Frost injury of crops is closely related to the epiphytic population dynamics of ice nucleation-active (INA) bacteria, and the injury can be reduced by decreasing the INA bacterial population. In order to predict the epiphytic population of INA bacteria on crops, a rapid and accurate detection method has to be developed. In the previous report, we produced some antibodies against INA proteins purified from the outer membrane of INA bacteria. However it was difficult to produce the antibodies because the purification procedures of the INA proteins were complicated, and the final yield was too low. We designed a specific peptide from the N-terminal region of INA protein by computer analysis and synthesized the peptide in vitro in this experiment. The peptide sequence was Asp-Ser-Por-Leu-Ser-Leu-His-Ala-Asp, that is corresponding to the highly conserved region in several INA proteins, with predicted beta turn, coiling, and hydrophilic region. A polyclonal anti-INA peptide antiserum produced specifically recognized INA bacteria as few as 10 colony-forming units (CFU) in the ELISA reactions and did not respond to other non-INA bacteria. Serological specificity of the anti-INA peptide antiserum will facilitate the forecasting of the INA bacterial population dynamics on crops.
Mi Ryoung Oh;Hyung Seop Kim;Bora Jang;Jong Hyeok Kim;Keon Gang Jang;Jong Woo Park;Wonho Yih
Ocean and Polar Research
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제45권2호
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pp.57-69
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2023
Growth responses along the gradient of water temperature, salinity, and light intensity and cytotoxicity against Artemia nauplii were explored using Ostreopsis sp. and Coolia canariensis strains, representing the two potentially toxic epiphytic dinoflagellate (EPD) species from Jeju coastal waters of Korea. Variation in maximum growth rate (GRmax) and maximum biomass yield (Ymax) along the environmental gradients was quite contrasting between the two strains, which appears to be reflected in the in situ abundance distribution of the corresponding genera. The more eurythermal characteristics of Ostreopsis sp. strain were in good agreement with the relative distribution of Ostreopsis spp. and Coolia spp. in 520 macroalgal samples collected from 6 stations. The more stenohaline C. canariensis strain was well matched by a markedly narrower range of salinities in the in situ distribution of Coolia spp. than the salinity range for Ostreopsis species. The differences in light adaptation between the high light-preferring Ostreopsis sp. strain and the more euryphotic C. canariensis strain were remarkably consistent with the distinct vertical profiles of Ostreopsis spp. and Coolia spp. abundance in the red alga Amphiroa sp. off Moom-seom. Cytotoxicity against Artemia nauplii in the Ostreopsis sp. preparation with 1000 cells ml-1 was similar to that in C. canariensis preparation with 12000 cells ml-1, which is noteworthy. Thus, the new potential cytotoxicity risks from C. canariensis along with the well-known toxic genus Ostreopsis may be introduced to Jeju coasts, which necessitates further exploration into the contrasting ecological niches occupied by EPD species in relation to their cytotoxicity.
Nelson, Wendy A.;Sutherland, Judith E.;Hwang, Mi Sook;Choi, Han-Gu
ALGAE
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제29권3호
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pp.177-181
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2014
An epiphytic bladed member of the Bangiales was found growing in Christchurch (South Island, New Zealand). Molecular sequence data and morphological comparisons revealed that the New Zealand specimens belong to the species Pyropia koreana (M. S. Hwang & I. K. Lee) M. S. Hwang, H. G. Choi, Y. S. Oh & I. K. Lee. This is the first record of Py. koreana in the southern hemisphere and a new record of an introduced species in New Zealand.
There are recognized three new species of Polysiphonia sensu lato at a 10-20 m water depth from Jeju Island, Korea. We described the morphology of three new species and analyzed rbcL sequences to infer phylogenetic relationships among Polysiphonia sensu lato. Polysiphonia amplacapilli sp. nov. is characterized by an epiphytic, discoid holdfast, 5-7 pericentral cells, large trichoblasts, lateral branches connecting with trichoblasts, only slightly corticated in the basal parts, cut-off rhizoids and a spiral arrangement of tetrasporangia. Polysiphonia morroides sp. nov. is characterized by saxicolous, cut-off rhizoids, four pericentral cells, ecorticate, spiral arrangement of tetrasporangia, and it was collected at the fast-flowing water habitat in 20-25 m depth. Polysiphonia sabulosia sp. nov. is characterized by ecorticate, 5-6 pericentral cells, a single filamentous trichoblast, lateral branches connecting with the trichoblasts, cut-off rhizoids, and spiral arrangement of tetrasporangia, and is growing in the sandy locations. The phylogenetic analysis of rbcL sequences demonstrated that three new species are clearly distinguished from other species of Polysiphonia sensu lato.
The cluster analysis on the distribution of epiphytic lichens on the north, south, east and west slope of Mt. Hanra was carried out by three methods, sum of square algorithm (SSA), prinicipal component analysis (PCA) and multidimensional scaling method(MDS). Analysis of concentration (AOC) was used for the comparison between the lichen communities of north and south slope. The lichen species was identified 35 species by Hale and Culberson technique. The classification of sites by SSA method was divided into two areas in four slopes, and that of species by SSA, PCA and MDS methods was classified into three clusters in east slope, four clusters in south and west slope, and there clusters in north slope. The comparison between north and south slope of the distribution of lichens indicates that loight elevation of north slope (NH; 1600m~1900m) was similar to that of relative low elevation of south slope (SL; 1000m~1300m). The genus lichen, Anaptychia, Parmelia, Lobaria and peltigera was found as the dominant genus in both slopes.
West, John A.;Kamiya, Mitsunobu;Loiseaux de Goer, Susan;Karsten, Ulf;Zuccarello, Giuseppe C.
ALGAE
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제28권3호
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pp.241-266
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2013
The mangrove algal flora of Guam and the Federated States of Micronesia has been poorly explored. We add to our knowledge of this region by observations of collections from these regions. This paper presents new and additional records of: Rhodophyta-Acrochaetium globosum, Colaconema sp., Caulacanthus indicus, Bostrychia moritziana / B. radicans, B. radicosa, B. simpliciuscula, B. kelanensis and B. tenella, Murrayella periclados, and Caloglossa ogasawaraensis; Chlorophyta-Boodleopsis carolinensis; and Phaeophyceae-Dictyota adnata, Dictyotopsis propagulifera, and Canistrocarpus cervicornis. Most specimens were cultured to investigate their reproductive biology and many specimens were further identified using molecular data. Low molecular weight carbohydrates (dulcitol, sorbitol, and digeneaside) were identified in samples of B. radicosa and B. simpliciuscula. We also present data on manganese-rich deposits found on B. simpliciuscula and B. tenella in culture, possibly formed by epiphytic bacteria.
Oteng'o, Antony Otinga;Avila-Peltroche, Jose;Jeong, So Young;Won, Boo Yeon;Cho, Tae Oh
환경생물
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제37권3호
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pp.285-292
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2019
Acinetospora filamentosa and Microspongium stilophorae are reported as new records from South Korea based on morphological and molecular analyses. A. filamentosa is mainly characterized by having the sparsely branched erect filaments, the scattered meristematic zones, forming crampons, plurilocular sporangia on both prostrate filaments and lower part of erect filaments, and spherical to oval unilocular sporangia formed either sessile or with a pedicel. M. stilophorae is an epiphytic thalli mostly on Stilophora sp. It is characterized by prostrate filaments with irregular cells, short erect filaments with short ramuli, phaeophycean hairs, uniseriate plurilocular sporangia on the terminal part of erect filament. Our molecular analyses of rbcL and cox1 genes reveals that A. filamentosa and M. stilophorae are nested within the clades of Acinetospora and Microspongium, respectively.
Aguilar-Rosas, Raul;Aguilar-Rosas , Luis E.;Mateo-Cid, Luz Elena;Mendoza-Gonzalez, Catalina
ALGAE
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제22권3호
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pp.153-157
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2007
Two species of marine red algae, Jania ungulata (Yendo) Yendo f. brevior (Yendo) Yendo and Peyssonnelia japonica (Segawa) Yoneshigue (Rhodophyta) were collected for the first time from Mexican Pacific coast. Their vegetative and reproductive structures are described, as well as the habitat where they were found and their geographical distribution along the Pacific coasts of Mexico. Jania ungulata f. brevior is a commonly growing epiphytic and Peyssonnelia japonica is epiphyte. The fact that we found this new records in Mexican coast is noteworthy, due that this species are originally described in Japanese coast. The absence of records of this species in the Mexican coast is likely related in part to the lack of specific collections and the fact that the specimens are small and delicate, and may commonly be unnoticed during samplings.
To establish a cultivation method of Petalonia fascia, seeds and seedlings cultures and growth tests were performed at the Daeri aquafarm in Haeui, Shinan, Jeollanamdo, Korea. Gametes were easily released from the mature plurilocular sporangia. They developed to crustose discoidal stolons and grew to filamentous and discoidal stolons. The indoor seeding was performed by using the 100-150 ${\mu}m$long fragments of stolons on Porphyra nets and the erect thalli developed from the cuttings when the seawater temperatures were 10-15$^{\circ}C$. In the experimental cultivation in the sea, 1-2mm long plantlets were found after 15 days of cultivation; after two months thalli grew to their maximal size of 215-355 mm long blades; after three months the length of thalli began to decrease due to distal disintegration and the plant color changed to yellow and epiphytic diatoms were attached on the thalli, which deteriorated the quality of products. The cultivation of P. fascia by the regeneration of filamentous-discoidal complexes was carried out successfully for the first time in Korea.
Five benthic species of the genus Gambierdiscus (Dinophyceae) were observed for the first time in the coastal waters of Pakistan, Northern Indian Ocean. The morphology of the epiphytic, ciguatera-related toxic species G. toxicus, G. belizeanus, G. polynesiensis, G. australes and G. cf. yasumotoi are presented here, described by the Kofoid system of thecal plates Po, 3', 7", 6c, 8s, 5"', 1p, 2"" with differences in cell shape, cell size, plates, pores around the apical pore plate by using light and scanning electron microscopy. The occurrence of these potentially toxic dinoflagellate species in Pakistani coastal areas of Manora Channel and Balochistan during high temperatures of 28-$32^{\circ}C$ is cause of concern for human health impacts from ciguatera fish poisoning.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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