• 제목/요약/키워드: basic template

검색결과 94건 처리시간 0.029초

Three-Dimensional Structure Prediction of Follicle-Stimulating Hormone Receptor Transmembrane Domain by Homology Modelling

  • Priya dharshini B
    • 통합자연과학논문집
    • /
    • 제16권1호
    • /
    • pp.33-38
    • /
    • 2023
  • The follicle stimulating hormone receptor (FSHR) is a glycoprotein hormone, that belongs to the GPCR superfamily. FSHR plays a major role in reproduction. The aberrant activation of FHS receptor leads to infertility and several reproductive disorders. The recently recognized roles of the FSHR in diverse extragonadal tissues is also closely related to Alzheimer's disease and cancers. Analysing the structural characteristics of the receptor is important in understanding the pathophysiology of diseases associated with the receptor. In this present study, homology modelling of FSHR-TM domain was developed using four different templates. Totally 20 models were developed using single template-based approach and selected three based on the validation of RC plot, RMSD, ProSA, QMEAN and ERRAT values. The developed models would be useful for further research on the structural characteristics and binding characteristics of the FSHR-TM domain.

P2X Receptor 3D Structure Prediction Using Homology Modelling

  • Sruthy Sathish;Thirumurthy Madhavan
    • 통합자연과학논문집
    • /
    • 제16권1호
    • /
    • pp.39-45
    • /
    • 2023
  • P2X receptors are ATP-activated ion channels in the plasma membrane. P2X receptors have a role in a diverse range of disorders, making them a valuable therapeutic target. Hence, the present investigation employed homology modelling of the P2X receptor based on the crystal structure of 5SVJ, 6AH4, 5YVE and 5SVL. Twenty models, using both single- and multiple template-based methods, were developed, and the best model was chosen based on the validation result. We observed that a strategy based on multiple templates provided greater accuracy. Future studies involving binding site and docking analysis can make use of the produced structures.

Structure Prediction of Gasdermin a Receptor by Homology Modelling

  • Subathra Selvam
    • 통합자연과학논문집
    • /
    • 제16권3호
    • /
    • pp.97-102
    • /
    • 2023
  • The gasdermins are a family of recently identified pore-forming effector proteins that cause membrane permeabilization and pyroptosis, a lytic pro-inflammatory type of cell death. A role in the regulation of cell proliferation and/or differentiation is suggested by the differentiation status-specific expression of gasdermin proteins in epithelial tissues. One of the GSDM protein is Gasdermin A (GSDMA), which decreased in stomach and esophageal cancers, suggesting a tumor suppressor role. GSDMA receptor antagonists have been researched as potential treatments for inflammatory diseases and baldness. GSDMA's significance in a wide range of disorders makes it an important therapeutic target. As a result, homology modelling of the GSDMA receptor was undertaken in the current study using the crystal structures of Mus musculus (GSDMA3), Human gasdermin D (GSDMD), and Murine gasdermin D (murine GSDMD). The best model was chosen based on the validation results after 20 models were developed utilising single template-based approaches. The generated structures can be used for further binding site and docking studies in the future.

허혈성 뇌졸중을 위한 뇌 자기공명영상의 의미적 특징 기반 템플릿 중심 의료 영상 매핑 기법 (Brain MRI Template-Driven Medical Images Mapping Method Based on Semantic Features for Ischemic Stroke)

  • 박예슬;이미연;이정원
    • 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
    • /
    • 제5권2호
    • /
    • pp.69-78
    • /
    • 2016
  • 허혈성 뇌졸중은 뇌혈관의 혈전이나 색전에 의해 뇌 혈류가 감소하게 되어 뇌 조직이 기능을 못하는 질환으로, 질환의 특성상 뇌혈관의 폐색 여부를 확인하는 것이 중요하기 때문에 질환의 진단에 있어서 의료 영상이 필수적으로 활용된다. 그 중에서도 뇌 자기공명영상은 뇌의 구조적인 정보들을 얻을 수 있어 질환을 진단하는데 그 지표로 널리 활용되고 있다. 하지만 허혈성 뇌졸중과 같은 응급 질환의 경우 빠른 진단과 처치에 도움이 될 수 있는 지능적인 시스템이 요구됨에 비해, 기존의 의료 영상 저장 시스템으로는 신속하고 직관적인 영상 정보 제공이 어렵다. 즉, 기존의 시스템은 피상적인 메타 데이터를 이용하여 의료 영상을 관리하고 있어 의료 영상에 내재된 주요 의미적 정보를 고려하지 못하고 있다. 따라서 본 논문에서는 뇌 자기공명영상이 내포하고 있는 주요 의미적인 정보인 뇌의 해부학적 구조와 같은 영상 정보를 제공할 수 있도록 하는 템플릿 중심의 영상 매핑 기법을 제안하고자 한다. 제안하는 기법은 방대한 양의 영상을 대표할 수 있는 대표 영상(템플릿)을 선정하여 의미적 특징과 대표 영상(템플릿) 사이의 대응성을 정립하고, 전문가(의사)에 의해서만 분석될 수 있는 영상 사이의 의미적 연관성을 표면화 시켜 의미 기반의 영상 관리를 가능케 한다.

cDNA Cloning, Sequence Analysis and Molecular Modeling of a New Peptide from the Scorpion Buthotus saulcyi Venom

  • Nikkhah, Maryam;Naderi-Manesh, Hossein;Taghdir, Majid;Talebzadeh, Mehdi;Sadeghi-Zadeh, Majid;Schaller, Janatan;Sarbolouki, Mohamad N.
    • BMB Reports
    • /
    • 제39권3호
    • /
    • pp.284-291
    • /
    • 2006
  • In this study, the cDNA of a new peptide from the venom of the scorpion, Buthotus saulcyi, was cloned and sequenced. It codes for a 64 residues peptide (Bsaul1) which shares high sequence similarity with depressant insect toxins of scorpions. The differences between them mainly appear in the loop1 which connects the $\beta$-strand1 to the $\alpha$-helix and seems to be functionally important in long chain scorpion neurotoxins. This loop is three amino acids longer in Bsaul1 compared to other depressant toxins. A comparative amino acid sequence analysis done on Bsaul1 and some of $\alpha$-, $\beta$-, excitatory and depressant toxins of scorpions showed that Bsaul1 contains all the residues which are highly conserved among long chain scorpion neurotoxins. Structural model of Bsaul1 was generated using Ts1 (a $\beta$-toxin that competes with the depressant insect toxins for binding to $Na^+$ channels) as template. According to the molecular model of Bsaul1, the folding of the polypeptide chain is being composed of an anti-parallel three-stranded $\beta$-sheet and a stretch of $\alpha$-helix, tightly bound by a set of four disulfide bridges. A striking similarity in the spatial arrangement of some critical residues was shown by superposition of the backbone conformation of Bsaul1 and Ts1.

국가 브랜드 사업으로서 템플스테이 고부가가치 전략을 위한 문화상품 디자인콘텐츠 개발 - 불전사물 중 운판을 중심으로 - (Development of the Cultural Product Design Contents for High Value Added Strategy of Temple Stay as National Brand Project - Based on cloud-shaped gong among the Bulgeonsamul -)

  • 김선영
    • 복식
    • /
    • 제63권4호
    • /
    • pp.30-43
    • /
    • 2013
  • This study provides suggestions of cultural product design contents by using the cloud-shaped gong in traditional temple culture in order to find a high value-added approach. The research herein is part of cultural design contents projects embedded with the spiritual value and symbolic connotation of temple culture. This would be meaningful to enhance its degree of utilization. This can also be a way to find a strategic alternative to a high value addition of temple stay and dissemination of temple culture. For the research methodology, literature was reviewed over temple stay and Bulgeonsamul. For motive design and development of cultural product design, both Adobe Illustrator CS3 and Adobe Photoshop CS3 were used as computer design program. The template image of cloud-shaped gong for basic motive design was selected from those available at the domestic temples for accurate depiction of its head and body. Finally, samples were adopted from those temples of Gounsa, Songgwangsa, Guinsa, Hwaeomsa, and Naesosa. For each motive, different colors were applied and ten basic motives were practiced in total. By repeating the process for these motives, three types of textile design were prepared. T-shirt designs used a round neckline as basic form, and it was designed for sleeved and sleeveless styles. Apron designs stressed V-neckline and two types were processed: one for the back seam line and the other for side seam line. Pendants were designed with modern and luxurious image so that so that it could be used in various types of accessories. Designs for the bedding applied pattern design of the motives and this was done in a way that gave the images a sense of stability and splendor.

색의대비 기반 템플릿을 이용한 색상 변환 (Color Transfer using Color Contrast Based Templates)

  • 박영섭;윤경현;이은석
    • 한국멀티미디어학회논문지
    • /
    • 제12권5호
    • /
    • pp.633-643
    • /
    • 2009
  • 본 논문에서는 다양한 색상을 가지는 입력 영상의 화질올 잘 유지하면서, 객체들 간 시각적인 차이를 뚜렷하게 표현하기 위해 색의대비 기반 템플릿을 이용하는 색상 변환 알고리즘을 제안한다. 이 방법은 CIE $L^{\ast}a^{\ast}b^{\ast}$색상 공간 중 유채색의 $a^{\ast}b^{\ast}$평면상에 분포된 입력 영상파 템플릿의 색상 데이터를 이용한다. 템플릿은 색상간의 대비효과를 고려하여 만들어지며, 사용자가 임의로 지정한 가준 색상들을 기반한 그라데이션 영상의 색상 분포를 표시하는 칙선 또는 곡선의 형태를 가진다. 또한, 만들어진 템플릿을 스플라인 곡선으로 모델링하고, 모텔링된 곡선의 제어점을 변형함으로써 간단하게 다른 기준 색상을 가지는, 새로운 탱플릿을 만들 수도 있다. 탬플릿을 이용한 색상 변환은 회귀분석과 칼라 매칭을 통해 이루어지며, 입력 영상의 색상분포를 템플릿의 색상 분포와 유사하게 변형함으로써 입력 영상의 색상 일관성올 유지하였다.

  • PDF

원격 제어 기능을 포함한 교육용 모바일 로봇 시스템의 설계 및 구현 (A Design and Implementation of Educational Mobile Robot System including Remote Control Function)

  • 정중수;정광욱
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
    • /
    • 제20권4호
    • /
    • pp.33-40
    • /
    • 2015
  • 본 논문에서는 원격 제어 기능을 갖는 교육용 로봇 시스템을 임베디드 환경에서 설계 및 구현하였다. 로봇 시스템의 기반이 되는 센싱 정보 처리와 소프트웨어 설계, 및 프로그래밍 실습 교육을 위한 템프릿 설계 기법을 제시하였다. 시스템의 개발 환경으로 CPU는 Cortex-M3 코어를 사용한 LPC1769 프로세서, 디버깅 환경은 LPCXPRESSO, 펌웨어 개발 언어는 C언어를, OS는 FreeRTOS를 사용하였다. 시스템 동작 과정은 무선 RF 통신을 이용하여 서버의 제어 명령을 수신하여, 교육용 로봇의 다양한 센서를 구동시킨다. 교육 과정으로는 로봇의 기본 동작 프로그램을 제공하여 실습생으로 하여금 컴파일 및 로딩이후 데모 동작을 우선 실행하도록 하였다. 이후 이의 데모 기능의 프로그래밍 기술을 교육하기 위해 단계별로 교육하도록 하였다. 로봇 동작과정에 대한 실습과 그에 대한 프로그래밍 기법이다. 또한 서버와 로봇간 통신 기법은 RF 통신환경에서 독자적인 프로토콜이 설계되었고, 로봇 센싱 데이터 처리과정을 분석하여 만족할 만한 성능 처리 결과를 제시하였다.

Fabrication Thermal Responsive Tunable ZnO-stimuli Responsive Polymer Hybrid Nanostructure

  • Lee, Jin-Su;Nam, Sang-Hun;Yu, Jung-Hun;Hwang, Ki-Hwan;Ju, Dong-Woo;Jeon, So-Hyoun;Seo, Hyeon-Jin;Yun, Sang-Ho;Boo, Jin-Hyo
    • 한국진공학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국진공학회 2014년도 제46회 동계 정기학술대회 초록집
    • /
    • pp.429.2-429.2
    • /
    • 2014
  • ZnO nanowire is known as synthesizable and good mechanical properties. And, stimuli-responsive polymer is widely used in the application of tunable sensing device. So, we combined these characteristics to make precise tunable sensing devise. In this work, we investigate the dependence of ZnO nanowire alignment and morphology on si substrate using nanosphere template with various conditions via hydrothermal process. Also, pH-temperature dependant tuning ability of nanostructure was studied. The brief experimental scheme is as follow. First, Zno seed layer was coated on a si wafer ($20{\times}20mm$) by spin coater. And then $1.15{\mu}m$ sized close-packed PS nanospheres were formed on a cleaned si substrate by using gas-liquid-solid interfacial self-assembly method. After that, zinc oxide nanowires were synthesized using hydrothermal method. Before the wire growth, to specify the growth site, heat treatment was performed. Finally, NIPAM(N-Isopropylacrylamide) was coated onto as-fabricated nanostructure and irradiated by UV light to form the PNIPAM network. The morphology, structures and optical properties are investigated by FE-SEM(Field Emission Scanning electron Microscopy), XRD(X-ray diffraction), OM(Optical microscopy), and WCA(water contact angle).

  • PDF

함정탑재 유도무기에 대한 OMS/MP 템플릿 개발 (A Development of OMS/MP Templete of Guided Weapons on Board Ship)

  • 권용수;이경행
    • 한국국방경영분석학회지
    • /
    • 제33권2호
    • /
    • pp.17-29
    • /
    • 2007
  • 함정탑재 유도무기 획득시 RAM분석의 목표 값 제공과 ROC 분석의 기초자료로 제공되는 OMS/MP는 소요군에서 작성토록 되어 있으나, 함정의 특수한 환경에 따른 정량화 된 데이터획득 및 관련 작성지침이 정립되지 않아 개발자중심의 제품개발 및 신뢰성 있는 무기체계 획득이 미흡한 실정이다. OMS/MP는 미래 전장 환경과 새로운 교리에 부합된 신 무기체계의 개발에 있어서 전 평시 어떻게 운용될 것인가를 전투개발자 측면에서 체계적이고 정량적으로 기술한 수락시험의 기준이 되는 가장 핵심이 되는 부분이다. 본 연구는 무기체계 개발시 군의 적정 요구성능과 연구개발자에게 최적의 무기체계 설계개념을 제공하는 정량화된 OMS/MP 개발 및 RAM 목표 값 산출 프로세스를 제시하였으며, 이를 기반으로 한 함정탑재 유도무기에 대한 OMS/MP 작성 템플릿을 개발했다.