• 제목/요약/키워드: Zika Virus

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Simple, Rapid and Sensitive Portable Molecular Diagnosis of SFTS Virus Using Reverse Transcriptional Loop-Mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP)

  • Baek, Yun Hee;Cheon, Hyo-Soon;Park, Su-Jin;Lloren, Khristine Kaith S.;Ahn, Su Jeong;Jeong, Ju Hwan;Choi, Won-Suk;Yu, Min-Ah;Kwon, Hyeok-il;Kwon, Jin-Jung;Kim, Eun-Ha;Kim, Young-il;Antigua, Khristine Joy C.;Kim, Seok-Yong;Jeong, Hye Won;Choi, Young Ki;Song, Min-Suk
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제28권11호
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    • pp.1928-1936
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    • 2018
  • Recently, human infections caused by severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (SFTSV), which can lead to fatality, have dramatically increased in East Asia. With the unavailability of vaccines or antiviral drugs to prevent and/or treat SFTSV infection, early rapid diagnosis is critical for prevention and control of the disease. Here, we report the development of a simple, rapid and sensitive portable detection method for SFTSV infection applying reverse transcription-loop mediated isothermal amplification (RT-LAMP) combined with one-pot colorimetric visualization and electro-free reaction platform. This method utilizes a pocket warmer to facilitate diagnosis in a resource-limited setting. Specific primers were designed to target the highly-conserved region of L gene of SFTSV. The detection limit of the RT-LAMP assay was approximately $10^0$ viral genome copies from three different SFTSV strains. This assay exhibited comparable sensitivity to qRT-PCR and 10-fold more sensitivity than conventional RT-PCR, with a rapid detection time of 30 to 60 minutes. The RT-LAMP assay using SFTSV clinical specimens has demonstrated a similar detection rate to qRT-PCR and a higher detection rate compared to conventional RT-PCR. Moreover, there was no observed cross-reactive amplification of other human infectious viruses including Japanese Encephalitis Virus (JEV), Dengue, Enterovirus, Zika, Influenza and Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV). This highly sensitive, electro- and equipment-free rapid colorimetric visualization method is feasible for resource-limited SFTSV field diagnosis.

Development and Clinical Evaluation of a Rapid Diagnostic Test for Yellow Fever Non-Structural Protein 1

  • Kim, Yeong Hoon;Kim, Tae-Yun;Park, Ji-Seon;Park, Jin Suk;Lee, Jihoo;Moon, Joungdae;Chong, Chom-Kyu;Neves, Ivan Junior;Ferry, Fernando Raphael;Ahn, Hye-Jin;Bhatt, Lokraj;Nam, Ho-Woo
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제57권3호
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    • pp.283-290
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    • 2019
  • A rapid diagnostic test (RDT) kit was developed to detect non-structural protein 1 (NS1) of yellow fever virus (YFV) using monoclonal antibody. NS1 protein was purified from the cultured YFV and used to immunize mice. Monoclonal antibody to NS1 was selected and conjugated with colloidal gold to produce the YFV NS1 RDT kit. The YFV RDTs were evaluated for sensitivity and specificity using positive and negative samples of monkeys from Brazil and negative human blood samples from Korea. Among monoclonal antibodies, clones 3A11 and 3B7 proved most sensitive, and used for YFV RDT kit. Diagnostic accuracy of YFV RDT was fairly high; Sensitivity was 0.0% and specificity was 100% against Dengue viruses type 2 and 3, Zika, Chikungunya and Mayaro viruses. This YFV RDT kit could be employed as a test of choice for point-of-care diagnosis and large scale surveys of YFV infection under clinical or field conditions in endemic areas and on the globe.

아시아 국가 내에서 감염빈도가 높은 플라비바이러스의 구별: 생물정보학적 접근을 통한 항원결정기 예측 (Discrimination of Flaviviruses with High Frequency of Infection in Asian Countries: Epitope Prediction by Bioinformatic Approaches)

  • 최재원;조병관;김민정;박수지;김학용
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제18권4호
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    • pp.99-113
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    • 2018
  • 최근 지구온난화로 인해 모기의 서식지가 넓어짐에 따라, 모기가 매개하는 감염병의 감염기회가 높아지고 있다. 플라비바이러스는 대표적인 모기매개 바이러스로, 아시아 국가 내에서 상대적으로 감염빈도가 높은 플라비바이러스로는 지카 바이러스, 뎅기 바이러스 및 일본뇌염 바이러스가 있다. 이들은 감염증상 및 치료방법이 다르기 때문에 정확한 구별진단이 요구되고 있지만, 아직까지 정확하게 구별 가능한 진단기술이 없다. 본 연구에서는 생물정보학 데이터베이스에 구축된 정보 및 분석도구를 바탕으로 플라비바이러스 구별 진단법에 대해 제안하였다. 3종 플라비바이러스의 면역진단을 위한 표적 단백질로는 외피단백질 및 비구조단백질 1을 선정하였으며, 이들의 아미노산 다중 서열 분석을 통해 상동성을 분석하였다. 이로부터 연속적 10-15개의 펩타이드로 구성된 항원결정기 후보를 선별하였으며, 면역원성 분석과 3차원 구조 예측을 통해 가장 유용한 항원결정기 2종을 제시하였다. 이는 아시아 국가 내에서 감염빈도가 높은 3종의 플라비바이러스의 구별진단을 위한 활용 가치가 높을 것으로 기대된다.

의료용 전동공기청정호흡기(PAPR)용 항균성 후드 및 필터 개발 (Development of Antibacterial Hood and Filter for Medical Powered Air Purifying Respirators (PAPR))

  • 고은주;조나현;이용택
    • 멤브레인
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    • 제33권6호
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    • pp.398-408
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    • 2023
  • 본 연구는 지카바이러스, 메르스, coronavirus disease-19 (COVID-19) 등의 감염병 방역 및 의료현장에서 사용할 수 있는 의료용 공기정화호흡기(powered air purifying respirators, PAPR)의 항균성 보호복의 후드와 필터를 개발하였다. PAPR은 전동팬 본체 및 필터, 배터리팩, 후드로 구성되며 보호복의 후드 소재는 뛰어난 흡습성, 풍압, 외부충격을 견딜 수 있는 폴리프로필렌 슐폰레이스(spunlace) 부직포 직물(SFS)을 사용하였다. 사용자의 감염위험을 낮추기 위해 후드의 외피에는 피톤치드계 물질을 사용하여 99.9%의 안티-박테리얼(antibacterial) 효과를 얻었으며 내피에는 친수가공을 하여 흡수성을 25% 향상시켰다. 의료용 보호복 후드에 필요한 인공혈액 침투저항성, 건조미생물 침투저항성, 습식세균 침투저항성, 그리고 박테리오파아지 침투저항성을 평가한 결과 2~6 단계의 합격평가를 받았다. 한편, 항균 처리된 슐폰레이스(spunlace filter, SF) 헤파 필터(high efficiency particulate air, HEPA)의 성능을 평가한 결과 우수한 항균성, 분진제거율, 차압 효과를 확인하였다.