey of 339 schoolchildren living in different urban environments. Logistic regression analysis was carried out with propensity score matched data (n=180) to assess the influences of cytokines (IL-13, IL-33, IL-4 and IL-5) on AR prevalence and to determine which environmental factors affected AR. Results: In univariate analysis, the AR prevalence was influenced by family history of AR (mother and siblings), environmental factors (odor condition and irritated symptoms of air pollution), and indoor allergens (D. farinae and D. pteronyssinus). The t-test demonstrated that eosinophils, Immunoglobulin E (IgE), and interleukins (IL-13 and IL-5) were statistically significantly different according to treatment of allergic rhinitis over the preceeding 12 months. The results of the multiple logistic regression analysis showed that a statistically significant association between several factors (such as irritated symptoms of air pollution (OR 4.075, CI 1.735-9.568), IL-13 (OR 0.825, CI 0.734-0.928), odor condition (OR 2.409, CI 0.908-6.389), and AR history of siblings (OR 2.217, CI 0.999-4.921)) and the prevalence of AR was found after adjusting for confounders. Conclusion: These results suggest that AR prevalence is significantly associated with cytokine level, genetic background, and outdoor environmental factors. Although living in a polluted area and genetic background can contribute to an increased risk of childhood AR, cytokine level should be considered as an important factor in the treatment of AR in the last 12 months.

체세포점수와 홀스타인 유방형질간의 관계 (Relationship of Somatic Cell Score and Udder Type Traits of Holstein Cattle)

  • 최태정;서강석;김시동;박병호;최재관;윤호백;나승환;손삼규;권오섭;조광현
    • Journal of Animal Science and Technology
    • /
    • 제50권3호
    • /
    • pp.285-292
    • /
    • 2008
  • 본 연구는 국제적인 경쟁력을 갖기 위한 젖소개량방법으로 체세포를 활용하는 방법을 모색하고자 선형심사 자료에서 유방염에 관련된 형질을 이용하여 새로운 선발지수를 개발하기 위한 단계로 국내 젖소집단의 체세포점수 분포와 변화추이를 분석해보고 연령, 분만계절, 비유단계의 환경효과를 구명하고 유방관련 형질과의 유전상관과 유전력을 구하여 기초자료로 활용하고자 본 연구를 진행하였다. 분석은 유우군 능력검정을 통하여 2000년부터 수집된 자료를 이용하였고 자료는 1산차 기록을 갖는 10,929개체의 290,144 검정일 기록과 37,723개의 유방형질 기록을 이용하였다. 분석에 이용된 유방형질은 전유방붙음성, 뒷유방높이, 뒷유방너비, 유방깊이, 앞유두길이의 형질이며 체세포 점수간의 표현형상관과 유전상관을 구하고 분산성분을 추정하였으며 개체모형을 이용하여 표현형상관과 유전상관을 분석하였다. 분석에 이용된 모형은 개체모형으로 DF-REML방식을 이용하여 추정하였고 유방깊이와 앞유두길이의 유전력은 0.23, 0.22로 체세포점수의 유전력은 0.08로 분석되었다. 유방형질과 체세포점수간의 표현형상관은 -0.03~-0.06으로 낮게 나타났으며 높은 유방붙음성을 갖을수록 낮은 체세포점수를 보였다. 체세포점수와 유방깊이, 체세포점수와 앞유두길이의 유전상관은 부의 상관을 보였다.

Single nucleotide polymorphism of GSTP1 and pathological complete response in locally advanced rectal cancer patients treated with neoadjuvant concomitant radiochemotherapy

  • Nicosia, Luca;Gentile, Giovanna;Reverberi, Chiara;Minniti, Giuseppe;Valeriani, Maurizio;de Sanctis, Vitaliana;Marinelli, Luca;Cipolla, Fabiola;de Luca, Ottavia;Simmaco, Maurizio;Osti, Mattia F.
    • Radiation Oncology Journal
    • /
    • 제36권3호
    • /
    • pp.218-226
    • /
    • 2018
  • Purpose: Standard treatment for locally advanced rectal cancer consists of neoadjuvant radiochemotherapy with concomitant fluoropyrimidine or oxaliplatin and surgery with curative intent. Pathological complete response has shown to be predictive for better outcome and survival; nevertheless there are no biological or genetic factors predictive for response to treatment. We explored the correlation between the single nucleotide polymorphisms (SNPs) GSTP1 (A313G) and XRCC1 (G28152A), and the pathological complete response and survival after neoadjuvant radiochemotherapy in locally advanced rectal cancer patients. Materials and Methods: Genotypes GSTP1 (A313G) and XRCC1 (G28152A) were determined by pyrosequencing technology in 80 patients affected by locally advanced rectal cancer. Results: The overall rate of pathological complete response in our study population was 18.75%. Patients homozygous AA for GSTP1 (A313G) presented a rate of pathological complete response of 26.6% as compared to 8.5% of the AG+GG population (p = 0.04). The heterozygous comparison (AA vs. AG) showed a significant difference in the rate of pathological complete response (26.6% vs. 6.8%; p = 0.034). GSTP1 AA+AG patients presented a 5- and 8-year cancer-specific survival longer than GSTP1 GG patients (87.7% and 83.3% vs. 44.4% and 44.4%, respectively) (p = 0.014). Overall survival showed only a trend toward significance in favor of the haplotypes GSTP1 AA+AG. No significant correlations were found for XRCC1 (G28152A). Conclusion: Our results suggest that GSTP1 (A313G) may predict a higher rate of pathological complete response after neoadjuvant radiochemotherapy and a better outcome, and should be considered in a more extensive analysis with the aim of personalization of radiation treatment.

참깨 품질 연구의 현황과 문제점 및 전망 (Current Status and Perspectives of Quality Improvement in Sesame)

  • 이봉호;이정일;박래경
    • 한국작물학회지
    • /
    • 제33권s01호
    • /
    • pp.86-97
    • /
    • 1988
  • Sesame(Sesamum indicum L.) is probably the most ancient oilseed crop known in the world. The seed of sesame is used in a variety of ways as food. The whole seed may be eaten raw, either roasted or parched, or fed to birds and stock. Sesame oil is used as a salad or cooking oil, in shortening, margarine and in the manufacture of soap. Minor uses are as a fixative in the perfume industry and formerly as a carrier for fatsoluble substances in pharmaceuticals such as penicillin. One of the minor constituents of sesame oil, sesamin, is used for its synergistic effect in pyrethrin insecticides, in addition of a small quantity of this substance markedly increases the effectiveness of fly sprays. The meal remaining after oil extraction can be used as and animal feed-stuff or as manure. In general sesame meal is considered to be equal to cottonseed or soybean meal as a protein supplement for livestock and poultry. It is especially high in certain amino-acids such as methionine, which is low in soybean meal, and thus can be combined with it or similar meal to form a more balanced ration. An attempt to summarize the literature review on quality improvement of sesame was made to discuss the accomplishments of the past and perspectives in the future. The reviews on quality improvement of sesame were mainly discussed in connection with the cultural practices and genetic informations in current status. The emphasis focussed on environmental variation of quality in cultural practices, such as harvest time, variety by location, climatic condition, fertilizer application, and growth regulator treatment. On the genetic variation of quality, it was discussed on variety background, mutation breeding, correlations, and inheritance of quality related characteristics. It also was discussed on relationship between quality and plant traits, storage condition or period, and seed coat color. Moreover, current research status were reviewed on some minor elements such as sesamin, oxalic acid, and trypsin inhibitor. As a results of the review, the lack of an effort to quality improvement in each utilization area was indicated as a problem area. More active efforts for the improvement of quality were also insufficient to incorporate the available genes for quality in breeding method or collection and analysis of breeding materials. Therefore, researches in the future would be recommended to emphasize on these problem areas.

  • PDF