• 제목/요약/키워드: dicA

검색결과 221건 처리시간 0.029초

dicA promoter DNA에 붙는 H-NS 단백질에 의한 dicA 유전자의 발현 조절 (H-NS binding on dicA promoter DNA inhibits dicA gene expression)

  • 윤상훈;이연호;임헌만
    • 미생물학회지
    • /
    • 제55권3호
    • /
    • pp.191-198
    • /
    • 2019
  • H-NS는 대장균에서 DNA 결합 단백질로 수많은 유전자의 발현에 영향을 주는 것으로 잘 알려져 있다. DicA 단백질은 dicF, dicB의 발현을 억제하여 대장균의 분열을 조절한다. dicA의 발현에 Cnu, H-NS의 관여 여부는 CnuK9E 돌연변이가 $37^{\circ}C$에서 dicA의 발현을 억제하여 대장균이 길게 자라는 현상을 일으키며 처음 알려졌다. 하지만 Cnu와 H-NS 두 단백질이 어떻게 dicA의 발현을 조절하는지에 대한 분자적인 기작 연구는 잘 되어있지 않다. 본 연구에서 H-NS가 dicA와 dicC 유전자의 프로모터 부근에 염기서열 특이적으로 결합하며, $37^{\circ}C$ 보다 $25^{\circ}C$에서 DNA 더 잘 결합하는 것을 확인하였다. 그리고 EMSA를 통해 Cnu는 H-NS의 DNA 결합의 oligomeric state를 변화시키는 방식으로 작용하는 것을 보여주었다. In vivo transcription assay와 real time PCR을 통해 H-NS가 제거된 대장균에서 dicA 프로모터 활성이 높아지고, 분열 초기 dicA의 발현이 조절 받지 못하고 증가하는 것으로 보아, H-NS는 dicA의 발현에 억제자로서 기능한다.

In vivo와 in vitro에서 DicA 단백질의 온도 의존적 DNA 결합 (Temperature-dependent DNA binding of DicA protein in vivo and in vitro)

  • 이연호;윤상훈;임헌만
    • 미생물학회지
    • /
    • 제55권3호
    • /
    • pp.181-190
    • /
    • 2019
  • 대장균 세포분열 조절에 관여하는 DicA 단백질은 $37^{\circ}C$보다 $25^{\circ}C$에서 DNA에 더욱 잘 결합한다. 그러나 DicA 단백질의 온도의존적 DNA 결합에 대한 분자적 원인은 명확하지 않다. 본 연구에서는 DicA 단백질이 어떻게 DNA에 결합하며, 왜 온도 의존적 결합양상을 보이는지 알아보았다. In vivo DNA 결합 분석 결과 RovA나 SlyA와 같은 DicA의 상동성 단백질과는 달리 DicA는 N 말단에 있는 DNA 결합 도메인을 이용하여 20개의 염기쌍으로 이루어진 dicC 조절자 유전자(Oc)에 결합함을 보여주었다. 또한 in vivo 실험에서 DicA는 $37^{\circ}C$ 보다 $25^{\circ}C$에서 DNA에 더 잘 결합하는 것으로 알려진 Cnu 또는 H-NS의 영향을 받지 않고 자체적으로 Oc에서의 온도 의존적 DNA 결합을 보인다. 하지만 정제된 DicA 단백질을 이용한 in vitro binding 실험에서는 온도 의존적 DNA 결합이 관찰되지 않았다. Crude 단백질을 이용한 실험에서 DicA 단백질의 온도 의존적 DNA 결합이 관찰되는 것으로 보아 DicA의 온도 의존적 DNA (Oc) 결합은 crude 단백질내에 존재하는 아직 알려지지 않은 in vivo factor에 의해 일어난다.

Dihydroartemisinine Enhances Dictamnine-induced Apoptosis via a Caspase Dependent Pathway in Human Lung Adenocarcinoma A549 Cells

  • An, Fu-Fei;Liu, Yuan-Chong;Zhang, Wei-Wei;Liang, Lei
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
    • /
    • 제14권10호
    • /
    • pp.5895-5900
    • /
    • 2013
  • Dictamnine (Dic) has the ability to exert cytotoxicity in human cervix, colon, and oral carcinoma cells and dihydroartemisinin (DHA) also has potent anticancer activity on various tumour cell lines. This report explores the molecular mechanisms by which Dic treatment and combination treatment with DHA and Dic cause apoptosis in human lung adenocarcinoma A549 cells. Dic treatment induced concentration- and time-dependent cell death. FCM analysis showed that Dic induced S phase cell cycle arrest at low concentration and cell apoptosis at high concentration in which loss of mitochondrial membrane potential (${\Delta}{\Psi}m$) was not involved. In addition, inhibition of caspase-3 using the specific inhibitor, z-DQMD-fmk, did not attenuate Dic-induced apoptosis, implying that Dic-induced caspase-3-independent apoptosis. Combination treatment with DHA and Dic dramatically increased the apoptotic cell death compared to Dic alone. Interestingly, pretreatment with z-DQMD-fmk significantly attenuated DHA and Dic co-induced apoptosis, implying that caspase-3 plays an important role in Dic and DHA co-induced cell apoptosis. Collectively, we found that Dic induced S phase cell cycle arrest at low concentration and cell apoptosis at high concentration in which mitochondria and caspase were not involved and DHA enhanced Dic induced A549 cell apoptosis via a caspase-dependent pathway.

Tensile and fracture characterization using a simplified digital image correlation test set-up

  • Kumar, Abhishek;Vishnuvardhan, S.;Murthy, A. Ramachandra;Raghava, G.
    • Structural Engineering and Mechanics
    • /
    • 제69권4호
    • /
    • pp.467-477
    • /
    • 2019
  • Digital image correlation (DIC) is now a popular and extensively used full-field metrology technique. In general, DIC is performed by using a turnkey solution offered by various manufacturers of DIC. In this paper, a simple and economical set-up for DIC is proposed which uses easily accessible digital single-lens reflex (DSLR) camera rather than industrial couple-charged device (CCD) cameras. The paper gives a description of aspects of carrying a DIC experiment which includes experimental set-up, specimen preparation, image acquisition and analysis. The details provided here will be helpful to carry DIC experiments without specialized DIC testing rig. To validate the responses obtained from proposed DIC set-up, tension and fatigue tests on specimens made of IS 2062 Gr. E300 steel are determined. Tensile parameters for a flat specimen and stress intensity factor for an eccentrically-loaded single edge notch tension specimen are evaluated from results of DIC experiment. Results obtained from proposed DIC experiments are compared with those obtained from conventional methods and are found to be in close agreement. It is also noted that the high resolution of DSLR allows the use of proposed approach for fracture characterization which could not be carried out with a typical turnkey DIC solution employing a camera of 2MP resolution.

디지털 이미지 상관관계를 이용한 Al 6061-T6 인장시험편의 변형률 측정에 관한 연구 (A Study of the Strain Measurement for Al 6061-T6 Tensile Specimen using the Digital Image Correlation)

  • 권오헌;김상태;강지웅
    • 한국안전학회지
    • /
    • 제28권4호
    • /
    • pp.26-32
    • /
    • 2013
  • A digital image correlation(DIC) method is a whole-field measurement technique that acquires surface displacements and strains from images information which characterized a random speckle as intensity grey levels. Recently years, this DIC method is being developed and used increasingly in various research. In this study, we tried to apply to aluminum alloy(Al 6061-T6) using DIC method and strain gauge. DIC results demonstrated the usefulness and ability to determine a strain. The test specimen used in this study was an aluminum alloy(Al 6061-T6, thickness 1 mm). For a strain measurement, a strain gauge was attached at the center of a specimen. A specimen was lightly sprayed with a white paint and a black dot pattern was sprayed on its fully dried white surface to obtain a random speckle. The experimental apparatus used to perform the tensile test consisted of universal dynamic tester(5 kN; T.O. Co.) under displacement speed of 0.5, 1.0 and 3.0 mm/min. A Model 5100 B Scanner(V. Co.) used to obtain a strain. A CCD camera connected to a PC uses to record the images of the specimen surface. After acquisition, the images were transferred to PC where the DIC software was implemented. An acquired image was evaluated by the DIC program. DIC method for displacement and strain was suggests and it results show a good consistent remarkably. DIC results demonstrated the usefulness and ability to determine surface strain was better than by using classical measurements. The strain field measurement using a DIC is so useful that it can be applied to map strain distributions at a full area. DIC method can evaluate a strain change so it can predict a location of fracture. The findings of the investigation suggest that the DIC method is an efficient and reliable tool for full-field monitoring and detailed damage characterization of materials.

UV-curable liquid crystal for a retarder

  • Hasebe, Hiroshi;Kuwana, Yasuhiro;Nakata, Hidetoshi;Nishiyama, Isa;Takeuchi, Kiyofumi;Takatsu, Haruyoshi
    • 한국정보디스플레이학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국정보디스플레이학회 2009년도 9th International Meeting on Information Display
    • /
    • pp.159-162
    • /
    • 2009
  • A liquid crystalline monomer is applicable to fabricate a retarder in which various types of alignment are fixed. We have developed the monomer, UV-curable liquid crystal optimized for coating processes. Applications and materials for the retarder are reviewed.

  • PDF

대면적 대상물 변위계측을 위한 스테레오 카메라 3차원 DIC 시스템 기초설계 및 검증에 관한 연구 (Design and Verification of 3D Digital Image Correlation Systems for Measurement of Large Object Displacement Using Stereo Camera)

  • 고영훈;서승환;임현성;김태렬;정문경
    • 화약ㆍ발파
    • /
    • 제38권2호
    • /
    • pp.1-12
    • /
    • 2020
  • 이미지 영상 상관법(DIC)은 대상물의 변위, 변형을 측정하기 위해 잘 확립된 방법이라 할 수 있다. 스테레오 카메라를 이용한 3차원 DIC 시스템은 기계산업 분야에서 재료의 변형 등을 측정하기 위해서 개발된 방법이다. 3차원 DIC 시스템을 지반 및 구조물의 변위측정 등을 위해 적용하는 부분에서의 문제는 대상물의 면적이 매우 크다는 것이 중요한 해결사항이다. DIC 알고리즘에는 대상 영역(FOV)에 대한 스케일링 기능이 있지만, 단일 카메라 시스템으로는 높은 정밀도의 시스템을 구현할 수 없다. 본 연구에서는 설정 대상물 면적(30m×20m)에서 0.5mm의 z변위 정밀도로 측정 할 수 있는 3차원 DIC 시스템의 스테레오 비전 조건을 실험을 통하여 제시하였다.

Stable Carbon Isotope Signature of Dissolved Inorganic Carbon (DIC) in Two Streams with Contrasting Watershed Environments: A Potential Indicator for Assessing Stream Ecosystem Health

  • Kim, Chulgoo;Choi, Jong-Yun;Choi, Byungwoong;Lee, JunSeok;Jeon, Yonglak;Yi, Taewoo
    • Proceedings of the National Institute of Ecology of the Republic of Korea
    • /
    • 제2권4호
    • /
    • pp.259-273
    • /
    • 2021
  • We conducted a study to investigate the characteristics of the carbon cycle of two streams (located in Shig a Prefecture, Japan), having similar size, namely, the Adokawa stream (length: 52 km, area: 305 km2, watershed population: 8,000) and the Yasukawa stream (length: 62 km, area: 380 km2, watershed population: 120,000), but with different degree of human activity. Samples were collected from these two streams at 14 (Adokawa stream) and 23 (Yasukawa stream) stations in the flowing direction. The dissolved inorganic carbon (DIC) concentration and the stable carbon isotope ratio of DIC (δ13C-DIC) were measured in addition to the watershed features and the chemical variables of the stream water. The δ13C-DIC (-9.50 ± 2.54‰), DIC concentration (249 ± 76 µM), and electric conductivity (52 ± 13 µS/cm) in Adokawa stream showed small variations from upstream to downstream. However, the δ13C-DIC (-8.68 ± 2.3‰) upstream of Yasukawa stream was similar to that of Adokawa stream and decreased downstream (-12.13 ± 0.43‰). DIC concentration (upstream: 272 ± 89 µM, downstream: 690 ± 37 µM) and electric conductivity (upstream: 69 ± 17 µS/cm, downstream: 193 ± 37 µS/cm) were higher downstream than upstream of Yasukawa stream. The DIC concentration of Yasukawa stream was significantly correlated with watershed environmental variables, such as, watershed population density (r = 0.8581, p<0.0001, n = 23), and forest area percentage of the watershed (r = -0.9188, p<0.0001, n = 23). δ13C-DIC showed significant negative correlation with the DIC concentration (r = -0.7734, p<0.0001, n = 23), electric conductivity (r = -0.5396, p = 0.0079, n = 23), and watershed population density (r = -0.6836, p = 0.0003, n = 23). Our approach using a stable carbon isotope ratio suggests that DIC concentration and δ13C-DIC could be used as indicators for monitoring the health of stream ecosystems with different watershed characteristics.

전역-국부 다중 DIC 시스템을 이용한 노치 구조물의 열변형 계측 (Thermal Deformation Measurement of Notched Structure Using Global-local Multi-DIC System)

  • 신서해;도안유엔뷰;구남서
    • 한국항공우주학회지
    • /
    • 제49권8호
    • /
    • pp.617-626
    • /
    • 2021
  • 비행체의 초음속 비행 중 고온 환경에서의 열 거동은 비행체의 열 구조 설계에 중요하다. 본 연구에서는 전역-국부 다중 디지털 이미지 상관기법을 사용하여 노치 구조물의 전 영역의 열변형 및 응력집중 현상에 대해 관찰/분석하였다. 다중 DIC 시스템은 2D DIC 시스템과 3D DIC 시스템으로 구성되었다. 가열 챔버를 이용하여 노치 시편을 가열하였으며 여러 온도에서 다중 DIC 시스템을 사용하여 구조물의 변형 이미지를 촬영하고 분석하였다. 다중 DIC 기법을 사용하여 노치 시편의 전 영역 변형률과 노치 부위의 응력집중 현상을 계측/분석하였으며 ABAQUSTM 프로그램을 이용하여 노치 시편에 대해 유한요소해석을 진행하고 실험결과와 비교 분석하였다. 본 연구를 통해 다중 DIC 시스템의 열변형 계측과 응력 집중 현상의 연구 분석에서의 활용 가능성을 보여주었다.

마이크로웨이브 조사와 Diisopropylcarbodiimide (DIC)/7-Aza-1-hydroxybenzotriazole (HOAt): N-Protected Amino Acid와 Hydrazine으로부터 다양한 Hydrazide합성을 위한 반응조건 (Microwave Irradiation and Diisopropylcarbodiimide (DIC)/7-Aza-1-hydroxybenzotriazole (HOAt): A Potent Combination for Synthesis of Variuos Hydrazide from N-Protected Amino Acid and Hydrazine)

  • Albatal, Mona;Ghani, Mohamad Abdul;El-Faham, Ayman;Al-Hazimi, Hassan M.;Hammud, Hassan H.
    • 대한화학회지
    • /
    • 제54권4호
    • /
    • pp.419-428
    • /
    • 2010
  • 마이크로웨이브 반응 장치 (Synthos 3000 Aton Paar, GmbH, 1400 W maximum magnetron)를 이용하여, diisopropylcarbodiimide (DIC)/와 1-hydroxybenzotriazoles (HOXt) (X = A or B)를 반응시켜서 amino acid hydrazide를 효율적으로 합성할 수 있는 반응 조건을 개발하였다. 일반적인 가열반응과 마이크로웨이브 반응을 반응 시간, 반응 조건 등을 비교하였을 때에, 마이크로웨이브 반응이 보다 효율적으로 진행되었으며, diisopropylcarbodiimide (DIC)와 1-hydroxybenzotriazole (HOBt) 반응에서보다는 diisopropylcarbodiimide (DIC)와 7-aza-1-hydroxybenzotriazole (HOAt)를 반응시켰을 때에 좋은 수율 (95 - 98%)로 얻어졌다.