• 제목/요약/키워드: TOL plasmid

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CAM 플라스미드를 함유하는 Pseudomonas putida PpG1에서 TOL 플라스미드이 DNA 재배열 (DNA Rearrangement of TOL Plasmid in Pseudomonas putida PpGl Harbouring CAM Plasmid)

  • 전효곤;조경연;고영희
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.433-436
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    • 1990
  • 접합에 의한 P.putida mt-2의 TOL를 CAM 함유 P.putida PpG1으로 이동시켜 형성된 접합주 P.Putida CST3A는 작아진 TOL(TOL$\Delta$)를 가지고 있었지만, m-toiuate를 분해할 수 있었다. 접합에 의한 이동실험은 CAM에 결합되어 CAM:TO* 플라스미드를 형성하고 있었다. 불화합성 Inc P9군에 속하는 NAH를 CAM:TOL* 과 TOL$\Delta$을 가지는 P.putida CST3A로 이동시키면 TOL$\Delta$의 방출이 관찰되었으나 m-toluate 대사에는 아무런 영향을 미치지 않았다.

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방향족 탄화수소 분해 Plasmid의 n-Alkane 자화성 Pseudomonas putida에로의 전이 (Conjugal Transfer of NAH, TOL, and CAM::TOL* Plasmid into n-Alkane Assimilating Pseudomonas putida)

  • Kho, Yung-Hee;Chun, Hyo-Kon;Cho, Kyong-Yun;Bae, Kyung-Sook
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.51-55
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    • 1989
  • TOL 플라스미드와 NAH 플라스미드는 n-알칸을 자화하는 P. putida KCTC 2405에 접합에 의해 각각의 이동은 가능하나 두 플라스미드는 불화합성에 기인하여 본 균주내에 공존할 수 없었다. TOL plasmid에서 불화합성 체계는 남겨두고 tol 유전자만 이 CAM plasmid내로 transposition 되어 형성된 CAM::TOL* 플라스미드는 NAH 플라스미드와 P. putida KCTC 2405에서 공존할 수 있어 m-toluate, naphthalene, camphor 및 n-alkane(C8-C24)를 분해할 수 있는 P. putida 3SK 균주를 육종하였다. CAM::TOL* 플라스미드는 선택성 배지에서 안정하였으나 비선택성 배지에서는 불안정하였다.

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Pseudomonas cepacia의 전달성 TOL plasmid의 특성과 불화합성 (Characterization and Incompatibility of Transmissible TOL Plasmid from Pseudomonas cepacia)

  • 조병남;조인선;최순영;유재근;민경희
    • 미생물학회지
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    • 제27권4호
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    • pp.334-341
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    • 1989
  • Toluate 분해 플라스미드를 pseudomonase cepacia SUB37에서 분리하여 분자량은 한천 젤 전기영동으로 측정한 결과 79. (119kb)로 확인되었다. 이 TOL플라스미드는 Pseudomonas의 다른 균주와 다른 속의 균주에 전달되었다. m-toluate 분해에서 가장 중요한 역할을 하는 catechol-2,3-oxygenase 활성을 P. cepacia SUB37과 transconjugant의 조효소액으로부터 측정한 결과, P. putida mt 2에서와 같이, meta pathway를 거쳐 m-toluate를 분해하는 유전자들이 plasmid에 암호화됨을 알수 있었다. P. cepacia SUB37 유래의 새로운 TOL plasmid는 IncP-4 불화합성군에 속하였고, 이것은 아마도 P. putida의 IncP-9 그룹의 TOL 플라스미드의 유도체로 사료된다.

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Flavobacterium odoratum의 TOL 플라스미드를 전달받은 광합성세균으로부터의 수소 생성 ($H_{2}$ production of photosynthetic bacteria transferred TOL plasmid from flavobacterium odoratum)

  • 오순옥;조인성;이희경;민경희
    • 미생물학회지
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    • 제29권6호
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    • pp.408-415
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    • 1991
  • TOL plsmid size of Flavobacterium odoratum SUB53 was estimated as 83 Md and the optimum concentration of m-toluate degradation by TOL plasmid was 5 mM. $H_{2}$ production by Rhodopseudomonas sphaeroides KCTC1425 was largely dependent on nitrogenase activity and showed the highest at 30 mM malate with 7 mM glutamate as nitrogen source. Nitrogenase activities were inhibited by 0.3 mM $NH_{4}^{+}$ions, to be appeared the decrease of $H_{2}$ production. Conjugation of TOL plasmids from F. odoratum SUB53 and Pseudomonas putida mt-2 to R. sphaeroides showed the optimum at the exponential stage of recipient cells in presence of helper plasmid pRK2013. According to the investigation of catechol-1,2-oxygenase (C-1, 2-O) and catechol-2,3-oxygenase (C-2,3-O) activities of R. sphaeroides C1 (TOL SUB53) and C2 (TOL mt-2), the gene for C-2,3-O is located on TOL plasmid and gene for C-1, 2-O on the chromosome of R. sphaeroides. m-Toluate was biodegraded by TOL plasmid in R. sphaeroides C1 and C2, presumably to be produced $H_{2}$ gas from the secondary metabolites of m-toluate.e.

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TOL 플라스미드 세균의 분리와 특성 (Isolation and Characterization of Naturally Occuring Bacteria Carried TOL Plasmid)

  • Nam, Cho-Byung;Cho, In-Sun;Rhee, Young-Ha;Ryu, Jae-Keun;Min, Kyung-Hee
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.321-326
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    • 1989
  • m-Toluate 최소배지에서 선택적 enrichment culture를 통하여 82개의 세균의 균주를 분리하였으며, ol들 중 두 균주는 Pseudomonas cepacia, 한 균주는 P. Putida, 한 균주는 Yersinia intermedia, 그리고 한 균주는 Flavobacterium odoratum으로 동정되었다. P. cepacia SUB37은 P. putida mt-2의 TOL 플라스미드와 비슷한 크기의 플라스미드를 가지고 있었으며, Flavobacterium odoratum과 Yersinia intermedia는 이보다 더 큰 플라스미드를 갖고 있었다. P. cepacia SUB37은 streptomycin에 감수성을 나타내었으나, rifampicin에는 내성을 나타내었다. 플라스미드를 갖는 P. cepacia SUB37은 탄화수소를 해당 알콜과 알데히드를 거쳐서 benzoate와 toluate 로 분해하였다. 플라스미드 제거실험으로, P. Cepacia SUB37의 플라스미드에는 탄화수소 분해과정 중 toluene과 xylene을 benzoate, toluate로 분해하는 효소와, 계속하여 meta pathway를 거치는 단계의 효소를 코딩하는 유전자들이 있음이 확인되었다. 또한 P. cepacia SUB37은 생장이 왕성하였을 때 m-toluate를 거의 분해하였다.

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다양한 난분해성 방향족 탄화수소를 분해하는 Pseudomonas의 균주개발 (Development of Versatile Strains of Pseudomonas Degrading Various Persistent Aromatic Hydrocarbons)

  • 이지현;최인성;박경량;박용근;이영록
    • 미생물학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.236-242
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    • 1990
  • 여러가지 난분해성 방향족 화합물을 분해하는 균주들을 개발하기 위해 2,4-D 분해 유전자를 갖는 재조합 플라스미드 pKG2. 나프탈렌 분해 유전자를 갖는 재조합 플라스미드 pKG3 그리고 TOL 플라스미드를 합성세제 분해능을 갖는 P p pulida KUD12와 프탈산에스테르를 분해하는 P.pUlida KUPlO에 각각 형질전환 또는 접합시켰다. P.pulida KUD12로부터 KUDIOl(pKG2), KUDI02(pKG3). KUDI03(TOL), KUD202(pKG3, TOL) 균주판, 또 P.pulida KUPlO으로부터 KUD 106(pKG2). KUD107(pKG3), KUD108(TOL) 균주을 각각 개발하였다. 개발균주의 분해능은 KUD101과 KUD102 그리고 KUD107이 원분해 균주와 비솟하였고, KUDI03과 KUD106 그리고 K KUD202는 원분해 균주보다 분해능이 떨어졌고 KUD108의 분해능은 원균주보다 우수하였다. 개발균주들의 혼합배양 에서는 KUD 107과 KUD108의 혼합배양이 다른 혼합배양틀보다 분해능이 우수한 것으로 나타났다.

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Degradation Properties of n-Alkane Assimilating Pseudomonas putida 3SK Carrying $CAM::TOL^{*}$ Plasmid and NAH Plasmid

  • Chun, Hyo-Kon;Cho, Kyung-Yun;Kho, Yung-Hee
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제4권4호
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    • pp.270-273
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    • 1994
  • Pseudomonas putida 3SK, which was constructed by the conjugal transfet of the $CAM::TOL^{*}$ plasmid of Pseudomonas putida CSnA and the NAH plasmid of Pseudomonas putida KCTC 2403 into n-alkane assimilating Pseudomonas putida KCTC 2405, showed a broad degradation spectrum and floc-forming ability. This strain degraded m-toluic acid, naphthalene, camphor and decane simultaneously. $Hg^{2+}$ at the concentration of 1 ppm in the minimal medium could not inhibit the growth of this strain. The degradation of m-toluic acid by Pseudomonas putida 3SK was not repressed by the easily utilizable compounds, such as glucose and succinate. But, the addition of formalin inhibited the growth of Pseudomonas putida 3SK. After the cultivation of this strain on the artificial wastewater containing m-toluic acid, naphthalene, camphor and decane for 24 hr, the initial COD value (1500) of the artificial wastewater was declined to 300.

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Pseudomonas putida의 Catechol 2,3-dioxygenase 유전자의 클로닝 (Cloning of Catechol 2,3-dioxygenase Gene from Pseudomonas putida)

  • 김영수;최봉수;민경락;김치경
    • 미생물학회지
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    • 제29권3호
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    • pp.155-159
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    • 1991
  • Four strains of Pseudomonas putida (NAH), Pseudomonas sp.(TOL), Achromobacter xylosoxidans, and Alcaligenes sp. were compared with their degradative capability of aromatic compounds. All of the bacterial strains were utilized catechol as a sole carbon source for growth, but signigicantly different in degradative properties for 5 other aromatic compounds. Catechol 2, 3-dioxygenase gene from P. putida (NAH) has been cloned and expressed in E. coli. The DNA clone designated pCNU101 contains NAH-derived 6 Kb insert and its physical map was characterized. A subclone (pCNU106) for the catechol dioxygenase gene in pCNU101 contained 2.0kb-DNA insery fragmented by HpaI and ClaI.

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Functional Analysis of the marB gene of Escherichia coli K-12

  • Lee, Chang-Mi;Park, Byung-Tae
    • 대한의생명과학회지
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    • 제10권2호
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    • pp.153-161
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    • 2004
  • Antibiotic resistance is often associated with the production of inner membrane proteins (for example, AcrAB/TolC efflux pump) that are capable to extrude antibiotics, detergents, dyes and organic solvents. In order to evaluate the unknown MarB function of Escherichia coli, especially focused on the function of OmpF porin, several mutants were construted by T4GT7 transduction. MarA plays a major roles in mar (multiple antibiotic resistance) phenotype with AcrAB/TolC efflux pump in E. coli K-12. Futhermore, MarA decreases OmpF porin expression via micF antisense RNA. Expression of acrAB is increased in strains containing mutation in marR, and in those carrying multicopy plasmid expressing marA. MarB protein of E. coli K-12 showed its activity at OmpF porin & TolC protein as target molecule. Some paper reported MarB positively regulates OmpF function. MarA shows mar phenotype, and MarB along with MarA show decreased MIC through OmpF function. By this experiment, MarB could decrease MIC through the OmpF porin & TolC protein as target.

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유전자 재조합 균주를 환경에 적용하기 위한 (동결) 건조 및 활성회복 조건 최적화 (Optimum Conditions of Freezing Lyophilization and Bioluminescence Activity Recovery for Environmental Applications Using a Recombinant Strain)

  • 고경석;김명희;공인철
    • 한국지하수토양환경학회지:지하수토양환경
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    • 제11권5호
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    • pp.43-50
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    • 2006
  • Bioreporter 균주는 복잡한 환경매체의 특정 오염원 탐지를 위해 유용하게 사용되고 있다. 특히 발광 유전자 재조합 균주는 민감하고 배경에 의한 영향을 받지 않는 장점이 있다. 사용한 유전자 재조합 균주(Pseudomonas putida mt-2 KG1206)는 TOL 플라즈미드와 pUCD615 벡터에 $P_{m}\;promoter$가 삽입된 재조합 플라즈미드를 함유하고 있으며, 톨루엔 계열 및 중요 분해산물에 대해 분해와 함께 발광을 생산하는 특성을 갖고 있다. 본 연구에서는 균주 동결 및 동결건조 준비 및 적용과정에 필요한 다양한 조건들을 조사하여, 향후 환경매체에 적용하기 위한 최적 방법에 대한 프로토콜을 작성하였다. 조사한 최적 조건들은 다음과 같다. 동결보호시약(24% sucrose), 동결건조 시간(12시간), 균주 농도($OD_{600}=0.6$), 동결균주 활성회복($35^{\circ}C$에서 빠르게 해동), 동결건조 균주 활성회복(LB배지에 $3{\sim}6$시간 노출), 현장 운반 조건(활성 회복 후 $20^{\circ}C$ 정도의 실온). 본 연구 결과는 재조합 균주 환경 적용을 위해 필요한 균주 동결 및 동결 건조에 대한 중요한 자료들을 제시하고 있다.