• 환경생물
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• 제42권3호
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• pp.332-344
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• 2024

포스핀(PH₃) 훈증은 저곡해충을 방제하기 위해 널리 사용되어 왔으며, 이러한 높은 의존도에 의해 저곡해충에서 포스핀에 대한 저항성이 유발되었다. 국내에서는 쌀바구미에서 포스핀 저항성이 보고된 바 있으나, 거짓쌀도둑거저리에서는 포스핀 저항성이 보고된 바 없다. 본 연구는 국내 다섯 지역에서 채집한 거짓쌀도둑거저리를 이용하여 포스핀에 대한 감수성을 평가하기 위해 수행되었다. 포스핀에 대한 감수성은 FAO 훈증법을 통해 조사하였으며, 실험에 사용한 모든 국내 거짓쌀도둑거저리 개체는 0.04 g m^-3 농도의 포스핀에서 사멸되었다. 0.01 g m^-3 농도의 포스핀에서는 국내 두 지역에서 채집한 거짓쌀도둑거저리에서 100%의 사멸이 이루어지지 않았다. dihydrolipoamide dehydrogenase (dld) 유전자의 P45S 점돌연변이는 포스핀 저항성 거짓쌀도둑거저리 계통(Aus07)에서 확인되었으나, 포스핀 감수성 거짓쌀도둑거저리 계통(Aus10)과 국내 다섯 지역에서 채집한 거짓쌀도둑거저리에서는 확인되지 않았다. dld 유전자와 사이토크롬 b5 환원효소(cyt-b5-r) 유전자의 발현량을 비교한 결과, 모든 시험 종에서 유의미한 차이가 발견되지 않았다. 그러나 cyt-b5-r 유전자의 경우에, Aus07에서 발현량이 감소한 것에 비해서 경주 채집 종에서 1.7배 이상 발현량이 높은 것을 확인하였다. 또한, cDNA 염기서열을 분석한 결과, dld 유전자 염기서열의 P45S (C133T)는 Aus07에서만 확인되었으며, 국내 5개 채집 지역의 거짓쌀도둑거저리 종에서는 cyt-b5-r 유전자 염기서열에서 특징적인 염기서열다형성이 확인되었다. 이번 연구는 국내 거짓쌀도둑거저리의 포스핀 감수성을 지속적으로 모니터링하여 저항성 개체를 신속하게 확인하고, 신속한 방제를 통해 포스핀 저항성 확산을 방지할 필요가 있음을 시사한다.

• Molecules and Cells
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• 제25권4호
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• pp.510-522
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• 2008

To construct the molecular systematics of the genus Megoura (Hemiptera: Aphididae), DNA based-identification was performed using four mitochondrial and three nuclear DNA regions: partial cytochrome c oxidase I (COI), partial tRNA-leucine + cytochrome c oxidase II (tRNA/COII), cytochrome b (CytB), partial 12S rRNA + tRNA-valine + 16S rRNA (12S/16S), elongation factor-1 alpha ($EF1{\alpha}$), and the internal transcribed spacers 1 and 2 (ITS1, ITS2). Pairwise sequence divergences between taxa were compared, and phylogenetic analyses were performed based on each DNA region separately, and the combined datasets. COI, CytB, $EF1{\alpha}$, ITS1, and ITS2 were relatively effective in determining species and resolving their relationships. By contrast, the sequences of tRNA/COII and 12S/16S were not able to separate the closely related species. CytB and $EF1{\alpha}$ gave better resolution with higher average sequence divergences (4.7% for CytB, 5.2% for $EF1{\alpha}$). The sequence divergence of COI (3.0%) was moderate, and those of the two ITS regions (1.8% for ITS1, 2.0% for ITS2) were very low. Phylogenetic trees were constructed by minimum evolution, maximum parsimony, maximum likelihood, and Bayesian phylogenetic analyses. The results indicated that the phylogenetic relationships between Megoura species were associated with their host preferences. Megoura brevipilosa and M. lespedezae living on Lespedeza were closely related, and M. nigra, monophagous on Vicia venosa, was rather different from M. crassicauda, M. litoralis, and M. viciae, which are oligophagous on Lathyrus and Vicia. The three populations of M. crassicauda formed a clade separated from M. litoralis and M. viciae. Nevertheless M. litoralis and M. viciae, which are morphologically similar, were not separated due to negligible sequence divergence. We discuss the phylogenetic relationships of the Megoura, and the usefulness of the seven DNA regions for determining the species level phylogeny of aphids.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제27권3호
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• pp.317-324
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• 2012

본 연구는 식품원료의 진위여부를 판별하기 위한 시험법으로 일반 프라이머를 이용한 DNA barcode 기법을 도입하였다. 동물성식품원료의 경우 미토콘드리아 DNA 중 cytochrome oxidase subunit I(COI) 부위 검출을 위하여 디자인된 프라이머(LCO1490/HCO2198 및 VF2/FISH R2)와 cytochrome b(cyt b) 부위 검출을 위하여 디자인된 프라이머(L14724/H15915)를 사용하였다. 상기 3 종류의 프라이머를 사용하여 가축류 6종(소, 돼지, 염소, 양, 말 및 사슴), 가금류 4종(닭, 오리, 칠면조 및 타조), 어류 7종(명태, 대구, 청대구, 청어, 송어, 다랑어 및 우럭)을 대상으로 PCR 후 전기영동하여 예상되는 PCR 산물의 생성 유무를 확인하였다. 가축류 6종에 대하여는 LCO1490/HCO2198, VF2/FISH R2 및 L14724/H15915 프라이머를 사용한 경우 COI 및 cyt b가 모두 검출되었으며, 가금류 4종은 LCO1490/HCO2198 및 VF2/FISH R2 프라이머를 사용한 경우만 COI이 검출되었다. 또한 어류 7종은 VF2/FISH R2 프라이머를 사용한 경우에만 COI 부위가 검출됨을 확인하였다. 식물의 경우 엽록체 DNA 부위를 이용하여 디자인된 3 종류의 프라이머(trnH/psbA, rpoB 1F/4R 및 rbcL 1F/724R)를 사용하였다. 각각의 프라이머를 이용하여 식물 5종(마늘, 양파, 무, 녹차 및 시금치)에 대하여 실험한 결과 3종류의 프라이머에서 PCR의 산물을 모두 확인하였으며 trnH/psbA 프라이머의 경우 식물 종마다 PCR 산물의 크기는 다르게 검출되었다. 본 연구에서는 17종의 식품원료별 일반 프라이머 및 PCR 조건을 확립하였으며, 생산된 PCR 산물을 대상으로 염기서열을 결정하고 유전자은행에 있는 염기서열과 DB 비교 분석을 통하여 식품에 사용된 원료의 진위여부 판별에 적용이 가능할 것으로 기대된다.

• Animal cells and systems
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• 제3권1호
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• pp.89-96
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• 1999

Nucleotide sequences of a 501 base-pair (bp) fragment in the mitochondrial cytochrome b (cyt b) gene were analyzed for 12 populations of Rana rugosa from Korea and Japan using a polymerase chain reaction (PCR) and direct silver sequencing. Two genetically distinct groups (type-A and type-B) were found in Korea. Type-A was found throughout most of South Korea and type-B was restricted to the mid-southeastern regions (Samchok, Yongdok, Chongsong and Pohang). But in the Tonghae population, both types were found. The level of mitochondrial DNA (mtDNA) sequence differences ranged from 0% to .0.8% among six populations of type-A, and 0 to 1.0% among 4 populations of type-B. However, sequence differences between type-A and type-B ranged from 5.4% to 6.6%, Using Kimura's two-parameter distance, the level of genetic sequence divergence between type-A and type-B was 6.7%. The Japanese R. rugosa was clustered very far from the Korean R. rugosa with 14.7%. In the neighbor-joining and UPGMA tree, all Korean samples were grouped, but subdivided into two types in 99% of the bootstrap iteration.