• Title/Summary/Keyword: VAN

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Novel Vancomycin Resistance System in Streptomyces coelicolor

  • Hong, Hee-Jeon
    • 한국미생물학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물학회 2005년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea
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    • pp.143-147
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    • 2005
  • The non-pathogenic, non-glycopeptide-producing actinomycete Streptomyces coelicolor carries a cluster of seven genes (vanSRJKHAX) that confers inducible, high-level resistance to vancomycin. The van genes are organised into four transcription units, vanRS, vanJ, vanK and vanHAX, and these transcripts are induced by vancomycin in a vanR-dependent manner. vanHAX are orthologuous to genes found in vancomycin resistant enterococci that encode enzymes predicted to reprogramme peptidoglycan biosynthesis such that cell wall precursors terminate in D-Ala-D-Lac, rather than D-Ala-D-Ala. vanR and vanS encode a two-component signal transduction system that mediates transcriptional induction of the seven van genes. vanJ and vanK are novel genes that have no counterpart in previously characterised vancomycin-resistance clusters from pathogens. VanK is essential for vancomycin resistance in S. coelicolor and it is required for adding Gly branch to stem peptides terminating D-Ala-D-Lac. Because VanK can recognise D-Lac-containing precursors but the constitutively expressed femX enzyme, encoded elsewhere on the chromosome, cannot recognize D-Lac-containing precursors as a substrate, vancomycin-induced expression of VanHAX in a vanK mutant is lethal. Further, femX null mutants are viable in the presence of glycopeptide antibiotics but die in their absence. Bioassay using vanJp-neo fusion reporter system also showed that all identified inducers for van genes expression were glycopeptide antibiotics, but teicoplanin, a membrane-anchored glycopeptide, failed to act as an inducer.

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van Schooten의 연동장치에 대한 현대적 재해석 (A Modern Reinterpretation of the Linkages by Van Schooten)

  • 허남구
    • 한국수학교육학회지시리즈E:수학교육논문집
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    • 제37권3호
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    • pp.483-495
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    • 2023
  • 17세기 수학자 van Schooten(1657)은 저서 'Exercitationum mathematicarum'에서 포물선, 타원, 쌍곡선을 그리기 위한 연동장치를 제시하였다. van Schooten이 제시한 연동장치는 활동 중심 수학교육과 학교수학에서 수학사를 활용하기 위한 소재로 사용될 수 있다. 특히 학생들이 고등학교 교육과정에서 이차곡선을 조작하며 학습할 기회를 제공받지 못하고 있다는 점에서, van Schooten의 연동장치는 활동과 탐구 중심의 수학교육을 실현하는 데 도움을 줄 수 있다. 이를 위해 van Schooten의 연동장치를 동적 기하 환경에서 구현하는 방법을 제시하고, van Schooten의 연동장치를 이용하여 그린 도형의 자취가 포물선, 타원, 쌍곡선임을 증명하였다.

Rapid Detection of Vancomycin-resistance Enterococci by SYBR Green Real-time PCR

  • Yang, Byoung-Seon
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.64-67
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    • 2014
  • Vancomycin-resistant Enterococci (VRE) are a leading cause of a nosocomial infection. While seven glycopeptide resistance genotypes have been found in Enterococci, vanA and vanB are the most common resistance genotypes. Aims of this study were to detect antibiotic susceptibilities of 23 Enterococcus spp, which broke out in a university hospital by the disk diffusion test, to investigate specific genes of vanA and vanB by conventional and real-time PCR. PCR for vanA and vanB was performed on 23 Enterococci, all 23 were positive for vanA type. This study reports the validation of a simple and rapid VRE detection method that can be easily incorporated into the daily routine of a clinical laboratory. Early detection of VRE strains, including those with susceptibility to Vancomycin, is of paramount clinical importance, as it allows a rapid initiation of strict infection control practices as well as a therapeutic guidance for a confirmed infection. The real-time PCR method is a rapid technique to detect vanA in Enterococci. It is simple and reliable for the rapid characterization of VRE.

Simple and Rapid Detection of Vancomycin-Resistance Gene from Enterococci by Loop-Mediated Isothermal Amplification

  • Baek, Yun Hee;Hong, Seung Bok;Shin, Kyeong Seob
    • 대한의생명과학회지
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    • 제26권3호
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    • pp.149-156
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    • 2020
  • We developed a simple and rapid method for detecting vancomycin resistance genes, such as vanA and vanB, using loop-mediated isothermal amplification (LAMP). To identify not only vancomycin resistance genes, but also the genus Enterococcus, primers were designed for vanA, vanB, and 16S rRNA. Screening for vancomycin susceptibility in Enterococcus was performed using Etest (bioMérieux Inc). The results of the LAMP assay were compared to those of real-time RT-PCR. The optimal conditions for the LAMP assay were 65℃ for 60 min. The detection limits of the LAMP assay for vanA, and vanB were 2 × 102 copies/reaction. Compared to RT-PCR, the sensitivities and specificities of LAMP for 16S rRNA, vanA, and vanB were 100/100%, 100/100%, and 100/100%, respectively. The vanA genotype-vanB phenotype accounted for 57.5% (46/80) of the vancomycin-resistant Enterococci samples collected from 2016 to 2019. In conclusion, the LAMP assay developed in this study showed high sensitivity and specificity for vancomycin-resistant genes. Moreover, due to the simplicity and rapidity of the LAMP assay, its use can be very useful in clinical microbiology laboratories.

SOLO 분류법과 van Hiele의 기하학습 수준 이론의 관련성에 대한 고찰 (A Study on the Relation Between SOLO Taxonomy and van Hele Theory)

  • 류성림
    • 한국수학교육학회지시리즈A:수학교육
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    • 제39권2호
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    • pp.151-166
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    • 2000
  • The purpose of this study is to understand what two models of SOLO taxonomy and van Hiele theory suggest and find out what relation there is between the category system of the SOLO taxonomy and the thinking level of the van Hiele theory. The van Hiele theory describes in line of ranking level so that it may increase the teaching effects by putting together a class, which takes into consideration the students thoughts. The SOLO taxonomy focused on the response mode of the students rather than the thinking level or the developmental stage of them to pursuit the method that can describe the students understanding in depth quality-wise. Although the SOLO taxonomy and the van Hiele model seem to have different form and character from outside in terms of their goals, a closer examination reveals that the two stances have much in common and that the models are complementary. Although the van Hiele placed more focus on the thoughts, because the conclusion was based on the students responses, the van Hiele theory can be interpreted within the structure identified in the SOLO model. In this study, we have tried to understand how the response structure form the SOLO taxonomy and the thinking level of the van Hiele theory are related, based on the studies of Pegg and Davery1998). If you briefly look at them, there are following corresponding relation between the SOLO taxonomy and the van Hiele theory. a) The relational level(R) in iconic moe is van Hiele level 1. b) The multisturctural level(M$_2$) in the second cycle of concrete-symbolic mode is van Hiel level 2. c) The relation level(R$_2$) in the second cycle of concrete-symbolic mode is van Hiele level 3. d) The unistructural level(U$_2$) in the second cycle of formal mode is van Hiele level 4. e) The postformal mode is van Hiele levle 5. Though it would be difficult to conclude that these correspondences were perfectly done, if you look at their relation, you can see that the learning process of the students were not carried out uniformly. Therefore, by studying the students response structure, using the SOLO taxonomy, and identifying the learning cycle and understand the geometrical concept more in depth.

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주기적인 외력을 가진 Van der Pol 발진기에서의 비선형 거동 해석 (Analysis of Nonlinear Behavior in Fractional Van der Pol Equation with Periodic External Force)

  • 배영철
    • 한국전자통신학회논문지
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    • 제11권1호
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    • pp.87-92
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    • 2016
  • Van der Pol 발진기는 비선형 제동 현상을 가진 비보존 발진기로서 높은 진폭에서의 에너지는 소산적이며 (dissipative)이고 낮은 진폭들에서는 생성되는 구조를 가진다. 본 논문에서는 Van Der Pol 발진기 모델에서 다른 거동을 확인하기 위하여 주기적 외력을 인가하고 여기에서 파라미터 변화에 따라 어떻게 리미트 사이클이 변화하는지에 대한 패턴을 확인하고자 한다.

다중 중합효소 연쇄반응을 이용한 반코마이신 내성 장구균의 신속 검출 (Rapid Detection of Vancomycin Resistant Enterococci Using Multiplex Polymerase Chain Reactions)

  • 김종배;김근희;송혜원;박성언;엄용빈;박상욱;김양수;박수진
    • 대한의생명과학회지
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    • 제5권1호
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    • pp.95-100
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    • 1999
  • 일반적으로 임상검사실에서 vancomycin resistant enterococci (VRE)를 검출하는 일은 어렵고, 시간이 많이 들며, 검체처리 비용도 많이 든다. 따라서 본 실험은 임상검체에서 분리된 세균으로부터 VRE를 신속하게 확인하고, 진단하기 위한 방법으로서 다중 중합효소 연쇄반응을 확립하였다. 본 실험에 사용된 primer는 장구균에 특이 한 유전자인 vanA, vanB, vanC-1, vanC-2/3 각각의 염기서열을 기초로 primer를 제작하고, 다중 중합효소 연쇄 반응을 실시하여 임상검체로부터 분리된 VRE 유전자의 type및 분포율을 조사하고자 하였다. 국내에서 분리된 75주의 장구균을 대상으로 다중 중합효소 연쇄반응을 실시한 결과 36주의 분리균주에서 vancomycin에 대해 높은 저항성을 보이는 vanA 유전자를 가진 것으로 나타났다. 그리고 18주에서는 vancomycin에 낮은 저항성을 내성을 보이는 vanC-1 또는 vanC-2/3 유전자를 보유한 것으로 나타났다. 따라서 본 실험에서 확립한 다중 중합효소 연쇄 반응 기법은 신속한 VRE 진단 방법으로 이용할 수 있을 것이다.

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제도.기술적용 현실화 시급

  • 한국정보통신산업협회
    • 정보화사회
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    • 통권3호
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    • pp.44-47
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    • 1988
  • 지난 해 5월 정부가 그룹 VAN을 허용함에 따라 그룹사 정보처리 네트웍화의 길이 열렸다. 이로써 우리 나라에도 민간 VAN이 시작되었다. 민간 VAN은 이미 선진 각국의 주요 기업에 의해 산업화되어 급성장하고 있고, 국내에서도 근래들어 그룹사들에 의해 경영정보 공동활용과 새로운 유망 사업 분야로서 구상되기에 이르렀다. 이렇게 도입 욕구가 팽배된 적절한 시기에 민간 VAN이 허용됨에 따라 럭키금성을 비롯한 6개 그룹사가 이에 참여 하고 있는 가운데 제도상.기술상의 제반 문제점들이 도출되고 있다. 그룹 VAN 진출 기업들을 회원으로 하고 있는 본 협회는 국내 민간 VAN 사업의 활성화를 위하여 구랍 28일 문제점들의 시정을 정책 당국과 공중통신사업자, 그리고 진출기업에 건의 했다. 그 내용을 전개한다.

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empe 압력셀에서 1-단계 유출법을 이용한 van Genchten모형과 Campbell모형의 불포화수리전도도 추정 검증 (Unsaturated Hydraulic Conductivity Functions of van Genuchten's and Campbell's models Tested by One-step Outflow Method through Tempe Pressure Cell)

  • 한경화;노희명;조현준;김이열;황선웅;조희래;송관철
    • 한국토양비료학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.273-278
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    • 2008
  • 이 연구는 Tempe 압력셀에서 1-단계 유출법을 이용하여 불포화수리전도도 추정모형인 van Genchten 모형과 Campbell 모형을 비교하고자 수행하였다. 토양 코아(컬럼)는 서울대학교 농업생명과학대학 부속 사과 과수원에 위치한 송정통 (the fine loamy, mesic family of Typic Hapludults) 의 Ap1, B1, C 층에서 채취하였다. 각 층위의 컬럼들에 대해 포화수리전도도를 측정하고 Tempe 압력셀에서 수분보유곡선을 측정한 후 최소좌승법으로 모형의 변수를 도출하였다. 수분보유곡선에서 모형과 측정치는 잘 적합하였고 포화근처에서 Campbell 모형의 적합도가 van Genchten 모형보다 약간 더 좋았다. Campbell 모형의 불포화수리전도도가 van Genchten 모형보다 높게 추정되었으며 1-단계 유출법의 불포화수리전도도는 C층에서 van Genchten 모형과 잘 적합하였고 Ap1층, B1층에서는 두 모형의 중간에서 van Genchten에 약간 더 가까웠다. 따라서 불포화수리전도도 측정범위-10~-75kPa에서 van Genuchten 모형이 실측치와 더 적합하다 할 수 있었고, 포화근처에서는 수분보유곡선과의 적합도가 Campbell 모형이 더 높은 것으로 보아 상대적으로 수리전도도함수의 정확도가 높을 것으로 추측할 수 있었다.

장구균의 vancomycin 내성 유전자와 종 특이유전자의 검출을 위한 Multiplex polymerase chain reaction 개발 (Development of multiplex polymerase chain reaction for the detection of vancomycin resistant genotypes and Enterococcus Sp.-specific genes)

  • 조윤상;이희수;김종만;안종삼;류판동;박용호;유한상;이문한
    • 대한수의학회지
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    • 제43권1호
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    • pp.103-112
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    • 2003
  • A multiplex PCR assay, which allows simultaneous detection of vancomycin resistant genotypes and Enterococcus species-specific genes, was developed. Vancomycin resistant enterococci (VRE) from chickens and humans could be detected for vanA, vanB, vanC-1, vanC-2, $ddl_{E.faecium}$ and $ddl_{E.faecalis}$ by multiplex PCR. Eight isolates of VRE from humans (n=11) had $ddl_{E.faecium}$ and vanA, and 3 isolates of the VRE had $ddl_{E.faecium}$ and vanB. One isolate of VRE from chickens (n=6) had $ddl_{E.faecium}$ and vanA, and 5 isolates of the VRE had only vanA. E. faecium, E. faecalis, E. gallinarum and E. casseliflavus were also confirmed for the species-specific gene by multiplex PCR. This multiplex PCR could detect E. faecium, E. faecalis, E. gallinarum, E. casseliflavus, vanA, vanB, vanC-1 and vanC-2, simultaneously. The PCR assay established in the present study can be an alternative to time-consuming biochemical tests and antibiotic susceptibility tests of Enterococcus spp.