• 한국작물학회지
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• 제48권4호
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• pp.345-350
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• 2003

A series of aqueous extracts and residues from leaves, stems, roots, pods and seeds of Korean black soybean (Glycine max (L.) Merr.) were assayed against alfalfa (Medicago sativa) and barnyard grass (Echinochloa crus-galli) to determine their allelopathic activities through petri-dish and greenhouse experiments, and the results showed highest inhibition in the extracts or residues from the seeds, and followed by pods. The extracts of 40g dry tissue $\textrm{L}^{-1}$ applied on filter paper in petri-dish bioassay significantly inhibited root growth of alfalfa, and especially extracts from seeds and pods reduced root length of alfalfa more than those from leaves, stems, or roots. Plant height, root length, shoot and root dry weights of barnyard grass were reduced significantly by residue incorporation of seeds and pods as the incorporated amount increased. These results suggest that black soybean plants had herbicidal potential, and their activities were exhibited differently depending on plant parts.

• Plant Resources
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• 제8권2호
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• pp.116-121
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• 2005

Compositae plants are known to contain biologically active substances that are allelopathic to agricultural crops as well as weed species. Aqueous or methanol extracts and plant residues from leaves of Xanthium occidentale were assayed against alfalfa (Medicago sativa) to determine its allelopathic effects, and the results showed that the extracts applied onto filter paper significantly inhibited seed germination as well as root growth of alfalfa. Aqueous leaf extracts of $40g\;L^{-1}$ were completely inhibitory on root growth of alfalfa, while root growths of barley (Hordeum vulgare L.) and soybean (Glycine max L.) were less sensitive. Leaf residue incorporation at $100g\;kg^{-1}$ into soil on seedling growth of barnyard grass (Echinochloa crus-galli Beauv. var. oryzicola Ohwi) inhibited both shoot and root fresh weights of barnyard grass by 94 and $96\%$, respectively. Methanol extracts from BuOn and EtOAc fractions of X. occidentale reduced alfalfa root growth more than did those from hexane and water fractions. The results based on bioassay of extracts and residues show that X. occidentale had potent an allelopathic activity against other plant species.

• 농약과학회지
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• 제12권1호
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• pp.9-17
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• 2008

일련의 새로운 cyclohexanone 유도체(5-benzofuryl-2-[1-(alkoxyimino)alkyl]-3-hy-droxycyclohex-2-en-1-ones)와 벼(Oryza sativa L.) 및 돌피(Echinochloa crus-galli)에 대한 제초활성과의 정량적인 구조-활성관계(QSARs)를 2D-QSAR 및 HQSAR 방법으로 검토하였다. 일반적으로 HQSAR 모델이 2D-QSAR 모델보다 예측성과 적합성이 좋았다. 2D-QSAR II 모델로부터 돌피의 제초활성은 분자의 Balaban 지수(BI)와 $R_1$ 및 $R_3$-기의 소수성에 의존적이었다. 또한, HQSAR IV 모델에 따라 $R_3=ethyl$ 기가 벼의 제초활성에 기여하는 반면에 5-(cyclohex-3-enyl)-2,3-dihydrobenzofuran 고리 부분은 두 초종의 제초활성에 기여하지 않았다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제31권6호
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• pp.1469-1473
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• 2010

Influences of alrylamino (R) substituents on the herbicidal activity ($pI_{50}$) of 1-(4-chloro-2-fluoro-5-propargyloxypheny)-3-(R)-thiourea analogues (1 ~ 35) against the barnyard grass (Echinochloa crusgalli) in the pre-emergence step were discussed quantitatively using comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) as the three dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) method. The statistically most satisfactory CoMFA models for the herbicidal activity against the barnyard grass had the better predictability ($r^2{_{cv.}}$) and correlativity ($r^2{_{ncv.}}$) than those of CoMSIA models. The optimized CoMFA model 1($r^2{_{cv.}}$ = 0.531 & $r^2{_{ncv.}}$ = 0.931) with the sensitivity to the perturbation (${d_q}^{2'}{dr^2}_{yy'}$ = 1.081) and the prediction ($q^2$ = 0.475) produced by a progressive scrambling analyses were not dependent on chance correlation. And statistical qualities with the atom based fit alignment (AF) were slightly higher than those of the field fit alignment (FF). According to the optimized CoMFA model 1, the contribution ratio (%) of the steric field (76.9%) on the herbicidal activity of the Thioureas was three-fold higher than that of the electrostatic field (20.1%) and the hydrophobic field (3.0%) had the least influence. A steric favor group is on the vicinity of the nitrogen atom in alrylamino (R) substituent, and a steric disfavor group is on the outer side of alrylamino (R) substituent. Thus, as the size of alrylamino (R) substituent increases, so does the herbicidal activity of the substituent.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2020년도 춘계학술대회
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• pp.45-45
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• 2020

A large number of expressed sequence tags (ESTs) in public databases have provided an opportunity for the systematic development of simple sequence repeat (SSR) markers. EST-SSRs derived from conserved coding sequences show considerable cross-species transferability in related species. In the present study, we assessed the utility of foxtail millet EST-SSRs in barnyard millet. A total of 312 EST-SSRs of foxtail millet were tested using 84 Echinochloa crus-galli germplasm accessions; a high rate of transferability (62%) and 46 primer sets (13%) were shown the polymorphism in barnyard millet. The 13% of functional EST-SSRs) was demonstrated between cereals and barnyard millet. SSR marker profile data were scored for the computation of pairwise distances as well as a Neighbor Joining (NJ) tree of all the genotypes. The averaged values of gene diversity (H_E) and polymorphism information content (PIC) were 0.213 and 0.179 within populations, respectively. The 84 barnyard millet germplasm accessions were divided into five different groups, which agreed well with their geographical origins. The exotic 12 accessions of India type barnyard millet (E. frumentacea) were all separated form Korean local collection genotype. The present results provide evidence of divergence between cultured and wild type barnyard, as a millet and grass. The polymorphic SSR markers indicated in this study were of great value in analysis of genetic diversity that can be further used for crop improvement through breeding.

• 농약과학회지
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• 제4권2호
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• pp.21-28
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• 2000

2-(4-(6-chloro-2-benzoxazolyloxy)phenoxy)-N-phenylpropionamide 유도체들의 선택적 제초활성에 관한 연구(성 등, 1999)에 근거하여 수답에서 발아 전(pre-emergence), 벼 (Oryza sativa L.)와 피 (Echinochloa crus-galli)에 대한 제초활성에 미치는 구조-활성과의 관계 (SAR)를 Free-Wilson 방법과 Hansch 방법을 이용하여 정량적으로 검토하였다. SAR 분석결과, 피에 대한 제초활성은 N-phenyl 고리상 meta-치환된 1 치환체와 ortho, para-치환된 2 치환체로서 소수성의 적정값, $({\pi})_{opt.}=1.34$을 가지는 전자 밀게에 의한 장 (F<0) 효과가 영향을 미치는 요소이었다. 벼에 대한 약해를 감소시키는 조건으로는 피의 경우와 같이 meta와 ortho, para-치환된 1- 및 2-치환체인 전자 밀게로서 적정값 $({\pi})_{opt.}=0.91$을 벗어나는 소수성 값을 가져야 한다는 조건이 벼와 피 사이의 선택성에 기여하는 물리-화학적인 요인이었다. 또한, 피의 제초활성은 건답의 경우와 비슷하였으나 벼에 대한 약해는 수답에서 매우 크게 나타남으로써 선택성을 관찰할 수가 없었다. 가수분해는 2-(4-(6-chloro-2-benzoxazolyloxy)phenoxy)propionic acid, (A) (obs. pKa=4.35 및 obs. logP=4.77)와 6-chloro-2- benzoxazol-one (B) obs. pKa=8.40 및 obs. logP=2.90)등을 생성하는 일련의 과정으로 진행되었으며 제초활성은 피보다 벼가 가수분해 생성물인 (A)를 비교적 잘 흡수하기 때문으로 짐작되었다. 그리고 SAR식에 따라 온실내에서 피에 대하여 가장 큰 활성을 나타내는 화합물은 2,6-dimethyl-4-methoxymethyl 치환체 ($pI_{50}=5.41$, 3g/ha)로 예상되었다.

• 농약과학회지
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• 제12권2호
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• pp.103-110
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• 2008

제3 세대 cyclic imide(CyI)계 제초성 화합물을 탐색하기 위하여 새로운 1-(4-chloro-2-fluoro-5-propargyloxyphenyl)-3-thiourea 유도체(1-40)들을 합성하고 발아전(pre-emergence) 단계에서 벼(Orysa Sativa)와 논피(Echinochlor crus-galli)에 대한 제초활성($pI_{50}$)을 측정한 다음에 초종별 및 부위별 사이의 제초활성에 관련한 상관성을 검토하였다. Alkyl 보다는 aryl 유도체의 합성 수율(%)이 전반적으로 높았으며 특히, alkyl-유도체의 경우, alkyl amine의 구조적인 형태에 따라 합성수율에 큰 차이를 보였다. 두 초종 및 초종부위 사이의 제초활성에 관한 상관성을 검토한 결과, 논피에 대하여 가장 큰 제초활성을 나타내는 경우는 논피뿌리-논피줄기 사이의 상관성에서 화합물 8 및 24 이었고 논피에 대하여 선택성을 나타내는 화합물은 11 및 6이었다.

• 농약과학회지
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• 제4권3호
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• pp.34-39
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• 2000

15종의 새로운 5-benzofuryl-2-[1-(alkoxyimino)alkyl]-3-hydroxycyclohex-2-en-1-one 유도체 중, 2,3-dihydro-2-ethyl-2,4,6,7-tetramethylbenzofuran-5-yl 치환체들을 합성하고 벼 (Oryza sativa L.) 씨앗과 3엽기 그리고 발아 후, 물피 (Echinochloa crus-galli)에 대한 제초활성을 측정한 바, 전체적으로 $R_{1}$=ethyl 치환체, $1{\sim}8$이 비교적 큰 제초활성을 나타내었다. Azomethine 결합의 N 원자상 alkoxy-치환체 ($OR_{2}$)가 변화함에 따른 구조와 제초활성과의 관계 (SAR)를 정량적으로 검토하였다. 그 결과, 벼는 입체효과에 그리고 물피는 소수성에 의존적이었다. 두 초종간 선택성의 조건은 적정값의 소수성, $(logP)_{opt.}=6.0$을 가지며 분자의 길이 (L)에 관여하는 $R_{2}$의 길이는 길고 폭 (B)에 관여하는 $R_{1}$은 작아야 할 것으로 설명되었다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제49권3호
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• pp.238-242
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• 2006

기질 분자로서 새로운 5-benzofuryl-2-[1-(alkoxyimino)alkyl]-3-hydroxycyclohex-2-en-1-one 유도체들의 치환기 변화$(R_1-R_4)$에 따른 발아 전, 벼(Oryza sativa L.) 및 논피(Echinochloa crus-galli)에 대한 제초활성을 비교 분자장 분석(CoMFA) 방법으로 연구하였다. 최적화 된 CoMFA 모델(벼: A5 및 논피: B3)은 atom based fit 정렬과 CoMFA장들의 조합 조건에서 유도되었으며 두 초종에 대한 두 모델들의 예측성과 적합성($q^2>0.6$ 및 ${r^2}_{ncv.}>0.94$)은 매우 양호하였다. HINT-CoMFA 등고도로부터 두 초종에 대한 선택성은 $R_2$와 $R_3$-치환기의 입체장과 소수성에 의존적이었다. 그러므로 입체적으로 작은 소수성 치환기의 도입으로 논피에 대한 제초활성을 개선할수 있을 것으로 예상되었다.

• 농약과학회지
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• 제3권3호
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• pp.11-19
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• 1999

Fenoxaprop-ethyl계 화합물의 amide 형태로 합성된 기질로써 일련의 2-(4-(6-chloro-2-benzoxazolyloxy)phenoxy)-N-phenylpropionamide 유도체들은 건답에서 발아 후 (post), 벼와 피 (Echinochloa crus-galli)에 대하여 Fenoxaprop-ethyl 보다 비교적 양호한 선택성을 나타내었으며 N-phenyl 치환체들의 선택성에 관한 구조-활성과의 관계 (SAR)를 Free-Wilson 방법과 Hansch 방법을 이용하여 정량적으로 검토하였다. 피의 제초활성에는 N-phenyl 고리상 meta-치환된 1 치환체들과 ortho, meta, para-치환된 3 치환체로서 methyl 및 methoxy 등의 치환체들이 비교적 높게 기여하였다. 또한 적정값 ($({\pi})_{opt.}=1.60$)의 소수성을 갖는 전자 밀게 (${\sigma}<0$)들의 공명효과 (R<0)가 제초활성을 개선하는데 영향을 미치고 있음을 알았다. 벼의 경우에는 para-치환된 1-치환체나 ortho, para-치환된 2-치환체로써 Taft의 입체효과 (Es)에 대한 적정값 ($(ES)_{opt.}=0.87$)을 벗어나는 전자 밀게에 의한 공명효과 (R<0)가 약해를 줄이기 위한 조건이었으며 벼와 피 사이의 선택성에 기여하는 물리-화학적인 요인이었다. 그리고 SAR식에 따라 온실 내에서 피에 대하여 가장 큰 활성을 나타내는 화합물은 2-ethoxy-3-methoxy-4-dimethylamino 치환체 ($pI_{50}$=6.60, 1g/ha)로 예상되었다.