• 제목/요약/키워드: Shock synthesis

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Psychrotolerance Mechanisms in Cold-Adapted Bacteria and their Perspectives as Plant Growth-Promoting Bacteria in Temperate Agriculture

  • Subramanian, Parthiban;Joe, Manoharan Melvin;Yim, Woo-Jong;Hong, Bo-Hui;Tipayno, Sherlyn C.;Saravanan, Venkatakrishnan Sivaraj;Yoo, Jae-Hong;Chung, Jong-Bae;Sultana, Tahera;Sa, Tong-Min
    • 한국토양비료학회지
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    • 제44권4호
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    • pp.625-636
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    • 2011
  • Cold-adapted bacteria survive in extremely cold temperature conditions and exhibit various mechanisms of adaptation to sustain their regular metabolic functions. These adaptations include several physiological and metabolic changes that assist growth in a myriad of ways. Successfully sensing of the drop in temperature in these bacteria is followed by responses which include changes in the outer cell membrane to changes in the central nucleoid of the cell. Their survival is facilitated through many ways such as synthesis of cryoprotectants, cold acclimation proteins, cold shock proteins, RNA degradosomes, Antifreeze proteins and ice nucleators. Agricultural productivity in cereals and legumes under low temperature is influenced by several cold adopted bacteria including Pseudomonas, Acinetobacter, Burkholderia, Exiguobacterium, Pantoea, Rahnella, Rhodococcus and Serratia. They use plant growth promotion mechanisms including production of IAA, HCN, and ACC deaminase, phosphate solublization and biocontrol against plant pathogens such as Alternaria, Fusarium, Sclerotium, Rhizoctonia and Pythium.

Observational Studies on Evolved Stars Using KVN and KaVA/EAVN

  • Cho, Se-Hyung;Yun, Youngjoo;Imai, Hiroshi
    • 천문학회보
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    • 제44권2호
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    • pp.51.1-51.1
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    • 2019
  • At the commissioning phase of KVN from 2009 to 2013, single-dish survey and monitoring observations were performed toward about 1000 evolved stars and about 60 relatively strong SiO and H2O maser sources respectively. Based on these single-dish results and VLBI feasibility test observations at K/Q/W/D bands in 2014, KVN Key Science Project (KSP) has started from 2015 and will be completed in 2019 as KSP phase I. Here we present the overview of observational studies on evolved stars using KVN. In KSP phase I, we have focused on nine KSP sources which show a successful astrometrically registered maps of SiO and H2O masers using the source frequency phase referencing method. We aim at investigating the spatial structure and dynamical effect from 43/42/86/129 GHz SiO to 22 GHz H2O maser regions associated with a stellar pulsation and development of asymmetry in circumstellar envelopes. Using the combined network KaVA (KVN+Japanese VLBI network VERA), KaVA Large Program titled on "Expanded Study on Stellar Masers: ESTEMA Phase I" was performed from 2015 to 2016. Based on ESTEMA Phase I, EAVN Large Program titled on "EAVN Synthesis of Stellar Maser Animations: ESTEMA Phase II" was also performed from 2018. The ESTEMA II project aims to publish composite animations of circumstellar H2O and SiO masers, which taken from up to 6 long-period variable stars with a variety of the pulsation periods (333-1000 days). The animations will exhibit the three-dimensional kinematics of the maser gas clumps with complexity caused by stellar pulsation-driven shock waves and anisotropy of clump ejections from the stellar surface. Adding three EAVN telescopes (Tianma 65m, Nanshan 26m and NRO 45m telescopes) with KaVA always secures the high quality of the maser image frames through the monitoring program.

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Ginsenosides Rg1 regulate lipid metabolism and temperature adaptation in Caenorhabditis elegans

  • Hao Shi ;Jiamin Zhao ;Yiwen Li ;Junjie Li ;Yunjia Li;Jia Zhang ;Zhantu Qiu ;Chaofeng Wu ;Mengchen Qin ;Chang Liu ;Zhiyun Zeng ;Chao Zhang ;Lei Gao
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제47권4호
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    • pp.524-533
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    • 2023
  • Background: Obesity is a risk factor for aging and many diseases, and the disorder of lipid metabolism makes it prominent. This study aims to investigate the effect of ginsenoside Rg1 on aging, lipid metabolism and stress resistance Methods: Rg1 was administered to Caenorhabditis elegans (C. elegans) cultured in NGM or GNGM. The lifespan, locomotory activity, lipid accumulation, cold and heat stress resistance and related mRNA expression of the worms were examined. Gene knockout mutants were used to clarify the effect on lipid metabolism of Rg1. GFP-binding mutants were used to observe the changes in protein expression Results: We reported that Rg1 reduced lipid accumulation and improved stress resistance in C. elegans. Rg1 significantly reduced the expression of fatty acid synthesis-related genes and lipid metabolism-related genes in C. elegans. However, Rg1 did not affect the fat storage in fat-5/fat-6 double mutant or nhr-49 mutant. Combined with network pharmacology, we clarified the possible pathways and targets of Rg1 in lipid metabolism. In addition, Rg1-treated C. elegans showed a higher expression of anti-oxidative genes and heat shock proteins, which might contribute to stress resistance Conclusion: Rg1 reduced fat accumulation by regulating lipid metabolism via nhr-49 and enhanced stress resistance by its antioxidant effect in C. elegans.

담배가루이(Bemisia tabaci, Aleyrodidae, Hemiptera)에서 Virus-induced Gene Silencing (VIGS) Vector를 이용하기 위한 cDNA Library 제작 (Construction of cDNA Library for Using Virus-induced Gene Silencing (VIGS) Vector with the Sweetpotato Whitefly, Bemisia tabaci(Hemiptera: Aleyrodidae))

  • 고나연;임현섭;유용만;윤영남
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제54권2호
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    • pp.91-97
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    • 2015
  • 담배가루이(Bemisia tabaci)는 외래해충으로 바이러스벡터로 작용하여, 토마토의 토마토황하잎말림병바이러스(TYLCV)를 비롯한 약 100여종의 바이러스를 매개하는 중요한 해충이다. 본 연구에서는 VIGS vector를 이용하여 담배가루이 방제를 위한 target 유전자들을 선발하기 위해 gateway system을 이용한 담배가루이 cDNA library 제작을 시도하였다. 첫 번째 방법으로 oligo d(T) primer를 사용하였을 때, 평균 약 1 kb의 insert와 $1.4{\times}10^4cfu$의 titer를 확인하였다. 그러나 insert size가 너무 커서 적절하지 않았다. 두 번째 방법으로 attB-N25 random primer를 이용하고, sonication을 6초 실시하여 다시 진행하였다. 그러나 확인되는 insert size는 다소 컸고, 몇몇은 insert가 너무 작아서 밴드가 확인 되지않았으며, $1.04{\times}10^54cfu$의 titer를 확인할 수 있었다. 세 번째 방법으로는 oligo d(T) primer를 이용하였고, sonication을 2초 실시하였다. 그 결과 300 bp~600 bp size의 insert가 확인되었으나, electro transformation을 사용한 첫번째, 두번째 방법에 비해 heat shock transformation을 사용하여 titer가 $5.2{\times}10^24cfu$로 매우 낮은 것을 확인 할 수 있었다. 결과적으로 cDNA library를 만들 때 먼저 random primer를 사용하여 First strand를 합성하여 poly A를 제거하고, 다음으로 sonication을 1초 실시하여 300~700 bp정도의 적절한 size의 insert를 생성하고, 마지막으로 electro-transformation을 실시하여 transformation 효율을 높인다면 VIGS vector에 적합한 cDNA library를 만들 수 있을 것으로 사료 된다.

누에 수정란 초기발현유전자 데이터베이스 구축 (Gene expression profile of the early embryonic gene of the silkworm, Bombyx mori)

  • 최광호;구태원;김성렬;김성완;전재범;박승원;강석우
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제51권2호
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    • pp.191-196
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    • 2013
  • 본 연구는 누에 수정란 초기에 발현하는 유전자를 대량 선발하고, 유용 유전자의 프로모터를 개발하기 위한 연구의 일환으로 추진하였다. 산란 후 2 ~ 16시간이 경과한 누에알로부터 cDNA 유전자은행을 제작하였다. 제작된 cDNA 유전자은행으로 전체 960개 클론을 무작위 추출하여 부분 염기서열 분석을 통해 EST를 제작하였다. 분석된 652개 ESTs 중 염기서열 상동성 분석을 통해 156개의 기존 알려진 유전자와 178개의 미지의 유전자로 구성된 334개 독립유전자를 최종 선발하여 'eegEST'로 명명하였다. eegEST 분석 결과, 기존 염기서열 정보가 알려진 156개 독립유전자 중 2회 이상 출현한 유전자 수는 143개로 전체의 34%를 차지하였으며, Hsp20.8 유전자(12회)와 ubiqutin-like 유전자(11회)가 가장 높은 출현 빈도를 나타내었다. 또한 eegEST 독립유전자의 추정 기능에 따른 분류에서 곤충 수정란 발생초기에 확인할 수 있는 기관 형성과 관련한 유전자가 전체 24%를 차지하고 있었다. 본 연구에서 작성된 누에 수정란 초기 발현유전자 데이터베이스(eegEST)는 곤충 발생학 연구를 위한 정보제공 뿐 아니라 형질전환누에 제작을 위한 프로모터 개발 연구에 활용될 수 있을 것으로 기대한다.

마우스 복강내 대식세포에 대한 Vibrio vulnificus Hemolysin의 세포독성 (The Cytotoxic Effect of Vibrio vulnificus Hemolysin on the Mouse Peritoneal Macrophages)

  • 임인수;이시은;김설;배미옥;이준행;신부안;정선식;류필열
    • 대한미생물학회지
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    • 제35권3호
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    • pp.251-261
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    • 2000
  • V. vulnificus is an estuarine bacterium which causes septicemia and shock in susceptible patients. The organism produces a hemolytic cytolysin (VvH), which has a membrane damaging effect on erythrocytes. To clarify the mechanisms by which VvH might contribute to virulence, we examined its effect on macrophages. When mouse peritoneal macrophages were harvested and co-cultured with hemolysin-positive V. vulnificus strains (100 bacteria/cell), about 60% of the macrophages were killed; macrophages were not killed when co-cultured V. vulnificus strain CVD 707, a VvH-negative deletion mutant. Exposure of macrophages to filtered culture supernatants (2.5 HU/ml) and purified VvH (3 HU/ml) resulted in an increase in dead cells (80 and 90%, respectively), as determined by the trypan blue dye exclusion method and LDH release from macrophages was also increased (70 and 65.5%, respectively). The cytotoxic effect of VvH on macrophages was both the dose- and time-dependent. The VvH caused damage to the macrophage membrane and was blocked significantly by preincubation with cholesterol (p<0.01). Fetal bovine serum showed remarkable inhibition of VvH synthesis by V. vulnificus and inhibited VvH activity in culture supernatant. Cell viability was increased by 35% (p<0.01) and LDH release decreased by 28% (p<0.01) when macrophages were incubated with V. vulnificus (100 bacterial cell) in DMEM-10% FBS for 2 hr. Bacterial clearance activity of mice against V. vulnificus CVD 707 was decreased by pretreatment with 10 HU of VvH. This result suggests that the VvH can impair the membrane of macrophages and may playa role in the pathogenesis of V. vulnificus septicemia.

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Anti-thrombic Properties of the Oriental Herbal Medicine, Daejowhan

  • Chang Gyu-Tae;Kim Jang-Hyun
    • 동의생리병리학회지
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    • 제19권5호
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    • pp.1391-1398
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    • 2005
  • The anti-thrombic properties of the oriental herbal medicine Daejowhan(DJW, 大造丸) which consists of 11 kinds of herbs (indicated as ratio) of Rehmanniae Radix 24%, Hominis Placenta 5%, Testudinis Carapax 9%, Eucommiae Cortex 9%, Asparagi Radix 9%, Phellodendri Cortex 9%, Achyranthis Radix 7%, Liriopis Tuber 7%, Angelicae Sinensis Radix 7%, Ginseng Radix 5% and Schizandrae Fructus 3% were investigated. The water extracts from DJW inhibited Platelet-activating factor(PAF) induced platelet aggregation. DJW was extracted with methanol and further fractionated by ethylacetate. A 70% methanol extract showed a strong inhibition against PAF-induced aggregation in vitro and in vivo assays. The ethylacetate soluble fraction was shown to have inhibitory effect on PAF-induced platelet aggregation in vitro assay. The ethylacetate soluble fraction specially protected against the lethality of PAF, while verapamil did not afford any protection. These results indicate that the water extracts and alcoholic-fractions inhibit the action of PAF in vivo by an antagonistic effect on PAF, so that it may be useful in treating disorders caused by PAF, such as acute allergy, inflammation, asthma, gastrointestinal ulceration, toxic shock and so forth. DJW was investigated regarding its assumed anti-thrombic action on human platelets which was deduced from its ability to suppress Arachidonic acid(AA)-induced aggregation, exocytosis of ATP, and inhibition of Cyclooxygenase(COX) and Thromboxane synthase(TXS) activity. The latter two effects were estimated from the generation of Prostaglandin $E_2(PGE_2)$ and Thromboxane $A_2(TXA_2)$ respectively. Exogenously applied AA ($100{\mu}mol/{\ell}$) provoked a $89\%$ aggregation of platelets, the release of 14 pmol ATP, and the formation of either 225 pg $TXA_2$ or 45 pg $PGE_2$, each parameter being related to 106 platelets. An application of DJW 5 min before AA dose-dependently diminished aggregation, ATP-release and the synthesis of $TXA_2$ and $PGE_2$ with $IC_{50}$ values of 74, 108, 65, $72{\mu}g/m{\ell}$, respectively. The similarity of the $IC_{50}$ values suggest an inhibition of COX by DJW as primary target, thus suppressing the generation of $TXA_2$ which induces aggregation of platelets and exocytosis of ATP by its binding on $TXA_2$-receptors.

출혈성 쇼크로 인한 급성 폐손상의 발병기전과 아스피린의 효과 (Effects of Aspirin on the Pathogenesis of Acute Lung Injury in Rats Subjected to Hemorrhage)

  • 박윤엽;이영만
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제60권1호
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    • pp.83-91
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    • 2006
  • 연구배경 : 아스피린이 출혈성 쇼크시 나타나는 급성 폐손상에 미치는 효과와 혈장 및 폐세척액 내 ferritin 농도변화를 알아보고자 본 연구를 시행하였다. 방 법 : 실험동물은 체중 350g 내외의 Sprague-Dawley 종 흰쥐를 사용하였고, 혈압측정 및 출혈을 시키기 위하여 catheter를 양쪽 대퇴동맥에 삽입하였다. 수술 후 polygraph를 이용하여 평균동맥압을 기록하였으며, 출혈은 withdrawal pump를 이용하여 5분간 체중 kg당 20 ml의 혈액을 출혈시켰다. 실험군은 대조군, 출혈군과 아스피린 처치군으로 분류하였다. 대조군은 출혈군과 동일하게 수술하고 출혈은 시키지 않았으며 나머지 과정은 출혈군과 동일하게 처리하였다. 아스피린 처치군은 출혈 30분 전 대퇴정맥으로 아스피린(10mg/kg)을 주입하였고, 출혈군은 체중 당 동일한 양의 생리식염수를 주입하였다. 출혈 2시간 후의 폐손상 정도와 아스피린이 이에 미치는 효과를 알아보기 위하여 폐장내 myeloperoxidase 활성도와 폐세척액 내의 단백함량과 백혈구 수 및 혈장 ferritin 농도와 폐세척액 내 ferritin 농도를 측정하였다. 결 과 : 폐장내 myeloperoxidase 활성도와 폐세척액 내의 단백함량과 백혈구수는 출혈 후 대조군에 비해 유의하게 증가하였다. 이러한 반응은 아스피린 전처치에 의하여 효과적으로 차단되었다. 혈장 및 폐세척액 내 ferritin 농도는 출혈 후 크게 증가하였는데, 아스피린 전처치로 반응이 억제되었다. 결 론 : 심한 출혈 후에 생기는 급성 폐손상은 아스피린 전처치로 효과적으로 예방될 수 있으며, 출혈 후 증가하는 혈장 및 폐세척액 내 ferritin 농도는 급성폐손상이 나타날 수 있는 환자에서 조기진단을 위한 생체지표 로 활용될 수 있다고 생각된다.

내독소처치 흰쥐에서 Tumor Necrosis Factor-$\alpha$치 상승에 따른 폐손상 악화 및 35 kDa 단백질 합성 (Lung Injury Indices Depending on Tumor Necrosis Factor-$\alpha$ Level and Novel 35 kDa Protein Synthesis in Lipopolysaccharide-Treated Rat)

  • 최영미;김영균;권순석;김관형;문화식;송정섭;박성학
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제45권6호
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    • pp.1236-1251
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    • 1998
  • 연구배경 : 급성폐손상의 병태생리학적 기전에는 염증세포들이 분비하는 다양한 염증성 매개물질들이 매우 중요한 역할을 한다. 이중 특히 tumor necrosis factor-$\alpha$ (TNF-$\alpha$) 는 다른 염증세포들의 화학주성 및 각종 염증성 매개물질 분비에 영향을 미치는 proin-flammatory cytokine으로 작용하는 한편, 직접적으로 세포손상을 야기시키는 세포독성 cytokine으로도 작용하는데, 급성폐손상에서 TNF-$\alpha$와 폐조직 손상과의 직접적인 관련성에 대해서는 아직 구체적으로 확인된 바가 많지 않다. 또한, 최근에 생체내 방어기전으로 스트레스 단백질에 대한 관심이 높아지면서, 단핵구에 내독소를 처치하거나, 동물에 내독소를 투여하기 전에 미리 스트레스 단백질을 합성시킨 경우, 내독소에 의한 손상을 감소시켜 준다는 연구가 보고되었지만, 내독소 자극 자체만으로 스트레스 단백질 합성이 유도되는지는 아직 분명하지 않다. 이에 저자들은 내독소 유도성 급성 폐손상에서 TNF-$\alpha$ 분비와 폐조직 손상을 포함한 일련의 염증반응과의 관계를 분석하고, 생체내 내독소 자극에 대하여 폐포대식세포에서 스트레스 단백질을 포함한 새로운 단백질 합성이 유도되는지 여부를 분석하고자 하였다. 연구방법 : 흰쥐의 기관내로 내독소를 투여한 후 시간별로 기관지폐포세척액내 TNF-$\alpha$농도, 염증세포 백분율 변화, 병리조직학적 소견을 관찰하고, 또한 각 시간대의 폐포대식세포에서 sodium dodesyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis와 inducible heat stress protein72에 대한 면역화학염색을 시행하여 단백질 합성양상을 분석하는 한편, 폐포대식세포에 다양한 농도의 내독소 자극과 열처리를 가한 후, 배양상층액에서 tumor necrosis factor-a 농도를 측정하고, 폐포대식세포의 단백질 합성양상을 분석하였다. 연구결과 : 내독소 투여 후 tumor necrosis factor-$\alpha$는 첫 1시간째부터 현저하게 증가하여 (p< 0.0001) 3시간째 최고치에 이르렀고 6시간째는 감소하기 시작하여 12시간째는 정상 대조군 수준으로 감소하였다. 내독소 투여 후 염증세포 백분율의 변화는 2시간째부터 시작하여 6시간째 최고에 이르러 12시간째까지 지속하였으며, 장시간째에 정상 대조군 수준으로 회복하였다. 병리조직학적 소견상 폐손상 지표 점수는 내독소 투여후 6시간째 최고치에 이르러 24 시간째까지 지속하였다. 내독소 투여 후 분리한 폐포대식세포에서 첫 1시간째부터 장시간째까지 정상 대조군에서는 관찰할 수 없던 35kDa의 새로운 단백질 띠가 관찰되었으며, 면역화학염색상 inducible heat stress protein72는 관찰되지 않았다. 내독소 자극을 가하지 않은 정상 대조세포군에 비해 내독소 자극을 가한 세포군의 배양상층액에서 tumor necrosis factor-$\alpha$ 농도가 유의하게 높았으며 (p<0.001), 내독소 자극만 가한 세포군에 비해 열충격 전처치후 내독소 자극을 가한 세포군의 배양상층액에서 tumor necrosis factor-$\alpha$ 농도가 10 ${\mu}g/ml$ 내독소 자극군만 제외하고 모두 유의하게 감소하였다 (p<0.05). 내독소 자극만 가한 세포군은 10 ${\mu}g/ml$의 고농도에서만 35 kDa 의 단백질 띠가 합성되었고 inducible heat stress protein72는 관찰되지 않았다. 열충격 전처치후 내독소 자극을 가한 세포군은 모두 inducible heat stress protein72가 관찰되었다. 결 론 : 기관내 내독소 투여에 의한 급성 폐손상에서 tumor necrosis factor-$\alpha$는 폐손상 정도와 밀접한 관련이 있다. 또한 내독소 자극에 의해서는 폐포대식세포에서 inducible heat stress protein72 합성이 유도되지 않으며, 35 kDa의 새로운 단백질 합성이 유도되었는데, tumor necrosis factor-$\alpha$ 농도 및 병리조직소견과의 관계를 볼 때, 급성 폐손상에 있어 35 kDa 단백질이 방어적인 역할을 담당하지는 않을 것으로 보이며, 이에 대해서는 향후 더 연구가 필요할 것으로 생각된다.

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병원성 Salmonella enterica serovar Typhimurium의 저온 유도성 산 내성 반응 (Low Temperature Inducible Acid Tolerance Response in virulent Salmonella enterica serovar Typhimurium)

  • 송상선;이선;이경미;임성영;조민호;박용근;박경량;이인수
    • 미생물학회지
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    • 제37권3호
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    • pp.228-233
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    • 2001
  • Salmonella enterica serovar Typhimurium의 대수 생장기 산 적응기전(acid tolerance response; ATR)은 pH 4.5 이하 조건에서 산 적응결과 형성된 것이며, 이것은 세균세포가 강한 산성환경에 노출되었을 때 생존율을 높일 수 있는 기전이다. ATR은 세균의 생장단계에 따라 대수 생장기 ATR과 생장 정지기 ATR로 구분되어질 수 있으며, 각 생장 단계는 산 적응 과정에서 합성되는 고유의 ASP (acid shock protein)가 존재한다. ATR 기전은 낮은 온도 등과 같은 환경조건에 영향을 받는다는 것이 본 실험 결과를 통하여 발견되었다. 낮은 온도 및 약산성 조건에 노출되었을 경우 강한 산성 조건에서 세균의 생존율은 증가하는 양상을 보였으며, 이때의 생존율은 $37^{\circ}C$에서 보여졌던 것보다 높게 나타났다. $25^{\circ}C$에서 산 적응을 하지 않은 경우의 세균은 $37^{\circ}C$와 비교하였을 경우 약 10,000배 정도의 생존율 증가를 보여주었다. 산 내성 반응에 주요한 기능을 담당하는 rpoS 돌연변이주의 산 내성도는 $37^{\circ}C$의 결과와 비교해블 때 저온의 조건에서 산 내성능이 높게 나타났다. 비륵 rpoS 돌연변이주가 저온에서 산 적응 여부에 관계없이 pH 3.1에서 유사한 ATR 양상을 보여주고 있지만, $25^{\circ}C$의 산성 조건에서 rpoS$\Omega$Ap 돌연변이주는 지속적 산 내성도를 나타내지 않음으로써 저온에서도 rpoS 의존성 ATR 기전이 존재하고 있다는 것을 알 수 있었다. 결과적으로 저온 조건에서는 rpoS의존적 및 -비의존적 ATR기전 모두가 존재하는 것으로 여겨진다. 저온 조건과 ATR의 기초연구를 위해서 병원성 5. enterica serovar Typhimurium UK1에서 low temperature acid tolerance (lat) 유전자를 P22-MudJ(Km, lacZ)를 이용한 lacz 오페론 융합법을 사용하여 LF452 latA::MudJ를 분리하였다. LF452 latA::MudJ 돌연변이주는 저온에서 산 적응기전을 보유하지 않았으며, 결과적으로 latA는 $25^{\circ}C$에서 산 적응 내성 기전에 관여하는 중요 유전자로 판단되며, latA의 유전자는 Salmonella Genetic Map상의 21.5 min에 위치하고 있다.

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