• 생명과학회지
• /
• 제16권6호
• /
• pp.1001-1005
• /
• 2006

SSR markers를 이용하여 벼의 품종간 유전적 유연관계 분석과 품종식별 방법에 대한 연구를 수행하여 얻어진 결과를 요약하면 다음과 같다. SSR primer 50개와 벼 보급종 21품종을 PCR 반응시킨 결과 다형성을 뚜렷하게 나타내는 primer는 23개였으며, 각 marker에 의해 발생된 대립유전자의 수는 $2{\sim}9$까지 검출되었고, 평균값은 3.00개로 나타났다. 유전적 다형성 정도를 나타내어 주는 SSR marker의 PIC 값은 최소 0.091에서부터 최대 0.839까지 다양하게 분석되었다. SSR marker를 이용하여 분석된 벼 21품종에 대한 전체 유전적 유사도는 $0.59{\sim}0.92$의 범위에 속하였고 유사도 지수 0.65를 기준으로 할 때 4개의 그룹으로 구분되었다. SSR marker중에서 RM206, RM225, RM418, RM478은 marker genotype에 의해 21 품종에 대해 각각 고유한 밴드 특성을 나타내어 품종판별이 가능한 것으로 나타났다. 금후 이 연구결과는 벼 보급종의 품종식별을 위해 효과적으로 이용될 수 있는 것으로 나타났다.

• 원예과학기술지
• /
• 제17권1호
• /
• pp.23-28
• /
• 1999

Prunus cerasifera, P. domestica 및 P. salicina에서 기원된 자두 53 종 또는 품종으로 부터 27 형태형질의 특성을 조사하여 품종 동정에 필요한 기초자료를 제공하고, 그들간의 분류적 관계를 알아보기 위하여 주성분분석 및 집괴분석을 실시하였다. 조사된 형태형질 중 잎의 크기, 잎의 형태 및 엽내 털 발생정도 등이 자 두아속 식물의 동정 및 분류적 관계 해석에 있어서 상당히 유용하게 이용될 수 있을 것으로 단되었으며, 잎의 길이, 엽병 길이, 밀선수, 형, 엽저, 만개기 등은 P. domestica계 자두와 P. salicina계 자두간에 명확한 차이를 나타내었다. 또한 주성분분석 득점치를 이용한 비가 평균결합법에 의한 집괴분석 결과 53개 분류 군들은 평균거리 1.0을 기준으로 할 때 P. alicina-P. cerasifera 표현군, P. domestica 표현군 및 P. pinosa 표현군 등 3개의 표현군으로 분류될 수 있어, 분류군들의 대략적인 분류적 관계 분석이 가능하였다. 그러나 정확한 종군 분류를 위해서는 보다 많은 형태형질의 용이 필요할 것으로 판단되었다.

• Journal of Plant Biotechnology
• /
• 제43권4호
• /
• pp.457-465
• /
• 2016

핵심 microsatellite 마커를 활용하여 우리나라에서 품종보호출원 및 등록된 콩 148 품종에 대한 DNA 프로파일 데이터베이스를 구축한 다음 유전적 유사도 분석을 통한 품종 식별력 정도를 조사하였다. 콩 148품종을 120개의 microsatellite 마커로 검정하고 밴드의 패턴이 명확하고 다형성 정도가 높은 핵심 마커 16개의 대립유전자의 수는 6 ~ 28개로 나타났고 평균 대립유전자의 수는 12.75개였다. PIC 값은 0.753 ~ 0.951 사이에 분포하였고 평균값은 0.863으로 아주 높았다. 콩 148 품종에 대하여 Jaccard 방법에 따라 유전적 유사도를 설정한 다음 비가중 산술평균결합에 의해 집괴분석하여 계통도를 작성하였을 때, 콩의 품종 유형 및 품종 육성 계보에 따라 5개의 대그룹으로 나누어졌으며 모든 품종이 식별이 가능하였다. 본 연구에서 콩 품종식별용 핵심 microsatellite는 품종보호출원 품종의 구별성, 균일성, 안정성의 확인, 품종진 위성과 관련된 종자분쟁, 종자 순도 관리에 매우 유용하게 활용될 수 있을 것이다.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
• /
• 제11권2호
• /
• pp.183-197
• /
• 1995

한국산 Phintella속에 속하는 6종의 기재와 동정은 불충분하고 불확실한 상태에 있다. 본 논문에서는 한국미기록종인 P.popovi를 포함한 7종에 대하여 그림, 검색표와 함께 재기재를 하였고, Wesolowska(198la)에 의하여 한국산으로 보고된 바 있는 Icius munitus를 P. cavaleriei로 synonym처리를 하였다. 또, 본인의 동정과 찍짓기를 검정하기 위하여, 134개체에 대한 표준편차 0.05 이하의 13개 형질비값으로 다변량분석을 실시하였다. 134개체에 대한 13개의 형질비값으로 시행된 판별분석의 결과는 만족스럽지 못하였으나, 13개의 형질비값에 대한 14개 OTU의 평균비값으로 시행된 군집분석의 결과는 다른 쌍들에 비하여 비유성이 큰 P. abnormis를 제외하고 저자의 짝짖기 결과와 일치함을 보여주었다. 완벽한 결과를 보여주지는 못하였으나. 단 한 종만 찍을 만들지 못하였기 때문에 전체 7종의 쌍을 얻을 수는 있었다. 이 방법이 보다 개선되면, 옳바른 짝을 검정하거나 동정할 때 유용하게 사용될 수 있을 것으로 생각된다.

• The Plant Pathology Journal
• /
• 제24권4호
• /
• pp.423-432
• /
• 2008

The difference of carbon source utilization and fatty acid composition between the pathotypes of Xanthomonas strains, which causing citrus bacterial canker was compared, and the physiochemical characteristics were used to analyze relationship of the strains for the first time. The pattern of several carbon sources utilization and fatty acids composition reliably discriminated the pathotypes of Xanthomonas strains. The dendrogram which was constructed by 95 carbon source utilization profiles differentiated X. axonopodis pv. citri A, $A^*$ and $A^w$ from the other pathotypes. When the dendrogram was drawn by combined analysis of carbon source utilization pattern and fatty acid composition, X. axonopodis pv. aurantifolii B, C and X. axonopodis pv. citrumelo formed a distinct cluster. The difference of carbon source utilization and fatty acid composition could be used effectively for the identification of pathotypes of citrus bacterial canker. The physiochemical characteristics strongly indicated that the strains isolated in Korea belong to X. axonopodis pv. citri A type. The cluster analysis by the band patterns of ERIC-, BOX- and REP-PCR allowed the discrimination of the pathotypes isolated from Korea. However, the rep-PCRs could not differentiate X. axonopodis pv. citri A types from $A^*$ and $A^w$ types. The overall results of metabolic profiles and rep-PCRs strongly indicated that the Korean isolates are X. axonopodis pv. citri A type.

• Fisheries and Aquatic Sciences
• /
• 제22권6호
• /
• pp.12.1-12.8
• /
• 2019

Background: Wild fish populations stock is continuously diminishing in the Indo-Ganges river basin, and the population status of most fishes is unidentified. The identification of the population status and the conservation of commercially important and endemic wild fish populations in this region are crucial for the management. The aim of this paper was to identify the population status of Cirrhinus reba, a promising aquaculture but vulnerable species in the Indo-Ganges river basin in Bangladesh. Methods: C. reba samples were collected from four isolated populations of the Brahmaputra (n = 30), the Padma (33), the Karatoya (31), and the Jamuna Rivers (30) in Bangladesh, and the population status was evaluated using morphometric and landmark comparisons. Data were analyzed with the Kruskal-Wallis test, univariate analysis, discriminant function analysis, and the formation of a dendrogram. Results: Three meristic characters (Pectoral fin rays, caudal fin rays, scale in lateral lines), four morphometric characters (head length, pre-orbital length, post-orbital length, maximum body depth), and truss measurement (4-7) were significantly different among the stocks. The step-wise discriminant function analysis retained 15 variables from morphometric and landmark measurements that significantly differentiated the populations based on the constructed DFI and DFII. Discriminate function analysis also showed that 91.2% of the original groups were classified into their correct samples. The cluster analysis of Euclidean distances placed the Jamuna population in one cluster and the Brahmaputra, the Padma, and the Karatoya populations in the second one. Conclusion : Morphological differences among the stock were probably due to different ancestral origin. This is the first report about population status of C. reba in their natural habitat of the Indian subcontinent. Further genetic studies and the evaluation of environmental impact on C. reba populations in Bangladesh are suggested to support our findings.

• 한국지능시스템학회논문지
• /
• 제12권4호
• /
• pp.334-340
• /
• 2002

본 논문에서는 상대적으로 큰 퍼지 엔트로피를 갖는 입력-출력 데이터 집단에 다중 회귀 분석을 적용하여 다차원 평면 클러스터를 생성하고, 이 클러스터를 새로운 퍼지 모델의 규칙으로 추가한 후 모델 파라미터의 개략 동조와 정밀 동조를 반복 수행하는 자기구성 퍼지 모델링을 제안한다 Weighted recursive least squared 알고리즘과 fuzzy C-regression model 클러스터링에 의해 퍼지 모델의 파라미터를 개략적으로 동조한 후 gradient descent 알고리즘에 의해 파라미터를 정밀 동조하면서 감수분열 유전 알고리즘을 이용하여 최적의 학습률을 탐색한다. 그리고, 자기구성 퍼지 모델링 기법을 이용하여 Box-Jenkins의 가스로 데이터, 비선형 다변수 정적 함수의 데이터, 하수처리 활성오니 공정과 Mackey-Glass 시계열 데이터의 모델링을 수행하고, 기존의 방법에 의한 모델링 결과와 비교하여 그 성능을 입증한다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
• /
• 제15권4호
• /
• pp.359-364
• /
• 2011

The seven selected primers OPA-02, OPA-04, OPA-18, OPD-07, OPD-08, OPD-15 and OPD-16 were used to generate unique shared loci to each species and shared loci by the two species. The hierarchical dendrogram indicates three main branches: cluster 1 (RORETZI 01~RORETZI 11) and cluster 2 (HILGENDORF 12~HILGENDORF 22) from two geographic populations of ascidians, Halocynthia roretzi and H. hilgendorfi. The shortest genetic distance displaying significant molecular difference was between individuals' HILGENDORF no. 14~HILGENDORF no. 19 (genetic distance =0.008). Ultimately, individual no. 02 of the RORETZI ascidian was most distantly related to HILGENDORF no. 21 (genetic distance=0.781). These results demonstrate that the H. roretzi population is genetically different from the H. hilgendorfi population. From what has been said above, the potential of PCR analysis to identify diagnostic markers for the identification of two ascidian populations has been demonstrated. Generally speaking, using a variety of decamer primers, this PCR method has been applied to identify specific markers particular to line, species and geographical population, as well as genetic diversity/polymorphism in diverse species of organisms.

• 한국대기환경학회지
• /
• 제13권1호
• /
• pp.51-63
• /
• 1997

Total suspended particulate matters in the ambient air were analyzed for eight chemical elements (Ca, Co, Cu, Fe, Mn, Pb, Si, and Zn) using an x-ray fluorescence spectrometry (XRF) at the Kyung Hee University - Suwon Campus during 1989 to 1994. To use these data as basis for source identification study, membership of each sample was selected to represent one of the well defined sample groups. The data sets consisting of 83 objects and 8 variables were initially separated into two groups, fine (d$_{p}$<3.3 ${\mu}{\textrm}{m}$) and coarse particle groups (d$_{p}$>3.3 ${\mu}{\textrm}{m}$). A hierarchical clustering method was examined to obtain possible member of homogeneous sample classes for each of the two groups by transforming raw data and by applying various distances. A disjoint principal component analysis was then used to define homogeneous sample classes after deleting outliers. Each of five homogeneous sample classes was determined for the fine and the coarse particle group, respectively. The data were properly classified via an application of logarithmic transformation and Euclidean distance concept. After determining homogeneous classes, correlation coefficients among eight chemical variables within all the homogeneous classes for calculated and meteorological variables (temperature. relative humidity, wind speed, wind direction, and precipitation) were examined as well to intensively interpret environmental factors influencing the characteristics of each class for each group. According to our analysis, we found that each class had its own distinct seasonal pattern that was affected most sensitively by wind direction.ion.

• Asian Journal of Atmospheric Environment
• /
• 제4권1호
• /
• pp.9-19
• /
• 2010

The size distribution of airborne particulate matter (PM) and the concentrations of associated metallic elements were investigated in a busy urban region of a typical Korean industrial city. The PM concentrations measured during the spring, except for those in the size range of 1.1 to 2.1 ${\mu}m$, were slightly higher than the PM concentrations in the summer. Coarse particles contributed greatly to the variation in PM concentrations in the spring, while fine and submicron particles contributed largely to the variation in PM concentrations in the summer. The difference in size modes of the PM concentrations between spring and summer may be explained by the Asian dust effect and its accompanying wind direction and speed. Extremely high enrichment factors (EFs) values (6,971 to 60,966) for all of the size distributions in PM were identified for cadmium (Cd). High EFs values (12 to 907) were also identified for other heavy metals including Cr, Cu, Ni, Pb, Zn and Mn. Low EF values (0.29 to 8.61) were identified for Ca, K, Mg and Na. These results support the common hypothesis that most heavy metals in ambient PM have anthropogenic sources and most light metals have crustal sources. The results of principal components analyses and cluster analyses for heavy metals indicate that the principal sources of PM and metals were emissions from non-ferrous metal smelters, oil combustion, incinerators, vehicular traffic and road dust.