Kim, Young-Ok;Heo, Yu Li;Nam, Bo-Hye;Kim, Dong-Gyun;Jee, Young-Ju;Lee, Sang-Jun;An, Cheul-Min
Fisheries and Aquatic Sciences
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제16권4호
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pp.311-318
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2013
The gene encoding an esterase from Photobacterium sp. MA1-3 was cloned in Escherichia coli using the shotgun method. The amino acid sequence deduced from the nucleotide sequence (948 bp) corresponded to a protein of 315 amino acid residues with a molecular weight of 35 kDa and a pI of 6.06. The deduced protein showed 74% and 68% amino acid sequence identities with the putative esterases from Photobacterium profundum SS9 and Photobacterium damselae, respectively. Absence of a signal peptide indicated that it was a cell-bound protein. Sequence analysis showed that the protein contained the signature G-X-S-X-G included in most serine-esterases and lipases. The MA1-3 esterase was produced in both soluble and insoluble forms when E. coli cells harboring the gene were cultured at $18^{\circ}C$. The enzyme was a serine-esterase and was active against $C_2$, $C_4$, $C_8$ and $C_{10}$ p-nitrophenyl esters. The optimum pH and temperature for enzyme activity were pH 8.0 and $30^{\circ}C$, respectively. Relative activity remained up to 45% even at $5^{\circ}C$ with an activation energy of 7.69 kcal/mol, which indicated that it was a cold-adapted enzyme. Enzyme activity was inhibited by $Cd^{2+}$, $Cu^{2+}$, $Zn^{2+}$, and $Hg^{2+}$ ions.
배추흰나비로부터 정제된 3개의 esterase의 특성을 조사하였으며 면역학적 연구를 통해 E6의 생리적 역할을 추정하였다. 억제제의 연구결과, E2, E6, E11 모두 carboxylesterase임이 밝혀졌다. Km 값은 E2, E6 및 E11이 각각 6.89 X 10-$^4$M. 3.19 $\times$ l0-$^4$M, 3.69 X 10-$^4$M이었다. 분자량은 E2, E6 및 E11이 각각 42 KD, 81 KD, 174 KD이었고 등전점은 각각 pH 5.54, pH 5.89, pH 6.50이었다. 변태에 따른 E6의 농도는 5령 말기에서 가장 높았으며 특히 중장조직에서 높게 나타났다. 따라서 E6은 소화효소로 사료된다.
The gene for esterase (rEst1) was isolated from a new species of genus Rheinheimera by functional screening of E. coli cells transformed with the pSMART/HaeIII genomic library. E. coli cells harboring the esterase gene insert could grow and produce clear halo zones on tributyrin agar. The rEst1 ORF consisted of 1,029 bp, corresponding to 342 amino acid residues with a molecular mass of 37 kDa. The signal P program 3.0 revealed the presence of a signal peptide of 25 amino acids. Esterase activity, however, was associated with a homotrimeric form of molecular mass 95 kDa and not with the monomeric form. The deduced amino acid sequence showed only 54% sequence identity with the closest lipase from Cellvibrio japonicus strain Ueda 107. Conserved domain search and multiple sequence alignment revealed the presence of an esterase/ lipase conserved domain consisting of a GXSXG motif, HGGG motif (oxyanion hole) and HGF motif, typical of the class IV hormone sensitive lipase family. On the basis of the sequence comparison with known esterases/ lipases, REst1 represents a new esterase belonging to the class IV family. The purified enzyme worked optimally at $50^{\circ}C$ and pH 8, utilized pNP esters of short chain lengths, and showed best catalytic activity with p-nitrophenyl butyrate ($C_4$), indicating that it was an esterase. The enzyme was completely inhibited by PMSF and DEPC and showed moderate organotolerance.
Since the anaerobic rumen fungi were discovered in the rumen of a sheep over two decades ago, they have been reported in a wide range of herbivores fud on high fibre diets. The extensive colonisation and degradation of fibrous plant tissues by the fungi suggest that they have a role in fibre digestion. All rumen fungi studied so far are fibrolytic. They produce a range of hydrolytic enzymes, which include the cellulases, hemicellulases, pectinases and phenolic acid esterases, to enable them to invade and degrade the lignocellulosic plant tissues. Although rumen fungi may not seem to be essential to general rumen function since they may be absent in animals fed on low fibre diets, they, nevertheless, could contribute to the digestion of high-fibre poor-quality forages.
We present here an in silico search of fungal sterol-esterase/lipase and bacterial depolymerase sequences from environmental metagenomes. Both enzyme types contain the α/β-hydrolase protein fold. Analysis of DNA conserved motifs, protein homology search, phylogenetic analysis, and protein 3D modeling have been used, and the efficiency of these screening strategies is discussed. The presence of bacterial genes in the metagenomes was higher than those from fungi, and the sequencing depth of the metagenomes seemed to be crucial to allow finding enough diversity of enzyme sequences. As a result, a novel putative PHA-depolymerase is described.
Dumorne, Kelly;Cordova, David Camacho;Astorga-Elo, Marcia;Renganathan, Prabhaharan
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제27권4호
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pp.649-659
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2017
Extremophilic microorganisms have established a diversity of molecular strategies in order to survive in extreme conditions. Biocatalysts isolated by these organisms are termed extremozymes, and possess extraordinary properties of salt allowance, thermostability, and cold adaptivity. Extremozymes are very resistant to extreme conditions owing to their great solidity, and they pose new opportunities for biocatalysis and biotransformations, as well as for the development of the economy and new line of research, through their application. Thermophilic proteins, piezophilic proteins, acidophilic proteins, and halophilic proteins have been studied during the last few years. Amylases, proteases, lipases, pullulanases, cellulases, chitinases, xylanases, pectinases, isomerases, esterases, and dehydrogenases have great potential application for biotechnology, such as in agricultural, chemical, biomedical, and biotechnological processes. The study of extremozymes and their main applications have emerged during recent years.
Recent developments in the application of molecular biology to food grade lactic acid bacteria (LAB) have shown that it could be feasible to engineer metabolic pathways to either enhance specific metabolic fluxes or to divert metabolites for the production of different or new end products. This engineering requires detailed knowledge of enzymes involved in metabolism and regulation within the targeted organism but little works have been done in this area. During biochemical and molecular characterisation of lactic bacterial enzymes, some of probiotic Lactobacillus and Bifidobacterium species were found to be very useful for food, nutraceutical and pharmaceutical industries. The enzymes are usually intracellular and the yields are very low to be useful for industrial applications. Among many enzymes and proteins of lactic bacteria studied, some of our gene cloning achievements have contributed to overproduction of lactic bacterial enzymes such as peptidases, esterases, lactases, bile salt hydrolases and linoleate isomerases for foods and nutraceuticals.
Changes in activity and classification of esterase isozymes during the tire cycle or Plodia inteipunctella (Hiibner) were investigated by the native polyacrylamide gel electrophoresis. The stage specificity in esterase activity and isozyme pattern was observed throughout the larvalpupal-adult transformation. The activity esterase was highest at the 3-day old adult stage, and the lowest level at the prepupal stage. A total of 12 esterase bands were identified throughout the development, and the bands showing high enzyme activity was observed in the middle part of gel. Twelve esterases on the basis of inhibition by the three types of inhibitors (organophosphates, eserine sulfate and sulfhydryl reagents) were classified into three class, namely, carboxylesterase (CE), arylesterase (ArE) and cholinesterase (ChE), and these classes contained 7, 3 and 2 isozymes, respectively.
Bacillus stearothermomophilus, a strong xylan degrader, was confirmed to express multiple esterase activities in addition to the major xylanolytic enzymes. One of the genes encoding the esterases was isolated from the genomic library of B. stearothermophilus constructed with EcoRl restriction endonuclease and pBR322 plasmid. Three recombinant plasmids showing the tributyrin degrading activity were selected from approximately 7, 000 E. coli HB101 transformants, and were found to have the same insert of a 3.2 kb DNA fragment. Restriction mapping and hybridization studies revealed that the gene(estII) on the hybrid plasmid (pKMG7) had originated from the B. stearothermophilus chromosome, and was distinct from the estl, another esterase gene of B. stearothermophilus isolated in the previous work. The E. coli cells harboring pKMG7 produced an acetylxylan esterase that exibited similar substrate specificity to the esterase encoded by the estI gene.
The potential for a given anticholinesterase pesticide to exhibit age-related toxicity is essential information for an accurate and proper risk assessment of that compound. This investigation was designed to study the age-related toxicity of active metabolites of four organophosphates using in vitro detoxification measurement. The blood samples were collected from 1 month and 18 months old rats. The $IC_{50}$ values of mouse brain recombinant AChE of chlorpyrifos-oxon, diazoxon, malaoxon and paraoxon were 10.35, 112.84, 151.28 and 18.43 nM, respectively. When the plasma of young rats, and $CaCI_2$were added, the $IC_{50}$ values of mouse brain recombinant AChE of chlorpyrfos-oxon, diazoxon, malaoxon and paraoxon were 31.89, 164.25, 139.94 and 16.36 nM, respectively. The $IC_{50}$ values of mouse brain recombinant AChE of chlorpyrifos-oxon, diazoxon, malaoxon and paraoxon were changed to 136.840, 1244.45, 654.54 and 52.66 nM by A-esterases In adult rats. These results suggest that four organophosphates have a potential toxicity to exhibit age-related sensitivity.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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