Hizb ut-Tahrir (HT) is an Islamic social movement that struggles to change the existing political system to the Islamic system. HT argues that all problems in the Muslim world are rooted in adopting secular thought and ideology and the separation between Islam and the state. Hence, HT works to persuade Muslims to abandon that way of life and only apply Islam as the country's only ideology and constitution. HT has spread this narrative since it started in 1953 in Jordan. With this ideological and political attitude, many countries consider HT a threat to their political and community life, suppressing this movement by arresting members and banning the group to reduce or end HT activities in these countries. The Indonesian government has also carried out this repressive policy to limit the influence of Indonesian HTI since 2017. This paper aims to discuss the strategy of Hizb ut-Tahrir to continue its political activities Indonesia after being dissolved by the Indonesian government in 2017. This article used content analysis method to interpret the data collected from interview and documents from Hizb ut-Tahrir. Responding to state repression, HTI sought other methods of action by changing the place of resistance or activities, and by changing its identity.
Background: Thanks to the development of the mathematical/statistical reverse engineering and the high-throughput measuring biotechnology, lots of biologically meaningful genegene interaction networks have been revealed. Steady-state analysis of these systems provides an important clue to understand and to predict the systematic behaviours of the biological system. However, modeling such a complex and large-scale system is one of the challenging difficulties in systems biology. Results: We introduce a new stochastic modeling approach that can describe gene regulatory mechanisms by dividing two (DNA and protein) layers. Simple queuing system is employed to explain the DNA layer and the protein layer is modeled using G-networks which enable us to account for the post-translational protein interactions. Our method is applied to a transcription repression system and an active protein degradation system. The steady-state results suggest that the active protein degradation system is more sensitive but the transcription repression system might be more reliable than the transcription repression system. Conclusions: Our two layer stochastic model successfully describes the long-run behaviour of gene regulatory networks which consist of various mRNA/protein processes. The analytic solution of the G-networks enables us to extend our model to a large-scale system. A more reliable modeling approach could be achieved by cooperating with a real experimental study in synthetic biology.
The present study was designed to investigate cellular regulation of phosphate metabolism between catabolically repressed and derepressed states in yeast (Saccharomyces uvarum). The activities of various phospatases and the contents of phosphate compounds were detected according to the culture phase and various phosphate concentrations. As the results, Saccharomyces uvarum derepressed many phosphate metabolizing enzymes such as alkaline phosphatase, acid phosphatase and ATPase more than ten fold simultaneously during catabolic repression (phospgate and sugar starvation). At the same state, the amounts of orthophosphate, nucleotidic labile phosphate and acid soluble polypgosphate were increased, compared to basal levels of normally cultivated cells. $Mg^{++}-stimulated$ type among all phospatases was appeared to have most of the enzyme activity. It could be postulated that $K^+ -stimulated$ alkaline phosphatase was directly or indirectly correlated with the synthesis of acid insoluble polyphosphate $Mg^{++}-stimulated$ phosphatase with the degradation of polyphosphates. In case of cultivation in the medium supplemented with sugar and phosphate (catabolic derepression), phospgatase activities except for alkaline phosphatase were decreased rapidly through the progressive batch culture, After 12 hrs culture, at early exponential phase, the cellular accumulation of acid insoluble polyphosphate increased about 5 fold, compared to those of the starved cells. Under catabolic repression, it could be postulated that intracellular phosphate metabolism was regulated by derepressions of phosphatases. The function of polyphosphate system was shown to compensate the ATP/ADP system as phosphate donor and energy source especially during catabolic repression.
Kim, Min Young;Lee, Ji Eun;Kim, Lark Kyun;Kim, TaeSoo
BMB Reports
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제52권2호
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pp.127-132
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2019
Cells must fine-tune their gene expression programs for optimal cellular activities in their natural growth conditions. Transcriptional memory, a unique transcriptional response, plays a pivotal role in faster reactivation of genes upon environmental changes, and is facilitated if genes were previously in an active state. Hyper-activation of gene expression by transcriptional memory is critical for cellular differentiation, development, and adaptation. TREM (Transcriptional REpression Memory), a distinct type of transcriptional memory, promoting hyper-repression of unnecessary genes, upon environmental changes has been recently reported. These two transcriptional responses may optimize specific gene expression patterns, in rapidly changing environments. Emerging evidence suggests that they are also critical for immune responses. In addition to memory B and T cells, innate immune cells are transcriptionally hyperactivated by restimulation, with the same or different pathogens known as trained immunity. In this review, we briefly summarize recent progress in chromatin-based regulation of transcriptional memory, and its potential role in immune responses.
We have examined the chromatin structure of the HMRE/HSP82 and HMRa/HSP82 allels using three complementary approaches : DNase I chromating footprinting, micrococcal nuclease (MNase) nucleosome-protected ladder assay, and an in vivo E. coli dam methylase accessibility assay. The footprinting results indicate that the promoter and silencer sequences are assembled into nucleoprotein complexes which exhibit no detectable change in structure, despite a 70-fold range in expression levels. In addition, the promoter region of the HMRa/HSP82 allele is cleaved randomly by MNase in all cases, indicating the absence of anonical nucleosomes over this region irrespective of SIR4 or heat-shock. Finally, no discernible difference in the accessibility of the HMRE/HSP82 locus to dam methylase in SIR4 vs. sir4 cells was seenm which again suggests that the chromatin structure of HMRE/HSP82 allele is identical regardless of SIR4. Altogether, our results indicate that in contrast to other observations of the silent mating-type loci, no discernible structural alteration is detected at either HMR/HSP82 allele regardless of SIR genetic background or transcriptional state of the gene.
$NF{\kappa}B$ and ZAS3 are transcription factors that control important cellular processes including immunity, cell survival and apoptosis. Although both proteins bind the ${\kappa}B$-motif, they produce opposite physiological consequences; $NF{\kappa}B$ activates transcription, promotes cell growth and is often found to be constitutively expressed in cancer cells, while ZAS3 generally represses transcription, inhibits cell proliferation and is downregulated in some cancers. Here, we show that ZAS3 inhibits $NF{\kappa}B$-dependent transcription by competing with $NF{\kappa}B$ for the ${\kappa}B$-motif. Transient transfection studies show that N-terminal 645 amino acids is sufficient to repress transcription activated by $NF{\kappa}B$, and that the identical region also possesses intrinsic repression activity to inhibit basal transcription from a promoter. Finally, in vitro DNA-protein interaction analysis shows that ZAS3 is able to displace $NF{\kappa}B$ by competing with $NF{\kappa}B$ for the ${\kappa}B$-motif. It is conceivable that ZAS3 has therapeutic potential for controlling aberrant activation of $NF{\kappa}B$ in various diseases.
In Saccharomyces cerevisiae UV irradiation and a variety of chemical DNA -damaging agents induce the transcription of specific genes, including several involved in DNA repair. One of the best characterized of DNA -damage inducible genes is PHRI, which encodes the apoenzyme for DNA photolyase. Basal-level and damage-induced expression of PHRI require an upstream activation sequence, UASPHRI. Here we report the identification of the UlvIE6 gene of S. cerevisiae as a regulator of UASPHRl activity. Surprisingly, the effect of deletion of UME6 is growth phase dependent. In wild-type cells PHRI is induced in late exponential phase, concomitant with the initiation of glycogen accumulation that precedes the diauxic shift. Deletion of UNIE6 abolishes this induction, decreases the steady-state concentration of photolyase molecules and PHRI mRNA, and increases the UV sensitivity of a rad2 mutant. The results suggest that UM E6 contributes to the regulated expression of a subset of damage-responsive genes in yeast. Furthermore, the upstream repression sequence, URSPHRI, is required for repression and damage-induced expression of PHRl. Here we show identification of YER169W and YDR096W as putative regulators acting through $URS_{PHRI}$. These open reading frames were designated as RPHI (YERl69W) and RPH2 (YDR096W) indicating regulator of PHRI. Simultaneous disruption of both genes showed a synergistic effect, producing a four-fold increase in basal level expression and a similar decrease m the induction ratio following treatment of methyl methanesulfonate(MMS). Mutation of the sequence ($AG_4$) bound by Rphlp rendered the promoter of PHRI insensitive to changes in RPHI or RPH2 status. The data suggest that RPHI and RPH2 act as damage-responsive negative regulators of PHRI. Surprisingly, the sequence bound by Rphlp in vitro is found to be $AG_4$ which is identical to the consensus binding site for the regulators Msn2p and Msn4p involved in stress-induced expression. Deletion of MSN2 and MSN4 has little effect on the induction$.$ ratio following DNA damage. However, all deletions led to a significant decrease in basal-level and induced expression of PHRI. These results imply that MSN2 and MSN4 are positive regulators of P HRI but are not required for DNA damage repression. [Supported by grant from NIH]om NIH]
Chinese American Writer, Ha Jin has been writing exclusively about the life in his native Communist China. His stories and poems are almost all about the Chinese people so far. In addition, the distinctive Chinese flavour and the inexorably repressive image of China in his works present an 'Other' to the American culture. Such kind of Chineseness can also be found in Ha Jin's works and his career as a writer. The continued demand for knowledge of China, which is created by China's increasingly important role in the globalized economy, sustains the country's position as an Other for America. In his early four novels, Ha Jin portrays a totally repressive image of Communist China, an image of which functions perfectly as a form of otherness for his American readers. In Ha Jin's portrayal, the Chinese masses are subjected to the Communist authority through its bureaucracy and state-economy mechanism, as well as through the godlike image of Mao Zedong. They are to follow the Communist conscience and subscribe to unity-in-difference. Deviation from the one-party rule is intolerable. In each of the novels, Ha Jin presents a specific system of repression. In In the Pond, confrontation against Party authority is contained by a process of complicity. In Waiting, the Party's power is upheld through a system of surveillance in which people act as agents, resulting in a web of power which paralyses love. The Crazed illustrates a play of power by Party officials which, against the backdrop of the Tiananmen Square Massacre, is full of craze itself, driving people either out of sanity or out of the country. War Trash exposes the Communist power's repression to the extreme by presenting a case of dishonour in those whose life is debased as trash by the Party. The repressive image of China produced in these stories, which span over half a century, makes Ha Jin's China a perfect Other for the West. To sum up, Ha Jin's novels construct a repressive image of China. In his novels, Ha Jin exposes the working of repression in particular systems. Through these systems, he problematizes the notion of personal autonomy for Chinese people and proposes for his western/American readers a solution which eventually turns into a re-presentation of American hegemony.
The platelet-derived growth factor (PDGF) signaling pathway is essential for inducing a dedifferentiated state of vascular smooth muscle cells (VSMCs). Activation of PDGF inhibits smooth muscle cell (SMC)-specific gene expression and increases the rate of proliferation and migration, leading to dedifferentiation of VSMCs. Recently, microRNAs have been shown to play a critical role in the modulation of the VSMC phenotype in response to extracellular signals. However, little is known about microRNAs regulated by PDGF in VSMCs. Herein, we identify microRNA- 15b (miR-15b) as a mediator of VSMC phenotype regulation upon PDGF signaling. We demonstrate that miR-15b is induced by PDGF in pulmonary artery smooth muscle cells and is critical for PDGF-mediated repression of SMC-specific genes. In addition, we show that miR-15b promotes cell proliferation. These results indicate that PDGF signaling regulates SMC-specific gene expression and cell proliferation by modulating the expression of miR-15b to induce a dedifferentiated state in the VSMCs.
Modulation of the catabolic PEP-pathway of Anaerobiospirillum succiniciproducens was tried using some enzymatic inhibitors such as gases and chemicals in order to enhance succinic acid production. 10$\%$ CO increased the succinic acid/acetic acid (S/A) ratio but inhibited growth as well as production of succinic and acetic acid. Hydrogen gas also increased the S/A ratio and inhibited the synthesis of pyruvate: ferredoxin oxidoreductase when used in mixture with $CO_2$, Catabolic repression by acetic, lactic and formic acid was not recognized and other modulators such as glyoxylate, pyruvate derivatives, arsenic salt, phosphate and sulfate were shown not to be effective. Magesium carbonate was shown effective for repressing acetate production. Palmitic acid, myristic acid and phenylalanine did not affect acetate production but carprylic acid completely inhibited growth.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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