• Animal Bioscience
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• 제36권4호
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• pp.654-670
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• 2023

Objective: This study aimed to develop loop-mediated isothermal amplification (LAMP) combined with lateral flow dipstick (LFD) and compare it with LAMP-AGE, polymerase chain reaction (PCR), and standard Salmonella culture as reference methods for detecting Salmonella contamination in animal products and animal production environmental samples. Methods: The SalInvA01 primer, derived from the InvA gene and designed as a new probe for LFD detection, was used in developing this study. Adjusting for optimal conditions by temperature, time, and reagent concentration includes evaluating the specificity and limit of detection. The sampling of 120 animal product samples and 350 animal production environmental samples was determined by LAMP-LFD, comparing LAMP-AGE, PCR, and the culture method. Results: Salmonella was amplified using optimal conditions for the LAMP reaction and a DNA probe for LFD at 63℃ for 60 minutes. The specificity test revealed no cross-reactivity with other microorganisms. The limit of detection of LAMP-LFD in pure culture was 3×10² CFU/mL (6 CFU/reaction) and 9.01 pg/μL in genomic DNA. The limit of detection of the LAMP-LFD using artificially inoculated in minced chicken samples with 5 hours of pre-enrichment was 3.4×10⁴ CFU/mL (680 CFU/reaction). For 120 animal product samples, Salmonella was detected by the culture method, LAMP-LFD, LAMP-AGE, and PCR in 10/120 (8.3%). In three hundred fifty animal production environmental samples, Salmonella was detected in 91/350 (26%) by the culture method, equivalent to the detection rates of LAMP-LFD and LAMP-AGE, while PCR achieved 86/350 (24.6%). When comparing sensitivity, specificity, positive predictive value, and accuracy, LAMP-LFD showed the best results at 100%, 95.7%, 86.3%, and 96.6%, respectively. For Kappa index of LAMP-LFD, indicated nearly perfect agreement with culture method. Conclusion: The LAMP-LFD Salmonella detection, which used InvA gene, was highly specific, sensitive, and convenient for identifying Salmonella. Furthermore, this method could be used for Salmonella monitoring and primary screening in animal products and animal production environmental samples.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제8권1호
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• pp.42-52
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• 1991

최근 널리 사용되고 있는 제조회사가 다른 두가지 요시험지봉(Combur-9-test$^{(R)}$ RL & Multistix$^{(R)}$-SG)으로 요검사를 실시하면, 그 결과치의 표현에 있어 차이가 있으므로, 결과치 판정시 질병의 진단이나 치료의 효과 판정 및 경과관찰에 있어서 발생할 수 있는 혼란을 줄이고자, 환자검체와 표준검체에서 실시한 요시험지봉 검사결과를 비교 검토하여 아래와 같은 결론을 얻었다. 또한 두 시험지봉검사에 결과를 교환함에 있어 상응하는 결과치도 조사하였다. Combur-9-test RL 및 Multistix-SG를 이용하여, 1990년 12월 16일 부터 15일간 영남대학교 의과대학 부속병원 임상병리과에 요검사가 의뢰된 501명의 환자검체를 대상으로 하여 요시험지봉으로 화학적검사를 반정량적으로 시행한 결과 대체로 ${\pm}1$등급 범위내에서 일치하였다. Combur-9-test RL을 이용한 leukocyte esterase 검사와 요침사검사간의 비교에서 현미경적 농뇨와의 일치율은 83.7%, 민감도 48.1%, 특이도 90.3%, 양성예측율 47.4% 및 음성예측율 90.5%로 나타났다. Combur-9-test RL을 사용한 nitrite검사와 요배양검사간의 비교에서 요배양 양성과의 일치율은 93.0%, 민감도 19.4%, 특이도 84.7%, 양성예측율 53.8% 및 음성예측율 94.1%로 나타났다. 단백의 주 성분이 알부민 및 글로부린인 검체에서 실시한 요단백검사에서는 양자 모두에서 sulfosalicylic acid 법이 가장 민감하였고, 다음은 Multistix-SG, Combur-9-test RL의 순이었다. 요빌리루빈 및 요당검사에서는 두시험지봉이 비슷한 민감도를 나타내었다. 요중 백혈구검사에서는 요침사검사가, 요중 잠혈검사에서는 Combur-9-test RL이 가장 민감하였다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제58권5호
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• pp.183-189
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• 2015

Purpose: Catheter urine (CATH-U) and suprapubic aspiration (SPA) are reliable urine collection methods for confirming urinary tract infections (UTI) in infants. However, noninvasive and easily accessible collecting bag urine (CBU) is widely used, despite its high contamination rate. This study investigated the validity of CBU cultures for diagnosing UTIs, using CATH-U culture results as the gold standard. Methods: We retrospectively analyzed 210 infants, 2- to 24-month-old, who presented to a tertiary care hospital's pediatrics department between September 2008 and August 2013. We reviewed the results of CBU and CATH-U cultures from the same infants. Results: CBU results, relative to CATH-U culture results (${\geq}10^4$ colony-forming units [CFU]/mL) were widely variable, ranging from no growth to ${\geq}10^5CFU/mL$. A CBU cutoff value of ${\geq}10^5CFU/mL$ resulted in false-positive and false-negative rates of 18% and 24%, respectively. The probability of a UTI increased when the CBU bacterial count was ${\geq}10^5/mL$ for all infants, both uncircumcised male infants and female infants (likelihood ratios [LRs], 4.16, 4.11, and 4.11, respectively). UTIs could not be excluded for female infants with a CBU bacterial density of $10^4-10^5$ (LR, 1.40). The LRs for predicting UTIs based on a positive dipstick test and a positive urinalysis were 4.19 and 3.11, respectively. Conclusion: The validity of obtaining urine sample from a sterile bag remains questionable. Inconclusive culture results from CBU should be confirmed with a more reliable method.

• 대한임상검사과학회지
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• 제55권2호
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• pp.82-92
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• 2023

소변 침전물은 일반적으로 검사자가 원심분리한 소변을 현미경으로 검사한다. 따라서 소변 침전물 표본제작 과정의 차이가 검사 결과에 영향을 미치는지 확인했다. 요시험지 검사와 cobas u 701 analyzer에서 각각 백혈구 및 적혈구가 양성 반응으로 나온 107개의 신선한 검체를 수동 현미경검사를 위해 선택했다. 연구에서는 백혈구와 적혈구에 대해 자동분석기와 세 가지 수동 현미경검사법을 각각의 검사지침에 따라 평가하였다. 백혈구와 적혈구에 대한 cobas u 701 analyzer와 대한임상검사정도관리협회 간의 결정계수는 각각 r²=0.977과 r²=0.970이었다. 백혈구와 적혈구에 대한 cobas u 701 analyzer와 대한 임상검사정도관리협회 간의 일치도는 각각 74.8%, 77.6%였다. 대한임상검사정도관리협회 방법으로 표본을 제작하여 검사한 결과에서 자동분석기와 가장 좋은 상관성 및 일치도를 보였다. 결과적으로 소변 침전물 표본제작 방법의 차이는 침전물 농도에 영향을 미쳤으며 이는 HPF당 세포 등급과 수에 영향을 미쳤다. 따라서 보다 일관되고 정확한 검사 결과를 위해 소변 침전물 표본제작 과정을 표준화하는 것이 좋을 것으로 사료된다.