• Title/Summary/Keyword: TDGS

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Automated Analysis of TDGS Image for SNP Discovery (SNP 발견을 위한 TDGS (Two-Dimensional Gene Scanning) 영상의 분석)

  • Chang, Hwan;Park, You-Na;Lee, Bog-Ju
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2003.04c
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    • pp.238-240
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    • 2003
  • 게놈 프로젝트에 의해 인간 유전자 영기서열이 밝혀지면서 개개인의 유전자에 나타나는 SNP(Single Nucleotide Polymorphism)을 분석하여 질병의 진단과 예후, 치료와 예방이 미래에 가능하게 되었다. 본 논문은 그러한 SNP 분석을 위한 자동 분석 시스템의 영상 처리 과정으로서, 기존의 육안을 통해 분석하였던 TDGS 영상을 본 시스템의 자동적인 영상 처리 과정을 통해 SNP 분석을 위한 디지털 패턴을 추출한다. SNP 분석을 위해 사용되는 샘플은 대략 수백개가 되는데, 실험이라는 특성상 영상에 나타나는 불규칙한 요소들이 많고. 영상의 상태가 좋지 않은 경우 명암도가 낮은 반점들의 구분이 힘들게 된다. 본 논문에서는 TDGS 영상의 지역적 특성을 가장 잘 반영하기 위한 동적 이진화의 새로운 척도를 제안하였고, 영상에서 잡영과 배경을 제거한 후 남겨진 관심영역을 반점으로 판별하여 이를 디지털 패턴으로 추출한 결과를 보여 준다.

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Automated System on Extracting Digital Pattern for TDGS Image Analysis (TDGS 영상 분석을 통한 자동적 디지털 패턴의 추출)

  • Chang, Hwan;Park, You-Na;Lee, Bog-Ju
    • Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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    • 2003.05a
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    • pp.707-710
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    • 2003
  • 본 논문은 2차원 전기영동에 의해 나타나는 TOGS 영상을 분석하기 위한 시스템으로 실험적인 특성상 젤 위에 나타나는 반점들의 불규칙한 요소들이 많고 영상의 상태가 좋지 않은 경우 명암도가 떨어지는 반점들의 구분이 힘들게 된다. 기존의 전문가의 육안에 의한 TDGS 영상 분석은 그러한 불안적 요소들에 대해 유연하게 대처할 수 있는 능력이 있었다. 하지만, 그러한 예외적인 경우를 컴퓨터가 처리하기 위해서는 영상의 지역적 상태에 맞는 융통성 있는 영상처리 과정이 필요하고, 실제 분석에 사용되지 않는 반정들을 제외한 유효한 디지털 패턴의 판별이 요구된다. 이에 본 논문에서는 영상의 지역적 특성을 효과적으로 반영한 동적 이진화 방법을 통해 후보 패턴들을 추출하고, 모든 샘플들의 기준이 되는 Reference 패턴과 후보 패턴의 point matching 과정을 통해 디지털 패턴을 추출한다.

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Star formation and TDGs in the debris of interacting systems

  • Sengupta, Chandreyee;Dwarakanath, K.S.;Saikia, D.J.;Scott, T.C.
    • The Bulletin of The Korean Astronomical Society
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    • v.38 no.2
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    • pp.34.2-34.2
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    • 2013
  • Star formation beyond the galaxy discs and the principles governing it have attracted a lot of recent attention and the advent of ultraviolet (UV) and mid-infrared (MIR) telescopes like the GALEX and Spitzer have enabled major advances in such studies. In order to study the HI gas properties such as the morphology, kinematics and column density distributions, and their correlation with the star forming zones, especially in the tidal bridges, tails and debris, we carried out an HI survey of a set of Spitzer-observed interacting systems using the Giant Metrewave Radio Telescope (GMRT). Here we present results from three of these systems, Arp86, Arp181 and Arp202. In Arp86, we detect excellent star-gas correlation in the star forming tidal bridges and tails. In Arp181, we find the two interacting galaxies to be highly gas depleted and the entire gas of the system is found in the form of a massive tidal debris about 70 kpc from the main galaxies. In all three cases, Arp86, Arp181 and Arp202, the tidal debris seem to host ongoing star formation. We also detect three new candidate tidal dwarf galaxies (TDG) in these systems with large quantities of gas associated with them.

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