Young Woo Kim;Seon Been Bak;Yu Rim Song;Chang-Eop Kim;Won-Yung Lee
Journal of Ginseng Research
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제48권4호
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pp.373-383
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2024
Background: Network pharmacology has emerged as a powerful tool to understand the therapeutic effects and mechanisms of natural products. However, there is a lack of comprehensive evaluations of network-based approaches for natural products on identifying therapeutic effects and key mechanisms. Purpose: We systematically explore the capabilities of network-based approaches on natural products, using Panax ginseng as a case study. P. ginseng is a widely used herb with a variety of therapeutic benefits, but its active ingredients and mechanisms of action on chronic diseases are not yet fully understood. Methods: Our study compiled and constructed a network focusing on P. ginseng by collecting and integrating data on ingredients, protein targets, and known indications. We then evaluated the performance of different network-based methods for summarizing known and unknown disease associations. The predicted results were validated in the hepatic stellate cell model. Results: We find that our multiscale interaction-based approach achieved an AUROC of 0.697 and an AUPR of 0.026, which outperforms other network-based approaches. As a case study, we further tested the ability of multiscale interactome-based approaches to identify active ingredients and their plausible mechanisms for breast cancer and liver cirrhosis. We also validated the beneficial effects of unreported and top-predicted ingredients, in cases of liver cirrhosis and gastrointestinal neoplasms. Conclusion: our study provides a promising framework to systematically explore the therapeutic effects and key mechanisms of natural products, and highlights the potential of network-based approaches in natural product research.
Background/Aims: Endoscopic submucosal dissection (ESD) has been established as a treatment modality for superficial esophageal squamous cell carcinoma (ESCC). Long-term follow-up data are lacking in Western countries. The aim of this study was to analyze long-term survival in a Western center. Methods: Patients undergoing ESD for ESCC were included. The analysis was performed retrospectively using a prospectively collected database. Results: R0 resection rate was 96.7% (59/61 lesions in 58 patients). Twenty-seven patients (46.6%) fulfilled the curative resection criteria (M1/M2) (group A), 11 patients (19.0%) had M3 lesions without lymphovascular invasion (LVI) (group B), and 20 patients (34.5%) had lesions with submucosal invasion or LVI (group C). Additional treatment was recommended after non-curative resection. It was not performed in 20/31 patients (64.5%), mainly because of comorbidities (75%). Twenty-nine out of 58 (50.0%) patients died during a mean follow-up of 3.7 years. Death was related to ESCC in 17.2% (5/29) of patients. The disease-specific survival rate after curative resection was 100%. Overall survival rates after 5 years were 61.5%, 63.6% and 28.1% for groups A, B, and C, respectively. The overall survival was significantly worse after non-curative resection (p=0.038). Conclusions: Non-curative resection is frequent after ESD for ESCC in Western patients. The long-term prognosis is limited and mainly determined by comorbidity. Early diagnosis and pre-interventional assessments need to be improved.
Background/Aims: Double-balloon enteroscopy (DBE) allows for the diagnoses and treatment of small bowel tumors (SBTs). This study aimed to evaluate the utility of DBE for the diagnosis and treatment of SBTs. Methods: Patients diagnosed with SBTs who underwent DBE were included in this study. According to their endoscopic appearances, they were categorized as polyps or masses, and according to their histological characteristics, they were categorized as benign or malignant SBTs. Results: A total of 704 patients were retrospectively analyzed, and 90 (12.8%) were diagnosed with SBTs. According to their endoscopic appearance, 48 (53.3%) had polyps and 42 (46.7%) had masses. Additionally, 53 (58.9%) and 37 (41.1%) patients had malignant and benign SBTs, respectively, depending on their histological characteristics. Patients diagnosed with polyps were younger than those diagnosed with masses (p<0.001). Patients diagnosed with benign SBTs were younger than those diagnosed with malignant SBT (p<0.001). Overall, histological diagnosis was determined using DBE in 73 (81.1%) patients. Conclusions: DBE is a useful method for diagnosing SBTs. Additionally, the histological type of the lesion can be determined using DBE.
Background/Aims: Endoscopic ultrasound-guided tissue acquisition (EUS-TA) is essential for the diagnosis of pancreatic cancer. The feasibility of comprehensive genomic profiling (CGP) using samples obtained by EUS-TA has been under recent discussion. This study aimed to evaluate the utility of EUS-TA for CGP in a clinical setting. Methods: CGP was attempted in 178 samples obtained from 151 consecutive patients with pancreatic cancer at the Aichi Cancer Center between October 2019 and September 2021. We evaluated the adequacy of the samples for CGP and determined the factors associated with the adequacy of the samples obtained by EUS-TA retrospectively. Results: The overall adequacy for CGP was 65.2% (116/178), which was significantly different among the four sampling methods (EUS-TA vs. surgical specimen vs. percutaneous biopsy vs. duodenal biopsy, 56.0% [61/109] vs. 80.4% [41/51] vs. 76.5% [13/17] vs. 100.0% [1/1], respectively; p=0.022). In a univariate analysis, needle gauge/type was associated with adequacy (22 G fine-needle aspiration vs. 22 G fine-needle biopsy [FNB] vs. 19 G-FNB, 33.3% (5/15) vs. 53.5% (23/43) vs. 72.5% (29/40); p=0.022). The sample adequacy of 19 G-FNB for CGP was 72.5% (29/40), and there was no significant difference between 19 G-FNB and surgical specimens (p=0.375). Conclusions: To obtain adequate samples for CGP with EUS-TA, 19 G-FNB was shown to be the best in clinical practice. However, 19 G-FNB was not still sufficient, so further efforts are required to improve adequacy for CGP.
Ga-Yeong Shin;Hyun Ho Choi;Jae Myung Park;Sang Yoon Kim;Jun Young Park;Donghoon Kang;Yu Kyung Cho;Sung Soo Kim;Myung-Gyu Choi
Clinical Endoscopy
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제56권3호
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pp.325-332
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2023
Background/Aims: Administrative databases provide valuable information for large-cohort studies. This study aimed to evaluate the diagnostic accuracy of an administrative database for resected gastric adenomas. Methods: Data of patients who underwent endoscopic resection for benign gastric lesions were collected from three hospitals. Gastric adenoma cases were identified in the hospital database using International Classification of Diseases (ICD) 10-codes. The non-adenoma group included patients without gastric adenoma codes. The diagnostic accuracy for gastric adenoma was analyzed based on the pathological reports of the resected specimen. Results: Among 5,095 endoscopic resections with codes for benign gastric lesions, 3,909 patients were included in the analysis. Among them, 2,831 and 1,078 patients were allocated to the adenoma and non-adenoma groups, respectively. Regarding the overall diagnosis of gastric adenoma with ICD-10 codes, the sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value were 98.7%, 88.5%, 95.2%, and 96.8%, respectively. There were no significant differences in these parameters between the tertiary and secondary centers. Conclusions: Administrative codes of gastric adenoma, according to ICD-10 codes, showed good accuracy and can serve as a useful tool to study prognosis of these patients in real-world data studies in the future.
Background/Aims: This study aimed to clarify the efficacy and safety of pancreatic duct lavage cytology combined with a cell-block method (PLC-CB) for possible pancreatic ductal adenocarcinomas (PDACs). Methods: This study included 41 patients with suspected PDACs who underwent PLC-CB mainly because they were unfit for undergoing endoscopic ultrasonography-guided fine needle aspiration. A 6-Fr double lumen catheter was mainly used to perform PLC-CB. Final diagnoses were obtained from the findings of resected specimens or clinical outcomes during surveillance after PLC-CB. Results: Histocytological evaluations using PLC-CB were performed in 87.8% (36/41) of the patients. For 31 of the 36 patients, final diagnoses (invasive PDAC, 12; pancreatic carcinoma in situ, 5; benignancy, 14) were made, and the remaining five patients were excluded due to lack of surveillance periods after PLC-CB. For 31 patients, the sensitivity, specificity, and accuracy of PLC-CB for detecting malignancy were 94.1%, 100%, and 96.8%, respectively. In addition, they were 87.5%, 100%, and 94.1%, respectively, in 17 patients without pancreatic masses detectable using endoscopic ultrasonography. Four patients developed postprocedural pancreatitis, which improved with conservative therapy. Conclusions: PLC-CB has an excellent ability to detect malignancies in patients with possible PDACs, including pancreatic carcinoma in situ.
Sunah Suk;Yeon Joo Seo;Dae Young Cheung;Han Hee Lee;Jin Il Kim;Soo-Heon Park
Clinical Endoscopy
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제56권4호
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pp.470-478
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2023
Background/Aims: Metachronous recurrence incidences and risk factors following endoscopic submucosal dissection (ESD) for gastric adenocarcinoma and dysplasias were investigated. Methods: Retrospective review of electronic medical records of patients who underwent gastric ESD at The Catholic University of Korea, Yeouido St. Mary's Hospital. Results: A total of 190 subjects were enrolled for analysis during the study period. The mean age was 64.4 years and the male sex occupied 73.7%. The mean observation period following ESD was 3.45 years. The annual incidence rate of metachronous gastric neoplasms (MGN) was about 3.96%. The annual incidence rate was 5.36% for the low-grade dysplasia group, 6.47% for the high-grade dysplasia group, and 2.74% for the EGC group. MGN was more frequent in the dysplasia group than in the EGC group (p<0.05). For those with MGN development, the mean time interval from ESD to MGN was 4.1 (±1.8) years. By using the Kaplan-Meier model, the estimated mean MGN free survival time was 9.97 years (95% confidence interval, 8.53-11.40) The histological types of MGN were not related to the primary histology types. Conclusions: MGN following ESD developed in 3.96% annually and MGN was more frequent in the dysplasia group. The histological types of MGN did not correlate with those of primary neoplasm.
Background/Aims: We aimed to investigate (1) promising clinical findings for the recognition of focal type autoimmune pancreatitis (FAIP) and (2) the impact of endoscopic ultrasound (EUS)-guided tissue acquisition (EUS-TA) on the diagnosis of FAIP. Methods: Twenty-three patients with FAIP were involved in this study, and 44 patients with resected pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) were included in the control group. Results: (1) Multivariate analysis revealed that homogeneous delayed enhancement on contrast-enhanced computed tomography was a significant factor indicative of FAIP compared to PDAC (90% vs. 7%, p=0.015). (2) For 13 of 17 FAIP patients (76.5%) who underwent EUS-TA, EUS-TA aided the diagnostic confirmation of AIPs, and only one patient (5.9%) was found to have AIP after surgery. On the other hand, of the six patients who did not undergo EUS-TA, three (50.0%) underwent surgery for pancreatic lesions. Conclusions: Homogeneous delayed enhancement on contrast-enhanced computed tomography was the most useful clinical factor for discriminating FAIPs from PDACs. EUS-TA is mandatory for diagnostic confirmation of FAIP lesions and can contribute to a reduction in the rate of unnecessary surgery for patients with FAIP.
Background/Aims: Hybrid endoscopic submucosal dissection (ESD), in which an incision is made around a lesion and snaring is performed after submucosal dissection, has some advantages in colorectal surgery, including shorter procedure time and preventing perforation. However, its value for rescue resection in difficult colorectal ESD cases remains unclear. This study evaluated the utility of rescue hybrid ESD (RH-ESD). Methods: We divided 364 colorectal ESD procedures into the conventional ESD group (C-ESD, n=260), scheduled hybrid ESD group (SH-ESD, n=69), and RH-ESD group (n=35) and compared their clinical outcomes. Results: Resection time was significantly shorter in the following order: RH-ESD (149 [90-197] minutes) >C-ESD (90 [60-140] minutes) >SH-ESD (52 [29-80] minutes). The en bloc resection rate increased significantly in the following order: RH-ESD (48.6%), SH-ESD (78.3%), and C-ESD (97.7%). An analysis of factors related to piecemeal resection of RH-ESD revealed that the submucosal dissection rate was significantly lower in the piecemeal resection group (25% [20%-30%]) than in the en bloc resection group (40% [20%-60%]). Conclusions: RH-ESD was ineffective in terms of curative resection because of the low en bloc resection rate, but was useful for avoiding surgery.
Kyoung Won Kim;Tae Kyoung Kim;Joon Koo Han;Ah Young Kim;Hyun Ju Lee;Seong Ho Park;Young Hoon Kim;Byung Ihn Choi
Korean Journal of Radiology
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제1권4호
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pp.191-197
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2000
Because US plays a key role in the initial evaluation of hepatic hemangiomas, knowledge of the entire spectrum of US appearances of these tumors is important. Most hemangiomas have a distinctive US appearance, and even with those with atypical appearances on conventional gray-scale US, specific diagnoses can be made using pulse-inversion harmonic US with contrast agents. In this essay, we review the spectrum of US appearances of hepatic hemangiomas on conventional gray-scale, power Doppler, and pulse-inversion harmonic US with contrast agents.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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