• Journal of Species Research
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• 제9권4호
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• pp.427-442
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• 2020

We collected indigenous Korean ciliate species from diverse aquatic and terrestrial habitats in 2018 and 2019. The morphology of these ciliates was revealed based on the observations of living cells, and protargol-impregnated and/or silver carbonate-impregnated specimens. During this study, we found 16 previously unrecorded Korean ciliate species, which are as follows: 1) class Heterotrichea - Stentor introversus; 2) class Spirotrichea - Aspidisca orthopogon, Amphisiella sinica, Epiclintes auricularis rarisetus, Apokeronopsis wrighti, Pseudokeronopsis carnea, Trachelostyla pediculiformis, Strombidium apolatum, and Varistrombidium kielum; 3) class Phyllopharyngea - Chlamydodon obliquus, Dysteria aculeata, and Hartmannula angustipilosa; 4) class Litostomatea - Paraspathidium apofuscum; and 5) class Oligohymenophorea - Frontonia angusta solea, Metanophrys sinensis, and Uronemita binucleata. Here, we provide a diagnosis for each species with a brief remark. Among them, the infraciliature of the poorly known species, Stentor introversus and Dysteria aculeata, is described for the first time. Further, we revise the Korean population of Pseudokeronopsis pararubra, which was previously misidentified as Pseudokeronopsis carnea.

• 한국물환경학회지
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• 제29권6호
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• pp.825-831
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• 2013

The Suwon stream which consists of a mountainous reach, an artificial reservoir and an urban reach provides benthic macroinvertebrates with various habitats. This study was conducted to find out the influence of reservoir sluice control and water quality on benthic macroinvertebrates community in the Suwon stream from June to August, 2011. As a result, substrate composition showed little difference between the upper site (S2) and the lower site of the reservoir (S3). At site S3, water velocity was fastest, and water temperature was lowest due to the intermediate depth discharge of the reservoir. Cheumatopsyche brevilineata which prefer fast water velocity was dominant at site S3. Some biotic indices (H', J, and R) of site S3 decreased significantly whereas Benthic Macroinvertebrate Index (BMI) showed little difference between site S2 and site S3. EPT showed a negative correlation with water temperature. The sluice control of the reservoir leaded variations of water velocity and temperature, and seemed to make the state of aquatic ecosystem worse.

• 식물분류학회지
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• 제47권3호
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• pp.180-188
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• 2017

We evaluated the actual distribution, present status, and number of remnant individuals of Korean Sagittaria aginashi (Alismataceae) based on herbarium specimens and field surveys. We also reidentified Korean S. aginashi by analyzing sequences of the internal transcribed spacer (ITS) region. We found nine specimens of S. aginashi in herbaria from four localities housed at the Osaka Museum of Natural History (OSA) and at the Korea National Herbarium (KH). During our field research, we could not confirm the current statuses of two collection localities (Taereung and Ansan-si), though this was not the case for Ulsan-si. In addition, we found two new localities in Ulsan-si and Yangsan-si. These three remnant populations are distributed in wetlands in mountainous areas (elev. 480-740 m). With regard to the number of flowering and immature individuals in the three localities, there were <50 and <2,000, respectively, in total. ITS sequences demonstrated that the sequences of Korean and Japanese S. aginashi are uniform and distinct from other Sagittaria species. These results indicate that S. aginashi is a rare and threatened species in Korea. It should be listed as an endangered species on the Korean Red List and requires urgent protection by conservation programs, including the extensive surveys of other possible natural habitats.

• 한국농공학회논문집
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• 제63권6호
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• pp.89-100
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• 2021

The conservation of stream habitats has been gaining more public attention and fish habitat suitability index (HSI) is an important measure for ecological stream habitat assessment. The fish habitat preference is affected not only by physical stream conditions but also by water quality of which HSI was not available due to the lack of field data. The purpose of this study is to estimate the HSI of Zacco platypus for water quality parameters of water temperature, dissolved oxygen (DO), and biochemical oxygen demand (BOD) using the water environment monitoring data provided by the Ministry of Environment (ME). Fish population data merged with water quality were constructed by spatio-temporal matching of nationwide water quality monitoring data with bio-monitoring data of the ME. Two types of the HSI were calculated by the Instream Flow and Aquatic Systems Group (IFASG) method and probability distribution (Weibull) fitting for the four major river basins. Both the HSIs by the IFASG and Weibull fitting appeared to represent the overall distribution and magnitude of fish population and this can be used in stream fish habitat evaluation considering water quality.

• Environmental Engineering Research
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• 제23권4호
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• pp.374-382
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• 2018

Petroleum hydrocarbons pollutants, such as diesel fuel, have caused ecosystem damage in terrestrial and aquatic habitats. They have been recognized as one of the most hazardous wastes. This study was designed to optimize the effect of Tween 80 concentration, nitrogen (N)/phosphorus (P) ratio and salinity level on diesel biodegradation by Vibrio alginolyticus (V. alginolyticus). Response surface methodology with Box-Behnken design was selected with three factors of Tween 80 concentration (0, 5, 10 mg/L), N/P ratio (5, 10, 15) and salinity level (15‰, 17.5‰, 20‰) as independent variables. The percentage of diesel degradation was a dependent variable for 14 d of the remediation period. The results showed that the percentages of diesel degradation generally increased with an increase in the amount of Tween 80 concentration, N/P ratio and salinity level, respectively. The optimization condition for diesel degradation by V. alginolyticus occurred at 9.33 mg/L of Tween 80, 9.04 of N/P ratio and 19.47‰ of salinity level, respectively, with percentages of diesel degradation at 98.20%. The statistical analyses of the experimental results and model predictions ($R^2=0.9936$) showed the reliability of the regression model and indicated that the addition of biostimulant can enhance the percentage of diesel biodegradation.

• Mycobiology
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• 제49권6호
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• pp.559-581
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• 2021

The coastal marine ecosystems of Vietnam are one of the global biodiversity hotspots, but the biodiversity of marine fungi is not well known. To fill this major gap of knowledge, we assessed the genetic diversity (ITS sequence) of 75 fungal strains isolated from 11 surface coastal marine and deeper waters in Nha Trang Bay and Van Phong Bay using a culture-dependent approach and 5 OTUs (Operational Taxonomic Units) of fungi in three representative sampling sites using next-generation sequencing. The results from both approaches shared similar fungal taxonomy to the most abundant phylum (Ascomycota), genera (Candida and Aspergillus) and species (Candida blankii) but were different at less common taxa. Culturable fungal strains in this study belong to 3 phyla, 5 subdivisions, 7 classes, 12 orders, 17 families, 22 genera and at least 40 species, of which 29 species have been identified and several species are likely novel. Among identified species, 12 and 28 are new records in global and Vietnamese marine areas, respectively. The analysis of enzyme activity and the checklist of trophic mode and guild assignment provided valuable additional biological information and suggested the ecological function of planktonic fungi in the marine food web. This is the largest dataset of marine fungal biodiversity on morphology, phylogeny and enzyme activity in the tropical coastal ecosystems of Vietnam and Southeast Asia. Biogeographic aspects, ecological factors and human impact may structure mycoplankton communities in such aquatic habitats.

• The Plant Pathology Journal
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• 제40권3호
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• pp.251-260
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• 2024

Flavobacterium is a genus within the phylum Bacteroidota that remains relatively unexplored. Recent analyses of plant microbiota have identified the phylum Bacteroidota as a major bacterial group in the plant rhizosphere. While Flavobacterium species within the phylum Bacteroidota have been recognized as pathogens in the aquatic habitats, microbiome analysis and the characterization of novel Flavobacterium species have indicated the great diversity and potential of their presence in various environments. Many Flavobacterium species have positively contribute to plant health and development, including growth promotion, disease control, and tolerance to abiotic stress. Despite the well-described beneficial interactions of the Flavobacterium species with plants, the molecular mechanisms and bacterial determinants underlying these interactions remain unclear. To broaden our understanding of the genus Flavobacterium's role in plant health, we review the recent studies focusing on their ecological niche, functional roles, and determinants in plant-beneficial interactions. Additionally, this review discusses putative mechanisms explaining the interactions between plants and Flavobacterium. We have also introduced the importance of future research on Flavobacterium spp. and its potential applications in agriculture.

• 한국수산과학회지
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• 제29권4호
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• pp.527-536
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• 1996

동물플랑크톤이 쇄파대에서 어떻게 적응하여 살아가고 있는가를 연구하면서, 부유성 요각류 일곱 종의 주야 수평이동 양상을 조사하여 비교했다. 동해 영일만 쇄파대에서 수심 1m 되는 곳의 표층과 저층과 해변가 세 곳을 썰매형 네트로 채집했다(총시료수=108개). 쇄파대 요각류 집단은 일곱 종 (Acartia hudsonica, Fseudodiaptomus marinu, Paracalanus indicus, Calanus sinicus, Oithena similis, Sinocalanus tenellus, Labidocera bipinnata)이 우점했다. 쇄파대 요각류의 주${\cdot}$야간 생물량 차는 약 세 배였다. 표층에서 채집한 전체 요각류와 우점하는 일곱 종의 생물량은 주간보다 야간에 모두 유의하게 많았다. 하지만, 저층에서 주${\cdot}$야간 생물량의 차는 모두 유의하지 않았다. 이 연구에서 쇄파대 요각류의 약 $90\%$가 주야 수평이동하는 것을 밝혔다. 조금때 바람이 육지에서 바다쪽으로 불었지만, 표층에서 야간에 요각류 밀도가 높게 나타났다. 요각류가 해류에 따라 수동적으로 운반되지 않더라도 능동적으로 수평 방향을 유지하여 헤엄칠 수 있는 능력을 갖고 있기 때문인 듯하다. 요각류는 상대 조도의 변화에 따라 광반응 행동을 하고, 그래서 야간에 쇄파대에 모였다가 주간에 흩어지게 하는 주야 수평이동이 나타난 것 같다. 주야 수평이동은 요각류가 시각 포식자와 마주칠 기회를 줄일 것이다. A. hudsonica가 개체발생 단계별로 이동시각을 달리한 것은 발생단계에 따라 광반응 행동이 다르기 때문에 나타난 현상인 듯하다. 결과적으로 이것이 먹이를 둘러싼 종내 경쟁을 줄일 것 같다. 요각류 이동 자료에서 A. hudsonica, P. indicus, O. similis, S. tenellus 네종은 한 시간 이상 유영속도를 $20m\;h^{-1}$으로 유지할 수 있는 것으로 나타났다. 쇄파대에서 요각류가 차지하는 중요도를 바로 알려면, 주야 생물량이 매우 다르므로 주간과 야간 채집을 함께 해야 한다.

• Ecology and Resilient Infrastructure
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• 제9권3호
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• pp.194-205
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• 2022

하천에서 유사의 이동 및 퇴적으로 형성된 모래톱은 특이한 생물의 서식과 심미적 경관 측면에서 중요한 서식처이다. 본 연구는 보 상류에서 수문 개방에 의하여 노출된 모래톱에서 초기 식생의 발달과 그 분포를 확인하여 시간 경과에 따른 식생변화 과정을 파악하고자 하였다. 보 수문 개방 시기가 다른 금강의 3개 보 개방 구간과 보 운영에 영향을 받지 않는 대조 구간에서 보 개방 후 노출된 모래톱에서 식물군집 구조와 공간 분포의 변화를 파악하고 모래톱의 노출 기간에 따른 식물 군집 구조의 변화를 조사하였다. 금강의 보 상류구간에서 수문 개방으로 기존 홍수터 면적의 33% 이상의 면적에 해당하는 모래톱이 새롭게 형성되었다. 노출된 모래톱에는 1년생 중생식물, 다년생 수생식물, 다년생 습생식물, 아교목, 교목 군집에 속하는 9개 식물군집이 분포하였다. 모래톱의 노출 기간이 길어 짐에 따라서 나지 모래톱, 1년생 초본식물, 다년생 수생식물 군집의 면적은 감소하였고, 다년생 습생식물, 아교목, 교목 군집의 면적은 증가하였다. 하천 모래톱에서 시간 경과에 따른 식생의 변화는 수위 하강 전 수중 서식처의 조건과 물 흐름에 의한 물리적 교란의 정도에 따라서 3가지 천이 유형으로 구분할 수 있었다. 즉 모래톱의 천이과정은 1) 수생식물로부터 시작하는 '정수지 천이', 2) 일년생 습생 초본식물로부터 시작하는 '유수지 천이', 3) 버드나무류로 시작하는 '버드나무류 천이'로 구분할 수 있었다. 따라서 금강의 보 구간에서 하천 서식처 및 경관의 변화를 체계적으로 관리하기 위하여 모래톱에서의 식생 천이계열을 반영하여야 할 것으로 판단된다.

• 환경생물
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• 제38권1호
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• pp.146-159
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• 2020

본 연구는 국내 주요 수계 중 만경강, 섬진강, 남해권 수계, 탐진강, 영산강, 동진강과 연결된 농수로 어류의 종 조성과 어류 길드 특성, 군집 특성을 분석하였다. 2017년 9월부터 2018년 8월까지 4회에 걸쳐 현지 조사를 시행한 결과, 어류는 농수로에서 6목 11과 53종 3,633개체가 출현하였고 본류에서 9목 15과 57종 7,108개체가 출현했다. 농수로의 우점종과 아우점종은 칼납자루(Tanakia koreensis)와 납자루(T. lanceolata)로 나타났으며, 납자루아과의 어종이 우점하는 지점이 10지점 중 6지점으로 나타났다. 이는 담수성 이매패류의 서식에 기인한다고 사료된다. 그리고 환경부 지정 멸종위기 야생생물 I급 임실납자루(T. somjinensis)가 섬진강 수계의 농수로에서 출현했고, 멸종위기 야생생물 II급 큰줄납자루(Acheilognathus majusculus)와 꺽저기(Coreoperca kawamebari)가 각각 섬진강 수계, 섬진강과 탐진강 수계의 농수로에서 출현했다. 지점별로 어류 길드 분석 결과, 대체로 농수로가 본류보다 낮은 민감종의 비율을 나타냈다. 군집 분석 결과 하상 구조가 복잡하게 나타난 지점에서 비교적 안정적인 군집을 보였으며, 환경적 변수에 따른 분석 결과 하상 구조가 복잡한 농수로 그룹이 높은 다양도 지수와 낮은 우점도 지수를 나타냈다. 결과적으로 본 연구는 농수로의 어류 서식 특성을 나타내고, 향후 연구와 관리의 필요성을 제시했다.