• 식물병연구
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• 제12권2호
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• pp.139-143
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• 2006

VC/RT-PCR은 바이러스의 단백질과 PCR 튜브의 재질적 특성을 이용하여 바이러스 이병주의 즙액으로부터 핵산을 지니고 있는 바이러스를 polypropylene에 부착시키고 그 외 PCR 활성을 저해하는 식물 즙액은 PBST로 제거해 주므로써 정확하고 깨끗한 바이러스 진단이 가능하다. 이 방법은 바이러스에 대한 항혈청이 전혀 필요 없으며 포장 시료를 직접 이용해 30 분 이내에 바이러스 핵산을 획득할 수 있어 바이러스 진단이 빠르고 간편하며 경제적이고 감도 높은 실용적인 방법이다. TSWV 에 대한 VC/RT-PCR을 위해 다양한 마쇄 완충액을 시험한 결과 0.5%의 Sodium sulphite를 포함한 0.01M Potassium phosphate (pH 7.0)가 가장 안정적이었으며 VC/RT-PCR을 이용하여 TSWV에 대한 최적의 처리 과정을 확립하였다. TSWV에 최적인 완충액에 마쇄한 바이러스 감염 잎의 조즙액을 이용한 한계 희석 농도는 $10^{-5}$으로 높은 감도를 보여 낮은 농도의 바이러스를 보유한 기주로부터 정확하 게 바이러스를 감지해 낼 수 있게 되었다. 두가지 이상의 바이러스에 감염된 기주로부터 두 가지 이상의 프라이머를 이용해 바이러스를 감지해 내는 다중 진단을 위한 실험 중 식물체의 종류와 바이러스의 Primer의 종류가 진단결과의 정확도에 큰 영향을 미치며 이러한 결과는 식물체 즙액을 바로 이용하는 VC/RT-PCR 방법은 물론 식물체로부터 Total RNA를 따로 분리하여 RT-PCR을 이용한 결과에서도 동일하게 나타났다. 따라서 편리하고 실용 적인 VC/RT-PCR법의 정확성을 최대화시키기 위해서는 다중 진단을 저해하는 식물체적 원인과 Primer 사이의 간섭 현상에 대한 연구가 더 진행될 것이며 이러한 원인을 충분히 제거해 줄 수 있는 마쇄 완충액을 개발하고 프라이머 제작을 더욱 신중히 해야 할 것이다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제17권11호
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• pp.1765-1771
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• 2007

A polymerase chain reaction (PCR)-based method was developed to detect the DNA of Ralstonia solanacearum, the causal agent of bacterial wilt in various crop plants. One pair of primers (RALSF and RALSR), designed using cytochrome c1 signal peptide sequences specific to R. solanacearum, produced a PCR product of 932 bp from 13 isolates of R. solanacearum from several countries. The primer specificity was then tested using DNA from 21 isolates of Ralstonia, Pseudomonas, Burkholderia, Xanthomonas, and Fusarium oxysporum f. sp. dianthi. The specificity of the cytochrome c1 signal peptide sequences in R. solanacearum was further confirmed by a DNA-dot blot analysis. Moreover, the primer pair was able to detect the pathogen in artificially inoculated soil and tomato plants. Therefore, the present results indicate that the primer pair can be effectively used for the detection of R. solanacearum in soil and host plants.

• 드라이브 ㆍ 컨트롤
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• 제21권2호
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• pp.65-71
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• 2024

In this study, we suggested a key-point detection method for robot harvesting of oriental melon. Our suggested method could be used to detect the detachment part and major composition of oriental melon. We defined four points (harvesting point, calyx, center, bottom) based on tomato with characteristics similar to those of oriental melon. The evaluation of estimated key-points was conducted by pixel error and PDK (percentage of detected key-point) index. Results showed that the average pixel error was 18.26 ± 16.62 for the x coordinate and 17.74 ± 18.07 for the y coordinate. Considering the resolution of raw images, these pixel errors were not expected to have a serious impact. The PDK score was found to be 89.5% PDK@0.5 on average. It was possible to estimate oriental melon specific key-point. As a result of this research, we believe that the proposed method can contribute to the application of harvesting robot system.

• 식물병연구
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• 제27권2호
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• pp.84-90
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• 2021

2019년 6월 충남 논산의 당귀 재배 농가에서 원형반점, 괴사반점, 황화, 모자이크 등의 증상을 보이는 당귀잎을 채집하였고, 이들 시료에 대한 바이러스 감염 여부를 확인하기 위하여 전자현미경 검경과 감염우려가 있는 바이러스 3종(cucumber mosaic virus, broad bean wilt virus 2, tomato spotted wilt virus [TSWV])에 대해 reverse transcription polymerase chain reaction 진단을 수행한 결과 TSWV에 대해 양성반응을 보였다. 당귀 TSWV의 생물학적 특성을 구명하기 위해 순수분리하여 5과 28종의 지표식물과 일당귀에 즙액접종하여 기주범위와 병원성을 확인하였다. TSWV의 3 segment (L, M, S)의 전체 염기서열을 결정하고 기존에 보고된 TSWV 분리주와 계통분석을 한 결과, 당귀 TSWV 분리주(NS-AG-28)는 논산지역의 머위 분리주(TSWV-NS-BB20)와 가장 유사한 것으로 나타났다. TSWV는 넓은 기주범위를 가지고 있고 특히 고추, 토마토 등 가지과 작물에 큰 피해를 주고 있기 때문에, 당귀가 TSWV의 중간기주로서 작용하지 않도록 주의하고, 당귀의 바이러스병 피해를 예방하기 위하여 지속적인 모니터링이 요구된다.

• 농약과학회지
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• 제7권4호
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• pp.264-270
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• 2003

토마토 양액재배시 심각한 피해를 주는 역병균에 대한 간편하고 효과적인 방제방법을 확립하기 위하여 역병 방제 효과가 높은 metalaxyl copper oxychloride 수화제 (15% metalaxyl+35% copper oxychloride) 및 dimethomorph dithianon 수화제 (8% dimethomorph+30% dithianon) 2종에 대하여 유묘검정을 통하여 약제 처리농도를 12,500배, 25,000배, 50,000배로 설정하였다. 토마토를 암면에 정식하고 40일 후에 역병균을 접종하였으며, 접종 5일 후 시험약제를 설정된 농도수준으로 양액탱크에서 혼합한 양액을 토마토 뿌리에 공급하였다. 약제처리 후 metalaxyl copper oxychloride 수화제는 처리당일, 1, 3, 7, 15일 간격으로 양액중 metalaxyl의 농도를 조사한 결과 25,000배와 50,000배 처리구의 농도는 15일 후에도 처리당일과 비슷한 농도수준을 유지하였다. Dimethomorph dithianon 수화제의 처리구중 dimethomorph는 모든 처리구에서 metalaxyl과 유사한 경향을 보였지만, dithianon은 처리후 농도가 급격히 감소하는 경향을 보였다. Metalaxyl copper oxychloride 수화제를 처리한 토마토중 metalaxyl의 잔류량은 1회 처리구를 제외한 모든 처리구에서 $0.02\sim0.04$ mg/kg 수준으로 검출되었다. Dimethomorph dithianon 수화제 처리구의 토마토중 dimethomorph는 12,500배 처리구 $0.012\sim0.021$ mg/kg, 25,000배 처리구는 $0.001\sim0.006$ mg/kg, 50,00베 처리구 $0.001\sim0.003$ mg/kg이 각각 검출되었으나 dithianon은 12,500배 3회 처리구에서 0.005, 50,000배 2회 처리구에서 0.003 mg/kg이 검출되었다. 역병 방제효과시험에서 모든 처리구에서 높은 방제가를 나타냈으나, 12,500배 처리구에서는 모두 약해가 관찰되었다. 따라서, 양액재배 토마토의 역병 방제를 위해서는 25,000배와 50,000배로 조제된 metalaxyl copper oxychloride 50% 수화제는 15일 간격 $1\sim3$회, dimethomorph dithianon 38% 수화제는 10일 간격 $1\sim3$회 혼합처리하는 것이 역병 방제효과와 생산물의 안전성 측면에서도 만족스러운 것으로 확인되었다.

• 한국식품과학회지
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• 제41권2호
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• pp.210-214
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• 2009

APC 지정시설과 APC 미지정시설의 선별대와 작업자, 공중낙하균을 대상으로 하여 미생물 오염도를 비교해 보았다. 그 결과 선별대의 경우 일반세균과 대장균군 모두 높은 수준으로 오염되어 있었고 S. aureus와 Salmonella도 검출되었다. 특히 모든 시료에서 S. aureus 의 오염이 매우 높아 제품으로의 직접적인 교차 오염이 우려되었다. 이와 같이 APC 지정시설과 APC 미지정시설간의 미생물 오염도 차이가 거의 없는 것은 기존의 APC 시설이 미생물학적 개념이 없이 단순히 저장의 용도로만 설치되었기 때문인 것으로 생각된다. 하지만 GAP제도를 도입 운영하기 위하여 APC 시설은 단순한 농산물 저장의 기능뿐만 아니라 2차 오염이 발생할 수 없는 구조를 갖추어 위생적인 선별 및 유통이 이루어져야 하고, GAP 운영의 연장선에서 관리 운영해야 할 것 이다. 아울러 일정한 기간마다 시설에 대한 위해요소 분석을 하여 APC시설의 미생물학적 측면에서의 적절한 유지, 보관 여부를 모니터링 하고, 그 결과를 문서화 하여야 할 것이다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제27권1호
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• pp.93-97
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• 2011

For quarantine purpose, we selected five plant RNA viruses including Cucumber vein yellowing virus (CVYV), Cucurbit yellow stunting disorder virus (CYSDV), Potato aucuba mosaic virus (PAMV), Potato yellow dwarf virus (PYDV), and Tomato chlorosis virus (ToCV), which are not reported in Korea and cause serious economic losses to the family Cucurbitaceae or Solanaceae. To detect those viruses, we employed RT-PCR technique with specific oligonucleotide primer pairs and tested their detection efficiency for each virus. To design RT-PCR primers, coat protein was used for CVYV, CYSDV, and ToCV whereas RNA polymerase and nucleocapsid regions were used for PAMV and PYDV, respectively. The development of an RT-PCR based method proved a useful tool for rapid detection and identification of quarantine virus infections.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권1호
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• pp.193-201
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• 2010

A specific and rapid real-time PCR assay for detecting Ralstonia solanacearum in horticultural soil and plant tissues was developed in this study. The specific primers RSF/RSR were designed based on the upstream region of the UDP-3-O-acyl-GlcNAc deacetylase gene from R. solanacearum, and a PCR product of 159 bp was amplified specifically from 28 strains of R. solanacearum, which represent all genetically diverse AluI types and all 6 biovars, but not from any other nontarget species. The detection limit of $10^2\;CFU/g$ tomato stem and horticultural soil was achieved in this real-time PCR assay. The high sensitivity and specificity observed with field samples as well as with artificially infected samples suggested that this method might be a useful tool for detection and quantification of R. solanacearum in precise forecast and diagnosis.

• The Plant Pathology Journal
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• 제27권4호
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• pp.378-384
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• 2011

Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV), a member of genus Begomovirus, was isolated in Korea in 2008. We sequenced and analyzed the DNA-A of 51 TYLCV isolates from Korea, and 13 of the TYLCV isolates were selected as type representatives of TYLCV from six Korean provinces. The 13 TYLCV isolates were classified into Korea Group 1 (KG1, nine isolates) and Korea Group 2 (KG2, four isolates) based on the results of phylogenetic analysis and genome size (2774 and 2781 nucleotides, respectively). A recombination detection program 3 (RDP3) revealed two recombinations between the TYLCV Korea isolates and other TYLCV isolates [Thailand (AF206674), Iran (AJ132711), and Israel (X76319)]. TYLCV Jeju isolate was characterized by two recombination events (E1 and E2) caused by the presence of E1 in ORF V1 and C3, which may seem to be the mutations of the high nucleotide transversion and transition rate. Collectively, our results suggest that the occurrence of nucleotide transversions and transitions in TYLCV DNA-A might have induced novel recombination events within the TYLCV Korea isolates.

• 미생물학회지
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• 제4권2호
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• pp.5-10
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• 1966

The relationships between tumor score and peroxidase activities of tomato stems infected with Agrobacterium tumefaciens strain A6Kl, B6, T372 11BNV6, 11BV7 and wounded stem as a control were examined in relation to crown gall tumor development on purpose to study the lignification of tumor tissue which is affected to the development of crown gall tumor. As the previous paper has been mentioned the fact that the induction of tumor tissues were inhibited or limited in the lignified stem of host plant. It was presumed that the activities of peroxidase related to the development of lignification were decreased during the period of tumor development. But the experimental result in this experiment shows that the peroxidase activities of crown gall tumor-tissues infected with the A. tumefaciens strains which are already known as virulent are increasing during four weeks, however, in the strain 11BNV6 and wound the peroxidase activities are decreasing on the second week after the inoculation of the bacteria strains. These results could be explained on the basis of that possible regulatory agents of lignification which were accumulated in tumor tissues, IAA, ascorbic acid, glutathion(GSH) and caffeic acid esters, were postulated to act as antioxidants which has been suggested by Stafford. Total nitrogen contents in relation to crown gall tumor development were determined for the detection of protein synthesis related to the enzyme activities which are increasing in the time of plant growth. Generally six groups are contained the largest amount of nitrogen on the second week after the inoculation of the bacterium. Comparing to the tumor score, it is presumed that the all of enzyme activities including peroxidase in tumor tissues are increasing from the second week through the third week after the inoculation of bacterium and the protein synthesis is stimulated under the most appropriated temperature during the above periods.