• 대한의생명과학회지
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• 제4권2호
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• pp.113-120
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• 1998

국내에서 채집한 진드기의 라임병 및 ehrlichiosis 원인체 보균 상태를 조사하기 위하여 총 516마리 (Ixodes spp. 22마리 , Haemaphysalis spp. 494마리)의 ixodid 진드기를 봄과 가을에 걸쳐 강원도 고산지대 일원에서 채집하였다. 수집한 진드기에서 DNA를 추출·정제한 후 추출한 DNA를 template로 이용하여, Borrelia burgdorferi sensu lato 및 Ehrlichia spp.에 특이하게 반응하도록 제작한 primer를 이용한 중합효소연쇄반응 (polymerase chain reaction, PCR)을 실시하였으며, 이 결과를 oligonucleotide probe를 사용한 southern blotting을 통하여 다시 확인하였다. 총 516마리의 진드기중 B. burgdorferi sensu lato DNA 양성인 진드기는 68 (13.2%)마리 (B. burgdorferi sensu stricto, 2； B. afzelii, 1; B. garinii, 33； B. tanukii, 8； B. turdae, 4)로 나타났으며 이 중 37 (7.2%)마리의 진드기는 southern blot analysis에서도 양성으로 확인되었다. 또한 101 (19.2%)마리의 진드기가 Ehrlichia spp.에 대한 PCR에서 양성이었으나, 이들 중 25 (4.8%)마리만이 southern blot analysis에서 양성으로 확인되었다. 그러나 사람의 병인체로 추정되는 human granulocytic ehrlichiosis (HGE) agent DNA를 보균한 진드기는 확인되지 않았다. 한편 라임병균과 ehrlichiosis원인체를 동시에 보균한 것으로 밝혀진 진드기가 3마리에서 (0.6%) 확인되어, 국내에서도 진드기 교상시 이들 두 가지 열성질환이 동시에 감염될 가능성이 있는 것으로 사료됨으로 진드기 매개성 열성질환에 대한 적절한 진단법 등을 보다 체계적으로 연구하여야 할 것으로 판단된다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제39권5호
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• pp.403-408
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• 1996

토양에서 세균군집의 DNA를 추출하여 이사디 분해세균의 밀도와 군집변화를 tdfA 유전자와 Spa Probe를 이용하여 조사하였다. 이사디 분해균주인 Pseudomonas cepacia/pJP4을 토양에 여러 가지 밀도로 접종한 후 추출된 토양세균군집의 DNA를 Southern blot에서 분석한 결과, 본 실험에 사용된 DNA probe method에 의해 이 세균을 $10^5\;cells/g$ soil 수준까지 검출할 수 있는 것으로 나타났다. 이사디를 가해준 microcosm 토양에서 추출된 세균군집의 DNA를 분석한 실험에서는 Pseudemonas pickettii와 Sphingomonas Paucimobilis가 우점종으로 검출되었고, 사용된 두 가지의 DNA probes는 토양의 이사디 분해미생물에 대해 매우 높은 특이성을 가지고 있는 것으로 나타났다. 밭에 이사디를 장기 적으로 가해준 후 추출된 토양세균군집의 DNA를 분석 한 실험에서는 이사디를 최소한 10 ppm 이상 가해주어야 토양의 이사디 분해세균을 DNA probe method에 의해 검출할 수 있었고, tfdA 유전자는 실제의 밭토양에서도 높은 특이성을 나타냈으나 Spa probe는 일부의 토착세균에 비특이적으로 반응하는 것으로 나타났다. 토양에서 추출된 세균군집의 DNA를 분석하는 DNA probe method는 Southern blot과 함께 사용되었을 때 토양에 존재하는 이사디 분해미생물을 실험실 배지에 배양하지 않고 검출할 수 있었고,이 미생물들의 밀도, 군집변화, 유전적 변화 등을 효과적으로 분석할 수 있는 것으로 나타났다.

• 한국작물학회지
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• 제38권3호
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• pp.275-282
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• 1993

본 연구는 한국 옥수수의 $\alpha$-amylase의 유전자 클로닝을 주된 목표로 하여 수행되었다. 이를 위하여 여러 식물체의 $\alpha$-amylase 염기서열로 부터 잘 보존된 부분을 참고로 oligonucleotlde probe 및 PCR primer를 설계, 합성하고, 옥수수의 유묘로부터 전체 RNA를 분리하여 northern blot analysis를 통하여 확인한 다음, 이로부터 첫 번째 가닥 cDNA를 만든 후, 여기서 얻은 RNA : DNA hybrid를 주형으로 한 polymerase chain reaction을 통하여 길이 가 약 500bp되 는 PCR 산물을 얻었다. 이를 클로닝하기 위해 pUC19을 클로닝 백터로 사용하여 재조합 플라스미드인 $\ulcorner$pZM$\alpha$'$\lrcorner$를 만들었다. 합성 probe를 이용, Southern blot analysis한 결과, $\ulcorner$pZM$\alpha$'$\lrcorner$가 옥수수 mRNA로 부터 증폭된 DNA의 일부분을 갖고 있음을 확인하였으며, 그 길이는 PCR 산물과 같은 500bp가량 되는 것으로 나타났다.

• 한국균학회지
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• 제39권3호
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• pp.235-238
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• 2011

팽이균사체의 형질전환을 위하여 Agrobacterium 세포를 사용하였다. 특히, Agrobacterium 세포의 감염단계 전에 약한 NaOH용액을 처리하였으며 이로써 균사체 세포들의 표면 상해 발생을 기대하였다. 그 결과, hygromycin 저항성 ($hyg^r$) 균사체는 NaOH 처리를 거친 경우에서만 출현하였다. 형질전환 균사체의 $hyg^r$ 유전자 도입은 PCR로 확인되었으며 또한 Southern blot hybridization과 western blotting 분석에 의하여 단일 유전자 copy의 삽입과 외래유전자의 발현을 확인할 수 있었다. 본 연구는 팽이균사체에 대한 효율적인 Agrobacterium 이용 형질전환수단을 보여주고 있다.

• 생명과학회지
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• 제9권6호
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• pp.704-708
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• 1999

This research was carried out for evaluating diagnostic value of antibody test in Fragile X syndrome. In antibody test of control individuals and carriers with a premutation, FMRP were detected in the lymphocytes, whereas the lymphocytes of male Fragile X syndrome patients were devoid of FMRP. Five Fragile X syndrome male patient, two Fragile X syndrome female patients, three carriers were diagnosed by southern blot. Five boys who were diagnosed as the patients by antibody test were turned out full mutation and having multiple smear beside normal single band. However, fragile site of X chromosome was not expressed in Fragile X syndrome patients by chromosome analysis. These results showed that antibody test was a fast and simple method, but the diagnostic power was "perpect" for males, whereas the results were less specific for females.r females.

• Journal of Plant Biology
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• 제38권2호
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• pp.137-141
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• 1995

We isolated a cDNA clone, BLSC1, encoding 5' exon of ATP synthase CF0 subunit I from broccoli. BLSC1 is 285 nucleotides long which consists of a 5' noncoding region of 34 nucleotides, a 5' exon of 145 nucleotides and an intron of 106 nucleotides. The 5' exon codes for 48 amino acids which reveals mostly hydrophobic. The amino acid sequence deduced from BLSC1 shares 83%, 83% and 91% identities with the genes coding for atpF from wheat, rice and spinach, respectively. Genomic Southern blot analysis for BLSC1 showed a typically strong signal for a gene located in the chloroplast genome. Northern blot analysis identified three major classes of transcripts showing strong positive signals in the leaves, but only trace amounts of the transcripts were identified in the other organs like stems, flowr buds and roots.

• BMB Reports
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• 제39권6호
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• pp.766-773
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• 2006

Fragile-X-syndrome (FXS) is the most common type of inherited cognitive impairment. The underlying molecular alteration consists of a CGG-repeat amplification within the FMR-1 gene. The phenotype is only apparent once a threshold in the number of repeats has been exceeded (full mutation). The aim of this study was to characterize the FMR-1 CGG-repeat status in Argentine patients exhibiting mental retardation. A total of 330 blood samples from patients were analyzed by PCR and Southern blot analysis. Initially, DNA from 78 affected individuals were studied by PCR. Since this method is unable to detect high molecular weight alleles, however, we undertook a second approach using the Southern blotting technique to analyze the CGG repeat number and methylation status. Southern blot analysis showed an altered pattern in 14 out of 240 (6%) unrelated patients, with half of them presenting a mosaic pattern. Eight out of 17 families (47%) showed a (suggest deleting highlight). The characteristic FXS pattern was identified in 8/17 families (47%), and in 4 of these families 25% of the individuals presented with a mosaic model. The expansion from pre-mutation to full mutation was shown to occur both at the pre and post zygotic levels. The detection of FXS mutations has allowed us to offer more informed genetic counseling, prenatal diagnosis and reliable patient follow-up.

• Animal cells and systems
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• 제9권4호
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• pp.205-209
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• 2005

A rapid, simple and efficient method to extract RNA from the adult polyps of a soft coral, marine cnidarian, Scleronephthya gracillimum $(K\ddot{u}kenthal)$; was developed in this study. The highest yield and purity of RNA was obtained with the lysis solution containing 35 mM EDTA, 0.7 M LiCl, 7.0% SDS, and 200 mM Tris-Cl (pH 9.0). Approximately $40{\mu}g$ of total RNA was extracted from 200 mg of liquid nitrogen-pulverized polyp tissue. The ratio of absorbance at 260 nm and 280 nm ranged from 1.8 to 2.0. The results of the reverse transcription polymerase chain reaction (RTPCR) with ${\beta}-actin$ gene specific primers and Northern blot analysis using the same gene probe revealed that the RNA extracted by our method had high quality, and was sufficient for subsequent molecular biological analyses. This method was effective for RNA extraction from other soft coral species which belong to the genus Dendronephthya.

• 식물조직배양학회지
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• 제21권6호
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• pp.319-326
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• 1994

십자화과 식물의 유용유전자를 cloning하기 위한 기초연구로서 십자화과 식물인 Armoracia rusicna의 재분화계와 형질전환계를 확립하고, gene tagging을 하기 위하여 binary vector에 삽입된 옥수수의 transposon 유전자 Ac/Ds를 도입한 결과, NAA 0.1 mg/L와 BA 1.0 mg/L를 함유한 MS 배지에서 최적의 shoot를 유기할 수 있었으며, MS 기본배지에 옮기면 쉽게 발근을 유도할 수 있었다. 옥수수의 Ac/Ds의 유전자를 잎에 형질전환시킨 결과 8-10%의 형질전환율을 보였으며, 엽병의 경우에도 4%의 형질전환 식물체가 얻어졌다. Kanamycin 100 mg/L 농도에서 선발한 개체를 PCR 분석 및 Southern blot분석을 행하였던 결과 PCR분석으로부터 Ds유전자가 식물에 도입된 것이 확인되었고, Southern blot 분석으로부터 Ac/Ds 모두가 도입된 것이 확인되었다.

• 식물조직배양학회지
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• 제27권6호
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• pp.441-445
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• 2000

저인산 조건하에서 인산 흡수 효율이 높은 벼 품종을 개발하고자 담배의 인산수송자 유전자를 벼에 형질전환하였다. 동진벼로부터 유도된 callus를 담배의 인산수송자 유전자가 도입된 A. tumefaciens LBA 4404와 공동배 양한 후, 선발배지에서 증식된 callus를 250 mg/L carbenicillin, 2 mg/L kinetin, 0.1 mg/L NAA가 첨가된 MS배지에 옮겨 약 2주 후부터 소식물체를 얻었다. Carbenicillin 250 mg/L 첨가된 MS 기본배지에서 소식물체의 발근을 유도하여 재분화 식물체를 얻었다. 선발된 callus는 약 52%의 식물체 재력화율을 보였다. 선발된 재분화 식물체에 대한 PCR 분석을 수행하여 형질전환 벼 식물체에 담배의 인산수송자 유전자가 삽입되었음을 확인하였다. 형질전환체의 genonlic DNA로부터 PCR에 의해 증폭된 DNA에 대한 Southern blot분석 결과, 대조 식물체에서는 band가 검출되지 않았으나 형질전환 식물체에서는 인산수송자 유전자와 동일한 1.7kb의 band가 검출되어 외래유전자인 담배 인산수송자 유전자가 안전적으로 도입되었음이 확인되었다.