• 제목/요약/키워드: chromosome 5

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제주특산 한라참나물(Pimpinella hallaisanensis)의 핵형분석과 Bicolor FISH (Karyotyping Analysis and Bicolor FISH of Pimpinella hallaisanensis, an Endemic to Jeju Island)

  • 김수영;김찬수;도재화;이중구
    • 식물분류학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.151-162
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    • 2008
  • 제주도 특산식물인 한라참나물의 염색체수를 재조사하기 위해 핵형분석과 bicolor FISH를 수행하였다. 한라참나물의 체세포 염색체수는 2n=2x=22로 관찰되었고, 염색체의 길이는 $3.58-5.82{\mu}m$였다. 염색체의 구성은 2쌍의 중부 염색체(염색체 1과 2번), 4쌍의 차중부 염색체 (염색체 3, 4, 6, 8번), 그리고 5쌍의 차단부 염색체(염색체 5, 7, 9, 10, 11번)로 확인되었다. Bicolor FISH를 통해 3쌍의 5S와 4쌍의 45S rDNA 위치를 확인하였으며, 5S rDNA의 경우 염색체 4번의 장완 말단 부위에서 2쌍과 염색체 6번의 장완 중심과 동원체 사이에서 1쌍의 signals가 관찰되었다. 45S rDNA signals는 염색체 4, 6, 10 그리고 11번의 단완 말단에서 각각 확인되었다. 본 종의 염색체수가 핵형분석 및 FISH를 통해 이전의 연구결과와 다르게 분석됨으로써 한라참나물의 염색체수의 재고가 필요하다고 사료되었다.

시험관내의 인체폐암 세포 A549의 방사선 및 5-Fluorouracil에 대한 효과 (The Effect of 5-FU and Radiation on A549 Cells In Vitro)

  • 이명자;전하정;이원영
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제7권1호
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    • pp.1-13
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    • 1989
  • Effects of ionizing radiation alone and combined with chemotherapy on tumor growth and it's clonal specificity monitored by changes in distribution of chromosome number were studies in A549 ceil line originated from human adenocarcinoma of the lung. Radiation (300 rad, 600 rad and 900 rad) were delivered with or without 5-FU. Forty eight hours later, 57.5% of growth inhibition of cell w8s seen in cells treated with 5-FU concentration of $0.4{\mu}g/ml$ for 24hr exposure. Cell survival curves after radiation with and without 5-FU were made. Chromosomal analysis of cells in metaphase in control, and in cells treated with 300 rad of radiation, or $0.4{\mu}g/ml$ of 5-FU treatment, and combined treatment of both were done to examine the changes in ploidy and number of chromosome. Radiation combined with S-FU enhanced growth inhibition of A549 cells. However, no evidence of synergegic effects in growth. inhibition was observed in the cells treated with the combination therapy. Pattern of chromosomal distribution of survived cells were shifted from hyperploidy to hypoploidy by single dose of radiation (300 rad). As radiation dose increased a large number of hypoploidy cells were observed. Following treatment of cells with 5-FU, chomosomal distribution of survived cells were also shifted to hypodiploidy which were seen in cells treated with radiation, The ceil treated with 5-FU and fellowed by radiation within 24 hrs had cell with increased number of hypodiploidy cells. Almost same type of chromosomal changes were reproduced in cells treated with combined treatment with radiation and 5-FU. Minor differences were that cells with fewer number of chromosome were more frequent in cells treated with combined therapy. Further increase in cells of hypoploidy (93%) having 1-10 chromosome were induced by additional radiation. Therefore, the enhanced therapeutic effect of 5-FU combined with radiation of A549 cells appeared to be additive rather than synergistic.

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호밀(Secale cereale L.)의 핵형분석과 rDNA의 Physical Mapping (Karyotype Analysis and rDNA Physical Mapping in Rye (Secale cereale L.))

  • 이준수;서봉보;김민
    • 한국육종학회지
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    • 제42권2호
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    • pp.163-168
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    • 2010
  • 본 실험은 곡류 작물중에서 육종의 소재로써 많은 장점을 지닌 호밀을 Gimsa C-분염법과 FISH기법을 이용하여 구성이질 염색질과 5S와 18S-26S rRNA 유전자의 염색체상의 위치를 확인하고자 본 실험을 수행하였다. 그 결과를 요약하면 아래와 같다. 표지되었으며 2차협착으로 부수체가 존재하는 1번 염색체의 부수체의 말단과 5번 염색체의 중간에 표지되었고, 18S-26S rDNAs 유전자는 1개의 염색체에 표지되었으며 이 염색체는 2차협착으로 부수체가 존재하는 1번 염색체의 인 형성체 부위에 표지되었다. 1번 염색체에는 5S 와 18S-26S rDNAs 유전자가 표지되었고 5번 염섹체에는 5S rDNA 유전자만이 표지되었다.

Detection of the BCR/abl Gene Rearrangement by Reverse Transcriptase Based Polymerase Chain Reaction

  • Lee, Kyung-Ok;Park, Young-Suk;Kim, Yong-Woo;Han, Jung-A;Kim, Yoon-Jung
    • BMB Reports
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    • 제29권3호
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    • pp.241-247
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    • 1996
  • The Philadelphia (Ph) chromosome is the single most intensively studied chromosome alteration characterizing a human malignancy. The specific genetic alteration of chronic myelogenous leukemia (CML) is the formation of the BCR/abl fusion gene in leukemic cells. The presence of the BCR/abl gene has important diagnostic and prognostic implications in CML. The detection of BCR/abl transcripts by reverse transcriptase based polymerase chain reaction (RT-PCR) was investigated in patients with CML in whom the Ph chromosome abnormality was documented by cytogenetic analysis. In a total of 68 CML patient cases, the Ph chromosome was found in 53 cases (77.9%) by cytogenetic analysis. On the other hand, sixty two cases (91.2%) were detected to have BCR/abl gene rearrangement Of these, b3a2 was 44 cases (64.7%) and b2a2 was 17 cases (25,0%). There was one case with both b3a2 and b2a2 (1.5%). Of the fifteen cases of Ph chromosome negative by cytogenetic anlaysis, the BCR/abl gene was observed in nine cases, The results of BCR/abl fusion gene confirmed by the direct sequencing method correlated well with PCR analysis, The amplified PCR products were detected by $1{\times}10^{-5}$ dilutions. In conclusion, PCR technique is sensitive, rapid and relatively simple for a laboratory test in detecting the BCR/abl fusion gene with CML regardless of the result of cytogenetic analysis.

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복제수 증폭시스템과 염색체 분단기술을 이용한 Simultaneous YAC Manipulation-Amplification (SYMA) 시스템의 개발 (Development of Simultaneous YAC Manipulation-Amplification (SYMA) system by Chromosome Splitting Technique Harboring Copy Number Amplification System)

  • 김연희;남수완
    • 생명과학회지
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    • 제20권5호
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    • pp.789-793
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    • 2010
  • 복잡한 진핵생물에서의 물리적 지도 작성이나 기능해석에 효모인공염색체(YAC)를 이용하기 위해서는 원하는 target region의 인공염색체화 및 single-copy인 YAC의 복제수를 늘이는 것이 요구된다. 본 연구에서는 YAC manipulation system에 복제수 증폭시스템(copy number amplification system)을 도입한 Simultaneous YAC Manipulation-Amplification (SYMA) system을 구축하였다. 식물염색체를 가진 YAC clone의 splitting과 증폭을 위해 conditional centromere와 thymidine kinase (TK) 유전자를 가진 pBGTK plasmid를 구축하였고, splitting fragment의 PCR을 위한 주형으로 사용하였다. 590 kb의 YAC clone은 splitting과 동시에 copy number amplification element를 가진 100 kb YAC와 490 kb YAC로 분리되었고, 100 kb YAC는 유도기질로 3 mg/ml sulfanilamide와 $50\;{\mu}g/ml$ methotrexate (S3/M50)의 첨가에 의해 14.4배로 그 복제수가 증가하였음을 확인할 수 있었다.

한국산 왕고들빼기속(Lactuca)의 핵형분석 (A karyotype analysis of Lactuca (Asteraceae) in Korea)

  • 양지영;최경;박재홍
    • 식물분류학회지
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    • 제39권1호
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    • pp.24-28
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    • 2009
  • 본 연구에서는 왕고들빼기속 (Lactuca) 중에서 한국에 자생하는 왕고들빼기 (L. indica)와 두메고들빼기 (L. triangulata)의 체세포염색체수와 핵형을, 귀화종인 가시상치 (L. scariola)의 체세포염색체수와 핵형을 처음으로 조사하였다. 체세포염색체의 기본수는 x = 9이었고 염색체 배수화 현상은 나타나지 않았다. 염색체 조성을 조사한 결과 왕고들빼기는 2n = 18 = 2 m + 7 sm, 가시상치는 2n = 18 = 1 m+ 6 sm + 2 st, 두메고들빼기는 2n = 18 = 2m + 5 sm + 2st로 나타났고, 왕고들빼기와 두메고들빼기의 경우 염색체의 단완 말단에 부수체가 존재하였다. 왕고들빼기, 가시상치, 두메고들빼기의 반수체 게놈의 길이는 각각 $56.3{\mu}m$, $35.3{\mu}m$, $72.5{\mu}m$로 나타났고, 각 염색체의 크기는 귀화종인 가시상치가 $2.7-5.3{\mu}m$로 가장 작았으며 왕고들빼기와 두메고들빼기는 각각 $4.7-7.5{\mu}m$, $5.0-8.0{\mu}m$로 비슷하였다. 가시상치의 핵형은 sect. Tuberosae에 속하는 왕고들빼기, 두메고들빼기와 차이를 보인 반면, sect. Lactuca, subsect. Lactuca에 속하는 분류군의 핵형과 유사한 것으로 조사되었다.

헐떡이풀의 핵형분석과 Bicolor FISH를 이용한 물리적 지도 작성 (Karyotype Analysis and Physical Mapping of rDNAs Using Bicolor-FISH in Tiarella polyphylla D. Don)

  • 김수영;이중구
    • 한국자원식물학회지
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    • 제20권5호
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    • pp.446-450
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    • 2007
  • 헐떡이풀은 다년생 초본으로 중국, 일본, 대만 그리고 한국에 분포한다. 특히 우리나라에서는 울릉도에서만 분포하는데, 천식 치료, 타박상 그리고 청각장애의 치료에 사용된다. 약용작물로써의 높은 가치에도 불구하고 염색체 수를 제외한 다른 세포유전학적인 연구가 거의 이루어지지 않았다. 따라서 핵형분석 뿐만 아니라 bicolor FISH를 통한 5S 와 45S rDNA의 물리적 지도작성에 관한 연구가 수행되었다. 체세포 염색체 수는 2n=2x=14로 염색체의 길이는 $1.66{\sim}3.50{\mu}m$ 이다. 또한 염색체의 구성은 4쌍의 차중부 염색체(염색체 1, 2, 3, 6)와 2쌍의 차단부 염색체(염색체 5, 7)그리고 1쌍의 단부 염색체(염색체 4)로 확인되었다. 또한 4번 염색체가 부수체 염색체로 관찰되었다. Bicolor-FISH를 통해 각각 1쌍의 5S와 45S rDNA 위치를 확인하였는데, 5S rDNA의 경우 염색체 3번의 동원체 부위에서 확인되었고, 45S rDNA는 염색체 4번의 단완 말단 부위에서 관찰되었다. Bicolor-FISH는 헐떡이풀 염색체상에 rDNA 유전자의 위치 확인에 매우 유용한 정보를 제공하는 기술로 사용되었다.

더덕 ( Codonopsis lanceolata ) 의 세포유전학적 연구 II. 지역별 염색체형의 차이 (Cytogenetic Studies of Codonopsis lanceolata Benth. Et. Hook. Geographical Variety of Somatic Chromosomes in Local Type)

  • 윤의수
    • 한국자원식물학회지
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    • 제5권1호
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    • pp.31-35
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    • 1992
  • The somatic chromosome numbers were counted to be 2n = 16 of Codonopsis lanceolata. Chromosomes 2 and 7 of Sokrisan and Koheung II has a hetero satellite on short arm. Chromosome 5 of Bakwoonsan showed homo satllite on short arms. Short arms of chromosomes 1 and 5 has homo satellite and short arms of chromosomes 2 and 7 has hetero satellite of Jilin.

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화상처리를 이용한 반자동 핵형분석 시스템의 개발 (Development of Semi-Automatic Karyotyping System Using Image Processing)

  • 김학경;강병철;박준형;서진호;김상봉
    • 제어로봇시스템학회논문지
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    • 제9권10호
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    • pp.844-851
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    • 2003
  • We introduces a development result of semi-automatic karyotyping system using image processing method to improve a long time working of the manual method and 5% error of traditional automatic karyotying system for analyzing karyotying. The karyotyping procedures have many routine tasks such as searching metaphases, taking pictures, developing, editing, etc. There are several automatic karyotyping systems in order to reduce the task in advanced countries. However, they are very expensive, applicable to only human chromosome, and have too many functions to use easily. This paper takes aim at high quality image resolution and development of interface that can adjust brightness and contrast of image on-line. The system can be applied to animal and plants as well as human's chromosome. The system developed in this paper is applied to pig and human. The effectiveness of the system is proved by hospitals in Korea.

MNNG에 의한 DNA 회복합성과 염색체 이상과의 연관성에 관한 연구 (The Repair of MNNG-Induced DNA Damage and Its Relation to Chromosome Aberrations in Mammalian Cells)

  • Kim, Choon-Kwang;Lee, Chun-Bok
    • 한국동물학회지
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    • 제23권3호
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    • pp.115-123
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    • 1980
  • DNA 회복합성과 염색체이상과의 연관성여부를 추구하기 위하여 CHO 세포를 재료로 MNNG의 농도와 처리후 시간경과에 따른 절제회복율을 조사하고 이들 염색체 이상율과 비교하여 다음과 같은 결과를 얻었따. 1. MNNG에 의한 절제회복율은 $0.5 \\times 10^-5M$에서 $0.5 \\times 10^-5M$까지 농도의 증가에 따른 절제회복율의 증가를 보인다. 또 $1 \\times 10^-5M$ 처리후 0시간째는 절제회복율의 최고치를 보이다가 그후 점자 감소하여 24시간에는 0시간의 66%정도 나타난다. 2. MNNG에 의한 염색체이상은 $1 \\times 10^-5M$ 처리후 6시간에 최대치를 보이며 이상형의 대부분은 염색분체 절단을 나타낸다. 그러나 시간이 경과함에 따라 염색체분체절단은 감소하고 염색분체교환은 증가하여 24시간에는 두종류의 이상율이 비슷하게 이른다. 3. MNNG 처리후 시간경과에 따른 절제회복율은 전체이상율과 대체로 일치한다. 그러나 염색분체교환 또는 염색분체절단과는 어떤 비례관계도 보이지 않는다. 따라서 이같은 결과들은 MNNG에 의한 DNA 상해 및 그 회복은 염색체의 회복 현상과는 연관성이 없음을 암시하는 것이다.

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