Two lactic acid bacteria (LAB) with high ornithine-producing capacity were isolated from kimchi. Examination of the biochemical features using an API kit indicated that the strains belonged to the members of Weissella genus. They were gram positive, short rod-type bacteria, and able to grow anaerobically with $CO_2$ production. The isolates grew well on MRS broth at $25\sim37^{\circ}C$ and pH of 6.0~7.0. The optimum temperature and pH for growth are $30^{\circ}C$ and pH 6.5. The isolates fermented arabinose, ribose, xylose, glucose but not cellobiose, galactose, raffinose, or trehalsoe. The 16S rDNA sequences of isolates showed 99.6% and 99.7% homology with the Weissella koreensis S5623 16S rDNA (access no. AY035891). They were accordingly identified and named as Weissella koreensis OK1-4 and Weissella koreensis OK1-6, and could produce ornithine from MRS broth supplemented with 1% of arginine at a productivity of 27.01 and 31.41 mg/L/h, respectively. This is the first report on the production of ornithine by the genus Weissella isolated from kimchi.
Weissella koreensis DMW12 was isolated from kimchi added Myeongtae (Theragra chalcogramma), and its complete genome sequence was determined. The complete genome of strain DMW12 includes a single circular 1,518,288-bp chromosome without plasmids. The G+C content of the genome is 35.6 mol%. Although strain DMW12 did not showed protease and lipase activities, the genome includes 33 protease- and 3 lipase-encoding genes. The genome of strain DMW12 does not include acquired antibiotic resistance genes against ampicillin, chloramphenicol, clindamycin, erythromycin, gentamicin, kanamycin, tetracycline, and streptomycin.
Seung-Min Yang;Eiseul Kim;So-Yun Lee;Soyeong Mun;Hae Choon Chang;Hae-Yeong Kim
Microbiology and Biotechnology Letters
/
v.51
no.1
/
pp.128-131
/
2023
Here we report the draft genome sequence of Weissella koreensis strain HJ and genomic analysis of its key features. The genome consists of 1,427,571 bp with a GC content of 35.5%, and comprises 1,376 coding genes. In silico analysis revealed the absence of pathogenic factors within the genome. The genome harbors several genes that play an important role in the survival of the gastrointestinal tract. In addition, a type III polyketide synthase cluster was identified. Pangenome analysis identified 68 unique genes in W. koreensis strain HJ. The genome information of this strain provides the basis for understanding its probiotic properties.
PCR-based Weissella species-specific detection method was developed to apply for the discrimination of Korean and Chinese kimchi by detecting a Weissella species only found in Korean or Chinese kimchi. PCR primers were designed from the species-specific sequence in the recN gene of each species. The primers allowed the species-specific detection and identification of nine species in the genera Weissella, and were successfully applied to the detection of W. cibaria, W. confusa, W. koreensis, and W. soli in kimchi with 20 ng template DNA. W. cibaria, W. confusa, and W. koreensis were detected from the Korean kimchi samples tested but W. soli was not detected. However, the four species were detected from Chinese kimchi samples. PCR-based W. soli-specific detection could not be perfectly applied as the Chinese kimchi discriminating method but has significance as an approach to evaluate the potential of scientific verification method based on the difference of microbial community.
Demand for a rice cake, a popular traditional food in Korea, is rising, but its industrial-scale production is extremely difficult due to its short shelf-life caused by starch retrogradation and microbial spoilage. By means of the sourdough fermentation technique, we attempt to develop rice cakes with a longer shelf-life. Heterofermentative lactic acid bacteria (Weissella koreensis HO20, Weissella kimchii HO22) isolated from kimchi were used to ferment wet-milled rice flour for their abilities to produce exopolysaccharides and to inhibit the microbial spoilage of rice cakes. After 24 hr of fermentation at $25^{\circ}C$, viable cell counts in rice dough increased from $10^6$ CFU/g to $10^8$ CFU/g and total titratable acidity increased from 0.05% to 0.20%, whereas pH decreased from 6.5 to 5.1. Fermented rice flour showed significantly lower peak, trough, and final viscosities as well as breakdown and setback viscosities measured by rapid viscoanalyzer. Both lactic acid bacteria showed in vitro antifungal activity against Penicillium crustosum isolated from rice cakes. The antifungal activity remained constant after the treatments with heat, proteinase K and trypsin, but fell significantly by increase of pH. Rice cakes made of fermented rice flour were found to retard mycelial growth of P. crustosum. The degree of retrogradation as measured by the hardness of the rice cake was significantly reduced by the use of fermented rice flour. The results suggest that use of fermented rice flour has a beneficial role in retarding starch retrogradation and in preventing fungal growth, hence extending the shelf-life of rice cakes.
This study was carried out to obtain basic data for the industrial use of Weissella koreensis and Lactobacillus sakei. The antibacterial activity of supernatants obtained from W. koreensis and L. sakei were tested against pathogenic bacteria such as Escherichia coli KCCM 11234, Salmonella enteritidis KCCM 3313, Salmonella enteritidis KCCM 12021, Salmonella typhimurium KCCM 40253, and Salmonella typhimurium KCCM 15. The supernatant of L. sakei showed antibacterial activity against E. coli KCCM 11234, S. enteritidis KCCM 12021, and S. typhimurium KCCM 15, while the supernatant of W. koreensis showed antibacterial activity against E. coli KCCM 11234 and S. enteritidis KCCM 12021. The effect of pH changes and heat treatment on antibacterial activity of the supernatants was examined using the sensitive pathogenic bacteria (E. coli KCCM 11234, S. enteritidis KCCM 12021 and S. typhimurium KCCM 15). Antibacterial activity against sensitive pathogenic bacteria was maintained under heat treatment at all temperatures, but there was no antibacterial activity associated with pH modification. Furthermore, it was confirmed that the antibacterial activity of the supernatants obtained from W. koreensis and L. sakei was a result of organic acids including, lactic, acetic, phosphoric, succinic, pyroglutamic, citric, malic, and formic acids. Therefore, the present study showed that the organic acids produced by L. sakei and W. koreensis exhibited a strong antibacterial activity against pathogenic bacteria. Moreover, in the food industry, these organic acids have the potential to inhibit the growth of pathogenic bacteria and improve the quality of stored food.
A polymerase chain reaction (PCR)-restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis was applied to detect and identify ten Weissella spp. frequently found in kimchi. The previously reported genus-specific primers designed from 16S rDNA sequences of Weissella spp. were adopted but PCR was performed at the increased annealing temperature by $4^{\circ}C$. The sizes of amplified PCR products and restricted fragments produced by AluI, MseI, and BceAI endonucleases were well correspond with the expected sizes. W. kandleri, W. koreensis, W. confusa, W. minor, W. viridescens, W. cibaria, and W. soli were distinguished by AluI and MseI and W. hellenica and W. paramesenteroides were identified by BceAI. W. thailandensis was distinguished when restriction pattern of other species was compared but identified by the single use of MspI.
Kim, Tae-Woon;Lee, Ji-Yeon;Song, Hee-Sung;Park, Jong-Hyun;Ji, Geun-Eog;Kim, Hae-Yeong
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
v.14
no.1
/
pp.105-109
/
2004
This study was conducted to investigate the potential origin of Weissella species, which were found in ingredients of kimchi, such as salted Chinese cabbage, radish, green onion, red pepper powder, pickled shrimps, garlic, and ginger. Ten strains of Weissella species (Weissella thailandensis, W. kimchii, W. koreensis, W. minor, W. halotolerans, W. hellenica, W. kandleri, W. confusa, W. viridescens, and W. paramesenteroides) and lactic acid bacteria isolated from ingredients of kimchi were analyzed by SDS-PAGE of whole-cell proteins. Several strains with patterns identical to those of Weissella kimchii were isolated from green onion. On the basis of biochemical characteristics and 16S rDNA sequence comparisons, these strains were identified as Weissella kimchii, suggesting green onion as a major origin of Weissella kimchii found in kimchi.
Terminal-restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) analysis, one of rapid culture-independent microbial community analysis methods, was used to determine the lactic acid bacterial complexity and dynamics during kimchi fermentation at $15^{\circ}C$ and $4^{\circ}C$. At both temperatures, the common presence of Leuconostoc mesenteroides, Lc. inhae, Lc. kimchi, Weissella koreensis, W. cibaria, Lactobacillus sakei, Lb. curvatus, Lb. plantarum, Lb. paraplantarum, Lb. pentosus, and Lb. brevis was predicted. Lc. citreum and Enterococcus faecalis were detected at $15^{\circ}C$ and $4^{\circ}C$, respectively. W. koreensis predominated during the mid stage of kimchi fermentation whereas lactobacilli were dominants during later stage. Lb. sakei and Lb. curvatus became dominants regardless of fermentation temperature but the growth of Lb. plantarum, Lb. paraplantarum, Lb. pentosus, and Lb. brevis was restricted at psychrophilic temperature. Some species of leuconostocs were maintained until the later stage of kimchi fermentation.
Pediococci selective medium (PSM) supplemented with ampicillin (A) reported as valid for the detection and enumeration of pediococci included in foods and animal feed was evaluated for the selective detection of the genus Pediococcus in kimchi. PSM is based on the complex basal medium MRS supplemented with cysteine hydrochloride, vancomycin, novobiocin, and nystatin. In the medium evaluation with known species, the growth inhibition of leuconostocs, Pediococcus pentosaceus, Lactobacillus casei, Lactobacillus curvatus, Oenococcus oeni, and Streptococcus thermophilus was not confirmed. In the application of kimchi samples on the selective medium, leuconostocs, P. pentosaceus, Weissella koreensis, Lb. curvatus, Lactobacillus brevis, and Lactobacillus sakei were detected. PSM+A was proved to be not applicable for the detection of pediococci in kimchi.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.