• 생명과학회지
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• 제17권12호
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• pp.1729-1733
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• 2007

BAK1(Brassinolide insensitive associated receptor kinase 1)는 브라시노스테로이드 생합성 대사관련 신호전달 매체이다. BR 생합성 및 신호전달 돌연변이체는 매우 특징적인 난쟁이 표현형을 보인다. 과채류전용 양액배지인 Sonneveld 양액을 이용하여 양분결핍에 의해 왜성을 나타내는 토마토를 선발하였다. 선발된 토마토에 대해 이차원 전기영동법으로 단백질체를 분석한 결과, 발현차를 나타내는 28개의 단백질 spot이 분리되었다. 분리된 단백질 spot중 현저하게 발현이 억제된 단백질 spot 6개를 선발하여 단백질 서열을 결정하였다. 실험 결과, pI 4.5, 분자량 24 kDa를 나타내는 단백질은 브라시노스테로이드 생합성에 관여하며 왜성 표현형을 나타내는 신호전달 단백질, BAK1으로 동정되었다. BCK1, cystein proteinase, sulfutase, peroxidase, zinc finger factor로 동정 된 나머지 단백질들은 브레시노스테로이드 생합성관련 신호전달기작에 관여하는 단백질로 추정되었다. BAK1을 검정하기 위해 단백질 서열이 결정된 부위로부터 프라이머를 디자인하여 RT-PCR를 수행한 결과, 증폭된 500 bp의 산물이 정상과 발현차를 보여주었는데 이 결과는 양분조절에 의해서도 BAK1의 발현이 조절될 수 있음을 시사한다.

• Journal of Breast Disease
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• 제6권2호
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• pp.60-72
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• 2018

Purpose: According to American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists guidelines, breast cancer is human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) positive if there is HER2 protein overexpression at a 3+ level on immunohistochemistry (IHC 3+) or gene amplification (more than six copies per nucleus) on fluorescence in situ hybridization (FISH+). However, there have been few reports on whether outcomes differ based on diagnosis by these two techniques. In this study, we compared outcomes based on the two methods in patients with HER2-positive breast cancer. Methods: This study was a retrospective analysis of HER2-positive breast cancer in 18,304 patients, including 14,652 IHC 3+ patients and 3,652 FISH+ patients from the Korean Breast Cancer Society Registry. We compared breast cancer-specific survival and overall survival based on IHC 3+ and FISH+ status with or without trastuzumab. Results: Breast cancer-specific survival was significantly different between the IHC 3+ and FISH+ groups, with 5-year cumulative survival rates of 95.0% for IHC 3+ and 98.5% for FISH+ patients who did not receive trastuzumab (p=0.001) in Kaplan-Meier methods. However, there were no significant differences in breast cancer-specific survival and overall survival between IHC 3+ and FISH+ groups regardless of trastuzumab treatment in Cox proportional hazards models. Conclusion: The survival outcomes were not affected by the different two diagnostic methods of HER2-positive breast cancer. Further research to evaluate differences in prognosis and other characteristics according to the diagnostic methods of HER2 positivity is needed in the future.

• 한국지반환경공학회 논문집
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• 제19권10호
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• pp.13-19
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• 2018

2016년 경주지진에 이어 2017년에도 포항지진이 발생하여 우리나라 동남권 지역이 지진의 위협을 받고 있는 실정이다. 특히, 포항지진에서는 연안의 퇴적지반에서 액상화 현상이 발생하여 이에 대한 대책 마련이 크게 중요시되고 있다. 지반 액상화는 지표면 위의 구조물뿐만 아니라 지중의 시설에 대해 직접적인 영향을 줄 수 있기 때문에 발생 가능한 지진에 대한 시설물의 액상화 위험도를 파악하여 이에 대한 대책을 마련할 필요가 있다. 이 연구에서는 최근 국내에서 지진이 발생한 동남권 지역의 전력구를 대상으로 지진 시 액상화 위험도를 평가하였다. 이때, 발생 가능한 지진은 재현주기 1,000년으로 고려하였으며 지진 시 액상화 위험도는 액상화 발생가능성 지수를 통해 검토하였다. 액상화 위험도 분석은 2단계로 진행되었으며 1단계에서는 동남권 전력공동구 설치위치의 지반조사자료를 토대로 액상화 발생 가능성 지수를 산정하여 액상화 위험도를 분석하였다. 이때, 지반 내 증폭현상은 지반종별 지반증폭계수를 통해 고려되었다. 2단계 위험도 분석은 1단계 분석에서 액상화 발생 가능성이 매우 높게 판정된 전력구 주변의 시추공 정보를 바탕으로 지진응답해석을 수행하고 이를 토대로 액상화 발생 가능성 지수를 재산정하여 지진 시 액상화 위험도를 재분석하였다. 이때, 이용된 지반조사자료는 국토지반정보 통합DB센터의 자료이며 지진응답해석에서는 3가지의 실지진 가속도 시간이력곡선을 이용하였다. 연구결과, 국내 지중 시설물에 대한 액상화 위험도 평가를 1단계 광역기반의 액상화 위험도 평가를 수행하고 2단계 평가에서는 1단계 평가에서 위험한 곳으로 평가된 지역에 대해서 지진응답해석을 동반한 위험도 평가를 재수행하는 것이 매우 합리적이고 유효적절한 것으로 나타났다.

• 토지주택연구
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• 제5권2호
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• pp.115-120
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• 2014

현재 국내 내진설계기준에서 제시하고 있는 지반분류 방법 및 지반 증폭계수는 기반암이 주로 30m 이내에 위치하는 일반적인 국내 지반특성을 제대로 반영하지 못하고 있다. 따라서, 본 연구에서는 점성토 지반에 근입된 비정형 말뚝기초(PHC 500, 중심 간격 3D)에 대한 동적 원심모형 실험을 실시하여 자유장과 기초판의 응답 스펙트럼 결과를 비교하였다. 장주기 영역에서는 SE 지반의 설계 스펙트럼 가속도보다 기초와 자유장에서 계측된 실제 스펙트럼 가속도가 작게 나타났고, 기초에서 발생한 스펙트럼 가속도는 지진 하중이 커지면 SD 지반의 설계 스펙트럼 가속도와 유사해지는 것을 확인할 수 있었다. 이것은 연약한 지반(SE 지반)에 대한 현행 설계기준이 지진 하중을 과대평가하고 있으며 비경제적 설계를 할 수 있음을 의미한다. 1.5초 이상의 장주기 영역에서는 실험에서 측정된 스펙트럼 가속도가 SC 지반의 표준설계응답스펙트럼 가속도보다 작게 나타났고 기초 및 자유장 조건에 의한 스펙트럼 가속도 차이가 거의 발생하지 않았다. 따라서, 실제 아파트에 해당하는 1.5초 이상의 장주기에서는 국내 지반조건을 고려하여 실험에서 측정된 스펙트럼 가속도를 설계에 적용하면 표준설계스펙트럼을 적용할 때 보다 경제적인 설계가 가능한 것으로 나타났다.

• 한국철도학회논문집
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• 제19권3호
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• pp.331-340
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• 2016

본 연구에서는 광폭 침목형 아스팔트콘크리트 궤도의 최적 도상 두께와 설계수명 결정을 위한 설계그래프를 개발하기 위하여, 주요 성능 파라미터로서 윤중 및 설계속도, 교통량 (MGT), 각층 재료 강성, 아스팔트콘크리트 도상 두께 등을 설정하였다. KTX 설계속도를 반영, 동적 할증계수를 고려한 준정적 윤중을 계산하고 이를 아스팔트콘크리트 궤도 상부에 재하시 아스팔트콘크리트 도상 하면에 발생하는 인장 변형률 및 흙노반 상면에서의 수직변형률을 ABAQUS프로그램을 활용하여 3차원 구조해석을 통해 산정하였다. 임의 성능 파라미터의 조합을 달리 구성하면서 임의 아스팔트콘크리트 궤도구조 단면에 대한 구조해석을 실시하였다. 계산된 아스팔트콘크리트 도상 하면 인장 변형률과 흙 노반상 수직 변형률을 손상이론에 적용하여 임의 궤도 단면구성과 성능 파라미터 조합 시에 기대할 수 있는 광폭 침목형 아스팔트콘크리트 궤도의 설계수명을 예측할 수 있는 설계그래프를 개발하였다. 이 설계그래프를 바탕으로 실무에서 간단히 설계 목적으로 활용할 수 있는 광폭 침목형 아스팔트콘크리트 궤도구조의 설계수명 50년에 대응하는 설계표를 개발하였다.

• 동의생리병리학회지
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• 제18권4호
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• pp.1192-1198
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• 2004

Sasang Constitutional Medicine is a major branch of Korean Traditional Medicine. The differences of disease susceptibility to be shown in Sasang constitution may be due to genetic factors. Therefore, I examined interrelationship among cerebral infarction (CI), apolipoprotein E (apo E) gene polymorphism, and Sasang constitutional classification. Apo E is a key protein modulating the highly atherogenic apoB containing lipoproteins and is a candidate gene for the development of coronary artery disease (CAD). The ε2 and/or ε4 alleles were the first to be implicated in premature CAD, which resulted in this polymorphism being extensively studied. I investigated the association between apo E genotype and CI by case-control study in a Korean population. I also classified CI patients and control group into groups according to Sasang Constitutional Medicine. 218 CI patients and 379 controls without CI were examined. Apo E genotype was determined by 8% polyacrylamide gel separation after DNA amplification. A frequency of apo E ε3/ε3 in the apo E genotype distribution was higher in the CI patients compared with that in controls. Also, it was widely known that Taeumin was easily attacked with CI, but there was no association between apo E polymorphim and Taeumin. However, the Taeumin constitution did not enhance the relative risk for CI in the subjects with apo E ε2 and/or ε4 alleles. No differences in the apo E genotypes frequencies were observed in the Taeumin compared with that in the other constitutions. In addition, I investigated whether the DD(deletion/deletion) or ID(insertion/deletion) genotype of angiotensin converting enzyme (ACE) gene, a candidate gene for CI, was associated with CI, Taeumin constitution, and apo E polymorphism. As a result, the frequency of Taeumin constitution was significantly higher in CI patients with both apo E ε3/ε4 and ACE ID/DD genotypes than in the remaining Sasang constitutions. In summary, it was concluded that the apo E polymorphism is a major risk factor for CI in Koreans and the ACE ID/DD genotype enhanced the relative risk for CI in the subjects with apo E ε3/ε4 genotype and Taeumin constitution.

• 식물조직배양학회지
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• 제24권1호
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• pp.37-41
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• 1997

고추의 형질전환율을 높이기 위하여 우선적으로 효율적인 재분화조건을 구명하였다. 고추의 하배축과 자엽 모두 2mg/L zeatin과 0.1 mg/L NAA ( I )에서 51%, 1.0 mg/L BAP와 10.0 mg/L IBA ( II)는 45.1%의 재분화율을 보였으며, 두 배지에 5 $\mu$M AgNO$_3$을 첨가하였을 때 I의 배지에서 보다 건강한 식물체를, II의 배지에서는 재분화율이 약 8%로 증가함을 보였다. 따라서 II의 배지 조건은 가격이 비싼 zeatin의 효과를 대치할 수 있었다. 이렇게 얻어진 효율적인 재분화배지에 고추의 하배축과 자엽을 ADA와 NPT II 유전자를 함유한 Agrobacterium tumefaciens pDY183을 이용하여 형질전환을 유도하여, kanamycin 100 mg/L에서 선발하여 성공적으로 형질전환체를 얻었다. 식물체내로의 ADA와 NPT II 유전자의 도입은 PCR을 이용하여 확인하였으며, Northern blot에 의하여 ADA 유전자의 전사여부를 확인하였다. ADA 효소의 활성도는 spectrophotometer를 이용하여 측정하여 본 결과 고추세포내에서 정상적으로 발현하였으므로 동물유전자인 ADA가 식물체 형질전환시 표시 유전자로서의 사용가능성이 확인되었다.

• 한국항해항만학회지
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• 제30권6호
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• pp.533-539
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• 2006

오늘날에 항만부진동의 문제는 대형선박이 입출항하는 항만의 설계에서 가장 현저한 인자로 작용한다. 연안 항만에서 탄성체의 삭으로 계류하고 있는 대형 선박은 장주기파랑과 계류시스템간의 공진으로 인해 종종 이탈되기도 한다. 특히, 장주기 파랑의 증폭비가 현저해지면 화물의 하역에 장애를 가져오며 계류삭이 절단되는 경우도 발생한다 이중 국내에서 부진동의 문제가 가장 현저하게 나타난 항만은 포항신항이며, 이에 따른 문제가 도선사 협회나 지역해양수산청으로부터 보고되고 있다. 그러나 이 항만에서 부진동을 야기하는 장주기 파랑의 내습을 막는 것은 어렵다. 더구나 정부는 이미 포항신항에서 발생하고 있는 이러한 문제점을 해결하지 않고 영일만의 입구에서 신항만 건설을 이미착수해놓고 있다. 본 연구는 영일만 입구의 4.1km에 달하는 방파제 건설과 신항만 계획을 반영하여 이들이 항만 부진동에 어떠한 변화를 가져오는 것인가에 대해 다룬다. 사용한 수치기법은 확장완경사방정식을 사용한 표준형식을 갖춘 것으로 수치실험결과를 이전 연구를 통해 이루어진 관측치와 비교하였으며, 이것이 어느 수준까지의 토론으로 이끌어 낼 것이며 장래 항만개발에 변화를 가져올 것으로 본다.

• Journal of Genetic Medicine
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• 제14권2호
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• pp.56-61
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• 2017

Purpose: Neurofibromatosis type 2 (NF2) is characterized by multiple tumors, including vestibular schwannoma (VS) and others affecting cranial and peripheral nerves. NF2 is caused by mutation of the NF2 gene. The mutation spectrum of NF2 has not been characterized in Korean patients. In the current study, the clinical and genetic characteristics of Korean NF2 patients were analyzed. Materials and Methods: Twenty-five unrelated Korean families were enrolled according to the Manchester criteria. Genetic analysis was performed by direct sequencing and multiplex ligation-dependent probe amplification methods using genomic DNA from peripheral lymphocytes or tumor tissues. Results: All patients had bilateral/unilateral VS and/or other cranial and peripheral nerve tumors. Two patients were familial cases and the other 24 patients were sporadic. Germline NF2 mutations were detected in peripheral lymphocytes from both familial cases, but only in 26.1% of the 23 sporadic families. Somatic mutations were also found in tumor tissues from two of the sporadic families. These somatic mutations were not found in peripheral lymphocytes. A total of 10 different mutations including 2 novel mutations were found in 40.0% of studied families. Five mutations (50.0%) were located in exon 6 of NF2, the FERM domain coding region. Conclusion: Family history was an important factor in identifying germline NF2 mutations. Further study is required to investigate whether exon 6 is a mutation hotspot in Korean NF2 patients and its correlation to phenotypic severity.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제13권12호
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• pp.6311-6318
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• 2012

Background: HER2/neu overexpression due to gene amplification is an important factor in breast cancer, modifying the sensitivity to anti-HER2 monoclonal antibody therapy. The clinical significance of HER2 expression in non small cell lung carcinoma (NSCLC) is currently under evaluation. The tumor suppressor gene PTEN negatively regulates the HER2/PI3K/Akt signalling pathway. The purpose of this study was to evaluate the role of simultaneous alteration in HER2 and PTEN protein expression in relation to biological behaviour of NSCLCs. Materials and Methods: Protein expression was determined by immunohistochemistry in sixty-one (n=61) NSCLC cases along with CISH for HER2 gene analysis and detection of chromosome 17 aneuploidy. Patients were followed-up for a period of 34 to 41 months after surgery. Results: HER2 overexpression (2+/3+score) was detected in 17 (27.9%) patients while loss of PTEN expression was observed in 24 (39.3%) cases, low expression in 29 (47.6%) and overexpression in 8 (13.1%). Simultaneous HER2 overexpression and PTEN low/loss of expression were correlated with metastasis (71.4% vs 36.2% p=0.03). Analysis in the subgroup of 22 patients of pTNM stage III with lymph node status N1 or N2 revealed that there was a relationship between the number of positive regional lymph node groups and simultaneous deregulation of the two genes (p=0.04). Multivariate analysis determined that HER2 overexpression was associated with an increasing risk of developing metastases (OR: 4.3; 95%CI: 1.2-15.9; p: 0.03) while PTEN overexpression was associated with lower risk (OR: 0.1; 95%CI: 0.1, 1.0; p: 0.05). Conclusions: Simultaneous HER2/PTEN deregulation is a significant genetic event that leads to a more aggressive phenotype of NSCLC.