• 제목/요약/키워드: VirTEX

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Mtatioal Analysis of the Role of vir-box in the Expression of the virE Gene

  • Han, Seong-Su;Sim, Woong-Seop
    • Journal of Microbiology
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    • 제37권3호
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    • pp.175-179
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    • 1999
  • To elucidate the role of vir-box in the expression of the virE gene, the vir-box was modified by site-directed mutagenesis and tested for ${\beta}$-galactosidase activities. A, C, T T, A, C substitutions at -62, -63, and -65 positions, destroying the 5'-region of the vir-box and A T at position -55, destroying the 3'-region of the vir-box respectively, showed only 17% promoter activity. When the vir-box was modified to contain perfect dyad symmetry structure (DSR) by the substitutions T, G A, T at -60 an d-61 positions, ${\beta}$-glactosidase activity increased 302%. These results indicate that the 5' and 3'-region of vir-box as well as the imperfect DSR of the vir-box itself may play a very important role in the regulation of virE gene expression.

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Mutational Analysis of the Region between vir Box and -35 Sequence in virE Promoter of pTiA6

  • Woong Seop Sim
    • Journal of Plant Biology
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    • 제38권3호
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    • pp.259-266
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    • 1995
  • To investigate how the dyad symmetry region (DSR) and the distance between vir box and -35 sequence of the virE promoter plays a role in virE gene expression, two mutants were constructed by base substitution and insertional mutagenesis. The base substitutional mutation, a AAlongrightarrowCG substitution at positions -39 and -40 on the DSR, showed the level of $\beta$-galactosidase activity approximately 91% of the wild type virE promoter activity. Therefore, the native structure of the DSR seems to be not essential for virE expression. The insertional mutation, constructed by inserting 8 bp ClaI linker between -49 and -50, displayed the $\beta$-galactosidase activity at 12% of the native virE promoter activity. However, this striking reduction appears to be not caused by destruction of the native DSR structure, but by shifting the vir box far from putative -35 sequence.

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Diversity of vir Genes in Plasmodium vivax from Endemic Regions in the Republic of Korea: an Initial Evaluation

  • Son, Ui-han;Dinzouna-Boutamba, Sylvatrie-Danne;Lee, Sanghyun;Yun, Hae Soo;Kim, Jung-Yeon;Joo, So-Young;Jeong, Sookwan;Rhee, Man Hee;Hong, Yeonchul;Chung, Dong-Il;Kwak, Dongmi;Goo, Youn-Kyoung
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제55권2호
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    • pp.149-158
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    • 2017
  • Variant surface antigens (VSAs) encoded by pir families are considered to be the key proteins used by many Plasmodium spp. to escape the host immune system by antigenic variation. This attribute of VSAs is a critical issue in the development of a novel vaccine. In this regard, a population genetic study of vir genes from Plasmodium vivax was performed in the Republic of Korea (ROK). Eighty-five venous blood samples and 4 of the vir genes, namely vir 27, vir 21, vir 12, and vir 4, were selected for study. The number of segregating sites (S), number of haplotypes (H), haplotype diversity (Hd), DNA diversity (${\pi}$ and ${\Theta}_w$), and Tajima's D test value were conducted. Phylogenetic trees of each gene were constructed. The vir 21 (S=143, H=22, Hd=0.827) was the most genetically diverse gene, and the vir 4 (S=6, H=4, Hd=0.556) was the opposite one. Tajima's D values for vir 27 (1.08530, P>0.1), vir 12 (2.89007, P<0.01), and vir 21 (0.40782, P>0.1) were positive, and that of vir 4 (-1.32162, P>0.1) was negative. All phylogenetic trees showed 2 clades with no particular branching according to the geographical differences and cluster. This study is the first survey on the vir genes in ROK, providing information on the genetic level. The sample sequences from vir 4 showed a clear difference to the Sal-1 reference gene sequence, whereas they were very similar to those from Indian isolates.

수중채널 시뮬레이터를 활용한 수중음향통신 시스템 성능 분석 (Performance Analysis of Underwater Acoustic Communication Systems Using Underwater Channel Simulation Tool)

  • 오세현;김현수;김재수;조정홍;정재학;송희천
    • 한국음향학회지
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    • 제31권6호
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    • pp.373-383
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    • 2012
  • 수중음향통신 시스템의 성능은 다중경로 전달특성에 의해 발생하는 인접심볼간 간섭(ISI, Inter-Symbol Interference)과 도플러 편이(Doppler shift)에 영향을 받는다. 그러므로 해양도파관 환경의 수치실험은 다중경로에 의해 발생하는 시간 확산과 송 수신기의 움직임으로 발생하는 도플러 편이로 인한 시변동성을 고려해야 한다. 본 논문에서는 해양도파관 환경의 변동성을 고려한 가상의 신호 생성 시뮬레이터인 VirTEX(Virtual Time series EX-periment)를 활용[10]하여 시뮬레이터 기반 수중음향통신 시스템의 성능을 검증하였다. 수중음향통신 시스템 성능 검증을 위해 해상실험에서 획득한 실측데이터와 VirTEX 기반 수치모의 된 데이터의 채널응답분석 및 통신성능 분석을 수행한다. 해상실험 및 수치모의실험을 통해 수신된 탐침신호의 채널 임펄스 응답(channel impulse response) 분석결과 다중경로 개수와 깊이에 따른 채널응답의 변화 경향이 매우 유사함을 확인하였으며, 해상실험 및 수치모의실험을 통해 수신된 통신신호의 BER(Bit Error Rate)을 통하여 VirTEX 시뮬레이터를 활용한 수중음향통신 시스템의 통신성능을 확인하였다.

TRMM-PR/VIRS와 GMS 자료를 이용한 강수량 추정에 관한 연구 (Rainfall Estimation Using TRMM-PR/VIRS and GMS Data)

  • 김영섭;박경원
    • 대한원격탐사학회지
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    • 제18권6호
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    • pp.319-326
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    • 2002
  • TRMM-PR/VIRS와 GMS 자료를 이용하여 강수량을 추정하였다. 강수량 추정의 검증에는 기상청의 AWS 관측자료를 이용하였다. 본 연구의 강수량 추정 절차는 다음과 같다: 1) TRMM-PR 자료와 AWS 자료를 이용하여 Z-R 관계식을 도출한다. 2) Z-R 관계식에 의한 추정치와 VIRS의 TBB 자료를 이용하여 강수량 추정식을 도출한다. 3) 새롭게 도출된 식의 VIRS의 TBB 대신 GMS의 TBB 자료를 대입하여 광역의 강수량을 추정한다. Z-R 관계식은 Z=303R$^{0.72}$로 나타났고 상관계수는 0.57이었다. 새롭게 제시된 강수량 추정식에 의한 결과의 상관계수는 0.67, RMSE는 17mm/hr로 나타났다. 강수량 추정식은 집중호우 때 과소추정하는 경향을 보였다.

중장거리 다중송신채널 환경에서 수중음향통신 시뮬레이터 성능 분석 및 검증 (Performance analysis and verification of underwater acoustic communication simulator in medium long-range multiuser environment)

  • 박희진;김동현;김재수;송희천;한주영
    • 한국음향학회지
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    • 제37권6호
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    • pp.451-456
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    • 2018
  • 최근 장거리 수중음향통신 연구가 활발하게 진행되고 있다. 장거리 수중음향통신 연구를 위한 해상실험은 해양환경의 영향을 크게 받고 높은 비용과 많은 시간이 소요된다. 따라서 장거리 환경에서 수중음향통신 시스템의 성능을 예측하고 검증하기 위한 시뮬레이터에 대한 연구가 필요하다. 본 논문에서는 장거리 수중음향통신 시뮬레이터의 개발을 목적으로 중장거리 다중송신환경에서 수중음향통신 시뮬레이터로서 VirTEX(Virtual Time series EXperiment)의 성능을 분석하고, 해상 실험 결과와 비교 검증하였다. 송신 신호는 탐침을 위한 Chirp신호와 16QAM 방식으로 변조된 통신 신호를 사용하였다. VirTEX를 통해 수신 신호를 모의하고 다중송신환경에 의해 발생하는 채널 간 간섭을 적응 수동형 시역전을 이용하여 보상하여 통신 성능을 분석하였다. 또한 2005년 7월 이탈리아의 Elba island 북쪽 해역에서 수행한 FAF05(Focused Acoustic Field 2005) 실험 데이터와 비교하여 이를 검증하였다.

근접쌍성 AG Virginis의 분광학적 연구 (A SPECTROSCOPIC STUDY OF THE CLOSE BINARY AG VIRGINIS)

  • 김호일;이충욱;이재우;손미림
    • Journal of Astronomy and Space Sciences
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    • 제22권4호
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    • pp.353-362
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    • 2005
  • 2004년 3월 25일부터 4일 동안 보현산천문대의 1.8m 망원경과 BOES(Bohyunsan Optical Echelle Spectrograph)를 사용하여 AG Vir의 고분산 분광관측을 수행하고, 전위상에 걸쳐 총 59개의 스펙트럼을 얻었다. 쌍성계의 시선속도를 얻기 위하여, 교차상관함수(CCF; Cross-Correlation Function) 와 선폭증가함수(BF; Broadening Function)를 관측된 스펙트럼의 분석에 사용하였다. 이때, 교차상관함수 분석을 통하여 주성의 시선속도만을 얻을수 있었던 반면, 선폭증가함수 분석을 통하여 두 성분별의 시선속도를 모두 구할 수 있었다. 우리는 분광 궤도요소($K_1=90.5km/s$$K_2=258.8km/s$)와 Bell, Rainger, & Hilditch(1990)의 측광학적 해로부터 AG Vir의 절대 물리량을 다음과 같이 산출하였다. 즉, $M_1:1.99M_\bigodot,\;M_2:0.62M_\bigodot,\; R_1=2.21R_\bigodot,\;R_2=1.36R_\bigodot,\;L_1=13.17L_\bigodot$, 그리고 $L_2=3.47L_\bigodot$. 우리가 구한 각 성분별의 질량과 반경은 Bell, Rainger, & Hilditch(1990)의 값보다 더 크고, 광도 또한 더 밝다. 발표된 모든 시선속도곡선을 재분석한 결과, AG Vir의 시스템 속도는 약 ${\pm}8km/s$의 비교적 큰 편차를 나타낸다. 그러나 이 변화가 Qian(2001)이 제안한 제3 천체의 광시간 효과에 의해 일어난다고 단정 지을 수 있는 근거를 찾을 수는 없었다.

2008-2009년 충북지역 벼 줄무늬잎마름병 발생 요인 분석 (Analysis of the Factors Involved in the Occurrence of Rice Stripe virus in Chungcheongbukdo in 2008 and 2009)

  • 강효중;안기수;한종우;정경헌;박세정;지재준;김정수
    • 식물병연구
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    • 제16권2호
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    • pp.109-114
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    • 2010
  • 충북지역의 벼 줄무늬잎마름병 발생 요인을 분석하기 위하여 2008년과 2009년 충북도내 청원, 진천, 보은 등 3개 지역에서 월동 애멸구 보독충율 및 애멸구 밀도, 자연 기주 식물의 바이러스 감염율, 농가 포장에서의 벼 줄무늬잎마름병 발생율을 조사하였다. 월동 애멸구의 보독충율은 2008년에 0%, 2009년에는 1.1%로 나타났다. 2009년 6월 상순 채집된 시료의 보독충율은 진천 1.4%, 보은 4.2%로 월동 애멸구의 보독충율보다 높게 나타났으며 이는 2009년 중국에서 비래한 애멸구 성충 집단과 관련이 있는 것으로 추정된다. 월동 애멸구 밀도는 2008년에는 청원 3.8, 진천 7.5, 보은 20.8마리/$m^2$, 2009년에는 청원 8.4, 진천 13.1, 보은 14.6마리/$m^2$로 나타났다. 2009년 2차조사(5월 상순)와 3차 조사(6월 상순)에서도 매우 낮은 밀도를 보였으나 3차 조사 시기에 일부 지점에서는 성충 태로 높은 밀도를 나타냈으며 이들은 국내에서 월동한 애멸구가 아닌 2009년 중국에서 비래한 애멸구 집단과 관련이 있는 것으로 추정된다. 자연 기주 식물에서 RSV가 감염된 시료는 없었다. 따라서 이러한 결과로부터 월동애멸구의 낮은 보독충율과 밀도, 자연 기주 식물의 낮은 감염율 및 적절한 재배관리 등 복합적 요인으로 인하여 지금까지 충북지역에서 RSV 발생이 낮았던 것으로 사료된다.

질량비가 작은 접촉쌍성 GR Vir

  • 오규동;김천휘
    • 한국우주과학회:학술대회논문집(한국우주과학회보)
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    • 한국우주과학회 2003년도 한국우주과학회보 제12권2호
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    • pp.21-21
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    • 2003
  • 접촉쌍성 가운데 질량비(q=m$_2$/m$_1$)가 0.2이하로 매우 작은 접촉쌍성은 그리 흔한 접촉 쌍성이 아니다. 현재까지 이러한 질량비가 작은 접촉쌍성들이 30개 정도가 알려져 있으며 이 가운데도 절대량이 잘 알려진 별들은 14개 정도에 불과하다. 이러한 원인은 이 별들에 대한 분광관측이 이루어져 있지 않기 때문이다. 따라서 이러한 접촉쌍성의 진화 상태를 보다 확실하게 이해하기 위하여 이러한 별들의 절대량을 얻는 것이 요구된다. 이번 연구에서는 Cereda at al.(1988)에 의하여 측광관측(B & V) 결과만 이루어진 후 궤도 요소가 알려져 있지 않은 GR Vir의 관측 자료와 함께 최근 Rucinski & Lu(1999)가 발표된 분광관측 결과를 이용하여 WD 프로그램을 적용하여 이 별의 궤도요소와 함께 절대량을 얻고 이로부터 이 별의 진화 상태를 조사하였다.

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The Spin-Orbit Alignment of Dark Matter Halo Pairs: Dependence on the Halo Mass and Environment

  • An, Sung-Ho;Yoon, Suk-Jin
    • 천문학회보
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    • 제44권1호
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    • pp.35.1-35.1
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    • 2019
  • We present a statistical analysis on the spin-orbit alignment of dark matter halo pairs in cosmological simulations. The alignment is defined as the angular concurrence between the halo spin vector (${\vec{S}}$) and the orbital angular momentum vector (${\vec{L}}$) of the major companion. We identify interacting halo pairs with the mass ratios from 1:1 to 1:3, with the halo masses of 10.8 < $Log(M_{halo}/M_{sun}$) < 13.0, and with the separations smaller than a sum of their virial radii ($R_{12}<R_{1,vir}+R_{2,vir}$). Based on the total energy ($E_{12}$), the pairs are classified into flybys ($E_{12}$ > 0) and mergers ($E_{12}{\leq}0$). By measuring the angle (${\theta}_{SL}$) between ${\vec{S}}$ and ${\vec{L}}$, we confirm a strong spin-orbit alignment signal such that the halo spin is preferentially aligned with the orbital angular momentum of the major companion. We find that the signal of the spin-orbit alignment for the flyby is weaker than that for the merger. We also find an unexpected excess signal of the spin-orbit alignment at $cos{\theta}_{SL}{\sim}0.25$. Both the strength of the spin-orbit alignment and the degree of the excess depend only on the environment. We conclude that the halo spin is determined by the accretion in a preferred direction set by the ambient environment.

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