• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제13권11호
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• pp.5563-5568
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• 2012

Based on our previous report on gastric cancer which documented ATP4A and ATP4B mRNA down-regulation in gastric tumors relative to normal gastric tissues, we hypothesized that epigenetic mechanisms could be responsible. ATP4A and ATP4B mRNA expression in gastric cancer cell lines AGS, SNU638 and NUGC-3 was examined using reverse transcriptase PCR (RT-PCR). AGS cells were treated with TSA or 5'-AzaDC and methylation specific PCR (MSP) and bisulfite sequencing PCR (BSP) analysis were performed. MSP analysis was on DNA from paraffin embedded tissues sections and plasma. Expression analysis revealed downregulation of ATP4A and ATP4B genes in gastric cancer cell lines relative to normal gastric tissue, while treatment with 5'-AzaDC re-activated expression of both. Search for CpG islands in their putative promoter regions did not indicate CpG islands (CGI) but only further downstream in the bodies of the genes. Methylation specific PCR (MSP) in the exon1 of the ATP4B gene and exon7 in ATP4A indicated methylation in all the gastric cancer cell lines tested. MSP analysis in tumor tissue samples revealed methylation in the majority of tumor samples, 15/19, for ATP4B and 8/8 for ATP4A. There was concordance between ATP4B and ATP4A down-regulation and methylation status in the tumour samples tested. ATP4B methylation was detectable in cell free DNA from gastric cancer patient's plasma samples. Thus ATP4A and ATP4B down-regulation involves DNA methylation and methylated ATP4B DNA in plasma is a potential biomarker for gastric cancer.

• BMB Reports
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• 제41권12호
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• pp.840-845
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• 2008

Nucleophosmin/B23, a major nucleolar phosphoprotein, is overexpressed in actively proliferating cells. In this study, we demonstrate that B23 exclusively localizes in the nucleolus, whereas ATP depletion results in the redistribution of B23 throughout the whole nucleus and destabilizes B23 via caspase-3 mediated cleavage. Interestingly, ATP binding precedes PI(3,4,5)P3 binding at lysine 263 and ATP binding mutants fail to restore the anti-apoptotic functions of B23 in PC12 cells. Thus, the ATP-B23 interaction is required for the stability of the B23 protein and regulates cell survival, confining B23 within the nucleolus in PC12 cells.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제8권1호
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• pp.53-57
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• 2011

목 적: 윌슨병은 간조직에 구리의 과도한 침착으로 발병하는 상염색체 열성 유전질환이다. 지금까지 ATP7B 유전자가 유일한 원인유전자로 알려져 왔다. 그러나, 약 15%의 환자에서는 ATP7B 유전자 돌연변이가 발견되지 않는다. 본 연구는 ATP7B 유전자의 돌연변이가 발견되지 않은 윌슨병 환자를 대상으로 새로운 원인 유전자를 발견하기 위하여 시행되었다. 대상 및 방법: ATP7B 돌연변이가 발견되지 않은 12명의 윌슨병 환자를 대상으로 ATP7B 와 상호작용을 하는 것으로 알려진 ATOX1, COMMD1, GLRX, DCTN4와 ZBTB16 유전자의 전사부위와 엑손-인트론 경계부위의 염기서열을 분석하였다. 결 과: DCTN4 유전자의 12번 엑손에 존재하는 c.1084A>G(p.Thr362Ala)를 포함하는 3가지의 변이가 환자에서 발견되었다. in silico 분석을 통해 3가지 변이 중 c.1084A>G가 유일하게 단백질 기능 변화를 일으킬 것으로 예측되었다. 176명의 윌슨병 환자와 414명의 정상인을 대상으로 이 변이의 빈도를 조사한 결과, 정상인보다 윌슨병 환자에서 더 높은 빈도를 나타내었다(상대비, odds ratio [OR]=3.14, 95% 신뢰도=1.36-7.22, P=0.0094). 결 론: 본 연구의 결과는 ATP7B 와 상호작용하는 DCTN4 유전자의 c.1084A>G (p.Thr362Ala) 다형성이 윌슨병의 발병과 연관이 있음을 시사한다.

• 대한수의학회지
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• 제36권4호
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• pp.887-894
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• 1996

Cyclopiazonic acid(CPA) known as stimulating the release of intracellular calcium, aflatoxin $B_1(AFB_1)$ causing gastrointestinal hemorrhage frequently were used as model toxic mycotoxins in these studies. First of all, the effects of various mycotoxins on the platelet aggregation response were determined. The effects of mycotoxins on the ATP release from platelet by aggregating factors were investigated. The results and conclusions obtained from these studies are : 1) CPA promoted ADP, collagen, thrombin, A.A. and PAF-induced rabbit platelet aggregation. $AFB_1$ inhibited collagen, A.A. and PAF-induced rabbit platelet aggregation only. 2) CPA increased both aggregation and disaggregation time, whereas $AFB_1$ decreased in a dose dependent manner. 3) CPA increased ADP, thrombin, A.A. and PAF-induced ATP release. $AFB_1$ increased A.A.-induced ATP release and decreased PAF-induced release in a dose dependent manner. In conclusion, CPA promoted platelet aggregation by the increase of ATP. Antiaggregating effects of AFB1 may be due to decreases of ATP. These data provide the basis for the future study of roles of ATP release in platelet aggregation.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제18권4호
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• pp.778-783
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• 2008

Anthrax is an infectious disease caused by toxigenic strains of the Gram-positive bacterium Bacillus anthracis. To identify the mitochondrial proteins that are expressed differently in murine macrophages infected with spores of B. anthracis Sterne, proteomic and MALDI-TOF/MS analyses of uninfected and infected macrophages were conducted. As a result, 13 mitochondrial proteins with different expression patterns were discovered in the infected murine macrophages, and some were identified as ATP5b, NIAP-5, ras-related GTP binding protein B isoform CRAa, along with several unnamed proteins. Among these proteins, ATP5b is related to energy production and cytoskeletal rearrangement, whereas NIAP-5 causes apoptosis of host cells due to binding with caspase-9. Therefore, this paper focused on ATP5b, which was found to be down regulated following infection. The downregulated ATP5b also reduced ATP production in the murine macrophages infected with B. anthracis spores. Consequently, this study represents the first mitochondrial proteome analysis of infected macrophages.

• Childhood Kidney Diseases
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• 제16권2호
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• pp.109-114
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• 2012

Medullary sponge kidney disease (MSK)는 신장 수질 피라미드부위에서 야기되는 희귀질환으로 collecting precalyceal duct의 낭종성 확장(dilatation)과 ectasia을 특징으로 한다. MSK 환자의 발생 빈도에 대해서는 명확히 알려진 바가 없으며, 특히 소아 청소년 연령에서는 매우 드물게 발견된다. 연구자들은 국내 소아신장학회 회원들을 대상으로 MSK 환자의 전수 조사를 실시하였고 현재까지 문헌상으로 보고된 관련 유전자들인 GDNF, ATP6V1B1, ATP6V0A4 유전자에 대한 분석을 실시하였기에 이를 보고하는 바이다.

• ALGAE
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• 제20권4호
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• pp.261-270
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• 2005

We analyzed chloroplast ATP synthetase beta subunit(atpB) sequences from 32 strains of the zygnemophycean green algae, Staurastrum, Staurodesmus, and a single species of Xanthidium. A total of 42 atpB sequences including previously published ones was aligned for phylogenetic analyses. The phylogenies were validated with bootstrap analysis and Kishino-Hasegawa test. Taxa of Staurastrum excluding S. muticum indicate that they can be characterized by taxa having the ornamented cell wall or the process of cells. However, the genus Staurodesmus was grouped with taxa having the smooth cell wall and the absence of process or arms. The results suggest that the genus Staurodesmus could be extended to include Staurastrum muticum, Desmidium, Onychonema and Xanthidium. Further taxon sampling of Staurodesmus and putative relatives is necessary for a solid classification of the genus.

• 식물분류학회지
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• 제38권4호
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• pp.371-388
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• 2008

Coryloideae 35집단에 대한 계통 유연관계를 알아보기 위하여 핵 DNA의 waxy 유전자와 엽록체 DNA의 atpB-rbcL intergenic spacer 지역에 대한 염기서열을 분석하였다. Waxy 유전자 분석에서 Coryloideae의 4개 속은 단계통군을 형성하였으며, 개암나무속은 단계통군을 형성하면서 군내군의 가장 기부에 분계조(clade)를 형성하였다. Ostryopsis속은 서어나무속과 새우나무속을 위한 자매군을 형성하였으며, 새우나무속 역시 단계통군을 형성하였다(BS=86, PP=99). AtpB-rbcL 분석에서는 Ostryopsis속이 아과 내에서 가장 기부에 분계조를 형성하였다. 개암나무속은 서어나무속-새우나무속과 Ostryopsis속의 중간에 위치하였고(BS=98, PP=100), 서어나무속은 새우나무속 분류군들과 함께 높은 지지도(BS=100, PP=100)를 가지고 하나의 clade를 형성하였다. Waxy 유전자 분석에서 서어나무속의 Carpinus절은 단계통을 형성하였지만 Distegocarpus절은 병계원군(paraphyletic group)으로 나타났다. 개암나무속의 경우는 2개의 subclade를 형성하였지만 속내 절 또는 아절 등의 분류계급과는 일치하지 않았다. AtpB-rbcL 분석에서는 대부분의 분류군들이 각각의 clade내에서 polytomy를 형성하여 차이를 보였다. 이상의 결과에서 두 유전자의 계통분석 결과가 뚜렷하게 불일치하였고, 특히 Ostryopsis속의 위치와 새우나무속의 단계통 여부, 그리고 서어나무속과 새우나무속의 유연관계가 가장 큰 차이를 보였다. 따라서 이들에 대한 추가적인 연구가 필요한 것으로 판단된다.

• 한국식품영양학회지
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• 제6권3호
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• pp.158-168
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• 1993

For the conversion of WAD to NADP, Immobilized Brevibacterium ammoniagenes cells with NAD kinase was coupled with ATP-generating system by acetate kinase. The membrane permeability of B. ammoniagenes was improved by toluene treatment of cells. The toluene treated B. ammoniagenes cells were immobilized for stable enzyme activity. Partially purified acetate kinase was used in the reaction system. The optimum conditions for the efficient conversion of UAD to WADP by energy-coupled system were investigated. B. ammoniagenes cells treated with toluene for the Improvement of membrane permeability showed 4.5 fold improved permeability in the conversion of NAD to NADP compared with Intact cells. 3% k-carrageenan as the immobilization matrix of B. ammoniagenes showed the best efficiency for the conversion of NAD to NADP The optimum conditions for the WAR to WARP conversion reaction coupled nth ATP-generating system were 10mM acetylphosphate, 5mM ADP 200mM inorganic phosphate, 10mM MgCl2, 250mg/ml Immobilized cells, 49.3mUnit/ml acetate kinase, pH 7.5 and 37$^{\circ}C$. Under the optimum conditions, 72% of 5mM(340mg/ml ) NAD was converted to UADP In 12 hours.

• 대한임상검사과학회지
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• 제52권1호
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• pp.45-52
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• 2020

고혈압은 종종 심혈관 질환 및 신장 질환으로 이어지며 전 세계적으로 중요한 문제이다. 유전적으로 많은 단일 염기 다형성이 고혈압과 관련이 있다. 많은 GWAS 연구에서 ATP2B1 유전자가 혈압과 연관성이 높다는 것을 발견했다. 본 연구에서는 한국인 994명을 대상으로 수축기 혈압, 이완기 혈압과 ATP2B1 유전자의 SNP와 연관성을 분석하였다. 또한, BMI수치에 따라 하위그룹으로 계층화하여 차이가 있는지 확인하고자 하였다. 다중선형회귀분석에서 수축기 혈압 및 이완기 혈압과 가장 높은 통계적 유의성을 보인 SNP를 선정하였다. 수축기 혈압과 이완기 혈압에서의 one-way analysis of variance를 시행하였고, 고혈압 발생 위험에 대한 다중로지스틱회귀분석을 시행하였다. 다중로지스틱회귀분석은 연령 기준으로 구분하여 시행하였으며, 연령, BMI, 공복 시 혈당을 통제한 방법에서 비교하였다. 수축기 혈압에서는 4개의 SNP (rs10506974, rs7136259, rs17249754, rs17836882)가, 이완기 혈압에서는 6개의 SNP(rs10506974, rs10777237, rs7136259, rs17249754, rs1371075, rs10506983)가 유의하게 관련성을 보였다. 추가적으로, 유전자형(genotype)에 따른 분석에서는 남성에게서 고혈압 위험에 대한 유의한 odd ratio 값을 보였다. 본 연구는 ATP2B1 다형성이 수축기 혈압과 이완기 혈압에 영향을 미치는 것을 제안한다.