• 제목/요약/키워드: endo-B-1

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Bacillus circulans 유래 cellulolytic xylanase 유전자(bglBC2)의 염기서열 결정 및 분석 (Nucleotide Sequence of Cellulolytic Xylanase Gene (bglBC2) from Bacillus circulans)

  • 김지연
    • 미생물학회지
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    • 제42권1호
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    • pp.67-72
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    • 2006
  • 클로닝된 Bacillus circulans ATCC21367 유래 cellulolytic xylanase 유전자(bglBC2)의 염기서열을 결정 분석하였다. 본 유전자는 1,224 bp의 407개 아미노산을 암호하는 open reading frame (ORF)으로 구성되어 있었으며 염기서열로부터 산출된 유전자의 분자량은 45 kDa으로 효소의 SDS-PAGE로부터 측정된 분자량과 일치하였다. ATG 개시 코돈의 9bp 위쪽에 Shine-Dalgarno (SD) 서열로 추정되는 5'-AAAGGAG-3' 서열이 확인되었고 그 상단에 promoter로 추정되는 -35 서열(TTTACA)과 -10 서열(TATACT)이 위치하고 있었으며, 이는 B. subtilis promoter consensus sequence와 유사하였다. 한편, 이 효소의 아미노산 서열은 이미 보고된 B. circulans KSM-N257의 alkaline $endo-\beta-1,4-glucanase$와는 97%, B. circulans WL-12의 $endo-\beta-1,3-1,4-glucanase$와는 75%, Bacillus sp. KSM-330의 $endo-\beta-1,4-glucanase$ (cellulase)와는 45%의 유사성을 나타내었다. 또한 bglBCS 염기서 열의 정보를 GenBank에 등록하였으며 등록번호는 Ar269256이다.

Aspergillus niger의 변이주(變異株)에 의(依)한 Endo-polygalacturonase의 생산(生産) (Production of Endo-Polygalacturonase of a Mutant of Aspergillus niger)

  • 박윤중;손천배
    • 농업과학연구
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    • 제12권2호
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    • pp.324-332
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    • 1985
  • 각종(各種) 시료(試料)로부터 1,573주(株)의 균주(菌株)를 분리(分離)하고 그 중에서 endo-polygalacturonase (Endo-PG) 활성이 강한 Aspergillus niger B-15를 선발하였다. 이어서 선정균주(選定菌株)에 자외선을 연차적(連次的)으로 조사(照射)하여 변이주(變異株) U-46을 얻었으며 친주(親株)와 변이주(變異株)의 균학적성질(菌學的性質)을 조사(調査)하고 변이주(變異株)의 효소생산조건(酵素生産條件)과 반응조건(反應條件)을 검토(檢討)하여 아래와 같은 결과를 얻었다. 1. 변이주(變異株) U-46은 친주(親株)보다 분생자두(分生子頭)의 크기가 작아지고 분생자병(分生子柄)의 길이가 짧아졌다. 2. 밀기울배지에서의 배양(培養)에 있어서 Endo-PG생산(生産)을 위한 최적조건(最適條件)은 친주(親株) B-15의 경우 밀기울에 대한 첨수량(添水量) 40%, 배양온도(培養溫度) $30{\sim}35^{\circ}C$였으나 변이주(變異株) U-46의 경우는 밀기울에 대한 첨수량(添水量) 60~70%, 배양온도(培養溫度) $35^{\circ}C$였다. 배양일수는 어느 것이나 2~3일간이 적당하였다. 3. 친주(親株)와 변이주(變異株)를 각각의 최적조건(最適條件)에서 배양(培養)할 경우 친주(親株) B-15의 Endo-PG에 비하여 변이주 U-46의 효소활성은 약 20배 높았다. 4. 밀기울배지(밀기울에 대한 첨수량(添水量) 60%)에 $35^{\circ}C$, 3일간 배양할 경우 변이주 U-46 은 친주(親株)에 비하여 Endo-PG 활성이 약 47배(倍)로, Exo-PG 활성은 약 18배로 증가되었으며 cellulase, ${\alpha}$-amylase 및 glucoamylase 활성도 증가되었다. 5. 밀기울에 $(NH_4)_2SO_4$을 1.2~1.5% 첨가(添加)한 배지에서 변이주(變異株) U-46의 Endo-PG 활성(活性)은 약 20% 증가되었다. 6. 변이주(變異株) U-46의 조효소액(粗酵素液)의 Endo-PG 반응(反應) 최적조건은 pH 4.0~4.5, $50^{\circ}C$이었다.

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Characterization of the 5-Flanking region upstream from the structural gene for Zymononas mobilis alcohol dehydrogenase

  • Yoon, Ki-Hong;Park, Seung-Hwan;Jung, Kyung-Hwa;Pack, M. Y.
    • Journal of Microbiology
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    • 제33권2호
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    • pp.126-127
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    • 1995
  • A Zymomonas mobilis DNA fragment consisting of 207 nucleotides, which corresponded to the 5'-flanking region of an adhB gene encoding alcohol dehydrogenase II, was fused to the structural gene coding for a Bacillus endo-.betha.--1, 4-glucanase. The Z. mobilis DNA framgment waw identified to promote 50-fold increase in the expression of endo-.betha.1. 4 glucanase gene in Escherichia coli.

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Molecular Cloning and Nucleotide Sequence of Endo-Inulinase Gene from Xanthomonas oryzae #5

  • 김병우;김미랑;유동주
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
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    • pp.655-659
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    • 2000
  • 토양에서 분리한 endo-inulinase 생산 균주인 Xanthomonas oryzae #5로 부터 11.5kb의 endo-inulinase 유전자를 포함하는 재조합 plasmid를 함유한 형질 전환주를 분리하였다. 11.5kb의 단편으로부터 8.6kb, 4.1kb의 단편을 포함한 pDI 2, pDI4 재조합 plasmid를 제작하여 활성을 확인한 결과 endo-inuliase 활성을 나타내었으며, 재조합 plasmid pDI 2를 이용하여 DNA sequence를 한 결과 endo-inulinase 유전자는 1,333개의 아미노산으로 구성된 ORF를 가지고 있었다. 또한 B. circulans MCI-2554의 CFTase와 아미노산 배열에 있어은 약 72%의 높은 homology를 나타냈었으며, 다른 fructan hydrolases, inulinase, levanase와의 아미노산 비교로부터 ${\beta}-fructouranosidase$ motif를 포함한 6개의 유사부위를 확인하였다.

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Endo-1,4-β-xylanase B from Aspergillus cf. niger BCC14405 Isolated in Thailand: Purification, Characterization and Gene Isolation

  • Krisana, Asano;Rutchadaporng, Sriprang;Jarupan, Gobsuk;Lily, Eurwilaichitr;Sutipa, Tanapongpipat;Kanyawim, Kirtikara
    • BMB Reports
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    • 제38권1호
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    • pp.17-23
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    • 2005
  • During the screening of xylanolytic enzymes from locally isolated fungi, one strain BCC14405, exhibited high enzyme activity with thermostability. This fugal strain was identified as Aspergillus cf. niger based on its morphological characteristics and internal transcribed spacer (ITS) sequences. An enzyme with xylanolytic activity from BCC14405 was later purified and characterized. It was found to have a molecular mass of ca. 21 kDa, an optimal pH of 5.0, and an optimal temperature of $55^{\circ}C$. When tested using xylan from birchwood, it showed $K_m$ and $V_{max}$ values of 8.9 mg/ml and 11,100 U/mg, respectively. The enzyme was inhibited by $CuSO_4$, EDTA, and by $FeSO_4$. The homology of the 20-residue N-terminal protein sequence showed that the enzyme was an endo-1,4-$\beta$-xylanase. The full-length gene encoding endo-1,4-$\beta$-xylanase from BCC14405 was obtained by PCR amplification of its cDNA. The gene contained an open reading frame of 678 bp, encoding a 225 amino acid protein, which was identical to the endo-1,4-$\^{a}$-xylanase B previously identified in A. niger.

EndoTwinn과 System B continuous wave of obturation units를 이용한 근단부 근관충전 효율비교 (Comparison of apical sealing ability of continuous wave of obturation technique using EndoTwinn and System B)

  • 신현주;박정길;허복;김현철
    • Restorative Dentistry and Endodontics
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    • 제32권6호
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    • pp.522-529
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    • 2007
  • 최근 continuous wave of obturation technique을 이용한 근관 충전 장비로서 열 적용뿐 만 아니라 초음파 진동의 기능이 부가된 EndoTwinn이라는 기구가 소개되었다. 이 연구의 목적은 일반적으로 널리 사용되는 System B와 새로운 기구인 EndoTwinn을 사용한 근관충전 시 근단 폐쇄 효율을 비교하기 위한 것이다. 직선형 치근을 가진 60개의 발치된 소구치와 상악 절치를 근관장 측정 후, 6% 경사의 엔진 구동형 니켈-타이타늄 파일을 이용하여 #35 파일까지 확대 및 세척하였다. SB군 (n=20)은 System B, ET군 (n=20)은 EndoTwinn을 이용해 충전하고, Obtura II를 이용하여 backfill하였다. 양성 대조군으로서 PC군(n=10)은 근관 형성 후 빈 근관으로 남겨두었다. SB, ET, PC군의 시편은 치근첨 주위 1 mm를 제외한 모든 치근면에 nail varnish을 적용하고 음성 대조군인 NSB군(n=5)과 NET군(n=5)의 시편은 치근첨을 포함한 모든 치근면에 nail varnish를 도포하였다. 각 치아의 치근첨을 메틸렌블루 용액에 2일간 담궈 보관한 후, 치근첨에서 5 mm까지 1 mm간격으로 절단하여 근관벽의 착색 정도를 평가하였고, 각 높이에서의 점수를 합하여 그 시편의 점수로 정하였다. 두 장비 간의 염색제 누출의 유의성 검정을 위해 student t 분석을 시행하였다. 완전히 잘려지지 않고 플러거에 가타퍼챠가 달려나오는 빈도를 비교하기 위해 카이 분석을 시행하였다. PC군은 모든 근관과 상아세관이 착색되었으며, NC군은 착색이 되지 않았다. ET군의 착색 정도가 SB군보다 유의하게 적게 나타났으며(p < 0.05). 플러거에 가타펴챠가 달려나오는 빈도는 유의한 차이가 없었다. 이 실험의 조건하에서, EndoTwinn을 이용해 충전한 경우에 System B를 이용해 충전한 경우보다 근단부 밀폐 정도가 더 좋은 것으로 사료된다.

DFT Study of p-tert-Butylcalix[5]crown-6-ether Complexed with Alkylammonium Ions

  • Oh, Dong-Suk;Choe, Jong-In
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제28권4호
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    • pp.596-600
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    • 2007
  • The structures and energies of p-tert-butylcalix[5]crown-6-ether (1) and its alkylammonium complexes have been calculated by DFT B3LYP/6-31G(d,p) method. We have studied the binding sites of these host-guest complexes focusing on the p-tert-butylcalix[5]arene pocket (endo) or the crown-6-ether moiety (exo) of 1. The smaller alkylammonium cations have the better complexation efficiency with p-tert-butylcalix[5]crown-6- ether than the bulkier alkylammonium ions. For the sec- and tert-butylammonium ions, the hydrogen-bond distances of the exo-complexes are shorter, therefore, stronger than the endo-cases. This DFT calculated result is in parallel with the trend of the experimental association constants of the branched butylammonium ions.

Expression and Secretion of Foreign Proteins in Yeast Using the ADH1 Promoter and 97 K Killer Toxin Signal Sequence

  • Hong, Seok-Jong;Kang, Hyen-Sam
    • BMB Reports
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    • 제31권2호
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    • pp.123-129
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    • 1998
  • Foreign proteins, $endo-{\beta}-1,4-glucanase$ of Bacillus subtilis, preS1+S2 region of hepatitis B virus large surface antigen, human ${\beta}_2-adrenergic$ receptor ($h{\beta}_{2}AR$), and bovine growth hormone (bGH) were expressed in Saccharomyces cerevisiae and secreted into the medium. These proteins were expressed using the alcohol dehydrogenase I (ADH1) promoter of Saccharomyces cerevisiae and secreted by signal sequence of the 97 K killer toxin gene of doublestranded linear DNA plasmid (pGKL1) of S. cerevisiae. All these proteins underwent severe modifications; in particular, N-glycosylation in the case of $endo-{\beta}-1,4-glucanase$, $h{\beta}_2AR$, and preS1+S2. Seventy four percent of the expressed $endo-{\beta}-1,4-glucanase$ was secreted into the culture medium. Highly modified proteins were detected in the culture medium and in the cell. Expressed $h{\beta}_2AR$, which has seven transmembrane domains, remained in the cell. The degrees of secretion and modification and the states of proteins in the culture medium and in the cell were quite different. These results indicated that the nature of the protein has a critical role in its secretion and modifications.

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N-Acyliminium에의 친핵성 부가에 의한 Octahydro-2,3-dioxo-cyclopenta[b]pyrrole-3a-carboxylates의 합성 (Synthesis of Octahydro-2,3-dioxo-cyclopenta[b]pyrrole-3a-carboxylates by Nucleophilic Addition to N-Acyliminium)

  • 서원준;정창희;최승주;박영규;김태흥;이상규
    • 대한화학회지
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    • 제38권12호
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    • pp.908-914
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    • 1994
  • 5원자 고리형 ${\beta}$-keto ester와 phenylalkylamine의 탈수축합으로 얻은 enamine A의 oxalyl화 및 물이나 메탄올 부가에 의하여 octahydro-2,3-dioxo-cyclopenta[b]-pyrrole-3a-carboxylate의 6a-hydroxy- 및 6a-methoxy-유도체(1~6)를 합성하였다. 헤테로 고리의 형성은 불안정한 N-acyliminium(B)체를 경유하여 일어나며, 안정한 부가체 C (1∼6)는 endo-ene형 pyrrolinium B에 친핵체를 부가하여 얻을 수 있었다.

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The Endo-β-1,4-Glucanase of Bacillus amyloliquefaciens Is Required for Optimum Endophytic Colonization of Plants

  • Fan, Xiaojing;Yang, Ruixian;Qiu, Sixin;Cai, Xueqing;Zou, Huasong;Hu, Fangping
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권5호
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    • pp.946-952
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    • 2016
  • The eglS gene in Bacillus amyloliquefaciens encodes an endo-β-1,4-glucanase that belongs to glycosyl hydrolase family 5. In this study, a disruption mutant of gene eglS was constructed to examine its role in bacterial adaptation in plants. The mutant TB2k, eglS gene inactivated bacterial strain, was remarkably impaired in extracellular cellulase activity. When inoculated on Brassica campestris, the TB2k population was reduced by more than 60% compared with the wild-type strain in the root, stem, and leaf tissues. Overexpression of eglS in the wild-type strain increased the bacteria population in the plant tissues. Further studies revealed that the transcription level of eglS was correlated with bacterial population. These data demonstrate that endo-β-1,4-glucanase of B. amyloliquefaciens is required for its optimal endophytic colonization.