• 제목/요약/키워드: chromosome 5

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유전자 알고리즘을 이용한 충돌회피 경로계획 (Collision-free Path Planning Using Genetic Algorithm)

  • 이동환;조연;이홍규
    • 한국항행학회논문지
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    • 제13권5호
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    • pp.646-655
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    • 2009
  • 본 논문은 로봇 충돌회피 경로계획의 문제점을 해결하기 위해 진화된 모델에 근거한 새로운 경로탐색 전략을 소개한다. 최적화된 지능형 검색 방법으로 잘 알려진 유전자 알고리즘을 이용하여 로봇 경로계획 방법을 설계하였다. 염색체 안에 있는 유전자 인자로 경로점을 고찰해보면 주어진 맵에 대한 가능한 해법이제공된다. 생성된 염색체 간의 거리가 먼 경우 유사한 염색체에 대한 적합도로 간주할 수 있다. 경로계획에 있어 본 논문에서 제안한 유전자 알고리즘의 유효성을 증명하기위해 다양한 방법으로 시뮬레이션을 실시하였으며, 제안한 경로 검색 방법은 정지된 장애물이나 복잡한 장애물에도 사용될 수 있음을 증명하였다.

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Isolation and Characterization of Pseudomonas sp. KM10, a Cadmium- and Mercury-resistant, and Phenol-degrading Bacterium

  • Yoon, Kyung-Pyo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제8권4호
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    • pp.388-398
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    • 1998
  • A bacterium which is resistant to both mercury and cadmium, and also capable of utilizing phenol as a carbon and energy source, was isolated from the Kumho River sediments near Kangchang Bridge, Taegu, Korea. The isolate was labeled Pseudomonas sp. KM10 and characterized. The bacteria grew in 4 mM $CdCl_2$and in $70{\mu}M$ $HgCl_2$. The bacteria efficiently removed over 90% of 1 g/l phenol within 30 h. In the presence of 1.250 g/l phenol, the growth of the microorganism was slightly retarded and the microorganism could not tolerate 1.5 g/l phenol. Curing of plasmid from the bacteria was carried out to generate a plasmidless strain. Subsequent experiments localized the genes for phenol degradation in plasmid and the genes for mercury resistance and cadmium resistance on the chromosome. Dot hybridization and Southern hybridization under low stringent conditions were performed to identify the DNA homology. These results showed significant homologies between the some sequence of the chromosome of Pseudomonas sp. KM10 and merR of Shigella flexneri R 100, and between the some sequence of the chromosome of Pseudomonas sp. KM10 and cadA of Staphylococcus aureus pI258. The mechanism of cadmium resistance was efflux, similar to that of S. aureus pI258 cadA, and the mechanism of mercury resistance was volatilization, similar to that of S. flexneri R100 mer.

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Quantitative analysis using decreasing amounts of genomic DNA to assess the performance of the oligo CGH microarray

  • Song Sunny;Lazar Vladimir;Witte Anniek De;Ilsley Diane
    • 한국생물정보학회:학술대회논문집
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    • 한국생물정보시스템생물학회 2006년도 Principles and Practice of Microarray for Biomedical Researchers
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    • pp.71-76
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    • 2006
  • Comparative genomic hybridization (CGH) is a technique for studying chromosomal changes in cancer. As cancerous cells multiply, they can undergo dramatic chromosomal changes, including chromosome loss, duplication, and the translocation of DNA from one chromosome to another. Chromosome aberrations have previously been detected using optical imaging of whole chromosomes, a technique with limited sensitivity, resolution, quantification, and throughput. Efforts in recent years to use microarrays to overcome these limitations have been hampered by inadequate sensitivity, specificity and flexibility of the microarray systems. The oligonucleotide CGH microarray system overcomes several scientific hurdles that have impeded comparative genomic studies of cancer. This new system can reliably detect single copy deletions in chromosomes. The system includes a whole human genome microarray, reagents for sample preparation, an optimized microarray processing protocol, and software for data analysis and visualization. In this study, we determined the sensitivity, accuracy and reproducibility of the new system. Using this assay, we find that the performance of the complete system was maintained over a range of input genomic DNA from 5 ug down to 0.15 ug.

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N-ethyl-N-nitrsourea와 N-methyl-N-nitrosourea에 의한 CHO 세포의 염색체 이상에 관한 연구 (Studies on Chromosome Aberrations Induced N-ethyl-N-nitrosourea and N-methyl-N-nitrosourea in CHO cells)

  • Kim, Choon-Kwang
    • 한국동물학회지
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    • 제24권3호
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    • pp.163-171
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    • 1981
  • CHO 세포를 재료로 ENU와 MNU를 여러농도로 처리한후 시간 경과에 따른 염색체 이상율을 조사하여 다음과 같은 결과를 얻었다. (1) ENU와 MNU에 의한 염색체 이상 빈도는 처리 후 시간의 경과와 농도에 따라 상이한 현상을 나타냈다. (2) ENU 처리군에서는 염색체 이상형은 염색분체 절단이 대부분이었으나 고농도군 ($10^-3 M$)에서는 처리 후 24시간에 염색분체 교환이 염색분체 절단을 능가하였다. (3) MNU 처리군에서는 염색체 이상형은 염색분체 절단이 대부분이었으나 $10^-4$ M 이상에서는 처리후 12시간부터 염색분체 교환이 염색분체 절단을 능가하였다.

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사람의 배양세포염색체의, 방사선감수성에 관한 연구 (Studies on the Radiosensitivity of the Chromosomes in Cultured Human Cells)

  • 강영선;김영진;이정길
    • 한국동물학회지
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    • 제10권1호
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    • pp.17-20
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    • 1967
  • The present experiment was perform to investigate the frequencies of chromosome aberration with special regard to the chromosome groups and the various time intervals after X-irradiation (60 r) in ormal human foetus cells grown in culture. The cytological preparations were prepared at every 5 through 30 hours after X-irradiation by the air-drying method. 1. The frequencies of chormosome aberration are on the whole decreased as tie elapses after irradiation and this is thought to be due to gradual recovery with time . However, a slight increase in frequencies is observed at 25 and 30 hours after irradiation respectively. This shows that the cells at the these periods are more sensitivity to X-irradation , and those cells are thought to be at G$_2$ and late S stage at the time of irradiation respectively, so t is evident that G$_2$ and late S stages a the time of irradiation respectively , so it is evident that G$_2$ and late S stages are more sensitive to X-irradiation than any other stages. 2. The frequencies of chormosome aberration are decreased in descending order of chormosome group number. The differences among these frequencies are highly significant statistically . Therefore it can be concluded that there is a highly significant difference in radiosensitivity among chromosome groups. that is, the chromosomes of the group A are the most radiosensitive , followed by B, C, D ,E and G in descending order.

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한국산 사슴쌍구흡충의 핵형분석 (The Karyotype of Payamphistomum cervi(Zeder, 1790) from Korean Cattle)

  • 이재구;김용환;박배근
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제25권2호
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    • pp.154-158
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    • 1987
  • As a series of systematic classification of paramphistomes, the worms in the rumen and reticulum were collected on 214 Korean cattle slaughtered at Jeonju abattoir from January, 1986 to April, 1987 and were classified by means of morphology. Afterwards, the karyotype of Paramphistomum cervi(Zeder, 1790) was detected by means of modified air.drying method from germ cells of the worms. The results were summarized as follows: 1. In the chromosome number of 254 p. cervi, the haploid cell was n:9 and the diploid 2n=18. The meiotic divisions were observed frequently; 1,924 haploid and 32 diploid cells were reliable. Nine pairs of mitotic chromosomes were homologous in the metaphase stage, and the chromosomes were composed of five medium-sized metacentrics (m) , subtelocentrics(st) or submetacentrics(sm) and four small-siRed subtelocentrics(st) or submetacentrics(sm). Meiotic metaphase was composed of five medium and four small chromosomes in size. 2. As a series of C-banding method, C-band was showed in centromeric region from all of the haploid germ cells. Whereas chromosome No. 3 and 5 included heterochromatin on the tip region, chromosome No. 4 on the distal region and No. 6 proximal region. And chromosomes No. 2 and 8 showed a remarkable C-band distinguished from other chromosomes.

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Neonatal Silver-Russell syndrome assumed to result from maternal uniparental heterodisomy of chromosome 7

  • Kang, Yoongu;Kim, Jinsup;Lee, Hyun Ju;Park, Hyun Kyung
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제17권2호
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    • pp.83-88
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    • 2020
  • Silver-Russell syndrome (SRS) is a rare genetic disorder characterized by intrauterine growth restriction, poor postnatal growth, relative macrocephaly, a triangular face, body asymmetry, and feeding difficulties. It is primarily diagnosed according to a clinical scoring system; however, the clinical diagnosis is confirmed with molecular testing, and the disease is stratified into the specific molecular subtypes. SRS is a genetically heterogeneous condition. The major molecular changes are hypomethylation of imprinting control region 1 in 11p15.5 and maternal uniparental disomy of chromosome 7 (UPD(7)mat). Therefore, first-line molecular testing should include methylation-specific approaches for these regions. Here, we report an extremely low birth weight (ELBW) infant with intrauterine growth retardation, postnatal growth retardation, and dysmorphic facial appearance-characteristics consistent with the clinical diagnostic criteria of SRS. Methylation-specific molecular genetic analysis revealed UPD(7)mat, while the loss of heterozygosity was not detected on chromosomal microarray analysis. We present a case of SRS with suspected uniparental heterodisomy of chromosome 7 in an ELBW infant.

제3세대 한우유전체지도작성 (The 3rd Generation Genome Map of the Korean Cattle (Hanwoo))

  • 이용석;최인호
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제51권2호
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    • pp.123-128
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    • 2009
  • 최근 한우의 유전체 연구의 핵심 소재인 박테리아인공염색체(BAC; Bacterial Artificial Chromosome) 클론이 제작되었고 이에 대한 염기서열의 해독과 이를 NCBI (National Center for Biotechnology Information)의 소 유전체 데이터(B_tau 2.1)와 비교 분석하여 한우의 유전체지도 초안(제2 세대 한우유전체지도)이 제작되었다. 본 연구에서는 기존에 확보한 한우의 박테리아인공염색체 클론의 염기서열을 최근에 공개된 소유전체 데이터(B-tau 3.1)와 비교 분석하여 한우 유전체 지도를 최신화하기 위해 실시하였다. 제2 세대 한우유전체지도에서 총 5,105개의 클론에 대한 염색체상 위치가 결정된 반면에 제3세대 한우유전체지도에서는 총 9,595개의 클론에 대한 염색체 위치가 결정되어 약 2배 정도로 향상되었다. 또한 겹치는 부분을 제외했을 때 제3세대 한우유전체지도에 사용된 클론은 소 전체 염색체의 약 37.27%에 해당되는 부분을 커버하는 것으로 나타났다. 앞으로 추가적인 한우 클론의 염기서열 해독을 통해 얻어진 데이터를 확보한다면 한우염색체 정밀 지도의 완성과 이를 이용한 한우 개량에 유용한 유전자 발굴에 활용될 수 있을 것으로 판단되다.

초자화동결된 생쥐 미성숙란의 세포골격과 염색체성상 (The Cytoskeletal and Chromosomal Constitution of Vitrified Immature Mouse Oocytes)

  • 박세필;이봉경;김은영;남화경;이금실;윤산현;정길생;임진호
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제26권3호
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    • pp.363-368
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    • 1999
  • 연구목적: 본 연구는 동해방지제인 EFS40을 이용한 초자화동결이 생쥐 미성숙란의 cytoskeleton과 염색체의 성상에 미치는 영향을 indirect immunocytochemistry방법과 염색체 분석법으로 알아보고자 실시하였다. 연구재료 및 방법: 본 실험은 생쥐 미성숙란을 EFS40 (40% ethylene glycol, 18% ficou과 0.5 M sucrose가 들어있는 M2배양액)으로 초자화 동결하여 융해한 후 16시간동안 체외 성숙을 유도하여, 제 1극체가 나타난 성숙된 난자를 기준으로 동해제노출군 또는 대조군과 비교 조사하였다. 결과: 초자화동결된 미성숙란의 응해 후 생존율과 체외성숙율은 90.3%과 64.7%로써, 동해제노출군 (86.7%, 69.2%)과 대조군 (100%, 58.3%)에 유사하였다. 초자화동결이 미성숙란의 microtubule과 microfilament에 미치는 영향을 조사하였던 바, 동결군의 microtubule과 micro-filament의 정상적인 형성율 (93.9%, 100.0%)은 동해 제노출군 (94.4%, 100.0%)과 대조군 (100.0%, 100.0%)의 성적과 유사하게 나타났다. 또한, 초자화동결군에서 정상적인 염색체수를 가진 난자의 비율도 65.8%로써, 대조군(79.6%)과 노출군 (69.0%)의 결과와 유의한 차이가 없었다. 결론: 생쥐 미성숙란을 EFS40에 노출하고 동결하는 것이 미성숙란의 cytoskeleton과 염색체성상에 영향을 미치지 않으며, 본 연구에서 사용된 EFS40을 이용한 초자화동결법은 생쥐 미성숙란 동결에 적합하다는 것을 알 수 있었다.

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주요 장미 7품종의 FISH 핵형분석 (FISH Karyotype Analysis of Seven Rose Cultivars)

  • 황윤정;한태호;;임기병
    • 원예과학기술지
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    • 제30권5호
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    • pp.568-572
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    • 2012
  • 효율적인 교배를 위해서는 모본 또는 부본으로 사용하게 될 개체의 배수성 검정이 선행되어야 한다. 이에 본 연구에서는 국내 장미 신품종 육성 프로그램에 이용되고 있는 장미 7품종의 FISH 핵형분석을 통하여 배수성을 확인하고 이를 육종에 있어서 기초 자료로 이용하고자 수행되었다. 배수성 검경 결과, 7품종 모두 4배체(2n = 4x = 28)인 것으로 관찰되었다. FISH 핵형분석 결과, 45S rDNA는 4개의 signal이 7번 염색체 단완의 말단부위에서 관찰되었다. 염색체의 길이 관찰 결과, '알렉산드라'는 $1.67-2.67{\mu}m$, '프로이트'는 $1.40-2.04{\mu}m$, '리틀실버'는 $1.64-2.24{\mu}m$, '테레사'는 $1.69-2.26{\mu}m$, '티네케'는 $1.70-2.65{\mu}m$, '비탈'은 $1.35-2.08{\mu}m$, '옐로우미미'는 $1.39-2.04{\mu}m$로 관찰되었다. 염색체 전체 길이의 합은 프로이트 품종이 $11.23{\mu}m$ 로 가장 작았으며 알렉산드라 품종이 $15.05{\mu}m$로 가장 크게 관찰되었다. 염색체의 조성은 중부동원체형, 차중부동원체형, 차단부동원체형으로 구성되었으나 차단부염색체는 관찰되지 않았다.