• 제목/요약/키워드: crypt length

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랜덤 코돈 원형 부호 기반의 DNA 워터마킹 (DNA Watermarking Method based on Random Codon Circular Code)

  • 이석환;권성근;권기룡
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제16권3호
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    • pp.318-329
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    • 2013
  • 본 논문에서는 DNA 시퀀스의 불법 복제 및 변이 방지를 위한 DNA 워터마킹 기법을 제안한다. 제안한 DNA 워터마킹은 랜덤 맵핑 테이블에 의하여 코돈들을 랜덤 원형 각도로 수치화한 다음, 웨이블릿 국부계수 최대치의 Lipscihtz regularity 상수에 의하여 삽입 대상 코돈들을 탐색한다. 워터마크 삽입과정에서 DNA의 아미노산 코드가 변경되지 않도록 하기위하여 삼중 코돈들의 랜덤 코돈 원형 각도에 워크마크를 삽입한다. 삽입 대상 코돈들의 길이와 위치는 랜덤 맵핑 테이블에 의존하므로, 이 테이블을 알지 못할 경우, 워터마크 추출이 어렵다. 그리고 제안한 방법은 다양한 길이의 DNA 서열에 64개 코돈(종료, 개시 코돈포함)들의 랜덤 맵핑 테이블을 적용함으로써 동일한 길이의 워터마크 키를 적용한다. 본 실험에서는 랜덤 맵핑 테이블과 삽입 위치의 높은 엔트로피를 통하여 워터마크의 보안성을 확인하였다. 또한 기존의 DNA-Crypt 워터마킹과의 유사한 용량 하에서 제안한 방법이 낮은 염기 변화율을 가지며, 포인트 변이, 삽입 및 삭제 변이에 대하여 낮은 에러률를 가지며, ROC 분석을 통하여 우수한 검출 능력을 가짐을 확인하였다.

Dimethylhydrazine으로 처리한 쥐에서 식이섬유소와 지방종류가 대장의 종양발생율과 세포증식에 미치는 영향 (Effect of Dietary Fiber and Fat on Tumor Incidence and Cell Proliferation of Colonic Mucosa in DMH-Treated Rats)

  • 최주선
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제31권4호
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    • pp.697-707
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    • 1998
  • This study was designed to observe the effect of dietary fiber and fat on colon tumor incidence and cell proliferation. Male Sqraue Dawley rats(n=225) at 7 weeks of age, were divided into 3 groups depending on the type of fat b(beef tallow, corn oil and DHA-rich fish oil) and each group was again divided into 3 groups depending on type of fiber(fiber-free, perctin and cellulose) . The experimental diet containing dietary fat at 15%(w/w) and fiber at 6%(w/w) levels was fed for 25 weeks. At the same time, each rats was intramuscularly injected with DMH two times a week for 6 weeks to geive total dose of 180mg/kg body weight. Cell proliferation was measured by in vivo incroporation of bromodeoxyuridine (BrdU) into DNA. Fish oil decreased the tumor incidence (9.67%) compared with beef talow (33.39%) and corn oil (21.21%). Tumor incidence was decreased in all groups that fed cellulose (11.67%) compared with those of fiber-free(21.74%) and pectic(19.70%). Most of tumors was distributed at the site of the distal colon. The rats fed both fish oil and cellulose significantly decreased th enumber of tumors and tumor incidence compared to other groups. Fish oil was more effective in preventing cell prolofieration by decreasing crypt length and labeling index(LI) compared with beef tallow(p<0.05). Cell proliferation in distal colon was more developed to the upper part of the crypt compared to proximal colon. Overall tumor incidence and cell proliferation were more affected by dietary fat. But the effect of dietary fiber was different depending on type of fat in the experimental diet. These results suggest that a DHA -rich fish oil may has more decisive effect in inhibiting the cell proliferation in colon.

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방사선에 의한 장점막 손상에 대한 5-Androstenediol의 보호효과 (Protective Effects of 5-Androstendiol (5-AED) on Radiation-induced Intestinal Injury)

  • 김중선;이승숙;장원석;이선주;박선후;조수연;문창종;김성호;김미숙
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제28권3호
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    • pp.141-146
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    • 2010
  • 목 적: 본 연구에서는 방사선에 의한 장점막 손상에 대한 5-androstendiol (5-AED)의 장점막 보호효과 여부를 마우스 위장관 조직에서 평가하여 방사선 보호제로서의 적용가능성을 모색하고자 하였다. 대상 및 방법: 30마리의 C3H/HeN 마우스를 대조군, 방사선 조사군, 방사선 조사 전 5-AED 처리군으로 나누어, 5 Gy와 10 Gy 전신방사선 조사하였다. 5-AED는 방사선 조사 24시간 전에 체중 당 50 mg/kg으로 피하 주사하였다. 10 Gy 전신 방사선 조사 후 3.5일에 마우스를 희생하여 공장조직을 채취하여 소장움 생존, 융모의 개수, 융모의 높이, 소장움의 크기, 10개 장상피세포 당 기저층의 길이를 측정하여 장점막 손상정도를 비교 평가하였다. 또한 apoptosis의 발생빈도수는 5 Gy 방사선 조사 후 12시간에 TUNEL 방법으로 검수하였다. 결 과: 10 Gy 방사선조사 전 5-AED 투여군에서, 방사선 조사군과 비교하여, 소장움의 소실이 상대적으로 적고 융모의 높이가 유의성 있게 증가하였다. 5-AED 전처치군에서 소장움의 크기가 방사선 조사군에 비교하여 증가하였고, 10개의 장 상피세포 당 기저층 길이는 5-AED 전처치군에서 감소함을 관찰하여 소장조직의 방사선 손상에 대해 5-AED의 보호효과가 있음을 확인하였다. 방사선 조사 시 증가한 apoptosis에 대해서는 5-AED의 투여가 유의성 있는 감소 효과를 나타내지 못하였다. 결 론: 5-AED 투여는 방사선에 의한 소장점막의 형태학적인 손상변화에 대해 보호효과가 있으며, 이러한 결과는 방사선 조사 전 5-AED 투여가 방사선에 의한 장점막 손상에 대한 보호약물로 활용될 수 있는 가능성을 제시한다.

우유 과민성 장병증(cow's milk-sensitive enteropathy)에서 소장 생검조직의 형태학적 계측을 이용한 정량적 분석 (Quantitative Analysis of Small Intestinal Mucosa Using Morphometry in Cow's Milk-Sensitive Enteropathy)

  • 황진복;김용진
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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    • 제1권1호
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    • pp.45-55
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    • 1998
  • 목 적: 우유 과민성 장병증(cow's milk-sensitive enteropathy, CMSE)은 우유를 식이 하였을 때 유해 반응과 함께 발생하는 상부 소장 점막의 손상이 병리적 특징으로 관찰되며, 이러한 점막의 손상은 우유를 제거하면 회복될 수 있고, 다시 유발시험을 하면 재발될 수 있다. CMSE 환자에서 소장 점막 손상의 정도를 형태학적 계측을 이용하여 정량적으로 분석하여 보고, 이를 이용한 CMSE의 진단적 가치 및 병리적 특성에 관하여 알아보고자 본 연구를 시행하였다. 대상 및 방법: 1994년 3월부터 1996년 6월까지 만성 설사와 성장 장애를 주소로 대구효성가톨릭 대학병원 소아과에 입원한 환자에서 우유에 대한 유발, 제거시험에 따른 임상적 반응 및 상부위장 관내시경을 시술하여 얻게 된 십이지장부의 생검조직 소견을 통하여 CMSE로 진단된 생후 $30.4{\pm}11.7$(14~56)일된 13명의 환아를 대상으로 하였다. 소장 생검조직의 형태학적 계측을 이용하여 융모 높이(villous height, VH), 음와 영역 깊이(crypt zone depth, CZD), 점막전체 두께(total mucosal thickness, TMT), 음와 영역에 대한 융모의 상대적 높이(VH/CD), 융모 1 mm당 상피세포간 림프구의 수(interepithelial lymphocytes, IEL), 0.5 mm의 점막근육판(muscularis mucosa)에 해당하는 상피 표면의 길이(length of surface epithelium, LSE), 상피층의 호산구 침윤(EOS-EP), 고유층(lamina propria)의 호산구 침윤(EOS-LP)을 측정하고, 대조군 및 회복기 생검 조직과 비교하였다. 결 과: 1) VH는 CMSE 환자군에서 $135{\pm}59\;{\mu}m$으로 대조군 $408{\pm}48\;{\mu}m$에 비하여 유의하게 낮았으며(p<0.001), 전례에서 융모 위축의 소견이 관찰되었다. 2) CZD는 CMSE 환자군에서 $311{\pm}65\;{\mu}m$으로 대조군 $188{\pm}24\;{\mu}m$에 비하여 유의하게 깊었다(p<0.05). 3) TMT는 CMSE 환자군에서 $449{\pm}56\;{\mu}m$으로 대조군 $596{\pm}71\;{\mu}m$에 비하여 유의하게 낮았다(p<0.001). 4) VH/CD는 CMSE 환자군에서 $0.46{\pm}0.28$로 대조군 $2.17{\pm}0.12$에 비하여 유의하게 낮았다(p<0.001). 5) LSE는 CMSE 환자군에서 $889{\pm}231\;{\mu}m$으로 대조군 $2547{\pm}378\;{\mu}m$에 비하여 유의하게 낮았다(p<0.001). 6) IEL은 CMSE 환자군에서 $34.1{\pm}10.5$개로 대조군 $13.6{\pm}3.6$개에 비하여 유의하게 높았다(p=0.001). 7) EOS-EP는 CMSE 환자군에서 $0.47{\pm}0.83$개로 의미 있는 침윤은 관찰되지 않았으며, 대조군 $0.80{\pm}0.84$개와 유의한 차이는 보이지 않았다. EOS-LP는 환자군에서 $2.67{\pm}3.72$개로 의미 있는 침윤은 관찰되지 않았으며, 대조군 $4.0{\pm}2.5$개와 유의한 차이를 보이지 않았다. 8) 회복기의 형태학적 변화는 VH $320{\pm}34\;{\mu}m$, CZD는 $194{\pm}19\;{\mu}m$, TMT $514{\pm}21\;{\mu}m$, VH/CD $1.41{\pm}0.25$, LSE $1840{\pm}210\;{\mu}m$, IEL $10.8{\pm}2.3$개로 관찰되었다. 결 론: 소장 조직의 생검은 상부위장관내시경을 이용하여도 그 임상적 유용성이 높으며, CMSE 환자에서 소장 점막의 손상은 형태학적 계측을 통하여 정량적으로 평가할 수 있으며 진단적 민감도가 높다. CMSE에서 점막의 손상은 빠른 융모 상피의 손상에 대한 음와 세포의 충분한 보상의 실패로 사료되며, 단백질 가수분해물의 수유후 빠른 회복이 관찰되었다.

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The Preventive Effects of Colon Cancer and Imflammatory Bowel Disease of Supercritical Heat-Treated Radish Extracts

  • Kim, Hyun-Kyoung
    • International Journal of Internet, Broadcasting and Communication
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    • 제12권2호
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    • pp.98-112
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    • 2020
  • There is a strong connection between the diet rich in antioxidants and the decreased incidence of inflammatory bowel disease and cancerous diseases. Diets that are rich in anti-oxidants particularly include fruits and vegetables containing the high amounts of vitamin A-E, carotenoids, and minerals. The supercritical heat-treated radish extracts of the research result had an inhibitory effect on the development of aberrant crypt foci (ACF), namely, preneoplastic lesions having a potential to become cancer cells and reduced the number of the aberrant crypt foci (ACF) consisting of four or more aberrant crypts (AC) having high risk to become tumors by about half. The supercritical heat-treated radish extracts can reduce the incidence of preneoplastic lesions having a high risk of developing cancer by about 28 %. DSS-treated mice developed symptoms similar to those of human UC, such as severe bloody diarrhea and weight loss. Supercritical heat-treated radish extracts, as well as sulfasalazine, suppressed colonic length and mucosal inflammatory infiltration. In addition, supercritical heat-treated radish extracts treatment significantly reduced the expression of pro-inflammatory signaling molecules through suppression both mitogen-activated protein kinases (MAPK) and nuclear factor-kappa B (NF-kB) signaling pathways, and prevented the apoptosis of colon. Moreover, supercritical heat-treated radish extracts administration significantly led to the up-regulation of anti-oxidant enzyme including SOD and Catalase.

Effects of vitamin A supplementation in the diet of breeding geese on offspring intestinal tissue morphology and immune performance

  • Yang, Haiming;Liang, Jingru;Dai, Hang;Wan, Xiaoli;Wang, Zhiyue
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제33권9호
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    • pp.1463-1469
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    • 2020
  • Objective: The effects of maternal and offspring dietary vitamin A (VA) supplementation on early body weight, digestive tract function and immune function in goslings were studied. Methods: Yangzhou geese (180 d old) were randomly divided into 5 experimental groups of 15 females and 3 males (the males were kept until slaughter). Eggs were collected for hatching during the peak laying period. A total of 96 goslings were selected from each treatment group (each fed a basic diet supplemented with 0, 4,000, 8,000, 12,000 or 16,000 IU/kg VA) and randomly divided into 2 groups, with 6 replicates in each group and 8 goslings in each replicate. The gosling diet was supplemented with 0 or 9,000 IU/kg VA. Results: i) Villus length, villus width and the muscle thickness of the duodenum, jejunum and ileum were increased and the crypt depth was reduced after adding 12,000 IU/kg VA to the goslings' diet (p<0.05). Adding 9,000 IU/kg VA to the offspring diet increased the length of the duodenal villi and width of the ileum and decreased the crypt depth of the ileum (p<0.05). ii) Supplementing the maternal diet with 12,000 IU/kg VA increased immune organ weight, the immune organ index and immunoglobulin content in goslings (p<0.05). The bursa weight and immunoglobulin G content of offspring were higher in the 9,000 IU/kg VA supplementation group than in the group with no supplementation (p<0.05). Conclusion: Offspring growth and development were affected by the amount of VA added into maternal diet. The negative effect of maternal VA deficiency on offspring can be compensated by adding VA to the offspring diet. Continued VA supplementation in the offspring diet after excessive VA supplementation in the maternal diet is unfavorable for gosling growth and development.

Growth performance, carcass traits and gut health of broiler chickens fed diets incorporated with single cell protein

  • Hombegowda, Gangavadi P.;Suresh, Bypanahalli N.;Shivakumar, Mysore C.;Ravikumar, Puttamallappa;Girish, Bekkere C.;Rudrappa, Satturu M.;Indresh, Huchamanadoddi C.
    • Animal Bioscience
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    • 제34권12호
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    • pp.1951-1962
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    • 2021
  • Objective: This study was conducted to evaluate single cell protein (SCP), produced from Methylococcus species, as a protein source on the growth performance, carcass traits and gut health of broiler chickens. Methods: Ten iso-nitrogenous and iso-caloric diets containing 0 (Control), 2.5%, 5%, 7.5%, and 10% SCP replacing either soybean meal (T1 to T5) or fish meal (T6 to T10) were formulated. Each diet prepared for starter (0 to 14 days), grower (15 to 21 days), and finisher (22 to 42 days) phases was offered to four replicates of 10 chicks each (n = 400). Growth performance at different phases and carcass characteristics and intestinal morphology on 42nd day of trial were measured. Results: Body weight gain in groups fed 2.5% and 5% SCP diets were comparable to control during different phases and cumulatively, however lower (p<0.01) in 7.5% and 10% SCP diets. Feed conversion ratio was better (p<0.01) in 2.5% and 5% SCP diets. Dressing percentage, abdominal fat percentage and meat:bone ratio were not affected (p>0.05) by SCP inclusion in the diets. However, breast percentage was higher (p<0.01) in 2.5% and 5% SCP groups and thigh percentage higher in 7.5% and 10% SCP groups. Total microbial count in duodenum, jejunum and ileum were not affected (p>0.05) by SCP inclusion up to 10% in diets. Duodenal villi length and crypt depth were highest (p<0.01) in group fed 5% SCP diets and lowest in group fed 10% SCP diets. Jejunal villi length and crypt depth as well as ileal villi length were lowest (p<0.01) in group fed 10% SCP diets. Body weight gain, feed consumption, feed conversion ratio and gut health were better (p<0.01) in broilers fed fish meal based diets compared to soybean meal based diets. Conclusion: It was concluded that inclusion of SCP up to 5% replacing soybean meal in broiler diets is beneficial in improving growth rate, breast yield and gut health status.

화학적 발암원을 투여한 쥐에서 녹차 추출물의 대장암 억제효과에 관한 생화학적 연구 (Biochemical Studies on Colon Tumor Non-Promoting Effect of Green Tea Extract in Chemical Carcinogen-Treated Rats)

  • 박현서
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제33권6호
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    • pp.632-638
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    • 2000
  • This study was designed to observe the effect of green tea on colon tumor incidence and biomarkers of colon carcinogenesis in 1, 2-dimethlhydrazine-treated rats. Male Sprague Dawley rats at 7 weeks of age were divided into two groups: control and green tea(GT) groups. Control rats had distilled water as drinking water but GT group received green tea extracts(2.5%, w/v water) as drinking water throughout the experiment periods. All rats were fed the experimental diet containing 15% fat by weight for 20 weeks. and were i.m. injected with DMH for 6 weeks to give total dose of 180mg/kg body weight. Tumor incidence was reduced in GT group (39%) compared with control group (56%) Green tea significantly reduced cell proliferation (total cells per crypt, crypt length and proliferative zone) in colonic mucosa and also significantly reduced the levels of preformed prostalandin E2(PGE2) and thromboxance B2(TXB2) in colonic mucosa but the fatty acid profile of total lipid in colonic mucosa was not significantly influenced by green tea. However the relative percent of C20:4 and the levels f preformed PGE2 and TXB2. were significantly higher in tumor tissue compared with normal surrounding mucosa.Green tea increased the fecal excretion of total bile acid but not scondary bile acid which is known as one of promoters for colon cancer,. These results suggest that green tea could have preventive effect against colon cancer when consumed daily by influencing on antioxidant effect and the metabolism of arachidonic acid.

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생쥐에서 과립구 집락형성인자(Granulocyte-Colony Stimulating Factor)의 공장점막에 대한 방사선 보호효과 (Radioprotective Effects of Granulocyte-Colony Stimulating Factor in the Jejunal Mucosa of Mouse)

  • 유미령;정수미;계철승;김연실;윤세철
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제19권1호
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    • pp.45-52
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    • 2001
  • 목적 : 최근 항암 화학요법이나 두경부의 방사선치료 후 나타나는 백혈구감소증을 치료하기 위해 조혈세포 성장인자인 과립구 집락형성인자를 투여한 결과, 백혈군감소증과 더불어 구강 점막염의 완화가 몇몇 임상연구에서 보고되고 있다. 그러나 그 기전이나 적절한 투여 방법에 대해서는 뚜렷이 밝혀지지 않았으며, 다른 위장관 점막에 대한 보호효과에 대해서도 아직 알려진 바가 없다. 이에 저자는 생쥐 공장 점막에 대한 과립구 집락형성인자의 방사선 보호제로서의 가능성을 알아보고자 하였다. 대상 및 방법 : 실험 동물은 체중 20 g 내외의 생후 $4\~5$주된 BALB/c 생쥐 105 마리로 각각 정상 대조군, 과립구 집락형성인자 단독투여군(제 I 군 : $10\;{\mu}g/kg/$일, 제 II 군 $100\;{\mu}g/kg/$일), 방사선 단독조사군(7.5 Gy 또는 12 Gy 전신조사), 그리고 방사선조사와 과립구 집락형성인자 병행 처치군(G-CSF I 또는 II+7.5 Gy, G-CSF I 또는 II+12 Gy)의 아홉군으로 구분하였다. 과립구 집락형성인자는 과립구 집락형성인자 단독투여군 및 방사선조사와 과립구 집락 형성인자 병행처치군 모두에서 방사선조사 2일 전부터 24시간 간격으로 방사선조사일까지 3일 동안 매일 1회 피하 주사하였고, 방사선조사는 6 MV 선형 가속기를 이용하여 7.5 Gy와 12 Gy를 각 군별로 1회 전신조사하였다. 각 군별로 생쥐를 방사선조사 후 1, 3, 7일에 희생하여 공장을 적출하고 H&E 염색 및 PAS 염색을 시행한 후, 공장 조직 표본에서 소낭선의 수, 융모의 길이 및 조직학적 손상등급을 측정하고 조직학적 변화를 관찰하였다. 결과 : 방사선조사없이 과립구 집락형성인자 만을 투여한 군(제 I 군 : $10\;{\mu}g/kg/$ 및 제 II 군: $100\;{\mu}g/kg/$) 에서는 정상 대조군에 비해 생쥐 공장 점막 변화에 유의한 차이가 없었다(p>0.05). 7.5 Gy 및 12 Gy 방사선 단독조사군에서는 정상 대조군에 비해 공장 점막의 소낭선 수의 감소와 높은 조직학적 손상등급을 관찰하였다(p<0.05). 12 Gy 방사선조사와 과립구 집락형성인자 병행처치군에서는 공장 점막의 손상이 7.5 Gy 방사선 단독조사군에 비해 1일 군에서는 차이가 없었으나(p>0.05), 3일 군에서 유의하게 높은 소낭선 수 및 낮은 조직학적 손상등급을 관찰하였고, 7일 군에서 낮은 조직학적 손상등급을 관찰하였다(p<0.05). 12 Gy 방사선조사와 과립구 집락형성인자 병행처치군에서의 공장 점막 손상은 12 Gy 방사선 단독조사군에 비해 소낭선의 수와 융모의 길이, 조직학적 손상등급의 차이가 유의하지 않았으며(p>0.05), 두 마리를 제외한 대부분의 생쥐가 방사선조사 후 5일 이내에 모두 사망하였다. 결론 : 한계 선량 이내의 전신 방사선조사시 과립구 집락형성인자는 생쥐의 공장 점막에 대한 방사선보호작용이 있는 것으로 사료된다.

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Intestinal Development and Function of Broiler Chickens on Diets Supplemented with Clinoptilolite

  • Wu, Q.J.;Zhou, Y.M.;Wu, Y.N.;Wang, T.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제26권7호
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    • pp.987-994
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    • 2013
  • The purpose of this study was to evaluate the effect of natural clinoptilolite (NCLI) and modified clinoptilolite (MCLI) on broiler performance, gut morphology, intestinal length and weight, and gut digestive enzyme activity. A total of 240 d-old male chicks were randomly assigned to 3 treatments, each of which comprised 8 pens of 10 chicks per pen. Birds in the control group were fed the basal diet, while those in the experimental groups were fed diets supplemented with NCLI at 2% (NCLI group), or MCLI at 2% (MCLI group), respectively, for 42 d. Compared with the control, supplementation with NCLI or MCLI had no significant (p>0.05) effects on productive parameters from d 1 to 42. Supplementation with NCLI or MCLI had no influence on the relative length and weight of small intestine at d 1 to 21. But supplementation with NCLI or MCLI significantly reduced the relative weight of duodenum. Supplementation with MCLI and NCLI was associated with greater (p<0.05) villus height in the jejunal and ileal mucosa compared with those areas in the controls from d 1 to 42. However, supplementation with NCLI and MCLI had no significant (p>0.05) influence on the crypt depth in the jejunal and ileal mucosa compared with those in the controls. The addition of either NCLI or MCLI to the diet improved the activities of total protease, and amylase in the small intestinal contents. In conclusion, supplementation with NCLI or MCLI in diets improved intestinal morphology, increased the intestinal length and weigh and gut digestive enzyme activity.