Journal of the Korean Data and Information Science Society
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제26권1호
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pp.161-168
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2015
전염병은 기초 감염 재생산 수가 시간에 따라 달라져서 상황을 관리하기 어렵기 때문에 확산을 통제하기 어려울 뿐 아니라 정확한 예측은 더욱 어렵다고 알려져 있다. 최근에 많은 모형들이 새롭게 제시되고 있으며 그에 따라 현저하게 다른 결과가 도출되고 있다. 연속된 시간에서 기초 감염 재생산 수는 일반적으로 확률과정이론이 적용되고 있다. 본 논문에서는 에볼라 바이러스 전염병 모형에서 전염확률분포의 추정 방법을 제시하였다. 이 방법은 대규모 전염병 발생에서 실시간 추정을 가능하게 함으로 적절한 질병관리를 용이하게 한다. 기니에서 발생한 에볼라 바이러스 자료를 제시한 방법으로 분석하였다.
Disease incidences of cucumber virus diseases in Jeonnam province were 52.5%, 16.1%, 35.2%, and 50.9% in 1999, 2000, 2001, and 2002, respectively. Rod- and flexuous rod-shaped virus particles were observed with the frequencies of 63.2% and 10.5%, respectively from the samples collected in 1999 under EM observation. Rod-shaped virus particles are considered as tobamovirus while flexuous rod shaped particles are considered as potyviruses. To further confirm their nature, total of 312 diseased virus samples were collected from 2000 to 2002, and tested by RT-PCR. Disease incidences of tobamoviruses including Cucumber green mottle mosaic virus and Kyuri green mottle mosaic virus were 48.7% and 3.8%, respectively while those of potyviruses including Zucchini yellow mosaic virus, Papaya ringspot virus, and Watermelon mosaic virus were 15.7%, 9.3%, and 5.1%, respectively. Interestingly, Cucumber mosaic virus was hardly detected. About 5.8% of tested samples were infected with more than one virus. Tobamovirus infection was consistently observed from September to December regardless of planting time, whereas infection of potyviruses was observed in many cucumber cultivating areas where it was planted in September and October.
Sweetpotato fields in Korea are highly infected with virus and virus like diseases that greatly diminish both yield and quality as indicated by field observations and laboratory tests. In order to solve this problem, there is an urgent need to produce and mass propagate virus-free planting materials for distribution to the farmers. These experiments were conducted, firstly, to determine the most appropriate culture media, nutrient solution, and cutting intervals to maintain growth and vigor of tissue cultured plantleta as mother plants for propagation in insect-proof greenhouse. And as a labor saving method, the production efficiency of plug trays for rapid propagation of stem cuttings as a source of planting materials was likewise evaluated. Results showed that plants grown in medium B supplied with 0.5 and 1.0 strength of MS nutrients had high growth rate, and 20-day cutting interval was the best. 72-plug tray was better than 128-plug. Secondly, it was to develop a technique for the production of first-generation seed roots using hydroponics cultivation system. The yield of virus-free plants propagated in the non-insect proof and open-field cultivation was 2,402 kg/10a, 6% higher than those in the insect-proof cultivation, and the rate of virus re-infection was 18% higher compared to 3.3% with insect-proof cultivation. Lastly, it was to investigate the growth performance of virus free plants in farmers' field. Differences were existed in the yield depending on the variety used, but virus free plants showed an increase of $6{\sim}24%$ over virus infected plants.
Among the plant specimens requested from agricultural actual places of farmers, Agency of agricultural extension services and so forth for the diagnosis of plant virus diseases in 2009, the rate of crop types was 87.5% for vegetables, 4.0% for upland crops and 3.5% for orchids. In vegetables, the crops damaged severely by viral diseases were red pepper and tomato by the infection rate of 51.6% and 26.5%, orderly. Virus species occurring vegetables were 19 and the economically important viruses were Cucumber mosaic virus (CMV), Tomato spotted wilt virus (TSWV), Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), Pepper mild mottle virus (PMMoV) with the infection rate of 33.2%, 16.9%, 16.1% and 7.4%, respectively. Rice stripe virus (RSV) occurred at the whole areas of west coast in Korea in 2009, and its incidence was 14.2% mainly on the susceptible cultivars and yield loss was estimated up to 50%. TYLCV was spread at 34 areas of Si and/or Gun, 22 areas in 2009 and 12 in 2008. Distribution of TSWV was expanded newly in 6 areas of Si and/or Gun including Gangryung, Gangwondo in 2009, and its occurrence areas were 23 Si and/or Gun after first incidence at Anyang area in 2004. Tomato bushy stunt virus (TBSV) was incited newly at Gimcheon area in 2009 with the infection rate of 65.2%, and its soil transmission rate was 55.0% in average.
Serum samples from 123 males and 123 females collected by age in 1996 were analyzed for antibodies against surface antigen of Hepatitis B virus and C22-3, C200 antigens of Hepatitis C virus. Sera from the children under the age of 10 showed 30% seropositivity to the surface antigen of Hepatitis B virus, 33.3% in $10{\sim}19$ year group, 20% in $20{\sim}29$ year group, 17.6% in $30{\sim}39$ year group, 3.3% in $40{\sim}49$ year group, 5.9% in $50{\sim}59$ year group, 8,3% in $60{\sim}69$ year group, 2.9% in $70{\sim}79$ year group, but antibody could not found in $80{\sim}86$ year group. 12 out of 123 male sera were positive, 19 out of 123 female sera were positive and overall rate of positivity of antibody against surface antigen of Hepatitis B virus was 12.6%. Serum samples from peoples under the age of 30 had not antibody against C22-3, C200 antigens of Hepatitis C virus. The positivity rate was 2.9% in $30{\sim}39$ year group. 5 out of 30 sera from $40{\sim}49$ year age group were positive, and 3 positive sera showed extremely high titer (1:524,288) but the titers of two remaining sera were 1:32, 1:8,192 respectively. 5.9% was positive in $50{\sim}59$ year group, 8.3% in $60{\sim}69$ year group, 11.8% in $70{\sim}79$ year group but all negative in $80{\sim}86$ year group 6 out of 123 male sera were positive (4.9%), 9 out of 123 female sera were positive (7.3%). Overall rate of positivity of antibody against C22-3, C200 antigen of Hepatitis C virus was 6.1 %. None out of 246 sera had both antibodies against Hepatitis B virus and Hepatitis C virus.
Potato (Solanum tuberosum) is one of the most important food crops worldwide and yields of potato can be affected by virus infection. While more than 40 viruses have been found in potato, only nine viruses (potato leafroll virus, potato viruses A, M, S, V, X and Y, potato moptop virus and tobacco rattle virus) and one viroid (potato spindle tuber viroid) have a significant economic impact on potato, worldwide. This review describes the geographical distribution of the most important viruses infecting potato and the genes for resistance or tolerance that have been identified against these various infectious agents. In some cases such resistance genes have been found only in other Solanum species. Few genes for resistance to the vectors of these viruses have been obtained and even fewer have been deployed successfully. However, transgenic resistance in potato has been achieved against seven of these disease agents.
Tibet orbivirus (TIBOV) was identified as a novel orbivirus in 2014. Antibodies against TIBOV were detected in cattle, Asian buffalo, and goats, while all the sequenced TIBOV strains were isolated from mosquitos and Culicoides. The known TIBOV strains have been classified into four putative serotypes. In this study, two TIBOV strains isolated from Culicoides spp. in Shizong County of Yunnan Province, China, were fully sequenced. The phylogenetic analysis of outer capsid protein 2 (VP2) indicated that these two viral strains belong to two novel putative serotypes of TIBOV. The updated putative serotypes may help in an investigation of the distribution and virulence of TIBOV.
Based on the geographic range and distribution of its rodent reservoir host, the European common vole (Microtus arvalis), Tula virus is likely to be widespread throughout Eurasia. Tula virus-infected voles have been captured in Central Russia, Austria, Czech and Slovak Republics, and the former Yugoslavia. Although serologic evidence for Hantaan (HTN) or Seoul (SEO) virus infection can be found in the vast majority of the more than 300 cases of hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) occurring annually in Korea, approximately 4% of Korean patients with HFRS show a more than 4-fold higher antibody titer to Puumala (PUU) virus than to HTN or SEO virus by double-sandwich IgM ELISA, suggesting the existence of pathogenic Puumala-related hantaviruses in Korea. To further define the geographic distribution and genetic diversity of Tula virus in Eurasia and to investigate the existence of previously unrecognized Microtus-borne hantavirus in Korea, arvicolid rodents were captured in Lodz, Poland in 1995 and in Yunchon-kun, Kyungki-do during April to May, 1998. In addition, sera from 18 Korean HFRS patients who showed higher (or the same) antibody titer to Tula virus than HTN and SEO viruses were examined for hantavirus RNA by RT-PCR. Hantaviral sequences were not detected in any of the 18 patients or in 35 reed voles (Microtus fortis) in Korea. Alignment and comparison of a 208-nucleotide region of the S segment, amplified from lung tissues of two hantavirus-seropositive Marvalis captured in Poland, revealed $80.8{\sim}83.2%$ sequence similarity, respectively, with Tula virus strains from Central Russia and the Czech and Slovak Republics. Phylogenetic analysis indicated that the newfound Tula virus strains from Poland were closely related to other Tula hantaviruses from Eurasia.
Arthropod-borne viruses (Arboviruses) are transmitted by arthropods such as Culicoides biting midges and cause abortion, stillbirth, and congenital malformation in ruminants, apparently leading to economic losses to farmers. To monitor the distribution of Culicoides and to determine their relationship with different environmental conditions (temperature, humidity, wind speed, and altitude of the farms) on 5 cattle farms, Culicoides were collected during summer season (May-September) in 2016 and 2017, and analyzed for identification of species and detection of arboviruses. About 35% of the Culicoides were collected in July and the collection rate increased with increase in temperature and humidity. The higher altitude where the farms were located, the more Culicoides were collected on inside than outside. In antigen test of Culicoides against 5 arboviruses, only Chuzan virus (CHUV) (2.63%) was detected in 2016. The Akabane virus (AKAV), CHUV, Ibaraki virus and Bovine ephemeral fever virus (BEFV) had a positive rate of less than 1.8% in 2017. In antigen test of bovine whole blood, AKAV (12.96%) and BEFV (0.96%) were positive in only one of the farms. As a result of serum neutralization test, antibodies against AKAV were generally measured in all the farms. These results suggest that vaccination before the season in which the Culicoides are active is probably best to prevent arbovirus infections.
Hantaviruses are distributed in rodent population world-widely even in geographical areas where hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) has not been reported. Various species of Family Muridae and Arvicolidae serve as the natural reservoirs of hantaviruses. Hantaan virus, Seoul virus, Puumala virus, Prospect HII virus, Sin Nombre virus and New York virus are members of genus Hantavirus and isolated from lungs of A. agrarius, R. norvegicus, C. glareolus, M. pennsylvanicus, P. maniculatus and P. leucopus respectively. This experiment was intended to find the distribution of hantavirus infection among wild rodents and isolate the hantavirus from lung tissue of seropositve Apodemus peninsulae, and compared the nucleotide and amino acid sequences with prototype of hantaan virus 76-118 strain. Hantaviral sequences were amplified from lung tissues of A. peninsulae by reverse-transcriptase polymerase chain reaction. Alignment and comparison of the 324 nucleotide of G2 region of M-genomic segment diverged 4.6% and 0% at the nucleotide and amino acid levels, and complete N protein-coding region of S-genomic segment diverged 3.7% and 1.4% nucleotide and amino acid levels, respectively. This is the report to spill-over on the hantaan virus from A. agrarius to A. peninsulae in Korea.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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