• 제목/요약/키워드: Streptomyces fradiae

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Study on the Biosynthesis on Neomycin: Characterization of Isocitrate Dehydrogenase of the Neomycin Producer, Streptomyces fradiae and its Possible Relation to the Regulation of Biosynthesis of Neomycin

  • Chang Hoon Lee;Yang Mo Goo;Kong Hwan Kim
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제12권5호
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    • pp.504-509
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    • 1991
  • S. fradiae showed very high activity of isocitrate dehydrogenase compared to other microorganisms. The activity of this enzyme was increased with the growth of the organism. But the increase might not imply its involvement in the growth. Rather its increased activity seemed to have a connection with the biosynthesis of neomycin. The enzyme showed high specificity toward $NADP^+$ and D-isocitrate with Km values of 5.75 and 6.74 uM, respectively, It was activated by $Mn^{2+}$. Its molecular weight was estimated from its gel retardation coefficient to be in the range of 61,000-63,000 daltons and its optimum pH was 8.0. The enzyme was thermally unstable.

한국(韓國) 중부(中部) 지방(地方)의 토양(土壤)에 분포되는 Streptomyces의 분류(分類) (Classification and Identification of Streptomyces Isolated from Soil of Middle Part of Korea)

  • 윤봉식;신관철;최재을
    • 농업과학연구
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    • 제16권1호
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    • pp.44-55
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    • 1989
  • 우리나라 토양중의 Streptomyces를 분류, 동정하고자 토양으로부터 총 826 균주이 Streptomyces를 분리하여 1차 배양하고 형태적, 생리적 특성이 다른 65 균주를 선발하여 I.S.P 방법에 따라 총 46 종의 Streptomyces를 동정하였으며 그 중 국내미기록종은 38종으로서 마음과 같다. 1) melanin 색소형성균 S. lavendulae, S. tuirus, S. purpurascens, S. violarus, S. lateritius, S. olivochromogenes, S. purpeofuscus, S. fulvoviolaceus, S. gallilaeus, S. naganishii, S. hygroscopicus subsp. ossamyceticus, S. nevagawaensis, S. anandii, S. phaeopurpureus, S. mirabilis, S. arenae, S. massasporeus, S. eurythermus. 2) Melanin 색소 비형성군 S. fellus, S. flavidovirens, S. exfoliatus, S. fumanus, S. termitum, S. glomeroaurantiacus, S. luteofluorescens, S. prunicolor, S. fradiae, S. tauricus, S. griseolus, S. misakiensis, S. poonensis, S. antimycoticus, S. diastaticus subsp. ardesiacus, S. nigrifaciens, S. tendae, S. narbonensis subsp. josamvceticus, S. atroolivaceus, S. chrysomallus subsp. fumigatus.

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참나무시들음 병원균 Raffaelea quercus-mongolicae에 대한 항균미생물 분리 (Antifungal Property of Microorganisms against Korea Oak Wilt Pathogen, Raffaelea quercus-mongolicae)

  • 이상현;이승규;김재영;이총규;김경희;이용섭
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제40권1호
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    • pp.66-69
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    • 2012
  • Raffaelea quercus-mongolicae에 대한 항균작용을 하는 미생물을 분리하기 위하여 200개의 균주를 분리하였으며 이 중 SG 1-9, 1-12와 SG 2-8, 2-10, 2-17 5개의 균주에서 항균활성을 확인하였다. 5개의 균주는 확인을 위하여 16S rDNA 염기서열 분석을 하였으며, SG 1-9는 Streptomyces cinnamoneus와 98%의 homology가 SG 1-12는 Burkholderia cepacia와 98% homology가 같은 것으로 나타났다. 또한 SG 2-8은 Streptomyces fradiae와 99%의 homology를 SG 2-10은 Staphylococcus epidermidis와 97%를 SG 2-17은 Staphylococcus epidermidis와 99%의 homology를 나타내었다. 위 5개의 균주 중 활성이 가장 강한 SG 2-17의 유기용매추출물과 단백질추출물을 분리하여 활성을 조사하였으며 유기용매추출물에서 강한 활성을 확인하였다. 3개의 유기용매 중 benzene 추출물이 가장 높은 Raffaelea quercus-mongolicae의 균사성장을 억제하였다.

Streptomyces tubercidicus에 존재하는 stu I endonuclease의 정제와 특징 (Purification and Characterization of stu I Endomuclease from Streptomyces Tubercidicus)

  • 김기태;정미영;유욱준
    • 미생물학회지
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    • 제25권3호
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    • pp.180-183
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    • 1987
  • Type II제한효소 Stu I을 순수정제하고 그 효소적 특성을 연구하였다. 100g(we weight)의 Streptomyces tubercidicus(ATCC 25502)로부터 얻은 crude extranct를 ammonium sulfate fractionation한 후, DEAE-Sephadex(A-50), QAE-Sephadex(A-50) 그리고 Heparin-agarose의 순서로 column chromatography를 수행하여 1,2mg의 비특이성 nuclease가 없는 Stu I 제한효소를 얻었다. 이 시료에 포함되어 있는 다른 오염 단백질은 Sephadex G-100 column으로 gel filtration 하여 제거함으로써, 순수한 Stu I 단백질을 얻을 수 있었다. 정제된 Stu I 제한효소는 10% SDS-polyacrylamide gel electrophoresis 결과 한 개의 band로 나타났으며, 그 분자량은 34,000 $\pm$ 1,000 dalton이었다. 이 효소는 $Mg^{2+}$이온 존재하에 중성의 pH(7.0-8.0)에서 최대의 활성을 나타내었다. NaCl은 이 효소의 활성에는 필요하지 않았다.

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Effects of Natural Selection, Mutagenesis, and Protoplast Formation and Cell Wall Regeneration on the Production of Aminoglycoside Antibiotics

  • Goo, Yang-Mo;Lim, Hyon-Joo;Lim, Seok-Ran;Kim, Kong-Hwan;Lim, Bun-Sam;Lee, Sae-Bae
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제12권4호
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    • pp.249-253
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    • 1989
  • High producers or blocked mutants of aminoglycoside antibiotic-producing Streptomyces spp. were selected by application of an agar plug method and by culturing individual colonies in broth. The productivities of aminoglycoside antibiotic producing organisms were increased by selection of a high producer from colonies obtained by spreading spores of wild strain, or survived from treatment of a mutagen or from the colonies regenerated from protoplast-formation and cell-wall regenerations. Some mutagen treated colonies lost the ability to produce antibiotics (5-8%). Some A-factor negative and deostreptamine or streptidine negative mutants were obtained by N-methyl-N'-nitro-N-nitrosomethylguanidine (MNNG) treatment. Many of the survivors from the MNNG treatment lost the ability to produce antibiotics. Major colonies produced less amount of antibiotics ; only few survived colonies produced more antibiotics than the parent. Resistance of Streptomyces spp. against the antibiotics produced by itself was also markedly affected by mutagen treatment.

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Application for Measuring the Glucose, Ammonia nitrogen, and Tylosin Concentration using Near Infrared Spectroscopy

  • Kim, Jong-Soo;Cho, Hoon
    • 환경위생공학
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    • 제23권2호
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    • pp.19-25
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    • 2008
  • For measurement of tylosin, ammonia nitrogen, and glucose concentration during the culture of Streptomyces fradiae using Near Infrared Spectroscopy, the calibration using various mathematical models was performed and then, based on the linear model, the validation was carried out. In the case of sucrose concentration using the MLR method, the Standard Error of Prediction and Multiple correlation coefficient were 1.97, and 0.991, respectively. In the case of ammonia nitrogen concentration using the PLSR method, the Standard Error of Prediction and Multiple correlation coefficient were 0.13, and 0.990, respectively. In the case of tylosin concentration using the PLSR method, the standard Error of Prediction and Multiple correlation coefficient were 0.54, and 0.984, respectively.

MLSB 항생제 내성인자인 ErmSF의 N-terminal 38개 아미노산 제거가 항생제 내성 효소활성에 미치는 영향 (Effect of Truncation of 38 Amino Acids in N-terminal Region of ErmSF, a MLSB Antibiotic Resistance Factor Protein, on Enzymatic Activity)

  • 이학진;진형종
    • 미생물학회지
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    • 제50권3호
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    • pp.239-244
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    • 2014
  • ErmSF는 macrolide 항생물질인 tylosin을 생성하는 Streptomyces fradiae가 보유한 4개의 항생제 내성인자 단백질 중 하나로 23S rRNA의 $A_{2058}$에 dimethylation 시킴으로써 항생제가 부착되는 것을 막음으로써 그 내성을 일으킨다. ErmSF는 다른 Erm 단백질과는 달리 긴 N-terminal end region을 가지고 있어서 그 역할을 알아보기 위해 1-38번째의 아미노산을 제거한 결손변이 단백질을 고안하고 대장균에서 발현하여 그 활성을 in vivo와 in vitro에서 관찰하였다. 결손변이 단백질을 발현하는 대장균은 결손에 의한 활성저하에 기인하여 야생형 단백질을 발현하는 대장균에 비하여 항생제에 대한 내성이 손상된 것을 관찰하였다. 세포 외 in vitro에서의 활성은 야생형 ErmSF에 비하여 약 20%가 손상된 것으로 나타났다. 이렇게 관찰된 활성의 저하는 결손 변이에 의한 활성화 부위에서 일어난 결손에 의한 것이라기 보다는 기질의 부착 또는 생성물의 효소에서의 이탈 과정이 손상되어서 나타나는 것으로 사료된다.

235 rRNA Monomethyltransferase인 tlrD의 클로닝, 이의 대장균에서 대량생산과 활성 검색 (Cloning of tlrD, 23S rRNA Monomethyltransferase Gene, Overexpression in Eschepichia coli and Its Activity)

  • 진형종
    • 미생물학회지
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    • 제43권3호
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    • pp.166-172
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    • 2007
  • ERM 단백질은 23S rRNA의 A2058에 methylation시킴으로써 macrolide-lincosamide- streptogramin B $(MLS_B)$계 항생제의 부착을 저해하여 항생제의 활성을 억제하는 내성 인자 단백질로 monomethylase와 dimethylase로 나누어진다. Dimethylase와 비교되는 monomethylase의 특성을 밝히기 위해 dimethylase (ErmSF)와 monomethylase (TlrD)를 동시에 보유한 Streptomyces fradiae에서 tlrD를 클론하고 대장균에서 최초로 대략생산을 시도하여 $37^{\circ}C$에서 세포내 전체 단백질의 55%를 차지할 정도로 대량생산된 불용성 단백질을 얻어내었다. 그러나 ErmSF와는 달리 낮은 온도에서 대량생산된 단백질이 용해성 단백질로 전환되지 않고 불용성 단백질로 남아있었다. Thioredoxin과 샤페론인 GroESL은 모두 ErmSF의 경우와 마찬가지로 용해성 단백질로의 전환에 도움을 주지 않았다. 이러한 차이점은 천재까지 전혀 밝혀지지 않은 단백질내의 구조적 특성에 의한 monomethylase와 dimethylase의 차이점을 밝힐 수 있다는 가능성을 말해주는 것으로 추정된다. 그러나 ErmSF의 경우와 동일하게 SDS-PAGE에서 검색되지 않은 미량의 발현된 용해성 단백질이 TlrD를 함유한 세포에 항생제에 대한 내성을 나타내게 하였고 이렇게 발현된 내성은 monomethylase에 의한 내성에서 기대되는 내성과 일치하였다.

Oleic Acid 내성균주로부터 Tylosin 생산 (Tylosin Production by Mutant Resistant to Oleic Acid)

  • 최두복;;문옥란;윤미란;지성남;신대윤
    • 한국환경보건학회지
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    • 제31권5호
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    • pp.360-364
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    • 2005
  • Streptomyces fradiae로부터 Tylosin을 효율적으로 생산하기 위해 지방산 내성균주을 분리 했다. 여러 지방산중에서 oleic acid 1.6 g/l 이상이 첨가될 때 세포 성장이 완전히 저해 되었다. 그러나 oleic arid 1.2 g/l에서 얻어진 TM-224-1 균주는 최대 균체농도와 tylosin 생산이 얻어졌다. 또한 oleic acid 소비속도는 parent strain 비해 3.8배 증가했다. Oleic acid 내성균주, TM-224-1 균주와 parent strain을 이용해서 jar fermentor에서 균체농도, tylosin 생산, 그리고 rapeseed oil 소비를 표준조건하에 5일동안 비교하였다. TM-224-1 균주을 이용할 경우 균체 농도는 초기에 parent strain비해 증가했으나 배양중반부터는 감소하기 시작했다. rapeseed oil 소비의 경우는 거의 비슷했다. 그러나 Tylosin 생산 수율은 parent strain 비해 약 3.2배 증가했다.

ErmSF의 N-Terminal End Region에 존재하는 $^{60}RR^{61}$의 23S rRNA Methylation에서의 역할 (Functional Role of $^{60}RR^{61}$ in 23S rRNA Methylation, Which is in N-Terminal End Region of ErmSF)

  • 진형종
    • 미생물학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.193-198
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    • 2008
  • ErmSF는, 235 rRNA의 A2058에 methylation 시켜서 macrolide-lincosamide-streptogramin B ($MLS_B$)계 항생제의 부착을 저해함으로써 항생제의 활성을 억제하는 내성인자 단백질인 ERM 단백질의 하나로, 다른 ERM 단백질과는 달리 긴 N-terminal end region을 가지고 있고 이 부위의 25%를 arginine이 차지하고 있다. 특히 $^{58}RARR^{61}$ 부위에 arginine이 모여 있어서 여기에 존재하는 R의 역할을 알아보기 위해 1-57, 1-59 그리고 1-60과 1-61이 제거된 결손 변이 단백질을 대장균에 발현하고 그 활성을 성장곡선을 작성하여 알아보았다. 그 결과 R60과 R6l이 활성에 중요한 것으로 관찰되었다. 1-59의 아미노산이 결손 된 유전자를 사용하여 R60A, R61A와RR60, 61AA의 위치선정 치환 변이 단배질의 세포내 활성을 측정하여 본 결과 R60의 역할이 R6l보다 큰 것으로 관찰되었으며 이들의 활성에서의 역할은 상호보완적인 것으로 나타났다. 그리고 이 아미노산들이 2차 구조인 $\alpha$-helix의 일부일 것으로 추정되었다.