• Journal of Animal Science and Technology
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• 제65권4호
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• pp.838-855
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• 2023

The highly pathogenic avian influenza (HPAI) virus triggers infectious diseases, resulting in pulmonary damage and high mortality in domestic poultry worldwide. This study aimed to analyze miRNA expression profiles after infection with the HPAI H5N1 virus in resistant and susceptible lines of Ri chickens.For this purpose, resistant and susceptible lines of Vietnamese Ri chicken were used based on the A/G allele of Mx and BF2 genes. These genes are responsible for innate antiviral activity and were selected to determine differentially expressed (DE) miRNAs in HPAI-infected chicken lines using small RNA sequencing. A total of 44 miRNAs were DE after 3 days of infection with the H5N1 virus. Computational program analysis indicated the candidate target genes for DE miRNAs to possess significant functions related to cytokines, chemokines, MAPK signaling pathway, ErBb signaling pathway, and Wnt signaling pathway. Several DE miRNA-mRNA matches were suggested to play crucial roles in mediating immune functions against viral evasion. These results revealed the potential regulatory roles of miRNAs in the immune response of the two Ri chicken lines against HPAI H5N1 virus infection in the lungs.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제54권6호
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• pp.777-786
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• 2016

Raillietina species are prevalent in domestic chickens (Gallus gallus domesticus) in Phayao province, northern Thailand. Their infection may cause disease and death, which affects the public health and economic situation in chicken farms. The identification of Raillietina has been based on morphology and molecular analysis. In this study, morphological observations using light (LM) and scanning electron microscopies (SEM) coupled with molecular analysis of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region and the nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit 1 (ND1) gene were employed for precise identification and phylogenetic relationship studies of Raillietina spp. Four Raillietina species, including R. echinobothrida, R. tetragona, R. cesticillus, and Raillietina sp., were recovered in domestic chickens from 4 districts in Phayao province, Thailand. LM and SEM observations revealed differences in the morphology of the scolex, position of the genital pore, number of eggs per egg capsule, and rostellar opening surface structures in all 4 species. Phylogenetic relationships were found among the phylogenetic trees obtained by the maximum likelihood and distance-based neighbor-joining methods. ITS2 and ND1 sequence data recorded from Raillietina sp. appeared to be monophyletic. The query sequences of R. echinobothrida, R. tetragona, R. cesticillus, and Raillietina sp. were separated according to the different morphological characters. This study confirmed that morphological studies combined with molecular analyses can differentiate related species within the genus Raillietina in Thailand.

• 농업과학연구
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• 제37권3호
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• pp.399-404
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• 2010

닭의 진화를 이해하기 위하여 변이가 많다고 알려진 LYZ 유전자의 엑손과 인트론에 존재하는 단일염기다형이 본 연구를 통해 확인되었다. 2개의 한국 재래실용계에서 총 24개체의 DNA 샘플이 본 연구에서 이용되었으며 단일염기 다형의 확인을 위하여 3개체의 샘플을 혼합하여 염기서열 분석을 실시하였다. 적색야계와의 비교를 통하여 두 한국 재래실용계는 18개의 염기서열변이를 확인할 수 있었으며 한국 재래실용계 간에는 15개의 염기서열 변이를 확인할 수 있었다. 총 33개의 변이 중 두 개의 삽입변이(21 bp와 4 bp)가 확인되었다. 한편, 2번째 엑손의 1426 bp 위치에 존재하는 단일염기 다형(p.Ala49Val)은 아미노산의 변이를 나타내는 미스센스 돌연변이로 확인되었다. 이 돌연변이는 이 lysozyme 효소의 촉매작용을 하는 위치에 놓여 있어 효소의 활성과 밀접한 관계가 있을 것으로 추정된다. 본 연구에서 밝혀진 LYZ 유전자의 변이는 이 유전자의 기능뿐 아니라 한국 재래실용계 집단의 구조를 이해하는데 기초자료로 이용될 것으로 사료된다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제25권3호
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• pp.226-231
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• 2010

본 논문은 합성형 성장호르몬으로 천연 프로게스테론에 비해 20~30배 강하게 작용하는 초산메드록시프로게스테론에 대한 정량한계, 표준물질의 직선성, 회수율 등의 유효성 평가 및 내부표준물질 선정을 통한 분석방법 최적화를 식품공전의 시험법을 기초로 수행하고, 이를 바탕으로 국내 유통식육 내 초산메드록시프로게스테론의 잔류량을 조사하였다. 그 결과 초산메드록시프로게스테론의 검출한계는 1.5 ug/kg, 정량한계는 5.0 ug/kg 으로 나타났으며 표준물질의 좋은 직선성 ($r^2$= 0.9968)을 확인 하였다. 내부표준물질의 비교결과 식품에 오염될 우려가 없는 progesterone-D9으로 선정하였다. 이를 시험한 결과 7.69분의 머무름 시간을 가지며, 정량이온은 m/z 324-100, 정성이온은 m/z 324-113으로 설정하였다. 내부표준물질에 대한 정량의 회수율 실험결과 67.5~109.5%로 높아진 회수율을 나타낸 것을 알 수 있었다. 이와 함께 전국의 서울특별시 및 6개 광역시에서 수거한 국내산 쇠고기 46건, 수입산 쇠고기 43건, 국내산 돼지고기 60건, 수입산 돼지고기 12건과 국내산 닭고기 35건의 초산메드록시프로게스테론의 잔류량을 실태 조사한 결과 검출된 경우는 한건도 없었다. 따라서, 초산메드록시프로게스테론에 대한 유통 식육은 안전한 것으로 조사되었다.

• 한국가금학회지
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• 제43권2호
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• pp.77-88
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• 2016

본 연구에서는 국산종계 개발을 위하여 5계통의 토종닭 순계를 이용하여 $5{\times}5$ 이면교배조합 시험을 수행하고, 공시된 25계통에 대한 스트레스 반응 정도를 비교 분석하였다. 스트레스 반응정도 표지로 텔로미어 함량 및 감축율, 열 스트레스 단백질 유전자(HSPs)로 HSP-70, $HSP-90{\alpha}$, $HSP-90{\beta}$의 발현율 및 DNA 손상율을 이용하여 분석하였다. 텔로미어 함량은 양적 형광접합보인법을 이용하고, HSPs 발현율은 quantitative real-time PCR 기법으로, DNA 손상율은 Comet assay법을 적용하였다. 분석 결과, 교배조합 25계통 간 텔로미어 함량과 감축율, HSPs 유전자 발현율 및 DNA 손상율 모두에서 유의한 차이를 보였고, 더불어 계통 간 체중 및 생존율에도 유의한 차이가 나타났다. 텔로미어 감축율, HSPs 유전자 발현율 및 DNA 손상율 모든 분석 값에서 W 및 Y 계통과의 교잡구가 다른 교잡구에 비해 유의하게 낮은 값을 보였고, 반면 G계통의 순계구가 가장 높은 값을 나타내었다. 생존율과 스트레스 표지 값들 간의 상관계수를 추정한 결과, 텔로미어 함량과는 저도의 정(+)의 상관, HSP-70, $HSP-90{\alpha}$, $HSP-90{\beta}$ 및 DNA 손상율과는 중도 및 저도의 부(-)의 상관을 나타내었다. 또한 폐사 개체와 생존 개체 간 HSP-70, $HSP-90{\alpha}$ 및 $HSP-90{\beta}$의 발현율을 비교 분석한 결과, 폐사 개체의 HSPs 발현율이 생존 개체에 비해 유의하게 높은 발현율을 보였다. 이상 스트레스 표지 값의 분석 결과를 종합할 때, 교잡계들이 순계에 비해 스트레스 저항성이 높은 것으로 판단되고, 더불어 W, Y와 같은 경량종 계통의 교잡계들이 외적 스트레스에 강한 반면, G, H, F와 같은 고체중 계통의 교잡계들은 스트레스에 민감한 것으로 사료된다.

• 한국가금학회지
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• 제40권4호
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• pp.379-388
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• 2013

Avian paramyxovirus (APMV) type 4 and 6 were isolated during an avian influenza (AI) surveillance program of wild birds. This study also conducted experimental infection of wild-bird-origin APMV type 4 and 6 in specific pathogen free (SPF) chickens to study pathogenicity and transmission within domestic flocks. In addition, serological prevalence data of APMV type 4 and 6 in domestic fowls was conducted with chicken sera collected from 2007 to 2009 in order to understand infection status. The results of the animal experiment showed that APMV type 4 and 6 had the ability to infect chickens with sero-conversion and to transmit the virus from infected birds to contacted birds, but showed low pathogenicity. Serological tests revealed that APMV type 4 was widespread in the poultry industry, especially in layer flocks, but the positive rate for APMV type 6 was very low. This study concluded that wild bird-origin APMV type 4 and 6 could infect the chickens by inter-species transmission and the seroprevalence of APMV type 4 was quite high in Korean poultry. However, since almost all the chicken flocks had a high level of antibody titer against APMV type 1, there was possibility of cross reaction between APMV type 1 and 4, which made the interpretations more complicated. In order to understand infection status in the natural environment, additional study is necessary regarding the seroprevalence of APMV type 4 and 6 in the wild bird population.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제29권6호
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• pp.782-792
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• 2016

As the most common neurodegenerative diseases, Alzheimer's disease (AD) and Parkinson's disease (PD) are two of the main health concerns for the elderly population. Recently, microRNAs (miRNAs) have been used as biomarkers of infectious, genetic, and metabolic diseases in humans but they have not been well studied in domestic animals. Here we describe a computational biology study in which human AD- and PD-associated miRNAs (ADM and PDM) were utilized to predict orthologous miRNAs in the following domestic animal species: dog, cow, pig, horse, and chicken. In this study, a total of 121 and 70 published human ADM and PDM were identified, respectively. Thirty-seven miRNAs were co-regulated in AD and PD. We identified a total of 105 unrepeated human ADM and PDM that had at least one 100% identical animal homolog, among which 81 and 54 showed 100% sequence identity with 241 and 161 domestic animal miRNAs, respectively. Over 20% of the total mature horse miRNAs (92) showed perfect matches to AD/PD-associated miRNAs. Pigs, dogs, and cows have similar numbers of AD/PD-associated miRNAs (63, 62, and 59). Chickens had the least number of perfect matches (34). Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analyses suggested that humans and dogs are relatively similar in the functional pathways of the five selected highly conserved miRNAs. Taken together, our study provides the first evidence for better understanding the miRNA-AD/PD associations in domestic animals, and provides guidance to generate domestic animal models of AD/PD to replace the current rodent models.

• 유기물자원화
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• 제27권2호
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• pp.19-30
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• 2019

본 연구는 국내산 우각이 혼합된 유기질비료를 개발하여 가장 많은 유기재배 면적을 차지하고 있는 벼를 포함하여 가지에 대한 시용효과를 조사하고 수입 유박을 대체할 유기자원으로 우각의 활용가능성을 구명하고자 실시하였다. 질소함량이 높은 국내산 유기자원 선발을 위하여 계분, 어분, 콩깻묵, 참깻묵, 들깻묵, 혈분, 우각, 맥주오니 등 8종을 분석하여 질소함량이 높은 유기자원을 선발하였고 보조제로 왕겨 바이오차, 미강 등을 원료별, 혼합비율별로 혼합하고 성분을 분석하여 유기농업에 사용 가능한 유기질비료 제조조건을 확립하였다. 우각은 전질소(T-N) 함량이 12.0 %로 높아 혈분 13.5 % 다음으로 높았으며 어분 및 깻묵은 전질소 함량이 5.9~7.9 % 수준이었다. 계분은 유기농업에 사용가능한 무항생제 산란계 계분을 사용하였으며, 맥주오니는 질소함량이 3.4 %로 나타났다. 무항생제 계분, 우각, 맥주오니 등을 주재료로 바이오차, 미강 등을 보조제로 사용하여 유기질비료를 제조한 결과. 수입유박의 질소함량(4.0~4.2 %) 대비 개발한 유기질비료의 질소함량은 7.5 %로 높고 중금속함량은 Zn 400 mg/kg, Cu 120 mg/kg 이하 등으로 나타나 질소 함량이 높고 유기농업자재 품질기준에 적합한 유기질비료를 개발하였다. 우각이 포함된 유기질비료를 사용하여 벼와 가지를 재배하면서 시용효과를 조사한 결과 토양검정질소시비량 기준 100 % 시용시 혼합유박 대비 시용량을 40 % 감소하였음에도 벼 생육 및 수량이 대등하였으며, 가지 재배시에도 동일한 결과를 나타내었다. 우각 등 국산 유기자원을 이용한 새로운 고농도 질소원 선발 및 이를 이용한 유기재배 적합 유기질비료 개발은 친환경농업 확대 보급의 중요성이 높아지고 있는 현 시점에서 지역자원을 이용한 기존 수입 혼합유박 대체 연구의 출발점이자 폐기되고 있는 국내 유기자원의 활용 방안 모색에서 큰 의미를 가지며 향후 확대 보급된다면 친환경농산물의 안정적 생산에 기여할 수 있을 것으로 기대된다.

• 대한수의학회지
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• 제34권1호
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• pp.107-113
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• 1994

The present study was undertaken to obtain the basic knowledge on the distribution of intestinal microflora and characterization of Bifidobacterium isolated from the intestine of cattle, pigs, chicken and dogs. Bacteroidaceae and Streptococcus were isolated from the feces of cattle as predominant organisms, and Bifidobacterium was in counts of $8.65{\pm}0.21$ log 10 organisms. Bacteroidaceae, Eubacterium and Peptococcaceae counts on the feces of pigs were particularly high, but Bifidobacterium did not isolated. In hens and dogs, the counts of Bifidobacterium were $7.60{\pm}0.71$ and $8.15{\pm}2.04$ log 10 organism, respectively. Isolated 7 Bifidobacterial strains were identified respectively to B. thermophilum from cattle, B. pullorum and B. animalis from pigs, and B. longum, B. adolescentis and B. pseudolongum from dogs by their carbohydrate fermentation ability.

• 한국축산식품학회지
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• 제31권3호
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• pp.405-412
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• 2011

The purpose of this study was to isolate and characterize bacteriocin-producing bacteria against Clostridium perfringens from domestic animals to determine their usefulness as probiotics. The feces of cattle and chicken were used as sources to isolate bacteriocin-producing bacteria using the spot-on-lawn method. In total, 900 bacterial stains were isolated from domestic animal feces, and 19 strains were finally selected after determining the inhibitory activity against the pathogenic indicator C. perfringens KCTC 3269. Eighteen strains of Bacillus subtilis and one strain of Brevibacillus parabrevis were identified by 16s rRNA sequencing. Most of the bacterial strains isolated were resistant to 0.5% bile salts and remained viable after 2 h at pH 3.0. Additionally, some B. subtilis strains showed strong inhibitory activity against Listeria monocytogenes. We isolated and screened B. subtilis strains CB 153 and CB 189 from cattle and B. subtilis MSC 156 and B. parabrevis MSC 164 from chickens using probiotic selection criteria such as inhibition activity against C. perfringens and tolerance to acid and bile salts. The isolated bacteriocin-producing bacteria and/or bacteriocin have the potential to be used as probiotics in the livestock industry.