Visarada, K.B.R.S.;Saikishore, N.;Kuriakose, S.V.;Rani, V. Shobha;Royer, M.;Rao, S.V.;Seetharama, N.
Plant Biotechnology Reports
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v.2
no.1
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pp.47-58
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2008
To select agronomically useful transgenic plants, a large number of transgenic events are initially produced, gene transfer confirmed, and advanced to obtain homozygous lines for testing in field trials. Direct in planta assays for identifying the transgene carriers in the segregating progeny are based on the activity of selectable marker gene and are easy, simple and inexpensive. For this purpose, expression of bar gene as measured by tolerance to damage by glufosinate ammonium, the active ingredient in the herbicide BASTA, was investigated. Dose damage curves were generated by leaf paint tests with BASTA on four genotypes of sorghum. Transgenic plants were characterized in terms of sensitivity to the concentration of glufosinate ammonium. In transgenics, symptoms of BASTA swab tests at different growth stages and PCR analysis for cry1B were carried out and correlated. Germination tests could not be employed for large scale evaluation of transgenic progeny because of mortality of tolerant seedlings after transplantation to soil. Based on the above findings, a simple, inexpensive, time-saving, two-step scheme for effective evaluation of transgenics and their progeny containing bar gene as selection marker using BASTA swab tests is described.
An Efficient in vitro regeneration system and an optimized Agrobacterium mediated transformation protocol are described, based on the use of young seedling cotyledons of Capsicum annuum L. Optimal regeneration efficiency can be obtained by cultivating cotyledon explants on media containing 4 mg/L benzyladenine and 0.1 mg/L indolacetic acid. The effect of antibiotics used to eliminate Agrobacteria, as well as the toxic level of some generally used selection agents (kanamycin, geneticin, hygromycin, phosphinotricin and methotrexate) in regenerating pepper tissues were determined. To enable the comparison of different selection markers in identical vector background, a set of binary vectors containing the marker genes for NPTII, HPT, DHFR and BAR respectively, as well as the CaMV 35S promoter/enhancer-GUS chimaeric gene was constructed and introduced into four different Agrobacterium host strains.
This paper presents several techniques of power spectrum estimation for high impedance fault detection. High impedance faults are those faults with current too low to be reliably cleared by conventional overcurrent protection. So power spectrum estimation is required. AR and MA techniques require optimal order for good performance of power spectrum estimation because these techniques are unstable for order selection. ARMA and Extended techniches are stable for order selection and have very sharp response. So ARMA and Extended Prony techniques are suitable for our purpose.
Plasmodium vivax merozoite surface protein-1 (PvMSP1) gene codes for a major malaria vaccine candidate antigen. However, its polymorphic nature represents an obstacle to the design of a protective vaccine. In this study, we analyzed the genetic polymorphism and natural selection of the C-terminal 42 kDa fragment within PvMSP1 gene ($PvMSP1_{42}$) from 77 P. vivax isolates, collected from imported cases of China-Myanmar border (CMB) areas in Yunnan province and the inland cases from Anhui, Yunnan, and Zhejiang province in China during 2009-2012. Totally, 41 haplotypes were identified and 30 of them were new haplotypes. The differences between the rates of non-synonymous and synonymous mutations suggest that $PvMSP1_{42}$ has evolved under natural selection, and a high selective pressure preferentially acted on regions identified of $PvMSP1_{33}$. Our results also demonstrated that $PvMSP1_{42}$ of P. vivax isolates collected on China-Myanmar border areas display higher genetic polymorphisms than those collected from inland of China. Such results have significant implications for understanding the dynamic of the P. vivax population and may be useful information towards China malaria elimination campaign strategies.
Marker-assisted gene pyramiding aims to produce individuals with superior economic traits according to the optimal breeding scheme which involves selecting a series of favorite target alleles after cross of base populations and pyramiding them into a single genotype. Inspired by the science of evolutionary computation, we used the metaphor of hill-climbing to model the dynamic behavior of gene pyramiding. In consideration of the traditional cross program of animals along with the features of animal segregating populations, four types of cross programs and two types of selection strategies for gene pyramiding are performed from a practical perspective. Two population cross for pyramiding two genes (denoted II), three population cascading cross for pyramiding three genes(denoted III), four population symmetry (denoted IIII-S) and cascading cross for pyramiding four genes (denoted IIII-C), and various schemes (denoted cross program-A-E) are designed for each cross program given different levels of initial favorite allele frequencies, base population sizes and trait heritabilities. The process of gene pyramiding breeding for various schemes are simulated and compared based on the population hamming distance, average superior genotype frequencies and average phenotypic values. By simulation, the results show that the larger base population size and the higher the initial favorite allele frequency the higher the efficiency of gene pyramiding. Parents cross order is shown to be the most important factor in a cascading cross, but has no significant influence on the symmetric cross. The results also show that genotypic selection strategy is superior to phenotypic selection in accelerating gene pyramiding. Moreover, the method and corresponding software was used to compare different cross schemes and selection strategies.
Park, Ji-Sun;Moon, Ki-Beom;Ha, Jang-Ho;Jang, Ji-Young;Kim, Mi-Jin;Jeon, Jae-Heung;Park, Sang-Un;Kim, Hyun-Soon
Korean Journal of Breeding Science
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v.49
no.3
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pp.170-179
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2017
Plant molecular farming has attracted a lot of attention lately in the field of mass production of industrially valuable materials by extending application of the plant as a kind of factory concept. Among them, protein expression system using rice(Oryza sativa L.) callus is a technology capable of mass culture and industrialization because of a high expression rate of a target protein. This study was carried out to develop an Agrobacterium-mediated transformation system to increase the utilization of rice callus. The transformation efficiency was improved by using the hand when seeds were de-husked for callus induction. Furthermore, we were possible induction of callus from 6 years old seed smoothly. Selection of the callus contained the target gene was required a cultivation period of at least 3 weeks, and the most efficient selection period was after 6 weeks of culture including one passage. This selection was confirmed that the gene was stably inserted into the genomic DNA of the plant cell by the southern blot analysis and progeny test. Such an efficient selection system of rice callus that can be cultured in the long term will be contribute to the industrialization of useful recombinant proteins using rice.
Lung volume reduction surgery(LVRS) has recently been advocated as an alternative or a bridge to lung transplantation for patients with evere dibbling emphysema. This procedure is a palliative treatment performed to alleviate the dyspnea of patients with emphysema and improve performance in the activities of daily living. The rationale of lung volume reduction for generalized emphysema is that the removing of the diseased and functionless lung may improve the function of remaining, less diseased lung. The factors critical to the success of LVRS are careful patient selection, accurate localization of target areas, meticulous anesthetic and operative technique, and intensive postoperative support. We have experienced a case of severe emphysema in a 59-year-old male patient. After selection process and pulmonary rehabilitation, the patient was treated with video-assisted thoracoscopic LVRS and the post-operative course was uneventful.
Journal of The Korean Association of Information Education
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v.22
no.3
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pp.367-374
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2018
In order to cultivate the human resources needed in the 4th industrial revolution era, it is necessary to select the gifted students and educate them systematically. Although excellent gifted students are important in a specific field, more convergent talents in the fields of mathematics, science, and information are required. The purpose of this study is to investigate how evaluation factors reflecting the characteristics of information gifted students affect the selection of science gifted students of a university gifted education center. In the characteristics of information gifted students, the cognitive factors such as Rule creation ability, Reasoning ability, Efficiency ability, Generalization ability, Structuring ability and Abstraction ability were highly correlated in selecting the science gifted students. Correlations in the applicants group of students for science gifted education center are higher than those in the first passers group and higher than those in the final successful candidates group. This means that the factors that shows the characteristics of the information gifted have a great influence on the selection of the science gifted.
Journal of Information Technology Applications and Management
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v.18
no.4
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pp.81-93
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2011
By using GOSST theory, this paper models SSCFLP taking FLP, capacity of the facilities, single source capacitated limitation level and service enhancement issues into consideration. GOSST theory is strongly suggested as the solution procedure for these issues. We have used clustering of Center of Gravity method using the case study of the company S and then, took a heuristic GOSST measure in the alternative selection process. As a result, the research finds an alternative solution that both meets the satisfactory level of service and achieves consistent distribution capacity. When using this modeling, especially, to select the location of the logistics distribution center, the efficiency of current facilities is maximized while offering the minimum geometric distance for the alternative. Also, we can expect that the illustrated model and alternative solution can be applied to architecture of distribution system, to selection of telecommunication system locations for wireless network and to relocation of related facilities due to their sensitivities to location and weight.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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