Han, Taeman;Park, In Gyun;Kim, Ki-Kyoung;Ivanov, Sergey;Park, Haechul
Korean journal of applied entomology
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v.56
no.3
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pp.229-239
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2017
The South Korean hermit beetle has previously been identified as Osmoderma opicum, which is distributed in Japan. Because of its rarity, this species is classified as an endangered species. To date, however, the identity of this species in South Korea has not been conclusively confirmed. To assess the taxonomic status of the hermit beetle occurring in South Korea, we performed a comparative study with the beetle's Eurasian congeners, based on morphological examination and molecular analysis using COI gene sequences. The results clearly showed that the South Korean hermit beetle is identical to Osmoderma caeleste, which has been described from the Russian Far East. Therefore, we suggest that the taxonomic identity of the South Korean hermit beetle is O. caeleste.
Kim, Kun-Ok;Hong, Sun-Hee;Lee, Yong-Ho;Na, Chae-Sun;Kang, Byeung-Hoa;Son, Yo-Whan
Journal of Ecology and Environment
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v.32
no.4
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pp.277-293
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2009
Disagreement among the various publications providing lists of Korean endemic plants makes confusion inevitable. We summarized the six previous reports providing comprehensive lists of endemic plants in Korea: 407 taxa in Lee (1982), 570 taxa in Paik (1994), 759 taxa in Kim (2004), 328 taxa in Korea National Arboretum (2005), 515 taxa in the Ministry of Environment (2005) and 289 taxa in Flora of Korea Editorial Committee (2007). The total number of endemic plants described in the previous reports was 970 taxa, including 89 families, 302 genera, 496 species, 3 subspecies, 218 varieties, and 253 formae. Endemic plants listed four times or more were collected to compare the data in terms of scientific names and synonyms (339 taxa in 59 families and 155 genera). If the varieties and formae were excluded, the resulting number of endemic plants was 252 taxa for the 339 purported taxa analyzed. Seven of the 155 genera analyzed were Korean endemic genera. Among the 339 taxa, the same scientific names were used in the original publications for 256 taxa (76%), while different scientific names were used for 83 taxa (24%). The four largest families were Compositae (42 taxa, 12.4%), Ranunculaceae (19 taxa, 5.6%), Rosaceae (19 taxa, 5.6%), and Scrophulariaceae (19 taxa, 5.6%). Saussurea (Compositae) had the highest number of taxa within one genus (17 taxa; 5% of total endemic taxa).
In order to study the taxonomic status of Cottus species from Korea, 19 morphological characters, egg number and size and hatched juvenile form in C. poecilopus and C. hangionsis were compared. The two species of C. poecilopus and C. hangionsis overlap each other in morphometric characters mostly, but snout length, caudal peduncle length and pectoral fin ray number were distinguished between them. Moreover the C. poecilopus and C. hangionsis specimens were differ from each other in the number of egg and size. The newly hatched juvenile form of C. hangiongensis produced many small eggs from which pelagic larvae were formed. In contrast, C. poecilopus produced well - developed juveniles. Two species have distinctly different life - cycles ; amphidromous for C. hangionsis and fluvial land - locked for C. poecilopus.
Abeliophyllum distichum Nakai (O1eaceae) is a monotype of Korea and is distinguished from related genus Forsythia Vahl by the morphological characters such as fruit shape, flower color and etc. Even though several intraspecific taxa were reported according to the color of flowers and shape of fruits, there have been many controversals on the taxonomic indentity and status of rank on those taxa. In the present study, we performed the RAPD analysis to delimit the infraspecific taxa of Abeliophyllum distichum and to investigate the genetic polymorphism and relationships among 12 populations. 212 scorable RAPD markers with 70 common markers were found from the PCR reactions with 16 random oligoprimers and were analyzed by Nei's genetic distance. From 0.108 to 0.321 of genetic variations were showed among the taxa. Some regional groups instead of same taxa were clustered from the phonogram of UPGMA analysis. Also, we could not find distinct lineage among intraspecific taxa. The result from RAPD analysis supported that the infraspecific taxa of Abeliophyllum distichum might be the individual variations and treated as the same taxa. RAPD analysis was very useful to confirm the high gene pool with diverse genetic polymorphism among Abeliophyllum distichum populations.
The taxonomic relationship of 3 taxa in $Carex$ sect. $Siderostictae$ were revealed by morphological and molecular studies. The morphological characteristics of Korean $Carex$ siderosticta Hance, which is a type species of sect. $Siderostictae$, was first reviewed in comparison with previous records in order to identify the difference. Then the distribution map of this species was formulated through previous floral literatures and voucher specimens. Although the leaf shape which is represented by length/width ratio showed a great variation depending on habitat condition, the rhizome creeping patterns, the presence of hair on the surface leaf margin and perigynium were shown to be good diagnostic characters to define delimitation of species level. The results from molecular study supported $C.$$ciliatomarginata$ Nakai should be ranked independently on species level.
Saussurea taquetii reported from Jejudo Island is either treated as a synonym of S. japonica or is recognized as a distinct taxon. Saussurea japonica and S. pulchella belong to the sect. Theodorea by having peculiar outer phyllaries with pale purplish scarious apical appendages; they are closely related to each other morphologically and are known to occur widely throughout the Korean Peninsula. To assess the taxonomic status of S. taquetii, we investigated representative populations of S. taquetii from jejudo Island, Korea, and S. japonica from Kyushu in Japan. We conducted a comparative study morphologically using specimens of three species from KH, CNU, and TI. Saussurea taquetii is very similar morphologically and ecologically to S. japonica in Kyushu. Unlike previous floristic treatments, we concluded that the two taxa, S. pulchella and S. taquetii, occur on the Korean Peninsula and on jejudo Island, respectively.
Abraham Okki, Mwamula;Oh-Gyeong Kwon;Chanki Kwon;Yi Seul Kim;Young Ho Kim;Dong Woon Lee
The Plant Pathology Journal
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v.40
no.2
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pp.171-191
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2024
Identification of Helicotylenchus species is very challenging due to phenotypic plasticity and existence of cryptic species complexes. Recently, the use of rDNA barcodes has proven to be useful for identification of Helicotylenchus. Molecular markers are a quick diagnostic tool and are crucial for discriminating related species and resolving cryptic species complexes within this speciose genus. However, DNA barcoding is not an error-free approach. The public databases appear to be marred by incorrect sequences, arising from sequencing errors, mislabeling, and misidentifications. Herein, we provide a comprehensive analysis of the newly obtained, and published DNA sequences of Helicotylenchus, revealing the potential faults in the available DNA barcodes. A total of 97 sequences (25 nearly full-length 18S-rRNA, 12 partial 28S-rRNA, 16 partial internal transcribed spacer [ITS]-rRNA, and 44 partial cytochrome c oxidase subunit I [COI] gene sequences) were newly obtained in the present study. Phylogenetic relationships between species are given as inferred from the analyses of 103 sequences of 18S-rRNA, 469 sequences of 28S-rRNA, 183 sequences of ITS-rRNA, and 63 sequences of COI. Remarks on suggested corrections of published accessions in GenBank database are given. Additionally, COI gene sequences of H. dihystera, H. asiaticus and the contentious H. microlobus are provided herein for the first time. Similar to rDNA gene analyses, the COI sequences support the genetic distinctness and validity of H. microlobus. DNA barcodes from type material are needed for resolving the taxonomic status of the unresolved taxonomic groups within the genus.
Individualities of precious health mushroom called Zhenghonggu@ from respective protections scattered among all main mountains of Fujian China were collected and recognized locally, then compared with Russula griseocarnosa. Their internal transcribed spacer (ITS) region (ITS1, ITS2 and 5.8S rDNA) of the nuclear rDNA were amplified, AMOVA analyzed, nested clade analyzed and then compared with the ITS sequences of relative Russula species from other regions of China to confirm the taxonomic status of Zhenghonggu$^@$ and its population structure. Total 23 haplotypes from different protections of Fujian can be clustered into three clades similar to the three lineages of Dahongjun$^@$ from southeastern China reported by Li et al. The geographic distribution characteristic of these three phylogeny clades may be closely coupled with the vegetation regionalization and/or the differences of coenosium construction of Fagaceae that is the host of Russula griseocarnosa. The correlation of taxonomy, phylogeny and geographical distribution of Russula are discussed.
The taxonomic status and the distribution of Rosenvingea species need attention because of the difficulties in morphological identification in the laboratory as well as in the field. We analyzed mitochondrial cox3 and plastid psaA gene sequences from Rosenvingea species from Vietnam, Mexico and Panama in combination with morphological examinations. Our results confirmed the occurrence of R. intricata and R. orientalis in Vietnam. R. intricata formed dense decumbent mats with many flat branches, often inter-adhesive, and was up to 5 cm in diameter. R. orientalis thalli were up to 18 cm long with narrow (less than 2 mm in width) tubular to compressed fronds. Both cox3 and psaA phylogenies revealed the non-monophyly of the genus Rosenvingea, as reported previously for other scytosiphonacean genera.
Wiriyadamrikul, Jutarat;Lewmanomont, Khanjanapaj;Boo, Sung Min
ALGAE
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v.28
no.1
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pp.53-62
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2013
Actinotrichia is a calcified galaxauracean red algal genus with temperate and tropical distributions in the Indian and Pacific Oceans. Morphological characteristics, along with rbcL and cox1 sequences, were analyzed from specimens collected in the western Pacific and the Indian Oceans. Both rbcL and cox1 data confirmed the occurrence of A. fragilis, A. robusta, and Actinotrichia sp. in this region. The presence of A. fragilis was verified in tropical Indo-Pacific and temperate northeast Asian waters and was characterized by high genetic diversity. Although A. robusta commonly occurs in the East China Sea, we confirmed its presence on rocks and crustose algae in the subtidal zone of three islands in the Andaman Sea. Actinotrichia sp. was similar to A. calcea in morphology and distribution, but with sufficiently different sequences, thus, additional sampling over the range will enable a more realistic evaluation of its taxonomic status.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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