• 제목/요약/키워드: XML DBMS

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PSAML을 이용한 단백질 구조 비고 시스템 (A Protein Structure Comparison System based on PSAML)

  • 김진홍;안건태;변상희;이수현;이명준
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제11권2호
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    • pp.133-148
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    • 2005
  • 단백질 구조에 대한 유사성과 특이성에 대한 이해는 단백질의 기능을 파악하는데 있어 중요한 역할을 하고 있기 때문에, 많은 단백질 구조를 비교하는 시스템이 개발되고 있다. 그러나 이러한 시스템들은 단백질 구조 비교를 위한 자신의 알고리즘에 맞게 PDB에서 제공하는 데이타를 가공해야 한다 더욱이 PDB 데이타베이스에 저장된 데이타가 증가함에 따라 대용량의 단백질 구조 데이타베이스를 대상으로 주어진 단백질과 유사한 부분구조를 찾는 시스템은 보다 많은 계산량이 필요하여진다. 본 논문에서는 XML 데이타베이스인 eXist를 이용하여 PSAML 문서를 제공하는 PSAML 데이타베이스에 기반을 둔 WS4E(A Web-Based Searching Substructures of Secondary Structure Elements) 단백질 구조 비교 시스템을 소개한다. PSAML(Protein Structure Abstraction Markup Language)은 XML기반의 단백질 구조 표현 기법으로서 단백질의 2차구조 구성요소와 그들 사이의 관계를 이용하여 단백질 구조를 정형화된 방법으로 기술한다. 구축된 PSAML 데이타베이스를 이용하여, WS4E는 PSAML로 표현된 단백질 구조에서 유사한 부분 구조를 찾는 웹서비스를 제공한다. 또한, PSAML 데이타베이스에서 비교 대상이 되는 단백질의 숫자를 감소시키기 위하여, 단백질 2차구조가 가지는 공간상의 정보를 이용하여 하나의 단백질 구조를 표현하는 기법인 topology string을 이용하였다.

GIS기반의 기후·환경 분야 자료 공유를 위한 Client/Server 방식의 통합DB 관리시스템 개발 (Development of an Integrated DB Management System for GIS-Based Client/Server Data Sharing in Climate and Environment Fields)

  • 최용국;김계현;이철용
    • 한국지리정보학회지
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    • 제17권2호
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    • pp.32-43
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    • 2014
  • 최근 이상기후로 인해 발생하고 있는 지구 환경 문제를 해결하기 위하여 기후변화와 지구환경시스템간의 상관관계를 규명하여야 한다. 이를 위해서는 기후변화 자료와 지구환경시스템 자료를 비교 분석하기 위한 기후 환경 통합DB가 구축되어야 한다. 선행 연구에서는 XML 기반의 기후 환경 통합DB를 구축하고 이를 관리하기 위한 시스템을 개발하였다. 그러나 선행 연구에서 개발된 시스템은 개별 PC에 자료를 독립적으로 저장 및 구축되도록 설계되어 여러 사용자의 동시접근이 불가능하였다. 또한 지속적으로 생산되는 자료의 양이 증가함에 따라 체계적인 관리가 어려운 실정이다. 따라서 본 연구에서는 독립적으로 구축된 기후 환경 통합DB를 개선하고 이를 손쉽게 활용하기 위한 GIS기반 통합DB 관리시스템 개발을 목표로 하였다. 우선 기후 환경 자료의 수집 및 분석을 통해 DBMS기반의 통합DB를 설계 구축하였다. 아울러 다양한 분야의 연구자가 통합DB에 쉽게 접근하여 활용이 가능하도록 복수의 PC와의 연결이 용이한 클라이언트/서버 모델 방식의 GIS기반 통합DB 관리시스템을 설계하고 개발하였다. 본 연구를 통해 개발된 GIS기반 통합DB 관리시스템은 산재되어 있는 기후 환경 자료를 통합하여 효율적인 관리 및 소재 파악이 용이하게 하여 기후 환경 통합 연구에서 자료의 중복 생산을 방지하여 시간적, 경제적 비용 절감효과를 가져올 것으로 기대된다.

이질적인 공간정보시스템의 상호 운용성을 위한 효과적인 지리데이터의 GML 사상 (Efficient Publishing Spatial Information as GML for Interoperability of Heterogeneous Spatial Database Systems)

  • 정원일;배해영
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제7권1호
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    • pp.12-26
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    • 2004
  • 과거 지리정보시스템은 고유의 독립적인 형식으로 지리 정보를 구축하여 서비스를 제공하여 왔으며, 최근에는 기존의 이질적인 지리정보시스템간의 다양한 지리 정보를 효율적으로 활용하기 위해 지리정보시스템에서의 상호 운용성 제공이 요구되고 있다. 이에 OGC(Open GIS Consortium)에서는 분산 환경에서 이질적인 지리정보시스템들간의 상호 운용성을 제공하기 위해 GML(Geography Markup Language)을 제안하였다. GML은 XML(extensible Markup Language)을 기반으로 공간 정보와 비 공간 정보를 포함하는 지리정보를 저장하고 전송하기 위한 인코딩 방법에 대한 명세를 제공하고 있다. 또한, GML은 웹 환경에서 맵 서버를 통해 지리 정보를 서비스하기 위한 인터페이스의 구현에 관한 명세를 포함하고 있다. 이에 GML 문서에서의 지리 정보와 기존의 지리정보시스템들이 가지는 지리정보간의 호환을 위한 연구가 활발히 진행되고 있다. 본 논문에서는 이질적인 지리 정보들의 상호 운용성을 제공하기 위해 GML 문서와 지리정보시스템간의 지리 정보를 사상시키는 기법을 제안한다. 이를 위해 기존의 지리정보시스템의 지리 정보를 GML 문서로 표현하는 방법과 GML 문서에 나타나는 지리 정보를 공간데이터베이스로 구축하는 방법에 대해 기술한다. 제안된 지리 정보 사상 기법을 통해 기 구축된 지리 정보간의 상호 운용성을 제공하여 웹 기반의 통합된 지리 정보서비스를 위한 프레임워크로 제공될 수 있다.

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관계 DBMS에 기반한 UDDI 3.0 레지스트리의 개발 (A Development of UDDI 3.0 Registry based on Relational DBMS)

  • 유수진;이경하;이규철
    • 한국전자거래학회지
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    • 제9권2호
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    • pp.163-181
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    • 2004
  • 최근에 들어 웹 서비스를 이용한 e-비즈니스를 활용사례가 증가하고 있으며 또한 많은 기업들이 웹 서비스를 이용한 e-비즈니스 시스템의 개발과 보급에 많은 노력을 기울이고 있다. 이렇게 웹 서비스를 개발하는 기업들의 가장 큰 관심사는 개발한 비즈니스서비스를 사용자가 쉽게 검색하고, 이용하도록 하는데 있으며, 이에 따라 웹 서비스의 등록과 검색의 지원을 위한 표준을 필요로 하게 되었다. 이러한 요구에 따라 OASIS에서는 웹 서비스에 대한 레지스트리 표준인 UDDI를 정의하게 되었으며, 최근에는 3.0 표준을 공개하였다. 그러나 이 표준의 복잡성으로 인하여, 아직 국내에서는 UDDI 3.0표준을 지원하는 레지스트리 시스템이 존재하지 않고 있으며, 외국에서도 웹 서비스 표준에 주도적인 역할을 수행해 온 몇몇 업체만이 테스트 버전만을 공개해 놓은 상태이다. 이에 따라 본 논문에서는 UDDI 3.0표준을 지원하는 레지스트리 시스템을 개발하였다. 개발된 시스템은 SQL표준을 지원하는 관계형 DBMS를 지원하고 있으며, UDDI의 모든 기능을 충실히 지원함으로써 웹 서비스 기반의 e-비즈니스 프레임워크에서 중요 기반 기술로 활용될 것으로 기대된다.

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모바일 환경에서 MPEG-7 스킴 기반의 내장형 멀티미디어 데이터베이스 관리 시스템 (MPEG-7 Scheme Based Embedded Multimedia Database Management System in Mobile Environment)

  • 안병태;강영신
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제12권2호
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    • pp.9-19
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    • 2007
  • 최근 모바일 장치에서의 멀티미디어 응용은 무선 인터넷의 급속한 발전으로 점점 증가하고 있다. 특히, 멀티미디어 컨텐츠의 대용량의 응용은 모바일 환경에서 점점 더 증가하고 있다. MPEG-7은 다양한 타입을 이용하여 멀티미디어 데이터를 검색할 수 있다. 그러나 멀티미디어의 제한된 용량으로 MPEG-7은 데스크 탑 컴퓨터시스템에서만 제한적으로 사용되고 있다. 따라서. 모바일 환경에서의 멀티미디어 데이터의 대용량 관리는 매우 중요한 연구 대상이 되고 있으며 이를 위한 클라이언트-서버 환경에서의 멀티미디어 데이터 관리를 위한 MPEG-7 기반의 내장형 데이터베이스 관리 시스템이 필요하게 되었다. 본 논문에서는 MPEG-7 데이터의 특성을 반영한 MPEG-7 데이터 클러스터링 방법을 제안한다. 또한 이를 바탕으로 PDA과 같은 모바일 장치에서 MPEG-7 스킴 기반의 내장형 멀티미디어 데이터베이스 관리 시스템을 개발한다.

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과거 합격자 시맨틱 데이터베이스를 활용한 디지털 인문학 연구 (Digital Humanities, and Applications of the "Successful Exam Passers List")

  • 이재옥
    • 동양고전연구
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    • 제70호
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    • pp.303-345
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    • 2018
  • 이 논문은 조선시대 과거급제자 명단인 방목의 디지털화 작업이 한 개인의 사회적 배경과 혈통에 대한 정보를 알려주는 것을 뛰어넘어, 양반 사이의 다양한 관계망을 파악하는 자료로서 어떻게 이용할 수 있는지를 보여주는 것이다. 디지털 인문학에서 조선시대 과거 합격자의 명단인 방목은 대단히 흥미로운 자료다. 이 자료를 기반으로 조선시대 사회상을 엿볼 수 있다. 한국학중앙연구원은 방목의 각종 데이터를 XML 문서로 만들어 데이터베이스를 구축 운영하고 있어, 필요한 항목을 추출하고 다양한 통계 자료를 만들 수 있다. 또 방목 데이터와 족보 데이터를 연결한다면 혼인 관계와 지역 연고, 당파 등 한 개인과 지역 사회에 대한 중층적인 스토리텔링을 구현할 수도 있다. 이미 한국학중앙연구원에서는 2005년부터 현재까지 문과방목 무과방목 사마방목 잡과방목의 디지털화를 완료하였다. 이 작업의 결과는 현재 '한국역대인물 종합정보시스템'에서 이용할 수 있다. 조선시대 다양한 과거급제자의 명단을 망라한 이 작업으로 조선시대 지배엘리트로부터 전문직 중인의 명단을 확보할 수 있게 되었다. 그럼에도 아직 이 작업결과를 통해 의미 있는 활용들이 일어나지 못하고 있다. 이 논문은 낱낱이 흩어져 있는 개인 정보들을 디지털 인문학이라는 학문적 접근을 통해 개인의 생애와 그 개인이 몸담은 사회의 심층을 들여다보는 창구로서 어떻게 활용할 수 있는지를 제시하고자 한다. 그래프 데이터베이스에 방목 데이터를 입력하면 급제자가 노드(node)가 되고 각 노드간 친족 관계와 혼인 관계를 시각적으로 살펴 볼 수 있다. 급제자들 상호 간의 인적 관계뿐만 아니라 여기에 족보 데이터를 추가하면 다양한 혼인 관계를 바탕으로 조선시대 문벌 가문의 단초를 한 눈에 알 수 있다.