남한해역에서 채집된 Raja속 어류를 Ishihara(1987)의 분류기준에 따라 동정한 결과 Raja(Okamejei) meerdervoortii Bleeker(오동가오리), R.(O.) acutispina Ishiyama(국명신칭:무늬홍어), R.(O.) kenojei Muller et Henle(홍어), R.(Dipturus) kwangtungensis Chu(국명신칭: 참홍어), R.(D.)pulchra Liu(눈가오리)등 5종이 확인되었다. 5종 10집단 165개체에 대한 전기영동법을 이용한 동위효소 분석 결과 13개의 효소 및 비효소성 단백질에서 24개의 유전자를 검출하고 대립인자 빈도를 산출하여 종간 비교를 실기하였다. 5종 중 R.(O.) kenojei 집단은 4집단 간 평균 S = 0.966으로 매우 가까운 유전적 근연치를 나타냈으며, R.(O.) meerdervoortii와 R.(O.) acutispina는 유전적 근연치가 S = 0.749였으며, R.(O.) kenojei와 R.(D.) kwangtungensis는 S = 0.829였으나, R.(D.) pulchra는 다른 4종과 S = 0.597의 값을 나타내어 유전적 근연관계가 제일 멀게 나타났다. R.(D.) kwangtungensis의 경우 동일 아속인 Dipturus 아속에 속하는 R.(D.) pulchra와는 유전적 근연치가 S = 0.648로 뚜렷한 차이가 있었으나, Okamejei 아속에 속하는 R.(O.) kenojei와는 S = 0.829의 가까운 유전적 근연치를 나타내어 주목된다. R.(O.) acutispina와 R.(D.) kwangtungensis는 한국 미기록종으로 동정되었다.
한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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pp.301-301
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2017
Subspecific difference of the percentage of white immature kernels (WIK) between japonica and indica rice cultivars was analyzed in relation to ripening temperature and yield characters. Thirty-three Chinese and 10 Japanese rice cultivars, including 32 japonica and 11 indica, were cultivated with three different cropping seasons for three years. The results were as follows: (1) Indica had less number of panicles, larger number of spikelets per panicle with higher yield, and longer and narrower kernels than japonica. In japonica, Chinese cultivars had less number of panicles and larger number of spikelets per panicle than Japanese cultivars. In addition, WIK was significantly higher in Chinese cultivars than in Japanese cultivars, because of the higher percentage of milky white kernels, even at similar temperature conditions during ripening. On the other hand, WIK in indica was not significantly different between the production areas and between the cropping seasons. (2) Regardless of subspecies, WIK in a large number of Chinese cultivars increased with increasing temperature during ripening within 20 days after heading, while this relation was uncommon in Japanese cultivars, showing the low temperature response. However, some Chinese cultivars had the low WIK with the low temperature response. (3) WIK in japonicawas positively correlated with 1000-kernel weight, spikelet density, kernel width and thickness, but negatively correlated with panicle length and grain filling percentage, while in indica it was positively correlated with panicle number per area, grain filling percentage, brown rice yield and kernel width, but negatively correlated with kernel length. These results indicated that WIK in both subspecies had a close relation to kernel size, and that WIK was high in japonica cultivars with wide and thick kernels and in indica cultivars with short and wide kernels.
Two subspecies, japonica and indica, have been reported in rice, which differ in several ecotypic traits. However, reproductive barriers in hybrid progenies between subspecies have been major obstacles in breeding programs using inter-subspecific hybridization. As the first step to elucidate the reproductive barriers, we developed subspecies-specific(SS) STS markers in this study. A total of 765 STS primers were designed through comparing DNA sequences at every $2{\sim}3$cM interval between japonica and indica rices, which are available at Web DBs such as IRGSP, NCBI, TIGR, and GRAMENE, and tested for subspecies-specificity using 15 indica and 15 japonica varieties of diverse origin. Of them, 67 STS markers were identified as SS STS markers and their subspecies-specificity scores were estimated. The SS markers were dispersed throughout the genome along chromosomes. Of them, 64 SS markers were mapped on an RIL population derived from a Dasanbyeo(indica)/TR22183(japonica) cross. Genomic inclination of RILs was evaluated based on the genotyping with different types of markers. Association test between markers and segregation distortion revealed that segregation distortion might not be the cause of generating SS markers. The SS markers will be applicable to estimate the genomic inclination of varieties or lines and to study the differentiation of indica and japonica, and ultimately to breed true hybrid rice varieties in which desirable characters from both subspecies are recombined.
중국과 북동 중국에 서식하는 등줄쥐 2아종 (Apodemus agrarius coreae와 A. agrarius manchuricus)의 아종 내의 유전자 다양성의 정도를 파악하고 2아종간의 차이를 확인하기 위해, 미토콘드리아 DNA cytochrome b 유전자의 부분 염기서열을 분석하였다. 열 여덟마리의 A. agrarius coreae로부터 10 haplotype이, 그리고 2마리의 A. agrarius manchuricus로부터 1 haplotype이 밝혀졌다. 아종 coreae의 10 haplotype간의 Tamura-Nei nucleotide 거리는 0.36에서 1.86%였고, 2아종 coreae와 manchuricus간의 nucleotide 거리는 0.37에서 1.47%였다. 아종 coreae내 최대 genetic divergene 거리는 2아종간의 최대거리보다 크게 나타났다. 또한 2아종의 11 haplotype을 비교했을 때에, 뚜렷하게 아군으로 나뉘어지지 않았다. 본 염기서열의 분석 결과는 지금까지의 형태적 연구의 결과와 일치하지 않았으며, cytochrome b 유전자는 A. agrarius의 2아종을 구분하기에 좋은 유전자 marker가 아닌 것으로 판단됐다. 앞으로, A. agrarius의 2아종간의 유전적 관계를 밝히기 위해 미토콘드리아 DNA control region의 분석이 필요하다고 본다.
분류학적으로 어려움이 있는 고로쇠 분류군(Acer pictum complex)은 한국, 중국, 일본의 고로쇠와 여러 변종 이외에 만주고로쇠, 우산고로쇠 등이 포함된다. 고로쇠 분류군의 주요 형질은 대부분 열매의 크기, 각도, 날개의 크기, 잎의 결각 등 정량형질로 인정되고 있어, 본 연구는 한중일(韓中日)의 125개체, 17개의 정량 형질, 5개의 형질간 비율 등 모두 22개의 형질로 다변량(PCA분석)과 단변량분석을 실시하였다. 다변량분석에 의하면 3개의 성분(PC) eigenvalues 누적비율이 0.59(ca. 59%)로서 매우 낮은 수치를 보였고 대부분 PCA상의 좌표 중앙에 몰리면서 종간 차이가 중첩되었다. 분포 영역의 동쪽에 분포하는 울릉도의 우산고로쇠는 열매와 잎의 형태에 있어 일본의 서쪽연안(일본해(日本海)=동해(東海))의 개체들과 중첩되었다. 한국의 경기도 서해안과 강원도 일대의 일부 개체중 중국 동북부에 분포하는 만주고로쇠형이 일부 관찰되었지만 한국의 고로쇠와 전형적인 만주고로쇠형(날개와 종자의 비=0.7이상)의 중간 형태를 확인하였다. 조사 형질중 날개의 길이, 날개/종자 길이의 비, 열매 각도는 우산고로쇠, 티벳고로쇠, 만주고로쇠 등을 구분하는 양상을 보였지만 한중일(韓中日)의 고로쇠 개체를 포함할 경우 모두 연속 변이로 확인되어 종간 식별이 불가능하였다. 따라서, 중국 내륙에서 일본까지 분포하는 고로쇠와 중국 동북부지역에서 황하강이북, 한국 북부, 중부지방의 경기도섬과 강원도지역에 분포하는 만주고로쇠, 울릉도의 우산고로쇠, 중국 남부에서 일본 Hokkaido이남에서 한국의 남부에 분포하는 털고로쇠는 모두 하나의 종으로 보는 것이 타당하다. 그러나, 조사된 정량적 형질이외에 종간 식별에 중요한 정성적 형질(털의 유무, 수피형태)과 지리적 분포를 고려하여 국내 분포하는 분류군을 고로쇠, 털고로쇠, 만주고로쇠 등 3 변종으로 정리하였다.
한국산 기름종개 3 아종의 분류학적 의문점을 해결하기 위하여 전국 23개 집단을 대상으로 체측반문을 비롯한 형태형질 분석과 전기영동법에 의한 유전자 분석을 실시하였다. 3 아종의 체측반문 변이 분석 결과 기름종개와 점줄종개에서는 각 아종 의 특정인 점열형 (A, B type: 14.5%)의 개체보다 중간형 (C, D type: 51.0%)의 빈도가 월등히 높았다. 기름종개 3 아종은 모두 암수간 체측반문 형태가 달리 발현되는 성적이형 현상이 뚜렷하였다. 형태계측 및 집단 판별분석에서 집단간 및 아종간의 뚜렷한 차이는 발견되지 않았다. 전기영동법에 의한 유전자 분석결과 3 아종중 줄종개 5개 집단의 평균 유전적 변이가 A=1.48. P=31.2%. HD= 0.082 및 HQ=0.099로서 기름종개(A=1.37. P=24.7%. HD=0.058 및 HQ = =0.065) 및 점줄종개(A=1.43, P=27,0%. 매=0.066 및 HQ=0.079)에 비하여 높은 변이를 나타내었다 각 아종의 유전적 근연관계에 있어 기름종개와 줄종개 및 점줄종개의 평균 유전적 근연치는 S = O.64로서 일반적인 담수어류의 종간차이를 보였고, 줄종개와 점줄종개간은 S=0.82로서 아종 수준의 유전적 근연관계를 나타내었다. 체측반문 변이, 형태분석 결과 및 유전자 분석결과 기름종개는 타 두 아종과 약 200만년전에 분화된 별종으로 사료된다. 기름종개 (C. t. taenia)의 학명사용에 있어 이미 보고된 자료(핵형, 형태, 분포 등)들을 비교할 때 중국산 C. Sinensis와 많은 차이가 있어 한국산 기름종개를 중국산 C. sinensis Sauvage a and Dabry 의 synonym으로 보는 것은 타당성이 없다. 그러나 줄종개와 점줄종 개는 형태 및 유전적 특정등을 고려할 때 아종으로 취급하는 것이 타당하리라 여겨 지며 앞으로 이들에 대한 학명의 재검토가 요구된다.
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