• 제목/요약/키워드: cytochrome $b_5$

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Lack of genetic divergence between Mogera wogura coreana from Korea and M. w. robusta from Northeastern China and adjacent Russia (Soricomorpha: Mammalia), reexamined from 12S rRNA and cytochrome b sequences

  • Koh, Hung Sun;Jang, Kyung Hee;Han, Eui Dong;Jo, Jae Eun;Jeong, Seon Ki;Ham, Eui Jeong;Lee, Jong Hyek;Kim, Kwang Seon;In, Seong Teek;Kweon, Gu Hee
    • Animal cells and systems
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    • 제16권5호
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    • pp.408-414
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    • 2012
  • To reexamine taxonomic status of endemic Mogera wogura coreana from Korea, we first obtained partial 12S rRNA sequences (893 bp) and complete cytochrome b gene sequences (1140 bp) of this subspecies, and these sequences and partial cytochrome b sequences (402 bp) were compared to the corresponding haplotypes of M. wogura from East Asia, obtained from GenBank. The one of three 12S rRNA haplotypes in M. w. coreana was identical to one 12S rRNA haplotype of M. w. robusta from East Asia: 10 complete and 13 partial cytochrome b haplotypes of M. w. coreana formed a single clade with one complete and four partial cytochrome b haplotypes of M. w. robusta, respectively. We considered that M. w. coreana from Korea is an endemic subspecies with only morphological differences, although it is necessary to reexamine the subspecies status of M. w. coreana. Additionally, in the 12S rRNA and complete cytochrome b sequences, M. wogura from Japan was distinct from the two continental subspecies of M. w. coreana and M. w. robusta with average distances of 1.76 and 5.65%, respectively; insular M. wogura, with within-group distances of 2.09 and 4.38%, respectively, was also genetically more divergent than the mainland M. wogura, with within-group distances of 0.08 and 0.57%, respectively. Thus, we considered that insular M. wogura of Japan dispersed into neighboring East Asian continent, which is opposite to the traditional hypothesis on the origin of Japanese M. wogura.

담배 현탁배양 세포의 Elicitor 유도성 5-epi-Aristolochene Hydroxylase 유전자의 클로닝 (Cloning of Elicitor-Inducible 5-epi-Aristolochene Hydroxylase in Tobacco Cell Suspension Culture)

  • Soon Tae Kwon;In-Jung Lee;Joseph Chappell
    • 생명과학회지
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    • 제8권5호
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    • pp.604-613
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    • 1998
  • 담배의 phytoalexin으로 알려진 capsidiol 생합성의 마지막 단계에 관여하는 5-epi-aristolochene hydroxy-lase 유전자의 일부를 RT-PCR 방법으로 클로닝하였다. 클로닝한 CYP-B3는 콩, 완두 등의 cytochrome P450계의 유전자와 높은 동일성을 보였으며 heme 결합부위로 알려진 FxxGxRxCxG을 포함하고 있는 것으로 나타났다. 또한 CYP-B3는 저온, 고온 또는 제초제 등에 의해서는 유도되지 않고 Elicitor에 의해서만 특이하게 유도되는 것으로 나타나 Phytoalexin 생합성에 관여하는 유전자임을 확인하였다. Cyt P450 억제제인 ancy-midol과 ketoconazol에 의해 CYP-B3의 전사는 억제되지 않는 반면 5-epi-aristolochene hydroxylase의 효소활성은 현저히 억제되는 것으로 나타나 이들 억제제는 전사후의 효소의 합성 또는 활성을 억제하는 것으로 나타났다.

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Tin-free 방오제인 Sea-Nine 211에 노출된 북방대합에서 MFO 효소계의 반응 (Responses of MFO System in Surf Clam, Pseudocardium sachalinensis, Injected with Sea-Nine 211 Antifoulant)

  • 이지선;전영하;심원준;전중균
    • 환경생물
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    • 제26권2호
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    • pp.102-108
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    • 2008
  • 방오도료로 많이 쓰인 유기주석화합물은 일반생물에게 미치는 독성이 매우 강하고 또한 내분비계 장애물질임이 밝혀지면서 이를 대체할 화합물들의 개발이 요구되고 있다. 그 가운데 이런 목적으로 만들어진 화합물인 Sea-Nine 211을 사용하여 이것이 해양생물 특히 저서생물인 패류에게 얼마나 영향을 미치는지를 살펴보고자 북방대합(P. sachalinensis)에게 강제 주사하여 생존율과 중장선의 미크로좀 중 I상 약물대사효소의 변화를 4일째가지 조사하였으며, 또한 비교를 위해 tributyltin chloride (TBTC)의 주사실험을 병행하였다. 생존율에서는 sham구나 Sea-Nine 211 실험구(5, 25 및 50 mg kg$^{-1}$)모두 생존하였으나 TBTC(1, 2 및 5 mg kg$^{-1}$) 실험구의 생존율은 4일째에 각각 70%, 30% 및 0%였다. 한편, 약물대사효소계 중 I상효소인 CYP는 Sea-Nine 211주사 후 시간이 지나면서 유도되었지만, TBTC는 반대로 저해되는 경향을 보였다. 그리고 P450R 활성은 Sea-Nine 211 실험구에서 시간 경과와 더불어 약간 증가하는 추세를 보였지만 sham구와는 유의적인 차이가 없었으나, TBTC실험구는 주사농도와 비례하면서 저해되었다. b5R활성도 마찬가지로 Sea-Nine 211 실험구는 큰 변화가 없었으나, TBTC실험 구에서는 유의적으로 저해되는 경향을 관찰할 수가 있었다. 이처럼 비주석계 방오도료 화합물인 Sea-Nine 211은 북방대합에 대한 독성이 TBTC에 비해 크게 낮았으며, 약물대사효소계에 미치는 영향도 TBTC는 저해하는데 반해서 P450R이나 b5R에는 별다른 변화를 일으키지 않았으나 CYP는 유도하였다.

사염화탄소로 유도된 Cytochrome P-450 활성도의 전환으로 본 Hedera rhombea 잎의 메탄올 추출물의 간독성 감소작용 (Chemoprotective Effect of Methanol Extract of Hedera rhombea Loaves on the Reversal of Cytochrome P-450 Activities Induced by Carbon Tetrachloride)

  • 홍영숙;김형래;배영숙;박상신
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제3권4호
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    • pp.245-250
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    • 1995
  • The carbon tetrachloride($CCl_4$) has been demonstrated to have a hepatotoxic effect in human or many other species. To investigate the enzyme induction of mixed function oxygenases in liver of male Sprague-Dawley rats a single 0.1, 0.5 mι/kg dose of carbon tetrachloride were given. At 24 hr after a single dose of 0.1 mι CC1$_4$/kg weight, methanol extract of Hedera rhombea leaves was administered with 100, 500 mg/kg weight. Assays of 7-ethoxyresorufin-Ο-deethylation(EROD),7-benzyloxyresorufin-Ο-deathylation(BROD),4-nitro-phenol-UDP-glucuronosyltransferase(UDPGT), Western blot and RNA slot blot were used as representatives of the activities of cytochrome P-450 enzymes. The change of the activity of CYP1A1 form measured by EROD assay and Western analysis using 1-7-1 monoclonal antibody was not observed. The activity CYP2B1 form by BROD assay and using 2-66-3 monoclonal antibody was remarkably increased. Elevated level of CYP2B1 mRNA was shown by slot hybridization with 2B1-specific probe. Administration of methanol extract of Hedera rhombea leaves reversed the enzyme activity and the level of mRNA, which suggest the chemoprotective effect of methanol extracts of Hedera rhombea leaves to carbon tetrachloride hepatotoxlcity.

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꽃뱀과 흰쥐의 간 마이크로좀에 존재하는 Cytochrome P45O 의존성 Monooxygenases의 특성 비교 (Comparison of Characteristics of Hepatic Microsomal Cytochrome P45O-dependent Monooxygenases from Snake and Rat)

  • Ja Young Moon;Dong Wook Lee;Ki Hyun Park
    • 생명과학회지
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    • 제8권6호
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    • pp.695-701
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    • 1998
  • 한국산 꽃뱀(Natrix tigrina Lateralis)의 간 마이크로좀에 존재하는 mixed function oxidase system 구성 성분들의 함량과 P45O 의존성 monooxygenase의 활성도를 조사하고 이들을 흰쥐(Sp. D)의 것과 상호 비교하였다. 꽃뱀에서의 P45O, b5 함량 및 NADPH-cytochrome c reductase 활성도는 흰쥐에서 보다 낮았으며, 7-ethoxycoumarin O-deethylase와 benzphetamine N-demethylase 활성도 역시 흰쥐에서 보다 상당히 낮았다. 그러나 aryl hydrocarbon hydroxylase와 testosterone hydroxylase 활성도는 흰쥐와 비교할 때 거의 비슷하거나 오히려 높았다. Testosterone의 수산화 반응에 대한 선택특이성을 조사한 결과, 꽃 뱀은 7$\alpha$ 위치에서, 흰쥐는 6$\beta$ 위치에서 가장 높은 수산화 반응물을 생성했다. 그러나 testosterone의 C2와 C3 위치에서의 수산화 반응에 대한 선택특이성은 꽃뱀과 흰쥐에서 비슷하였다. Radioimmunoassay (RlA)를 실시하여 5종 (CYP2B, CYP1A1, CYP1A2, CYP3A 및 CYP2El)의 P45O 동위효소의 구성비를 비교한 결과, 꽃뱀에서는 CYP1A1/1A2가, 흰쥐에서는 CYP2El이 각각 비교적 많이 존재하였다. 부분정제한 P45O을 SDS-PAGE와 RIA로 분석한 결과, 꽃뱀의 간 마이크로좀에 존재하는 P45O중에는 흰쥐와는 다른 종류의 P45O 동위효소가 존재함을 시사하였다.

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Mitochondrial Cytochrome b Gene of the Korean Subspecies of the Common Kestrel (Falco tinnunculus)

  • Lee, Jin-Hee;Ryu, Shi-Hyun;Park, Hee-Cheon
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제22권1호
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    • pp.87-89
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    • 2006
  • The mitochondrial cytochrome b gene of the Korean subspecies (Falco tinnunculus interstinctus) of the common kestrel has been analyzed. According to the molecular phylogeny of six subspecies of common kestrel, six subspecies of the common kestrel were divided into two clades: the first clade is composed of the South African subspecies (F. t. rupicolus) and the second clade includes 5 subspecies (F. t. tinnunculus, F. t. rufescens, F. t. interstinctus, F. t. canariensis and F. t. dacotiae) of the common kestrel. Korean subspecies, F. t. interstinctus was closely related to F. t. rufescens and original subspecies F. t. tinnunculus.

Genetic Differentiation in the Mitochondrial Cytochrome b Gene of Korean Brown Frog, Rana dybowskii (Amphibia: Ranidae)

  • Kim, Yu-Ri;Yang, Dong-Eun;Lee, Hyuk;Lee, Jung-Eun;Lee, Hyun-Ick;Yang, Suh-Yung;Lee, Hei-Yung
    • Animal cells and systems
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    • 제3권2호
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    • pp.199-205
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    • 1999
  • The nucleotide sequences of a 504 bp segment of the mitochondrial cytochrome b gene were analyzed to survey the intraspecific variation of the brown frog, Rana dybowskii, collected from nine populations in South Korea. Comparisons of sequence divergence of the cytochrome b gene suggest that the populations examined are clearly classified into two types (type 1 and type 2), diverged from each other by a high value of 14.3-15.9% sequence divergence. The two types are distributed allopatrically in most populations, but only one population occurs sympatrically. In the Tonghae population, their spawning grounds differ in that type 1 spawns in the puddle and type 2 spawns in the mountain creek. Based on the genetic divergences of the cytochrome b gene sequences, the phylogenetic status of Korean R. dybowskii is elucidated by comparing it with related brown frogs distributed in an area adjacent to the Korean Peninsula. Interspecific sequence divergences among type 1, type 2 and other related brown frog species (Russian R. dybowskii, R. pirica, R. ornativentris, R. chensinensis: 2n=24 chromosomes) used in this study ranged from 11.7 to 16.3%. R. dybowskii in Tsushima is very similar to our type 1 (sequence divergence=0-1.6%) and R. chensinensis in western China is closest to our type 2 (sequence divergence=6.8-7.5%).

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Genetic Relationships of Korean Treefrogs (Amphibia; Hylidae) Based on Mitochondrial Cytochrome b and 12S rRNA Genes

  • Jung Eun Lee;Dong Eun Yang;Yu Ri Kim;Hyuk Lee;Hyun Ick Lee;Suh-Yung Yang;Hei Yung Lee
    • Animal cells and systems
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    • 제3권3호
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    • pp.295-301
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    • 1999
  • The nucleotide sequence of a 447 base pair fragment in the mitochondrial cytochrome b gene and the complete sequence of the mitochondrial 12S ribosomal RNA gene, 938 bp, were analyzed to infer inter- and intraspecific genetic relationships of Hyla japonica and H. suweonensis from Korea and H, japonica from Japan. In the mitochondrial cytochrome b gene, genetic differentiation among H. japonica populations were 9.62% and 15.66% between H. japonica and H. suweonensis. Based on the Tamura-Nei distance, the level of sequence divergence ranged from 0.45% to 2.75% within Korean H. japonica, while 8.31%-8.87% between Korean and Japanese H. japonica and 11.51%-12.46% between H. japonica and H. suweonensis. In the neigh-bor-joining tree, Korean populations of H. japonica were clustered first at 2.22% and followed by Japanese H. japonica and H. suweonensis at 8.51% and 12.29%, respectively. In mitochondrial 12S rRNA gene, genetic differentiation between H. japonica and H. suweonensis nras 7.17% (68 bp) including 7 gaps. Based on Tamura-Nei distance, the level of sequence divergence ranged 3.53% between Korean and Japanese H. japonica and from 4.93% to 5.41% between H. japonica and H. suweonensis. Phenogram pattern of the 12S rRNA gene sequence corresponded with that of the mitochondrial cytochrome b gene.

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광합성세균 Rhodopseudomonas gelatinosa 의 시토크롬 c 산화효소의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of Cytochrome c Oxidase from Photosynthetic Bacterium, Rhodopseudomonas gelatinosa)

  • 강대길;최원기
    • 미생물학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.101-107
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    • 1992
  • 화학 영양성으로 배양한 Rps. gelatinosa 에서 2회의 시토크롬 c 친화성 크로마토그래피와 DEAE-Sephacel 이온 교환 크로마토그래피 등 3 단계의 크로마토그래피를 수행하여 시토로콤 c 산화효소를 정제하였다. 정제된 시토크롬 c 산화효소는 Sephacryl S-300 에 의한 분자걍이 약 110,000 Da 이고 SDS-gel 전기영동에 의한 분자량이 약 52.000 Da 으로써 이량체일 것으로 보인다. 전제된 시토크롬 c 산화효소는 온도데 매우 불안정하고 말 심장 시토크롬 c 를 기질로 사용했을때 Km 값은 $20\mu$M, Vmax 값은 44unit/mg prot. 이며 pH 6.4 의 효소방응 최적 pH 와 25.deg.C 의 최적 온도를 보였다. 환원된 시토크롬 c 산화효소는 554, 523, 421 nm 에서 .alpha., .betha. soret 흡수대를 보였고 chromatophore 에서와 마찬가지로 KCN 과 $NaN_{3}$ 에 의해서는 효소 활성도가 저해를 받았지만 CO 와 antimycin A, myxothiazol 에 의해서는 효소 활성도가 저해를 받지 않았다. 빛을 에너지원으로 배양하거나 또는 화학영양성으로 배양하든지 모두 시토크롬 c-551 이 생성되었고 환원된 시토크롬 c-551 은 시토크롬 c 산화효소에 의해 산화되었다. 시토크롬 c-551 을 기질고 이용하였을 때 시토크롬 c 산화효소의 Km 값은 $26\mu$M 이었고 Vmax 값은 31.unit./mg prot. 로써 말심장의 시토크롬 c 를 기질로 이용할때 보다 오히려 낮았다. 이와 같은 결과로 보아 화학 영양성은 배양한 Rhodopseudomonas gelatinosa 에서 호흡에 의한 전자전달은 시토크롬 c-551 이 시토크롬 $bc_{1}$ 복합체로 부터 전자를 받아 b-형 시토크롬 c 산화효소에 전자를 전달해 주고 최정적으로 산소를 환원시킬 것으로 생각된다.

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Capsaicin이 백서 간의 Cytochrome $P_{450}$에 미치는 영향 (Effects of Capsaicin on Liver Cytochrome $P_{450}$ in the Rat)

  • 김명혜;김낙두;이상섭
    • 약학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.111-118
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    • 1979
  • It was previously reported that cytochrome P$_{450}$ content in liver was increased when Capsicum acetone extract was given chronically to rats. The present study is aimed to investigate the effect of capsaicin, a principal component of red pepper, on the drug metabolizing enzymes in rat liver. Capsaicin (5mg/kg) was given intraperitoneally once a day for seven days and zoxazolamine paralysis time and hexobarbital sleeping time were determined 24 hrs after the last dose of capsaicin. Plasma hexobarbital concentration was also determined five and 15 min after hexobarbital administration to rats. Zoxazolamine paralysis time and hexobarbital sleeping time were shortened by 31.6% and 37.1%, respectively, compared with control group. Plasma hexobarbital concentration was lowered by 26.2% after five min and by 35.2% after 15 min, respectively, compared with control group. However, administration of single dose of capsaicin did not affect the zoxazolamine paralysis time and hexobarbital sleeping time. Microsomal cytochrome P$_{450}$ content and NADPH-cytochrome C reductase activity were increased by 14.6% and 11.6%, respectively in the rats pretreated with capsaicin for seven days, while cytochrome b$_{5}$ content was not changed. These results suggest that treatment with capsaicin for seven days may induce the drug metabolizing enzyme in rat liver.

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